MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC183

Total Repeats: 2573

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018686	TTA	2	6	4	9	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018686	ACA	2	6	50	55	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407702138
3	NC_018686	CTT	2	6	129	134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702138
4	NC_018686	ATG	2	6	283	288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702138
5	NC_018686	GGA	2	6	313	318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407702138
6	NC_018686	TGA	2	6	455	460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702138
7	NC_018686	AGA	2	6	463	468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702138
8	NC_018686	GAA	2	6	559	564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702139
9	NC_018686	GAA	2	6	609	614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702139
10	NC_018686	TGG	2	6	637	642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407702139
11	NC_018686	GAT	2	6	668	673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702139
12	NC_018686	TTA	2	6	713	718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018686	ATT	2	6	720	725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018686	TAA	2	6	742	747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018686	TAA	2	6	749	754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018686	GAA	2	6	818	823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702140
17	NC_018686	TAG	2	6	945	950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702140
18	NC_018686	AAG	2	6	1197	1202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702141
19	NC_018686	GAA	2	6	1286	1291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702141
20	NC_018686	GAA	2	6	1307	1312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702141
21	NC_018686	TAG	2	6	1377	1382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702141
22	NC_018686	TAA	2	6	1404	1409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702141
23	NC_018686	AGA	2	6	1420	1425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702141
24	NC_018686	AAT	2	6	1467	1472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702141
25	NC_018686	AGG	2	6	1524	1529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018686	CTA	2	6	1641	1646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702142
27	NC_018686	GGC	2	6	1685	1690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407702142
28	NC_018686	ATA	2	6	1704	1709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702142
29	NC_018686	GTT	2	6	1746	1751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407702142
30	NC_018686	TAC	2	6	1811	1816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702142
31	NC_018686	TGA	2	6	1985	1990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702142
32	NC_018686	TGT	2	6	2114	2119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407702142
33	NC_018686	AAT	3	9	2280	2288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702142
34	NC_018686	CTA	2	6	2440	2445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702142
35	NC_018686	TTC	2	6	2484	2489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702142
36	NC_018686	TGA	2	6	2555	2560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702142
37	NC_018686	ATT	2	6	2650	2655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702142
38	NC_018686	GAA	2	6	2724	2729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702142
39	NC_018686	TTC	2	6	2748	2753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702142
40	NC_018686	TAA	2	6	2756	2761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702142
41	NC_018686	AGT	2	6	2763	2768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702142
42	NC_018686	TAG	2	6	2810	2815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702142
43	NC_018686	GAA	2	6	2827	2832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702142
44	NC_018686	TGT	2	6	2852	2857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407702142
45	NC_018686	GTT	2	6	2943	2948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407702142
46	NC_018686	TAA	2	6	3017	3022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702142
47	NC_018686	TCT	2	6	3312	3317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702142
48	NC_018686	ATA	2	6	3451	3456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702142
49	NC_018686	CTT	2	6	3535	3540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702142
50	NC_018686	GAA	2	6	3543	3548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702142
51	NC_018686	TTA	2	6	3598	3603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702142
52	NC_018686	AAC	2	6	3667	3672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407702142
53	NC_018686	GAA	2	6	3809	3814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702142
54	NC_018686	CAG	2	6	3945	3950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407702142
55	NC_018686	GAT	2	6	4158	4163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702142
56	NC_018686	GAT	3	9	4230	4238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702142
57	NC_018686	ATG	2	6	4553	4558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702143
58	NC_018686	ATA	2	6	4654	4659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018686	TGG	2	6	4769	4774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407702144
60	NC_018686	GCA	2	6	4880	4885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407702144
61	NC_018686	CAA	2	6	4926	4931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407702145
62	NC_018686	ATA	2	6	5009	5014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702145
63	NC_018686	GGT	2	6	5042	5047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407702145
64	NC_018686	ATA	2	6	5133	5138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702145
65	NC_018686	ATA	2	6	5268	5273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702145
66	NC_018686	CTA	2	6	5283	5288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702145
67	NC_018686	TGC	2	6	5353	5358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407702145
68	NC_018686	AGA	2	6	5534	5539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702146
69	NC_018686	ATT	2	6	5562	5567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702146
70	NC_018686	AGA	2	6	5603	5608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702146
71	NC_018686	TTG	2	6	5647	5652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407702146
72	NC_018686	AAG	2	6	5749	5754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702146
73	NC_018686	ATC	2	6	5770	5775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702146
74	NC_018686	TCA	2	6	5897	5902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702146
75	NC_018686	ACA	2	6	5910	5915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407702146
76	NC_018686	AAT	2	6	6246	6251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702146
77	NC_018686	AAG	2	6	6286	6291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702146
78	NC_018686	GAT	2	6	6299	6304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702146
79	NC_018686	CAT	2	6	6324	6329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702146
80	NC_018686	CTT	2	6	6337	6342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702146
81	NC_018686	TGA	2	6	6410	6415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702146
82	NC_018686	AGA	2	6	6425	6430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702146
83	NC_018686	GTA	2	6	6477	6482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702146
84	NC_018686	AAC	2	6	6485	6490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407702146
85	NC_018686	AGA	2	6	6818	6823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702147
86	NC_018686	ATT	2	6	6888	6893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702147
87	NC_018686	TGG	2	6	6939	6944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407702147
88	NC_018686	AAT	2	6	7059	7064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702147
89	NC_018686	ATT	2	6	7097	7102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702147
90	NC_018686	GAG	2	6	7147	7152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407702147
91	NC_018686	GTG	2	6	7422	7427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407702147
92	NC_018686	TCT	2	6	7537	7542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702147
