MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bartonella quintana RM-11 chromosome

Total Repeats: 35817

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_018533	GT	3	6	116514	116519	0 %	50 %	50 %	0 %	403530014
2502	NC_018533	TGA	2	6	116562	116567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530014
2503	NC_018533	GAC	2	6	116611	116616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530014
2504	NC_018533	CTT	2	6	116689	116694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530014
2505	NC_018533	GTT	2	6	116815	116820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530014
2506	NC_018533	TGA	2	6	116821	116826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530014
2507	NC_018533	GCT	2	6	116851	116856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530014
2508	NC_018533	AGC	2	6	116900	116905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530014
2509	NC_018533	TTCA	2	8	116978	116985	25 %	50 %	0 %	25 %	403530014
2510	NC_018533	T	6	6	117007	117012	0 %	100 %	0 %	0 %	403530014
2511	NC_018533	GCT	2	6	117128	117133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530014
2512	NC_018533	TGTT	2	8	117134	117141	0 %	75 %	25 %	0 %	403530014
2513	NC_018533	A	8	8	117145	117152	100 %	0 %	0 %	0 %	403530014
2514	NC_018533	AG	3	6	117164	117169	50 %	0 %	50 %	0 %	403530014
2515	NC_018533	ATA	2	6	117180	117185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530014
2516	NC_018533	GGT	2	6	117205	117210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_018533	GTT	2	6	117227	117232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2518	NC_018533	TAA	3	9	117246	117254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2519	NC_018533	A	7	7	117329	117335	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2520	NC_018533	TCTTGT	2	12	117386	117397	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	403530015
2521	NC_018533	T	6	6	117397	117402	0 %	100 %	0 %	0 %	403530015
2522	NC_018533	CTT	2	6	117468	117473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530015
2523	NC_018533	GATA	2	8	117499	117506	50 %	25 %	25 %	0 %	403530015
2524	NC_018533	T	7	7	117522	117528	0 %	100 %	0 %	0 %	403530015
2525	NC_018533	CT	3	6	117555	117560	0 %	50 %	0 %	50 %	403530015
2526	NC_018533	TCA	2	6	117590	117595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530015
2527	NC_018533	ACG	2	6	117616	117621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530015
2528	NC_018533	GTT	2	6	117626	117631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530015
2529	NC_018533	TGGT	2	8	117641	117648	0 %	50 %	50 %	0 %	403530015
2530	NC_018533	CAG	4	12	117723	117734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530015
2531	NC_018533	AG	3	6	117883	117888	50 %	0 %	50 %	0 %	403530015
2532	NC_018533	GTTTT	2	10	117941	117950	0 %	80 %	20 %	0 %	403530015
2533	NC_018533	CCG	2	6	118042	118047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403530015
2534	NC_018533	AAC	2	6	118069	118074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530015
2535	NC_018533	ACTTCT	2	12	118076	118087	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	403530015
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2537	NC_018533	ACC	2	6	118189	118194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403530015
2538	NC_018533	T	7	7	118227	118233	0 %	100 %	0 %	0 %	403530015
2539	NC_018533	AG	3	6	118295	118300	50 %	0 %	50 %	0 %	403530015
2540	NC_018533	GT	4	8	118306	118313	0 %	50 %	50 %	0 %	403530015
2541	NC_018533	TTGA	2	8	118315	118322	25 %	50 %	25 %	0 %	403530015
2542	NC_018533	AAT	2	6	118327	118332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530015
2543	NC_018533	GGT	2	6	118374	118379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530015
2544	NC_018533	CGC	2	6	118385	118390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403530015
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2546	NC_018533	CAA	2	6	118437	118442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530015
2547	NC_018533	ACC	2	6	118469	118474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403530015
2548	NC_018533	GATTT	2	10	118483	118492	20 %	60 %	20 %	0 %	403530015
2549	NC_018533	TCT	2	6	118538	118543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530015
2550	NC_018533	ACG	2	6	118552	118557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530015
2551	NC_018533	ACA	2	6	118562	118567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530015
2552	NC_018533	ACG	3	9	118576	118584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530015
2553	NC_018533	TTC	2	6	118765	118770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530015
2554	NC_018533	TTC	2	6	118786	118791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530015
2555	NC_018533	GA	3	6	118811	118816	50 %	0 %	50 %	0 %	403530015
2556	NC_018533	AAT	2	6	118951	118956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530015
2557	NC_018533	GAT	2	6	118978	118983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530015
2558	NC_018533	AAC	2	6	118993	118998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530015
2559	NC_018533	TGT	2	6	119059	119064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530015
2560	NC_018533	ATTGT	2	10	119068	119077	20 %	60 %	20 %	0 %	403530015
