MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Brachyspira pilosicoli B2904 chromosome

Total Repeats: 88358

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_018607	TGA	2	6	157739	157744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404474826
5003	NC_018607	GA	3	6	157756	157761	50 %	0 %	50 %	0 %	404474827
5004	NC_018607	TAA	3	9	157780	157788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404474827
5005	NC_018607	AT	3	6	157809	157814	50 %	50 %	0 %	0 %	404474827
5006	NC_018607	AT	3	6	157896	157901	50 %	50 %	0 %	0 %	404474827
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5011	NC_018607	ATA	2	6	158058	158063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404474827
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5013	NC_018607	A	6	6	158242	158247	100 %	0 %	0 %	0 %	404474827
5014	NC_018607	TAC	2	6	158248	158253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404474827
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5017	NC_018607	TAC	2	6	158563	158568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404474827
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5019	NC_018607	GGA	2	6	158678	158683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	404474827
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5021	NC_018607	A	6	6	158845	158850	100 %	0 %	0 %	0 %	404474827
5022	NC_018607	AT	3	6	158864	158869	50 %	50 %	0 %	0 %	404474827
5023	NC_018607	GGA	2	6	158911	158916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	404474827
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5025	NC_018607	TTG	2	6	158968	158973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404474828
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5030	NC_018607	TAAA	2	8	159169	159176	75 %	25 %	0 %	0 %	404474828
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5033	NC_018607	TAG	2	6	159244	159249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404474828
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5038	NC_018607	T	6	6	159550	159555	0 %	100 %	0 %	0 %	404474829
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5042	NC_018607	TTAG	2	8	159679	159686	25 %	50 %	25 %	0 %	404474829
5043	NC_018607	TAT	2	6	159702	159707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404474829
5044	NC_018607	T	6	6	159723	159728	0 %	100 %	0 %	0 %	404474829
5045	NC_018607	T	6	6	159736	159741	0 %	100 %	0 %	0 %	404474829
5046	NC_018607	A	7	7	159817	159823	100 %	0 %	0 %	0 %	404474830
5047	NC_018607	TA	3	6	159827	159832	50 %	50 %	0 %	0 %	404474830
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5050	NC_018607	TTG	2	6	159867	159872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404474830
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5053	NC_018607	AT	3	6	159912	159917	50 %	50 %	0 %	0 %	404474830
5054	NC_018607	GA	3	6	159968	159973	50 %	0 %	50 %	0 %	404474830
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5057	NC_018607	CTT	2	6	160019	160024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404474830
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5059	NC_018607	ATT	2	6	160042	160047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404474830
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5082	NC_018607	TTTA	2	8	160767	160774	25 %	75 %	0 %	0 %	404474833
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5089	NC_018607	TGT	2	6	161019	161024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404474833
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5091	NC_018607	TAA	2	6	161087	161092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_018607	T	7	7	161109	161115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_018607	TAT	2	6	161142	161147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404474834
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5095	NC_018607	CAT	2	6	161186	161191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404474834
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5107	NC_018607	TAAA	2	8	161690	161697	75 %	25 %	0 %	0 %	404474836
5108	NC_018607	TCAT	2	8	161749	161756	25 %	50 %	0 %	25 %	404474836
5109	NC_018607	CT	3	6	161764	161769	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5110	NC_018607	TTTA	2	8	161770	161777	25 %	75 %	0 %	0 %	404474837
5111	NC_018607	TTG	2	6	161788	161793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404474837
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5113	NC_018607	T	6	6	161872	161877	0 %	100 %	0 %	0 %	404474837
5114	NC_018607	ACAATC	2	12	161927	161938	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	404474837
5115	NC_018607	T	6	6	161958	161963	0 %	100 %	0 %	0 %	404474837
5116	NC_018607	TAATT	2	10	162026	162035	40 %	60 %	0 %	0 %	404474837
5117	NC_018607	T	7	7	162049	162055	0 %	100 %	0 %	0 %	404474837
5118	NC_018607	CTT	2	6	162106	162111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404474837
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5120	NC_018607	AT	3	6	162146	162151	50 %	50 %	0 %	0 %	404474837
5121	NC_018607	AT	3	6	162187	162192	50 %	50 %	0 %	0 %	404474838
5122	NC_018607	T	6	6	162192	162197	0 %	100 %	0 %	0 %	404474838
5123	NC_018607	TAT	2	6	162239	162244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404474838
5124	NC_018607	AATCT	2	10	162259	162268	40 %	40 %	0 %	20 %	404474838
5125	NC_018607	AT	3	6	162343	162348	50 %	50 %	0 %	0 %	404474838
5126	NC_018607	AT	5	10	162369	162378	50 %	50 %	0 %	0 %	404474838
5127	NC_018607	AAG	2	6	162382	162387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404474838
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5130	NC_018607	TA	3	6	162419	162424	50 %	50 %	0 %	0 %	404474838
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5205	NC_018607	T	8	8	164777	164784	0 %	100 %	0 %	0 %	404474844
5206	NC_018607	T	6	6	164792	164797	0 %	100 %	0 %	0 %	404474844
5207	NC_018607	T	6	6	164810	164815	0 %	100 %	0 %	0 %	404474844
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5213	NC_018607	TTA	2	6	165136	165141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5221	NC_018607	TATATC	2	12	165427	165438	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	404474846
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5229	NC_018607	A	7	7	165673	165679	100 %	0 %	0 %	0 %	404474846
5230	NC_018607	ATA	2	6	165733	165738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404474846
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5232	NC_018607	T	7	7	165760	165766	0 %	100 %	0 %	0 %	404474846
5233	NC_018607	TTAA	2	8	165806	165813	50 %	50 %	0 %	0 %	404474846
5234	NC_018607	ATA	2	6	165873	165878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404474846
5235	NC_018607	TAT	2	6	165913	165918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404474846
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5237	NC_018607	ATA	2	6	165951	165956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404474847
5238	NC_018607	GTCATA	2	12	165999	166010	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	404474847
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5240	NC_018607	T	6	6	166062	166067	0 %	100 %	0 %	0 %	404474847
5241	NC_018607	ATA	2	6	166071	166076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404474847
5242	NC_018607	ATA	2	6	166080	166085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404474847
5243	NC_018607	CAT	3	9	166109	166117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404474847
5244	NC_018607	ATTT	2	8	166137	166144	25 %	75 %	0 %	0 %	404474847
5245	NC_018607	TTA	2	6	166192	166197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404474847
5246	NC_018607	AAT	2	6	166233	166238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404474848
5247	NC_018607	ACTA	2	8	166262	166269	50 %	25 %	0 %	25 %	404474848
5248	NC_018607	TCTTT	2	10	166296	166305	0 %	80 %	0 %	20 %	404474848
5249	NC_018607	TTA	2	6	166341	166346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404474848
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