MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bartonella quintana RM-11 chromosome

Total Repeats: 35817

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_018533	AGA	2	6	185027	185032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530061
4003	NC_018533	GAG	2	6	185100	185105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403530061
4004	NC_018533	AG	4	8	185140	185147	50 %	0 %	50 %	0 %	403530061
4005	NC_018533	GCA	2	6	185241	185246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530061
4006	NC_018533	A	7	7	185267	185273	100 %	0 %	0 %	0 %	403530061
4007	NC_018533	GCA	2	6	185425	185430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530061
4008	NC_018533	TC	3	6	185477	185482	0 %	50 %	0 %	50 %	403530061
4009	NC_018533	GGTTCT	2	12	185517	185528	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	403530061
4010	NC_018533	GA	4	8	185540	185547	50 %	0 %	50 %	0 %	403530061
4011	NC_018533	ATA	2	6	185593	185598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530061
4012	NC_018533	GTG	2	6	185603	185608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530061
4013	NC_018533	GGC	2	6	185678	185683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403530061
4014	NC_018533	CAAT	2	8	185704	185711	50 %	25 %	0 %	25 %	403530061
4015	NC_018533	AG	3	6	185733	185738	50 %	0 %	50 %	0 %	403530061
4016	NC_018533	GAA	2	6	185870	185875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530061
4017	NC_018533	GGT	3	9	186000	186008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530061
4018	NC_018533	ATT	2	6	186042	186047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530061
4019	NC_018533	GTG	2	6	186085	186090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530061
4020	NC_018533	TTG	2	6	186193	186198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530061
4021	NC_018533	ATG	2	6	186306	186311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530061
4022	NC_018533	TGC	2	6	186323	186328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530061
4023	NC_018533	TGG	2	6	186335	186340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530061
4024	NC_018533	GAA	2	6	186422	186427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530061
4025	NC_018533	TGG	2	6	186452	186457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530061
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4028	NC_018533	GGAA	2	8	186581	186588	50 %	0 %	50 %	0 %	403530061
4029	NC_018533	AGA	2	6	186589	186594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530061
4030	NC_018533	ATG	2	6	186675	186680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530061
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4033	NC_018533	GTT	2	6	186783	186788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530061
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4036	NC_018533	TCT	2	6	186900	186905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530061
4037	NC_018533	GAAGG	2	10	186930	186939	40 %	0 %	60 %	0 %	403530061
4038	NC_018533	G	7	7	186938	186944	0 %	0 %	100 %	0 %	403530061
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4041	NC_018533	TC	3	6	187061	187066	0 %	50 %	0 %	50 %	403530061
4042	NC_018533	GTT	2	6	187113	187118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530061
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4045	NC_018533	GATA	2	8	187208	187215	50 %	25 %	25 %	0 %	403530061
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4057	NC_018533	ATT	3	9	187694	187702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530062
4058	NC_018533	T	7	7	187707	187713	0 %	100 %	0 %	0 %	403530062
4059	NC_018533	TTA	2	6	187727	187732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530062
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4068	NC_018533	T	7	7	188281	188287	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_018533	AAG	2	6	188338	188343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_018533	AG	3	6	188361	188366	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_018533	ACC	2	6	188560	188565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4072	NC_018533	T	6	6	188618	188623	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_018533	TTCT	2	8	188757	188764	0 %	75 %	0 %	25 %	403530063
4074	NC_018533	AGA	2	6	188797	188802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530063
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4082	NC_018533	ATA	2	6	189269	189274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_018533	TAA	2	6	189276	189281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4087	NC_018533	TGA	2	6	189444	189449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_018533	ATA	2	6	189457	189462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_018533	TAATT	2	10	189482	189491	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_018533	AGA	2	6	189522	189527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_018533	T	7	7	189540	189546	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_018533	G	7	7	189551	189557	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_018533	A	6	6	189577	189582	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_018533	TACAA	2	10	189630	189639	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4095	NC_018533	AAT	2	6	189678	189683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_018533	ACAG	2	8	189698	189705	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4097	NC_018533	A	8	8	189731	189738	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_018533	A	6	6	189842	189847	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_018533	T	7	7	189852	189858	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_018533	AAT	2	6	189915	189920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_018533	GTC	2	6	189922	189927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4102	NC_018533	GTT	2	6	189966	189971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_018533	CG	3	6	190033	190038	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4104	NC_018533	AAG	2	6	190108	190113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_018533	A	6	6	190127	190132	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_018533	T	6	6	190267	190272	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_018533	CTT	2	6	190303	190308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4108	NC_018533	GAT	2	6	190422	190427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_018533	T	6	6	190457	190462	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_018533	AAT	2	6	190464	190469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_018533	GAA	2	6	190589	190594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_018533	ATGG	2	8	190596	190603	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_018533	ATGA	2	8	190611	190618	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_018533	A	7	7	190664	190670	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_018533	GA	4	8	190697	190704	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_018533	GA	3	6	190795	190800	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_018533	A	7	7	190911	190917	100 %	0 %	0 %	0 %	403530064
4118	NC_018533	AGA	2	6	190981	190986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530064
4119	NC_018533	TCA	2	6	191051	191056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530064
4120	NC_018533	ATGA	2	8	191106	191113	50 %	25 %	25 %	0 %	403530064
4121	NC_018533	A	6	6	191130	191135	100 %	0 %	0 %	0 %	403530064
4122	NC_018533	A	6	6	191140	191145	100 %	0 %	0 %	0 %	403530064
4123	NC_018533	AGC	2	6	191159	191164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530064
4124	NC_018533	G	6	6	191168	191173	0 %	0 %	100 %	0 %	403530064
4125	NC_018533	TGA	2	6	191210	191215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530064
4126	NC_018533	ATT	2	6	191239	191244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530064
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4128	NC_018533	T	6	6	191288	191293	0 %	100 %	0 %	0 %	403530064
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4248	NC_018533	GCTC	2	8	196334	196341	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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4500	NC_018533	ATT	2	6	207176	207181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

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