2561	NC_018533	ATAC	2	8	119094	119101	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2562	NC_018533	GAA	2	6	119175	119180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2563	NC_018533	GAC	2	6	119209	119214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2564	NC_018533	TTCA	2	8	119215	119222	25 %	50 %	0 %	25 %	403530016
2565	NC_018533	CAAG	2	8	119302	119309	50 %	0 %	25 %	25 %	403530016
2566	NC_018533	TG	3	6	119340	119345	0 %	50 %	50 %	0 %	403530016
2567	NC_018533	GTT	2	6	119368	119373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530016
2568	NC_018533	CTTT	2	8	119413	119420	0 %	75 %	0 %	25 %	403530016
2569	NC_018533	ACG	2	6	119435	119440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530016
2570	NC_018533	AGA	2	6	119466	119471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530016
2571	NC_018533	GTT	2	6	119560	119565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530016
2572	NC_018533	CAA	2	6	119569	119574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530016
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2577	NC_018533	T	6	6	119695	119700	0 %	100 %	0 %	0 %	403530016
2578	NC_018533	CAT	2	6	119701	119706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530016
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2581	NC_018533	C	6	6	119872	119877	0 %	0 %	0 %	100 %	403530017
2582	NC_018533	GTT	2	6	119880	119885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530017
2583	NC_018533	ATC	2	6	119932	119937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530017
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2587	NC_018533	TGAT	2	8	120092	120099	25 %	50 %	25 %	0 %	403530017
2588	NC_018533	TCA	2	6	120152	120157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530017
2589	NC_018533	GCT	3	9	120191	120199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530017
2590	NC_018533	TCA	2	6	120218	120223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530017
2591	NC_018533	TGA	2	6	120271	120276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530017
2592	NC_018533	AAG	2	6	120427	120432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530017
2593	NC_018533	TGC	2	6	120433	120438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530017
2594	NC_018533	AGA	2	6	120457	120462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530017
2595	NC_018533	T	6	6	120582	120587	0 %	100 %	0 %	0 %	403530017
2596	NC_018533	CAG	2	6	120633	120638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530017
2597	NC_018533	GA	4	8	120821	120828	50 %	0 %	50 %	0 %	403530017
2598	NC_018533	TAA	2	6	120984	120989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530017
2599	NC_018533	AGC	3	9	121012	121020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530017
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2601	NC_018533	GATT	2	8	121108	121115	25 %	50 %	25 %	0 %	403530017
2602	NC_018533	GTT	2	6	121175	121180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530017
2603	NC_018533	T	6	6	121179	121184	0 %	100 %	0 %	0 %	403530017
2604	NC_018533	ATTAA	2	10	121219	121228	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2605	NC_018533	ATT	2	6	121305	121310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2606	NC_018533	AAG	2	6	121425	121430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530018
2607	NC_018533	CTT	2	6	121584	121589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530018
2608	NC_018533	GAT	3	9	121614	121622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530018
2609	NC_018533	GAT	4	12	121659	121670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530018
2610	NC_018533	ACGATG	4	24	121684	121707	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	403530018
2611	NC_018533	GGT	2	6	121728	121733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530018
2612	NC_018533	TTC	2	6	121794	121799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2613	NC_018533	TTC	2	6	121829	121834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2614	NC_018533	GCATG	2	10	121904	121913	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2615	NC_018533	CCA	2	6	121945	121950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2616	NC_018533	AGC	2	6	122007	122012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2617	NC_018533	A	7	7	122044	122050	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2618	NC_018533	AAG	2	6	122087	122092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2619	NC_018533	AG	3	6	122103	122108	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2620	NC_018533	TTA	2	6	122112	122117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2621	NC_018533	A	6	6	122140	122145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2622	NC_018533	TAT	2	6	122147	122152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2623	NC_018533	CA	3	6	122179	122184	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2624	NC_018533	ATGA	2	8	122242	122249	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2625	NC_018533	ATT	2	6	122257	122262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2875	NC_018533	AT	3	6	132528	132533	50 %	50 %	0 %	0 %	403530025
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