MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bartonella quintana RM-11 chromosome

Total Repeats: 35817

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_018533	A	6	6	275690	275695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_018533	AAT	2	6	275705	275710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_018533	CGA	2	6	275788	275793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6004	NC_018533	TGC	2	6	275818	275823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6005	NC_018533	ATG	2	6	275908	275913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_018533	AGCA	2	8	275916	275923	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6007	NC_018533	TTGC	2	8	275960	275967	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6008	NC_018533	AGA	2	6	275972	275977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_018533	CAA	2	6	275979	275984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6010	NC_018533	T	6	6	276025	276030	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_018533	TGG	2	6	276037	276042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_018533	AAC	2	6	276051	276056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6013	NC_018533	TC	3	6	276066	276071	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6014	NC_018533	CA	3	6	276166	276171	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6015	NC_018533	GA	3	6	276206	276211	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_018533	T	8	8	276212	276219	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_018533	CAT	2	6	276314	276319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530135
6018	NC_018533	CCT	2	6	276337	276342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403530135
6019	NC_018533	TGT	2	6	276414	276419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530135
6020	NC_018533	AAT	2	6	276450	276455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530135
6021	NC_018533	TCA	2	6	276508	276513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530135
6022	NC_018533	CAA	3	9	276614	276622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530135
6023	NC_018533	TTG	2	6	276626	276631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530135
6024	NC_018533	ATC	2	6	276633	276638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530135
6025	NC_018533	GCG	2	6	276639	276644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403530135
6026	NC_018533	GCT	2	6	276721	276726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530135
6027	NC_018533	GCT	2	6	276733	276738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530135
6028	NC_018533	T	7	7	276764	276770	0 %	100 %	0 %	0 %	403530135
6029	NC_018533	GCA	2	6	276784	276789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530135
6030	NC_018533	TAAA	2	8	276898	276905	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_018533	CTG	2	6	276954	276959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530136
6032	NC_018533	T	6	6	276972	276977	0 %	100 %	0 %	0 %	403530136
6033	NC_018533	TTTTG	2	10	276997	277006	0 %	80 %	20 %	0 %	403530136
6034	NC_018533	TTC	2	6	277051	277056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530136
6035	NC_018533	AGT	2	6	277064	277069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530136
6036	NC_018533	CCG	2	6	277133	277138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403530136
6037	NC_018533	TCT	2	6	277169	277174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530136
6038	NC_018533	TGC	2	6	277181	277186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530136
6039	NC_018533	T	6	6	277188	277193	0 %	100 %	0 %	0 %	403530136
6040	NC_018533	T	6	6	277210	277215	0 %	100 %	0 %	0 %	403530136
6041	NC_018533	CAT	2	6	277216	277221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530136
6042	NC_018533	TCA	2	6	277224	277229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530136
6043	NC_018533	TCA	2	6	277258	277263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530137
6044	NC_018533	TTTA	2	8	277320	277327	25 %	75 %	0 %	0 %	403530137
6045	NC_018533	A	6	6	277403	277408	100 %	0 %	0 %	0 %	403530137
6046	NC_018533	TCT	2	6	277432	277437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530137
6047	NC_018533	TCC	3	9	277449	277457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403530137
6048	NC_018533	T	8	8	277508	277515	0 %	100 %	0 %	0 %	403530137
6049	NC_018533	ATA	2	6	277561	277566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530137
6050	NC_018533	AAG	2	6	277608	277613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530137
6051	NC_018533	TAA	2	6	277649	277654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530137
6052	NC_018533	AAT	2	6	277671	277676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530137
6053	NC_018533	GCT	2	6	277936	277941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530137
6054	NC_018533	TGT	2	6	277947	277952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530137
6055	NC_018533	TGA	2	6	277975	277980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530137
6056	NC_018533	GAA	2	6	277981	277986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530137
6057	NC_018533	GA	3	6	278001	278006	50 %	0 %	50 %	0 %	403530137
6058	NC_018533	T	6	6	278009	278014	0 %	100 %	0 %	0 %	403530137
6059	NC_018533	T	6	6	278026	278031	0 %	100 %	0 %	0 %	403530137
6060	NC_018533	TCA	2	6	278038	278043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530137
6061	NC_018533	CAG	2	6	278090	278095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530137
