MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Bartonella quintana RM-11 chromosome

Total Repeats: 4181

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018533	GATT	2	8	543	550	25 %	50 %	25 %	0 %	403529934
2	NC_018533	TGGC	2	8	732	739	0 %	25 %	50 %	25 %	403529934
3	NC_018533	GTCC	2	8	1233	1240	0 %	25 %	25 %	50 %	403529935
4	NC_018533	TGAT	2	8	1430	1437	25 %	50 %	25 %	0 %	403529935
5	NC_018533	TGCT	2	8	1900	1907	0 %	50 %	25 %	25 %	403529936
6	NC_018533	GACA	2	8	2112	2119	50 %	0 %	25 %	25 %	403529936
7	NC_018533	AGCA	2	8	2153	2160	50 %	0 %	25 %	25 %	403529936
8	NC_018533	ACGA	2	8	2268	2275	50 %	0 %	25 %	25 %	403529936
9	NC_018533	ACAT	2	8	2453	2460	50 %	25 %	0 %	25 %	403529937
10	NC_018533	ATGA	2	8	2742	2749	50 %	25 %	25 %	0 %	403529937
11	NC_018533	ACTA	2	8	3786	3793	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_018533	AGGA	2	8	4282	4289	50 %	0 %	50 %	0 %	403529939
13	NC_018533	CAAA	2	8	4623	4630	75 %	0 %	0 %	25 %	403529939
14	NC_018533	GCAA	2	8	5117	5124	50 %	0 %	25 %	25 %	403529939
15	NC_018533	GAGG	2	8	5190	5197	25 %	0 %	75 %	0 %	403529939
16	NC_018533	GCTG	2	8	5759	5766	0 %	25 %	50 %	25 %	403529939
17	NC_018533	GTTC	2	8	6549	6556	0 %	50 %	25 %	25 %	403529939
18	NC_018533	TGCG	2	8	6928	6935	0 %	25 %	50 %	25 %	403529940
19	NC_018533	CATT	2	8	7101	7108	25 %	50 %	0 %	25 %	403529940
20	NC_018533	TTTG	2	8	7170	7177	0 %	75 %	25 %	0 %	403529940
21	NC_018533	GCCA	2	8	7345	7352	25 %	0 %	25 %	50 %	403529940
22	NC_018533	CAAT	2	8	7826	7833	50 %	25 %	0 %	25 %	403529941
23	NC_018533	CCAA	2	8	8082	8089	50 %	0 %	0 %	50 %	403529941
24	NC_018533	ATTT	2	8	8758	8765	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018533	TGAC	2	8	9279	9286	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_018533	TTAC	2	8	9459	9466	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_018533	CGAG	2	8	10452	10459	25 %	0 %	50 %	25 %	403529943
28	NC_018533	ATCA	2	8	11042	11049	50 %	25 %	0 %	25 %	403529943
29	NC_018533	GAAG	2	8	11320	11327	50 %	0 %	50 %	0 %	403529944
30	NC_018533	ATTG	2	8	12593	12600	25 %	50 %	25 %	0 %	403529946
31	NC_018533	ATGC	2	8	12919	12926	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_018533	CAAA	2	8	13786	13793	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_018533	AGTT	2	8	14056	14063	25 %	50 %	25 %	0 %	403529948
34	NC_018533	GACA	2	8	14453	14460	50 %	0 %	25 %	25 %	403529949
35	NC_018533	TTTC	2	8	14563	14570	0 %	75 %	0 %	25 %	403529949
36	NC_018533	CTTT	2	8	14901	14908	0 %	75 %	0 %	25 %	403529949
37	NC_018533	TCAT	2	8	15121	15128	25 %	50 %	0 %	25 %	403529949
38	NC_018533	ATTT	2	8	15192	15199	25 %	75 %	0 %	0 %	403529949
39	NC_018533	ATTT	2	8	15333	15340	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018533	TTTC	2	8	15351	15358	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_018533	TAAA	2	8	15594	15601	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018533	AATG	2	8	15691	15698	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018533	AAAT	2	8	15713	15720	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018533	TAGT	2	8	15968	15975	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018533	TATT	2	8	16220	16227	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018533	TGAG	2	8	16399	16406	25 %	25 %	50 %	0 %	403529950
