MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Bartonella quintana RM-11 chromosome

Total Repeats: 21256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018533	GAT	2	6	129	134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403529934
2	NC_018533	TGA	2	6	165	170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403529934
3	NC_018533	ACA	2	6	174	179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403529934
4	NC_018533	CTT	2	6	229	234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403529934
5	NC_018533	TCG	2	6	369	374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403529934
6	NC_018533	GAT	2	6	406	411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403529934
7	NC_018533	TTG	2	6	587	592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403529934
8	NC_018533	GAA	2	6	694	699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403529934
9	NC_018533	GAA	2	6	769	774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403529934
10	NC_018533	CTG	2	6	776	781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403529934
11	NC_018533	GAA	2	6	825	830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403529934
12	NC_018533	ATG	2	6	840	845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403529934
13	NC_018533	TTG	2	6	891	896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403529935
14	NC_018533	TGA	2	6	938	943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403529935
15	NC_018533	GTT	2	6	991	996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403529935
16	NC_018533	TAT	2	6	1370	1375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403529935
17	NC_018533	TTA	2	6	1386	1391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403529935
18	NC_018533	TTA	2	6	1395	1400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403529935
19	NC_018533	TGT	2	6	1479	1484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403529936
20	NC_018533	AAG	2	6	1571	1576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403529936
21	NC_018533	GAA	2	6	1585	1590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403529936
22	NC_018533	CAA	2	6	1700	1705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403529936
23	NC_018533	TGC	2	6	1713	1718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403529936
24	NC_018533	TGA	2	6	1791	1796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403529936
25	NC_018533	GGT	2	6	1843	1848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403529936
26	NC_018533	ACA	2	6	2098	2103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403529936
27	NC_018533	AAC	2	6	2136	2141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403529936
28	NC_018533	AGA	2	6	2283	2288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403529936
29	NC_018533	GAA	2	6	2296	2301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403529936
30	NC_018533	GCT	2	6	2355	2360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403529937
31	NC_018533	TGA	2	6	2399	2404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403529937
32	NC_018533	GTT	2	6	2469	2474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403529937
33	NC_018533	AGA	2	6	2546	2551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403529937
34	NC_018533	AAT	2	6	2552	2557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403529937
35	NC_018533	GTC	2	6	2625	2630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403529937
36	NC_018533	TGA	2	6	2786	2791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403529937
37	NC_018533	CAA	2	6	2853	2858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403529937
38	NC_018533	ATT	2	6	2908	2913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403529938
39	NC_018533	ACA	2	6	2926	2931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403529938
40	NC_018533	GTT	2	6	3037	3042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403529938
41	NC_018533	TGA	2	6	3048	3053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403529938
42	NC_018533	TGA	2	6	3120	3125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403529938
43	NC_018533	CAA	2	6	3149	3154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403529938
44	NC_018533	ATA	2	6	3326	3331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403529938
45	NC_018533	TGG	2	6	3399	3404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403529938
46	NC_018533	TCA	2	6	3551	3556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403529938
47	NC_018533	TTC	2	6	3586	3591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403529938
48	NC_018533	ATT	2	6	3628	3633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018533	AGG	2	6	3730	3735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018533	TAT	2	6	3750	3755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018533	ATC	2	6	3952	3957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403529939
52	NC_018533	TAC	2	6	3996	4001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403529939
53	NC_018533	TGT	2	6	4069	4074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403529939
54	NC_018533	TGT	2	6	4133	4138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403529939
55	NC_018533	AGA	2	6	4211	4216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403529939
56	NC_018533	GAT	2	6	4299	4304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403529939
57	NC_018533	CAA	2	6	4330	4335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403529939
58	NC_018533	ATT	2	6	4356	4361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403529939
59	NC_018533	ATG	2	6	4411	4416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403529939
60	NC_018533	TGC	2	6	4556	4561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403529939
61	NC_018533	TTG	2	6	4566	4571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403529939
62	NC_018533	ACG	2	6	4631	4636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403529939
63	NC_018533	GAT	2	6	4725	4730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403529939
64	NC_018533	GCA	2	6	4833	4838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403529939
65	NC_018533	TGA	2	6	5027	5032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403529939
66	NC_018533	AAC	2	6	5096	5101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403529939
67	NC_018533	TTG	2	6	5128	5133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403529939
68	NC_018533	AGA	2	6	5276	5281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403529939
69	NC_018533	TGA	2	6	5329	5334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403529939
70	NC_018533	TGA	2	6	5363	5368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403529939