93	NC_018686	TAC	2	6	7553	7558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702147
94	NC_018686	TGA	2	6	7568	7573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702147
95	NC_018686	AGT	2	6	7600	7605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702148
96	NC_018686	AGC	2	6	7606	7611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407702148
97	NC_018686	AGA	2	6	7675	7680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702148
98	NC_018686	CAA	2	6	7694	7699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407702148
99	NC_018686	TAA	2	6	7705	7710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702148
100	NC_018686	GCT	2	6	7909	7914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407702148
101	NC_018686	AAG	2	6	8233	8238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702148
102	NC_018686	CTT	2	6	8245	8250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702148
103	NC_018686	CTA	2	6	8253	8258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702148
104	NC_018686	TAG	3	9	8283	8291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702148
105	NC_018686	GCA	2	6	8297	8302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407702148
106	NC_018686	ATG	3	9	8442	8450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702149
107	NC_018686	TGG	2	6	8531	8536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407702149
108	NC_018686	AAG	2	6	8545	8550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702149
109	NC_018686	AAC	2	6	8775	8780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_018686	AAG	2	6	8945	8950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702151
111	NC_018686	ATT	2	6	9123	9128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702151
112	NC_018686	GTT	2	6	9138	9143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407702151
113	NC_018686	AAG	2	6	9148	9153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702151
114	NC_018686	TAA	2	6	9173	9178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702151
115	NC_018686	TAA	2	6	9195	9200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702152
116	NC_018686	AGT	2	6	9253	9258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702152
117	NC_018686	TTA	2	6	9336	9341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702152
118	NC_018686	TTG	3	9	9423	9431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407702152
119	NC_018686	GTG	2	6	9432	9437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407702152
120	NC_018686	GAA	2	6	9643	9648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702153
121	NC_018686	AAC	2	6	9666	9671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407702153
122	NC_018686	AGA	2	6	9688	9693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702153
123	NC_018686	CAA	2	6	9722	9727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407702153
124	NC_018686	TAC	2	6	9738	9743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702153
125	NC_018686	GAA	2	6	9911	9916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702153
126	NC_018686	GAA	2	6	9998	10003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702153
127	NC_018686	GAA	2	6	10064	10069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702153
128	NC_018686	CAT	2	6	10103	10108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702153
129	NC_018686	TGC	2	6	10144	10149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407702153
130	NC_018686	AGA	2	6	10165	10170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702153
131	NC_018686	TGA	2	6	10171	10176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702153
132	NC_018686	GAA	3	9	10190	10198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702153
133	NC_018686	GAA	2	6	10241	10246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702153
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157	NC_018686	TAA	2	6	11515	11520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_018686	TCA	2	6	11571	11576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702154
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253	NC_018686	TAA	2	6	19046	19051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
254	NC_018686	ATG	2	6	19073	19078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702159
255	NC_018686	CTT	2	6	19117	19122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702159
256	NC_018686	GTT	2	6	19184	19189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407702159
257	NC_018686	GGA	2	6	19196	19201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407702159
258	NC_018686	AGC	2	6	19358	19363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407702159
259	NC_018686	CTT	2	6	19545	19550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702160
260	NC_018686	GAT	2	6	19691	19696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702160
261	NC_018686	ACA	2	6	19784	19789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407702160
262	NC_018686	AAC	2	6	19791	19796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407702160
263	NC_018686	AGA	2	6	19857	19862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702160
264	NC_018686	CTT	2	6	19954	19959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702160
265	NC_018686	TGG	2	6	20023	20028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407702160
266	NC_018686	AAG	2	6	20061	20066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702160
267	NC_018686	AAT	2	6	20126	20131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702161
268	NC_018686	CAA	2	6	20154	20159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407702161
269	NC_018686	TCC	2	6	20300	20305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407702161
270	NC_018686	AGA	2	6	20375	20380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702161
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272	NC_018686	CGT	2	6	20439	20444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407702161
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276	NC_018686	TTA	2	6	20928	20933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702161
277	NC_018686	TTA	2	6	20940	20945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702161
278	NC_018686	ATT	2	6	20986	20991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702161
279	NC_018686	ACA	3	9	21002	21010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407702161
280	NC_018686	GGT	2	6	21012	21017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407702161
281	NC_018686	GTG	2	6	21034	21039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407702161
282	NC_018686	CAA	2	6	21094	21099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407702161
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285	NC_018686	ATA	2	6	21277	21282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702161
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287	NC_018686	GAA	2	6	21624	21629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702161
288	NC_018686	GTT	2	6	21668	21673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407702161
289	NC_018686	TAA	2	6	21691	21696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702161
290	NC_018686	TCT	2	6	21769	21774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702161
291	NC_018686	ACC	3	9	21803	21811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407702161
292	NC_018686	TGA	2	6	22028	22033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702161
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297	NC_018686	GTT	2	6	22174	22179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407702162
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301	NC_018686	GCA	2	6	22336	22341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407702162
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378	NC_018686	GTG	2	6	28540	28545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
379	NC_018686	GAA	2	6	28622	28627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702170
380	NC_018686	TTA	2	6	28640	28645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702170
381	NC_018686	ATG	2	6	28665	28670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702170
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499	NC_018686	TAA	3	9	36534	36542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
500	NC_018686	TAC	2	6	36681	36686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702180

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