47	NC_018533	GAGC	2	8	17015	17022	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_018533	TTTA	2	8	17434	17441	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018533	AATG	2	8	17477	17484	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018533	GAAA	2	8	17787	17794	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018533	GTTT	2	8	17940	17947	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018533	AGCG	2	8	18787	18794	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_018533	CAAT	2	8	19644	19651	50 %	25 %	0 %	25 %	403529952
54	NC_018533	GATT	2	8	19779	19786	25 %	50 %	25 %	0 %	403529952
55	NC_018533	ATTT	2	8	20713	20720	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018533	ATTT	2	8	20885	20892	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018533	TACA	2	8	21337	21344	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_018533	TAAA	2	8	21369	21376	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018533	ATGG	2	8	22063	22070	25 %	25 %	50 %	0 %	403529953
60	NC_018533	TCTT	2	8	22605	22612	0 %	75 %	0 %	25 %	403529953
61	NC_018533	CAAA	2	8	23111	23118	75 %	0 %	0 %	25 %	403529953
62	NC_018533	GTGC	2	8	23395	23402	0 %	25 %	50 %	25 %	403529953
63	NC_018533	AGCA	2	8	23455	23462	50 %	0 %	25 %	25 %	403529954
64	NC_018533	CTGA	2	8	25012	25019	25 %	25 %	25 %	25 %	403529954
65	NC_018533	GAAG	2	8	25592	25599	50 %	0 %	50 %	0 %	403529956
66	NC_018533	GTTT	2	8	26080	26087	0 %	75 %	25 %	0 %	403529956
67	NC_018533	GCTC	2	8	26571	26578	0 %	25 %	25 %	50 %	403529956
68	NC_018533	GTGC	2	8	27000	27007	0 %	25 %	50 %	25 %	403529956
69	NC_018533	TGGT	2	8	27173	27180	0 %	50 %	50 %	0 %	403529956
70	NC_018533	ACTG	2	8	27756	27763	25 %	25 %	25 %	25 %	403529956
71	NC_018533	GCTT	2	8	28065	28072	0 %	50 %	25 %	25 %	403529956
72	NC_018533	AAAT	2	8	28169	28176	75 %	25 %	0 %	0 %	403529956
73	NC_018533	AGGC	2	8	28297	28304	25 %	0 %	50 %	25 %	403529956
74	NC_018533	GTTT	2	8	28339	28346	0 %	75 %	25 %	0 %	403529956
75	NC_018533	CAGA	2	8	28395	28402	50 %	0 %	25 %	25 %	403529956
76	NC_018533	TAAG	2	8	28850	28857	50 %	25 %	25 %	0 %	403529956
77	NC_018533	CTTT	2	8	29228	29235	0 %	75 %	0 %	25 %	403529957
78	NC_018533	ATTG	2	8	29242	29249	25 %	50 %	25 %	0 %	403529957
79	NC_018533	GGCA	2	8	29616	29623	25 %	0 %	50 %	25 %	403529957
80	NC_018533	GAAG	2	8	30028	30035	50 %	0 %	50 %	0 %	403529957
81	NC_018533	ATTC	2	8	30081	30088	25 %	50 %	0 %	25 %	403529957
82	NC_018533	TGAT	2	8	30378	30385	25 %	50 %	25 %	0 %	403529957
83	NC_018533	TTCC	2	8	30525	30532	0 %	50 %	0 %	50 %	403529957
84	NC_018533	GAAA	2	8	30802	30809	75 %	0 %	25 %	0 %	403529957
85	NC_018533	AATG	2	8	31056	31063	50 %	25 %	25 %	0 %	403529957
86	NC_018533	CGAA	2	8	31283	31290	50 %	0 %	25 %	25 %	403529957
87	NC_018533	GCAT	2	8	31492	31499	25 %	25 %	25 %	25 %	403529957
88	NC_018533	TCTT	2	8	31542	31549	0 %	75 %	0 %	25 %	403529957
89	NC_018533	CATC	2	8	31676	31683	25 %	25 %	0 %	50 %	403529957
90	NC_018533	TGGC	2	8	31916	31923	0 %	25 %	50 %	25 %	403529957
91	NC_018533	AAAG	2	8	33156	33163	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018533	TTTG	2	8	33365	33372	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018533	ACCA	2	8	33493	33500	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_018533	CAGC	2	8	34579	34586	25 %	0 %	25 %	50 %	403529958
95	NC_018533	AAGG	2	8	35834	35841	50 %	0 %	50 %	0 %	403529959
96	NC_018533	CGTC	2	8	36497	36504	0 %	25 %	25 %	50 %	403529959
