MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bartonella quintana RM-11 chromosome

Total Repeats: 35817

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_018533	AAG	2	6	162200	162205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_018533	AAG	2	6	162223	162228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_018533	AG	4	8	162287	162294	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_018533	ATT	2	6	162295	162300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_018533	AAT	2	6	162314	162319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_018533	GAA	2	6	162325	162330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_018533	A	6	6	162329	162334	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_018533	TA	3	6	162342	162347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_018533	TTG	2	6	162532	162537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_018533	T	6	6	162599	162604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_018533	T	6	6	162692	162697	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_018533	TG	3	6	162736	162741	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_018533	A	6	6	162824	162829	100 %	0 %	0 %	0 %	403530052
3514	NC_018533	TGG	2	6	162862	162867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530052
3515	NC_018533	GGCA	2	8	162878	162885	25 %	0 %	50 %	25 %	403530052
3516	NC_018533	ATTC	2	8	162902	162909	25 %	50 %	0 %	25 %	403530052
3517	NC_018533	A	6	6	162926	162931	100 %	0 %	0 %	0 %	403530052
3518	NC_018533	TGT	2	6	162980	162985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530052
3519	NC_018533	TGC	2	6	163052	163057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530052
3520	NC_018533	TCA	2	6	163077	163082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530052
3521	NC_018533	GTT	2	6	163086	163091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530052
3522	NC_018533	T	6	6	163098	163103	0 %	100 %	0 %	0 %	403530052
3523	NC_018533	AGG	2	6	163126	163131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403530052
3524	NC_018533	GTGAT	2	10	163132	163141	20 %	40 %	40 %	0 %	403530052
3525	NC_018533	GAA	2	6	163164	163169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530052
3526	NC_018533	GCAAAA	2	12	163179	163190	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	403530052
3527	NC_018533	ATA	2	6	163201	163206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530052
3528	NC_018533	TGC	2	6	163274	163279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530052
3529	NC_018533	GTT	2	6	163368	163373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530052
3530	NC_018533	CTG	2	6	163399	163404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530052
3531	NC_018533	AT	3	6	163459	163464	50 %	50 %	0 %	0 %	403530052
3532	NC_018533	TTGCA	2	10	163663	163672	20 %	40 %	20 %	20 %	403530052
3533	NC_018533	TC	3	6	163686	163691	0 %	50 %	0 %	50 %	403530052
3534	NC_018533	CAG	2	6	163724	163729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530052
3535	NC_018533	GTTT	2	8	163736	163743	0 %	75 %	25 %	0 %	403530052
3536	NC_018533	AG	3	6	163752	163757	50 %	0 %	50 %	0 %	403530052
3537	NC_018533	ATT	2	6	163785	163790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530052
3538	NC_018533	TGA	2	6	163895	163900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530052
3539	NC_018533	GGT	2	6	163999	164004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530053
3540	NC_018533	TTAT	2	8	164014	164021	25 %	75 %	0 %	0 %	403530053
3541	NC_018533	TGC	2	6	164076	164081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530053
3542	NC_018533	ACA	2	6	164131	164136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530053
3543	NC_018533	CTT	3	9	164246	164254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530053
3544	NC_018533	GCA	2	6	164308	164313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530053
3545	NC_018533	A	6	6	164358	164363	100 %	0 %	0 %	0 %	403530053
3546	NC_018533	GCT	2	6	164401	164406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530053
3547	NC_018533	GAT	2	6	164409	164414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530053
3548	NC_018533	TCA	2	6	164431	164436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530053
3549	NC_018533	TGA	2	6	164448	164453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530053
3550	NC_018533	TTG	2	6	164480	164485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530053
3551	NC_018533	GC	3	6	164533	164538	0 %	0 %	50 %	50 %	403530053
3552	NC_018533	AAGC	2	8	164665	164672	50 %	0 %	25 %	25 %	403530053
3553	NC_018533	GTT	2	6	164725	164730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530053
3554	NC_018533	TTC	2	6	164798	164803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530053
3555	NC_018533	TTGGG	2	10	164825	164834	0 %	40 %	60 %	0 %	403530053
3556	NC_018533	ATC	2	6	164897	164902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530053
3557	NC_018533	CTT	2	6	164918	164923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530053
3558	NC_018533	ATT	2	6	164938	164943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530053
3559	NC_018533	TGA	2	6	164946	164951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530053
