MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bartonella quintana RM-11 chromosome

Total Repeats: 35817

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_018533	CCA	2	6	138258	138263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403530030
3002	NC_018533	AGCA	2	8	138360	138367	50 %	0 %	25 %	25 %	403530030
3003	NC_018533	CCA	2	6	138429	138434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403530030
3004	NC_018533	CAC	2	6	138509	138514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403530030
3005	NC_018533	GAT	2	6	138536	138541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530030
3006	NC_018533	TTG	2	6	138648	138653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_018533	TAAGA	2	10	138690	138699	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_018533	AC	3	6	138702	138707	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3009	NC_018533	ATC	2	6	138847	138852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3010	NC_018533	CAA	2	6	138890	138895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530031
3011	NC_018533	AAG	2	6	138915	138920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530031
3012	NC_018533	AAG	2	6	138933	138938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530031
3013	NC_018533	AGC	2	6	138984	138989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530031
3014	NC_018533	AAT	2	6	139014	139019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530031
3015	NC_018533	GAT	3	9	139029	139037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530031
3016	NC_018533	GCT	2	6	139078	139083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530031
3017	NC_018533	AAT	2	6	139101	139106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530031
3018	NC_018533	AG	3	6	139124	139129	50 %	0 %	50 %	0 %	403530031
3019	NC_018533	TTG	2	6	139136	139141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530031
3020	NC_018533	A	6	6	139193	139198	100 %	0 %	0 %	0 %	403530031
3021	NC_018533	CCCA	2	8	139216	139223	25 %	0 %	0 %	75 %	403530031
3022	NC_018533	CAAT	2	8	139247	139254	50 %	25 %	0 %	25 %	403530031
3023	NC_018533	CAT	2	6	139301	139306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530031
3024	NC_018533	ATA	2	6	139367	139372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530031
3025	NC_018533	T	6	6	139750	139755	0 %	100 %	0 %	0 %	403530032
3026	NC_018533	G	6	6	139783	139788	0 %	0 %	100 %	0 %	403530032
3027	NC_018533	TGTT	2	8	139946	139953	0 %	75 %	25 %	0 %	403530032
3028	NC_018533	CAG	2	6	139981	139986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530032
3029	NC_018533	CAA	2	6	139999	140004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530032
3030	NC_018533	AAAG	2	8	140079	140086	75 %	0 %	25 %	0 %	403530032
3031	NC_018533	TCT	2	6	140103	140108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530032
3032	NC_018533	A	6	6	140198	140203	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_018533	ATGG	2	8	140338	140345	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_018533	TGT	2	6	140395	140400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_018533	GTA	2	6	140425	140430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_018533	TGG	2	6	140490	140495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530033
3037	NC_018533	TTA	2	6	140508	140513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530033
3038	NC_018533	TTGA	2	8	140518	140525	25 %	50 %	25 %	0 %	403530033
3039	NC_018533	TTA	2	6	140593	140598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530033
3040	NC_018533	AAGA	2	8	140623	140630	75 %	0 %	25 %	0 %	403530033
3041	NC_018533	CTG	2	6	140735	140740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530033
3042	NC_018533	TTG	2	6	140741	140746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530033
3043	NC_018533	GAT	2	6	140769	140774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530033
3044	NC_018533	GGA	2	6	140782	140787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403530033
3045	NC_018533	A	6	6	140795	140800	100 %	0 %	0 %	0 %	403530033
3046	NC_018533	TTA	2	6	140825	140830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530033
3047	NC_018533	TGA	2	6	140850	140855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530033
3048	NC_018533	GCA	2	6	140940	140945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530033
3049	NC_018533	GTT	2	6	140965	140970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530033
3050	NC_018533	CAGGAA	2	12	140975	140986	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	403530033
3051	NC_018533	TCA	2	6	140991	140996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530033
3052	NC_018533	TG	4	8	141022	141029	0 %	50 %	50 %	0 %	403530033
3053	NC_018533	GAG	2	6	141040	141045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403530033
3054	NC_018533	TGG	2	6	141135	141140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530033
3055	NC_018533	TGT	2	6	141182	141187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530033
3056	NC_018533	AAG	2	6	141227	141232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530033
3057	NC_018533	AAG	2	6	141280	141285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530033
3058	NC_018533	T	6	6	141310	141315	0 %	100 %	0 %	0 %	403530033
3059	NC_018533	T	7	7	141396	141402	0 %	100 %	0 %	0 %	403530033
3060	NC_018533	TAG	2	6	141467	141472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530033
3061	NC_018533	ATG	2	6	141503	141508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530033
3062	NC_018533	GTTG	2	8	141642	141649	0 %	50 %	50 %	0 %	403530033
3063	NC_018533	AAG	2	6	141658	141663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530033
3064	NC_018533	TGC	2	6	141735	141740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530033
3065	NC_018533	GCA	2	6	141784	141789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530033
3066	NC_018533	GTT	2	6	141871	141876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530033
3067	NC_018533	ATT	2	6	142088	142093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530033
3068	NC_018533	CAC	2	6	142100	142105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403530033
3069	NC_018533	GTTG	2	8	142107	142114	0 %	50 %	50 %	0 %	403530033
3070	NC_018533	GA	3	6	142200	142205	50 %	0 %	50 %	0 %	403530033
3071	NC_018533	A	7	7	142244	142250	100 %	0 %	0 %	0 %	403530033
3072	NC_018533	GTTT	2	8	142448	142455	0 %	75 %	25 %	0 %	403530033
3073	NC_018533	CTG	2	6	142487	142492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530033