97	NC_018533	TGGT	2	8	36884	36891	0 %	50 %	50 %	0 %	403529959
98	NC_018533	AAAC	2	8	37199	37206	75 %	0 %	0 %	25 %	403529959
99	NC_018533	GCAT	2	8	37700	37707	25 %	25 %	25 %	25 %	403529959
100	NC_018533	CCTT	2	8	38750	38757	0 %	50 %	0 %	50 %	403529960
101	NC_018533	TTAT	2	8	38921	38928	25 %	75 %	0 %	0 %	403529960
102	NC_018533	GAAA	2	8	39247	39254	75 %	0 %	25 %	0 %	403529960
103	NC_018533	ACAT	2	8	39491	39498	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_018533	TAAA	2	8	39836	39843	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018533	GCAC	2	8	40421	40428	25 %	0 %	25 %	50 %	403529962
106	NC_018533	TGTT	2	8	40592	40599	0 %	75 %	25 %	0 %	403529962
107	NC_018533	CTTG	2	8	40763	40770	0 %	50 %	25 %	25 %	403529962
108	NC_018533	AAAG	2	8	42333	42340	75 %	0 %	25 %	0 %	403529963
109	NC_018533	ATCA	2	8	42551	42558	50 %	25 %	0 %	25 %	403529964
110	NC_018533	TAAA	2	8	43416	43423	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018533	TGGT	2	8	43598	43605	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018533	TTAT	2	8	43688	43695	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018533	ATAA	2	8	44572	44579	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018533	AGGG	2	8	45546	45553	25 %	0 %	75 %	0 %	403529965
115	NC_018533	TCTT	2	8	46062	46069	0 %	75 %	0 %	25 %	403529965
116	NC_018533	GCAA	2	8	46258	46265	50 %	0 %	25 %	25 %	403529965
117	NC_018533	CTTG	2	8	46633	46640	0 %	50 %	25 %	25 %	403529965
118	NC_018533	TTGA	2	8	47001	47008	25 %	50 %	25 %	0 %	403529966
119	NC_018533	AAAT	2	8	47544	47551	75 %	25 %	0 %	0 %	403529966
120	NC_018533	GAAA	2	8	47573	47580	75 %	0 %	25 %	0 %	403529966
121	NC_018533	GTTC	2	8	47722	47729	0 %	50 %	25 %	25 %	403529966
122	NC_018533	CAAT	2	8	47731	47738	50 %	25 %	0 %	25 %	403529966
123	NC_018533	AGTA	2	8	48416	48423	50 %	25 %	25 %	0 %	403529966
124	NC_018533	TCAT	2	8	49080	49087	25 %	50 %	0 %	25 %	403529967
125	NC_018533	CATT	2	8	49517	49524	25 %	50 %	0 %	25 %	403529968
126	NC_018533	CCAC	2	8	49800	49807	25 %	0 %	0 %	75 %	403529968
127	NC_018533	ATCA	2	8	50067	50074	50 %	25 %	0 %	25 %	403529968
128	NC_018533	TTCA	2	8	50676	50683	25 %	50 %	0 %	25 %	403529968
129	NC_018533	ACTC	2	8	50988	50995	25 %	25 %	0 %	50 %	403529968
130	NC_018533	CCAG	2	8	51586	51593	25 %	0 %	25 %	50 %	403529968
131	NC_018533	ATAC	2	8	51669	51676	50 %	25 %	0 %	25 %	403529968
132	NC_018533	TTAT	2	8	51844	51851	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018533	GTTT	2	8	52540	52547	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018533	TTAT	2	8	52808	52815	25 %	75 %	0 %	0 %	403529969
135	NC_018533	GGAA	2	8	53494	53501	50 %	0 %	50 %	0 %	403529969
136	NC_018533	ATGC	2	8	53629	53636	25 %	25 %	25 %	25 %	403529969
137	NC_018533	GTGC	2	8	53742	53749	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_018533	TCAC	2	8	53796	53803	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_018533	ACAA	2	8	54529	54536	75 %	0 %	0 %	25 %	403529970
140	NC_018533	AGCA	2	8	54903	54910	50 %	0 %	25 %	25 %	403529970
141	NC_018533	TAAA	2	8	55344	55351	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018533	TTAT	2	8	55543	55550	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018533	TTCT	2	8	55914	55921	0 %	75 %	0 %	25 %	403529971
144	NC_018533	GACG	2	8	55934	55941	25 %	0 %	50 %	25 %	403529971
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