MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bartonella quintana RM-11 chromosome

Total Repeats: 35817

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018533	GAT	2	6	22419	22424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403529953
502	NC_018533	GCA	2	6	22549	22554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403529953
503	NC_018533	TCTT	2	8	22605	22612	0 %	75 %	0 %	25 %	403529953
504	NC_018533	TGG	2	6	22632	22637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403529953
505	NC_018533	CCA	2	6	22642	22647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403529953
506	NC_018533	T	7	7	22667	22673	0 %	100 %	0 %	0 %	403529953
507	NC_018533	GAT	2	6	22675	22680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403529953
508	NC_018533	TGA	2	6	22725	22730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403529953
509	NC_018533	TAT	2	6	22837	22842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403529953
510	NC_018533	AGC	2	6	22880	22885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403529953
511	NC_018533	TAA	2	6	22887	22892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403529953
512	NC_018533	TCC	2	6	22920	22925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403529953
513	NC_018533	AAG	2	6	22994	22999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403529953
514	NC_018533	CAAA	2	8	23111	23118	75 %	0 %	0 %	25 %	403529953
515	NC_018533	A	6	6	23116	23121	100 %	0 %	0 %	0 %	403529953
516	NC_018533	GC	3	6	23145	23150	0 %	0 %	50 %	50 %	403529953
517	NC_018533	CTG	2	6	23195	23200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403529953
518	NC_018533	CTT	2	6	23224	23229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403529953
519	NC_018533	T	6	6	23308	23313	0 %	100 %	0 %	0 %	403529953
520	NC_018533	GTGC	2	8	23395	23402	0 %	25 %	50 %	25 %	403529953
521	NC_018533	AAT	2	6	23438	23443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403529953
522	NC_018533	AGCA	2	8	23455	23462	50 %	0 %	25 %	25 %	403529954
523	NC_018533	GCG	2	6	23468	23473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403529954
524	NC_018533	ATC	2	6	23487	23492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403529954
525	NC_018533	ACA	2	6	23514	23519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403529954
526	NC_018533	TGT	2	6	23536	23541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403529954
527	NC_018533	TGG	2	6	23543	23548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403529954
528	NC_018533	GTGAA	2	10	23566	23575	40 %	20 %	40 %	0 %	403529954
529	NC_018533	A	6	6	23580	23585	100 %	0 %	0 %	0 %	403529954
530	NC_018533	TGA	2	6	23656	23661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403529954
531	NC_018533	GAT	2	6	23724	23729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403529954
532	NC_018533	GT	3	6	23820	23825	0 %	50 %	50 %	0 %	403529954
533	NC_018533	CAA	2	6	23858	23863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403529954
534	NC_018533	GAA	2	6	23910	23915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403529954
535	NC_018533	TTG	2	6	23971	23976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403529954
536	NC_018533	CAA	2	6	24009	24014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403529954
537	NC_018533	GAT	2	6	24015	24020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403529954
538	NC_018533	TGA	2	6	24050	24055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403529954
539	NC_018533	T	6	6	24090	24095	0 %	100 %	0 %	0 %	403529954
540	NC_018533	AAG	2	6	24154	24159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403529954
541	NC_018533	T	6	6	24363	24368	0 %	100 %	0 %	0 %	403529954
542	NC_018533	GT	3	6	24372	24377	0 %	50 %	50 %	0 %	403529954
543	NC_018533	A	6	6	24562	24567	100 %	0 %	0 %	0 %	403529954
544	NC_018533	CGT	2	6	24609	24614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403529954
545	NC_018533	GT	3	6	24613	24618	0 %	50 %	50 %	0 %	403529954
546	NC_018533	AAG	2	6	24652	24657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403529954
547	NC_018533	ACA	2	6	24662	24667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403529954
548	NC_018533	GAA	2	6	24675	24680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403529954
549	NC_018533	GTG	2	6	24684	24689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403529954
550	NC_018533	ATT	2	6	24692	24697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403529954
551	NC_018533	T	7	7	24919	24925	0 %	100 %	0 %	0 %	403529954
552	NC_018533	TAC	2	6	24983	24988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403529954
553	NC_018533	CTGA	2	8	25012	25019	25 %	25 %	25 %	25 %	403529954
554	NC_018533	AGC	2	6	25022	25027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_018533	A	7	7	25067	25073	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_018533	A	7	7	25098	25104	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_018533	CCA	2	6	25173	25178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403529955
558	NC_018533	TCA	2	6	25262	25267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403529955
559	NC_018533	ACCAC	2	10	25348	25357	40 %	0 %	0 %	60 %	403529955
560	NC_018533	GAA	2	6	25388	25393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403529955
561	NC_018533	TCA	2	6	25565	25570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403529956
562	NC_018533	GAAG	2	8	25592	25599	50 %	0 %	50 %	0 %	403529956
563	NC_018533	CTT	2	6	25614	25619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403529956
564	NC_018533	AAG	2	6	25630	25635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403529956