3074	NC_018533	CTG	2	6	142514	142519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530033
3075	NC_018533	CGT	2	6	142576	142581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530033
3076	NC_018533	ATG	2	6	142597	142602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530033
3077	NC_018533	AGG	2	6	142662	142667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403530033
3078	NC_018533	ATG	2	6	142709	142714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530033
3079	NC_018533	GTT	2	6	142750	142755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530033
3080	NC_018533	GTC	2	6	142782	142787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530033
3081	NC_018533	TCT	2	6	142815	142820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530033
3082	NC_018533	TTG	2	6	142874	142879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530033
3083	NC_018533	AGA	2	6	142991	142996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530033
3084	NC_018533	CCATT	2	10	143036	143045	20 %	40 %	0 %	40 %	403530033
3085	NC_018533	TGTCG	2	10	143050	143059	0 %	40 %	40 %	20 %	403530033
3086	NC_018533	GTTT	2	8	143193	143200	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_018533	T	6	6	143198	143203	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_018533	AG	3	6	143346	143351	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_018533	AT	3	6	143352	143357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_018533	TGC	2	6	143401	143406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530034
3091	NC_018533	CG	3	6	143436	143441	0 %	0 %	50 %	50 %	403530034
3092	NC_018533	ATG	2	6	143466	143471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530034
3093	NC_018533	TGG	2	6	143479	143484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530034
3094	NC_018533	CGG	2	6	143496	143501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403530034
3095	NC_018533	TGCG	2	8	143535	143542	0 %	25 %	50 %	25 %	403530034
3096	NC_018533	GCA	2	6	143573	143578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530034
3097	NC_018533	T	6	6	143629	143634	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_018533	T	7	7	143637	143643	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_018533	T	6	6	143676	143681	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_018533	CTTT	2	8	143683	143690	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3101	NC_018533	T	6	6	143688	143693	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_018533	AGA	2	6	143734	143739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_018533	T	6	6	143791	143796	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_018533	T	6	6	143804	143809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_018533	T	12	12	143811	143822	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_018533	ATT	2	6	143842	143847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_018533	A	9	9	143859	143867	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_018533	ATT	2	6	143881	143886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_018533	CAG	2	6	143908	143913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3110	NC_018533	T	6	6	143925	143930	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_018533	GATTTT	2	12	143935	143946	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_018533	CTG	2	6	143971	143976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3113	NC_018533	A	8	8	144001	144008	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_018533	TCAGA	2	10	144017	144026	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3115	NC_018533	GA	3	6	144025	144030	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_018533	TGT	2	6	144040	144045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_018533	TTTAG	2	10	144060	144069	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_018533	T	6	6	144110	144115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_018533	GT	3	6	144130	144135	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_018533	ATCAT	2	10	144156	144165	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3121	NC_018533	TGG	2	6	144195	144200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_018533	TGA	2	6	144206	144211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_018533	AAT	2	6	144232	144237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_018533	GTTTTT	2	12	144299	144310	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_018533	TGG	2	6	144325	144330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_018533	ATA	2	6	144396	144401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_018533	GTT	2	6	144432	144437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530035
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3251	NC_018533	CGA	3	9	150646	150654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530040
3252	NC_018533	CAAT	2	8	150661	150668	50 %	25 %	0 %	25 %	403530040
3253	NC_018533	TTG	2	6	150670	150675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530040
3254	NC_018533	TAT	2	6	150680	150685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530040
3255	NC_018533	ATG	2	6	150711	150716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530040
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3257	NC_018533	TTAT	2	8	150769	150776	25 %	75 %	0 %	0 %	403530040
3258	NC_018533	ATT	2	6	150800	150805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530040
3259	NC_018533	TGC	2	6	150845	150850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530040
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3264	NC_018533	CTT	2	6	151085	151090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530040
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3270	NC_018533	CTG	2	6	151261	151266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530040
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3292	NC_018533	CAT	2	6	152084	152089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3294	NC_018533	T	6	6	152163	152168	0 %	100 %	0 %	0 %	403530041
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3312	NC_018533	ATG	2	6	152819	152824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530042
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3321	NC_018533	TATTTT	2	12	153367	153378	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3341	NC_018533	AAT	2	6	154700	154705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3372	NC_018533	T	7	7	156679	156685	0 %	100 %	0 %	0 %	403530045
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