6062	NC_018533	T	7	7	278181	278187	0 %	100 %	0 %	0 %	403530137
6063	NC_018533	GA	3	6	278227	278232	50 %	0 %	50 %	0 %	403530137
6064	NC_018533	AAACGT	2	12	278254	278265	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	403530137
6065	NC_018533	CAT	2	6	278324	278329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530137
6066	NC_018533	ATGCA	2	10	278346	278355	40 %	20 %	20 %	20 %	403530137
6067	NC_018533	ATG	2	6	278374	278379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530137
6068	NC_018533	AAT	2	6	278394	278399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530137
6069	NC_018533	GC	3	6	278428	278433	0 %	0 %	50 %	50 %	403530137
6070	NC_018533	TCT	2	6	278545	278550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530137
6071	NC_018533	TGT	2	6	278673	278678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530137
6072	NC_018533	AAAT	2	8	278684	278691	75 %	25 %	0 %	0 %	403530137
6073	NC_018533	GGT	2	6	278704	278709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530137
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6075	NC_018533	ATA	2	6	278770	278775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530137
6076	NC_018533	AAT	2	6	278820	278825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530137
6077	NC_018533	ATC	2	6	278835	278840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530137
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6080	NC_018533	TGT	2	6	278994	278999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530137
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6082	NC_018533	TCA	2	6	279173	279178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530137
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6085	NC_018533	TCAA	2	8	279268	279275	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6086	NC_018533	T	7	7	279280	279286	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6087	NC_018533	GAA	2	6	279287	279292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6088	NC_018533	ATG	2	6	279345	279350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6089	NC_018533	CTGAA	2	10	279369	279378	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6090	NC_018533	AGG	2	6	279411	279416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6092	NC_018533	CCA	3	9	279492	279500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6093	NC_018533	GAA	2	6	279552	279557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6094	NC_018533	T	6	6	279579	279584	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6095	NC_018533	ATG	2	6	279604	279609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6096	NC_018533	GAA	2	6	279646	279651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6097	NC_018533	TTTG	2	8	279689	279696	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6098	NC_018533	ATA	2	6	279699	279704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6099	NC_018533	AGA	2	6	279715	279720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6100	NC_018533	GTT	2	6	279777	279782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_018533	AGC	2	6	279805	279810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6102	NC_018533	A	6	6	279811	279816	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_018533	TTG	2	6	279846	279851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_018533	AGG	2	6	279867	279872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_018533	AGA	2	6	279873	279878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6106	NC_018533	TTG	2	6	279879	279884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6107	NC_018533	A	6	6	279952	279957	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_018533	TCTT	2	8	279967	279974	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6109	NC_018533	TCA	2	6	280055	280060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6110	NC_018533	T	8	8	280109	280116	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6111	NC_018533	AC	3	6	280140	280145	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6112	NC_018533	GCG	2	6	280159	280164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6113	NC_018533	TA	3	6	280198	280203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6114	NC_018533	GAG	2	6	280229	280234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_018533	A	6	6	280316	280321	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6116	NC_018533	TTG	2	6	280356	280361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_018533	T	6	6	280506	280511	0 %	100 %	0 %	0 %	403530138
6118	NC_018533	TTATT	2	10	280627	280636	20 %	80 %	0 %	0 %	403530138
6119	NC_018533	CAA	2	6	280648	280653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530138
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6122	NC_018533	ATA	2	6	280845	280850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530138
6123	NC_018533	T	7	7	280879	280885	0 %	100 %	0 %	0 %	403530138
6124	NC_018533	A	8	8	280910	280917	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6125	NC_018533	GAC	2	6	281150	281155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6126	NC_018533	T	7	7	281248	281254	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6127	NC_018533	TTTC	2	8	281342	281349	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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6129	NC_018533	TCC	2	6	281527	281532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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