565	NC_018533	TGG	2	6	25650	25655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403529956
566	NC_018533	GCA	2	6	25668	25673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403529956
567	NC_018533	CAA	2	6	25696	25701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403529956
568	NC_018533	GTG	2	6	25707	25712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403529956
569	NC_018533	GCT	2	6	25718	25723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403529956
570	NC_018533	AGG	2	6	25732	25737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403529956
571	NC_018533	ATTTT	2	10	25766	25775	20 %	80 %	0 %	0 %	403529956
572	NC_018533	AG	3	6	25878	25883	50 %	0 %	50 %	0 %	403529956
573	NC_018533	T	8	8	25933	25940	0 %	100 %	0 %	0 %	403529956
574	NC_018533	GCA	2	6	26028	26033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403529956
575	NC_018533	GTTT	2	8	26080	26087	0 %	75 %	25 %	0 %	403529956
576	NC_018533	CTG	2	6	26199	26204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403529956
577	NC_018533	GAA	2	6	26215	26220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403529956
578	NC_018533	A	6	6	26219	26224	100 %	0 %	0 %	0 %	403529956
579	NC_018533	GAA	2	6	26288	26293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403529956
580	NC_018533	TCT	2	6	26324	26329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403529956
581	NC_018533	T	7	7	26368	26374	0 %	100 %	0 %	0 %	403529956
582	NC_018533	AGG	2	6	26465	26470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403529956
583	NC_018533	TTC	3	9	26479	26487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403529956
584	NC_018533	T	7	7	26564	26570	0 %	100 %	0 %	0 %	403529956
585	NC_018533	GCTC	2	8	26571	26578	0 %	25 %	25 %	50 %	403529956
586	NC_018533	GAA	2	6	26590	26595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403529956
587	NC_018533	ACA	2	6	26663	26668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403529956
588	NC_018533	GCA	2	6	26687	26692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403529956
589	NC_018533	CTT	2	6	26712	26717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403529956
590	NC_018533	TGA	2	6	26726	26731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403529956
591	NC_018533	A	6	6	26774	26779	100 %	0 %	0 %	0 %	403529956
592	NC_018533	T	6	6	26802	26807	0 %	100 %	0 %	0 %	403529956
593	NC_018533	GTC	2	6	26883	26888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403529956
594	NC_018533	GTGC	2	8	27000	27007	0 %	25 %	50 %	25 %	403529956
595	NC_018533	AG	3	6	27026	27031	50 %	0 %	50 %	0 %	403529956
596	NC_018533	AGC	2	6	27043	27048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403529956
597	NC_018533	TGGT	2	8	27173	27180	0 %	50 %	50 %	0 %	403529956
598	NC_018533	ATA	2	6	27278	27283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403529956
599	NC_018533	TTC	2	6	27322	27327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403529956
600	NC_018533	T	6	6	27360	27365	0 %	100 %	0 %	0 %	403529956
601	NC_018533	GT	3	6	27384	27389	0 %	50 %	50 %	0 %	403529956
602	NC_018533	GAT	2	6	27393	27398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403529956
603	NC_018533	ATC	2	6	27415	27420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403529956
604	NC_018533	CTG	2	6	27516	27521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403529956
605	NC_018533	AAT	2	6	27597	27602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403529956
606	NC_018533	T	6	6	27612	27617	0 %	100 %	0 %	0 %	403529956
607	NC_018533	CTG	2	6	27634	27639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403529956
608	NC_018533	T	8	8	27643	27650	0 %	100 %	0 %	0 %	403529956
609	NC_018533	ATT	2	6	27653	27658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403529956
610	NC_018533	GCA	2	6	27668	27673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403529956
611	NC_018533	ACTG	2	8	27756	27763	25 %	25 %	25 %	25 %	403529956
612	NC_018533	AAT	2	6	27796	27801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403529956
613	NC_018533	TCA	2	6	27833	27838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403529956
614	NC_018533	CAA	2	6	27904	27909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403529956
615	NC_018533	TCA	2	6	27932	27937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403529956
616	NC_018533	AAG	2	6	27944	27949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403529956
617	NC_018533	T	7	7	27958	27964	0 %	100 %	0 %	0 %	403529956
618	NC_018533	GCTT	2	8	28065	28072	0 %	50 %	25 %	25 %	403529956
619	NC_018533	TTG	2	6	28090	28095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403529956
620	NC_018533	T	6	6	28120	28125	0 %	100 %	0 %	0 %	403529956
621	NC_018533	AAAT	2	8	28169	28176	75 %	25 %	0 %	0 %	403529956
622	NC_018533	AAT	2	6	28183	28188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403529956
623	NC_018533	ATA	2	6	28193	28198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403529956
624	NC_018533	TCA	2	6	28205	28210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403529956
625	NC_018533	AGGC	2	8	28297	28304	25 %	0 %	50 %	25 %	403529956
626	NC_018533	T	6	6	28320	28325	0 %	100 %	0 %	0 %	403529956
627	NC_018533	CAG	2	6	28327	28332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403529956
628	NC_018533	GTTT	2	8	28339	28346	0 %	75 %	25 %	0 %	403529956
629	NC_018533	TTC	2	6	28381	28386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403529956
630	NC_018533	CAGA	2	8	28395	28402	50 %	0 %	25 %	25 %	403529956
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