3560	NC_018533	TTA	2	6	164960	164965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530053
3561	NC_018533	ATT	2	6	165025	165030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530053
3562	NC_018533	GA	3	6	165042	165047	50 %	0 %	50 %	0 %	403530053
3563	NC_018533	TGC	2	6	165105	165110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530053
3564	NC_018533	TTG	2	6	165194	165199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530053
3565	NC_018533	GCG	3	9	165247	165255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403530053
3566	NC_018533	T	6	6	165277	165282	0 %	100 %	0 %	0 %	403530053
3567	NC_018533	CAA	2	6	165293	165298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530053
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3569	NC_018533	GGA	2	6	165352	165357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403530053
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3571	NC_018533	TTG	2	6	165410	165415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530053
3572	NC_018533	T	6	6	165498	165503	0 %	100 %	0 %	0 %	403530053
3573	NC_018533	T	7	7	165519	165525	0 %	100 %	0 %	0 %	403530053
3574	NC_018533	CAA	2	6	165634	165639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530053
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3576	NC_018533	TTA	2	6	165680	165685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530053
3577	NC_018533	GA	3	6	165770	165775	50 %	0 %	50 %	0 %	403530053
3578	NC_018533	TGG	2	6	165804	165809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530053
3579	NC_018533	T	6	6	165825	165830	0 %	100 %	0 %	0 %	403530053
3580	NC_018533	TTG	2	6	165835	165840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530053
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3582	NC_018533	CAG	2	6	165917	165922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530053
3583	NC_018533	GCAAC	2	10	166093	166102	40 %	0 %	20 %	40 %	403530053
3584	NC_018533	T	6	6	166108	166113	0 %	100 %	0 %	0 %	403530053
3585	NC_018533	A	7	7	166198	166204	100 %	0 %	0 %	0 %	403530053
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3588	NC_018533	T	7	7	166295	166301	0 %	100 %	0 %	0 %	403530053
3589	NC_018533	GA	3	6	166382	166387	50 %	0 %	50 %	0 %	403530053
3590	NC_018533	GCT	2	6	166471	166476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530053
3591	NC_018533	TGT	2	6	166481	166486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530053
3592	NC_018533	ATT	2	6	166579	166584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530053
3593	NC_018533	TAT	3	9	166629	166637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530053
3594	NC_018533	GGTT	2	8	166656	166663	0 %	50 %	50 %	0 %	403530053
3595	NC_018533	GTTG	2	8	166731	166738	0 %	50 %	50 %	0 %	403530053
3596	NC_018533	TTG	2	6	166766	166771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530053
3597	NC_018533	GCGT	2	8	166805	166812	0 %	25 %	50 %	25 %	403530053
3598	NC_018533	AGC	2	6	166827	166832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530053
3599	NC_018533	TTCGTC	2	12	166838	166849	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	403530053
3600	NC_018533	G	6	6	166882	166887	0 %	0 %	100 %	0 %	403530053
3601	NC_018533	TGG	2	6	166953	166958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530053
3602	NC_018533	GTT	2	6	166999	167004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530053
3603	NC_018533	TCTT	2	8	167009	167016	0 %	75 %	0 %	25 %	403530053
3604	NC_018533	AGA	2	6	167040	167045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530053
3605	NC_018533	TAA	2	6	167057	167062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530053
3606	NC_018533	TAA	2	6	167074	167079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530053
3607	NC_018533	T	7	7	167129	167135	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_018533	CCA	2	6	167184	167189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3609	NC_018533	TAT	2	6	167248	167253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_018533	TG	3	6	167258	167263	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_018533	TAA	2	6	167277	167282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_018533	AAG	2	6	167359	167364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530054
3613	NC_018533	TCG	2	6	167395	167400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530054
3614	NC_018533	TGA	2	6	167449	167454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530054
3615	NC_018533	GAT	2	6	167510	167515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530054
3616	NC_018533	GCA	2	6	167525	167530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530054
3617	NC_018533	TAGG	2	8	167538	167545	25 %	25 %	50 %	0 %	403530054
3618	NC_018533	TTC	2	6	167598	167603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530054
3619	NC_018533	CA	3	6	167806	167811	50 %	0 %	0 %	50 %	403530054
3620	NC_018533	ATG	2	6	167829	167834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530054
3621	NC_018533	CT	4	8	167886	167893	0 %	50 %	0 %	50 %	403530054
3622	NC_018533	CAA	2	6	167907	167912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530054
3623	NC_018533	TAT	2	6	167920	167925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530054
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