71	NC_018533	ATA	2	6	5413	5418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403529939
72	NC_018533	TGC	2	6	5537	5542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403529939
73	NC_018533	GGA	2	6	5663	5668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403529939
74	NC_018533	AGA	3	9	5741	5749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403529939
75	NC_018533	GCT	2	6	5895	5900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403529939
76	NC_018533	ATT	2	6	5925	5930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403529939
77	NC_018533	CTT	2	6	5980	5985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403529939
78	NC_018533	ATT	2	6	6019	6024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403529939
79	NC_018533	ATC	3	9	6053	6061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403529939
80	NC_018533	ACT	2	6	6093	6098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403529939
81	NC_018533	CTA	2	6	6147	6152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403529939
82	NC_018533	AAG	2	6	6217	6222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403529939
83	NC_018533	ACG	3	9	6305	6313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403529939
84	NC_018533	TAT	2	6	6335	6340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403529939
85	NC_018533	AAG	2	6	6391	6396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403529939
86	NC_018533	CGT	2	6	6507	6512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403529939
87	NC_018533	AGC	2	6	6533	6538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403529939
88	NC_018533	GCT	2	6	6570	6575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403529939
89	NC_018533	GCA	2	6	6600	6605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403529939
90	NC_018533	ATT	2	6	6609	6614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403529939
91	NC_018533	CGT	2	6	6615	6620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403529939
92	NC_018533	ATG	2	6	6688	6693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403529939
93	NC_018533	AGA	2	6	6713	6718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403529939
94	NC_018533	GGA	2	6	6830	6835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403529939
95	NC_018533	ATG	2	6	6944	6949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403529940
96	NC_018533	GTT	2	6	6960	6965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403529940
97	NC_018533	AAG	2	6	7160	7165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403529940
98	NC_018533	TAA	2	6	7196	7201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403529940
99	NC_018533	CTT	2	6	7459	7464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403529940
100	NC_018533	TAT	2	6	7598	7603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403529940
101	NC_018533	ATG	2	6	7613	7618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403529940
102	NC_018533	CTT	2	6	7706	7711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403529940
103	NC_018533	ATT	2	6	7819	7824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018533	GCA	2	6	7855	7860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403529941
105	NC_018533	AGA	2	6	7861	7866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403529941
106	NC_018533	TGA	2	6	7876	7881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403529941
107	NC_018533	ATA	2	6	7908	7913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403529941
108	NC_018533	ATA	2	6	7949	7954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403529941
109	NC_018533	TGT	2	6	8132	8137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403529941
110	NC_018533	TAA	2	6	8176	8181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403529941
111	NC_018533	TGT	2	6	8204	8209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403529941
112	NC_018533	GCA	2	6	8250	8255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403529941
113	NC_018533	AAT	2	6	8316	8321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403529941
114	NC_018533	GTG	2	6	8332	8337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403529941
115	NC_018533	GTT	3	9	8439	8447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403529941
116	NC_018533	ATG	2	6	8452	8457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403529941
117	NC_018533	AGC	2	6	8474	8479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403529941
118	NC_018533	CCA	2	6	8518	8523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403529941
119	NC_018533	ATA	2	6	8601	8606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403529941
120	NC_018533	ACA	2	6	8665	8670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_018533	CTT	2	6	8743	8748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_018533	TTA	2	6	8784	8789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018533	AAT	2	6	8948	8953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018533	CAA	2	6	8966	8971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_018533	AGA	2	6	8983	8988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018533	GAG	2	6	9007	9012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018533	GAA	2	6	9116	9121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018533	CTT	2	6	9138	9143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_018533	AAT	2	6	9190	9195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018533	AAG	2	6	9260	9265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018533	TTC	2	6	9287	9292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_018533	AAG	2	6	9475	9480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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262	NC_018533	ACA	2	6	20582	20587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
263	NC_018533	ACA	2	6	20642	20647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
264	NC_018533	CAT	2	6	20707	20712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
265	NC_018533	TGT	2	6	20724	20729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
266	NC_018533	TAC	2	6	20764	20769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
267	NC_018533	GCT	2	6	20810	20815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
268	NC_018533	TTG	2	6	20966	20971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
269	NC_018533	AGG	2	6	21003	21008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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271	NC_018533	GAT	2	6	21274	21279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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