MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bartonella quintana RM-11 chromosome

Total Repeats: 35817

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_018533	TCA	2	6	252631	252636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530114
5502	NC_018533	GCA	2	6	252642	252647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530114
5503	NC_018533	CCAC	2	8	252677	252684	25 %	0 %	0 %	75 %	403530114
5504	NC_018533	TAA	2	6	252701	252706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530114
5505	NC_018533	CAT	2	6	252763	252768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530114
5506	NC_018533	GAG	2	6	252790	252795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403530114
5507	NC_018533	AGC	2	6	252796	252801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530114
5508	NC_018533	A	6	6	252825	252830	100 %	0 %	0 %	0 %	403530114
5509	NC_018533	T	6	6	252861	252866	0 %	100 %	0 %	0 %	403530114
5510	NC_018533	ATA	2	6	252961	252966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530114
5511	NC_018533	CATTT	2	10	253014	253023	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5512	NC_018533	AAG	2	6	253030	253035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_018533	ATT	2	6	253041	253046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530115
5514	NC_018533	CTT	2	6	253047	253052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530115
5515	NC_018533	T	6	6	253051	253056	0 %	100 %	0 %	0 %	403530115
5516	NC_018533	GTTT	2	8	253068	253075	0 %	75 %	25 %	0 %	403530115
5517	NC_018533	T	6	6	253085	253090	0 %	100 %	0 %	0 %	403530115
5518	NC_018533	CTTTT	2	10	253102	253111	0 %	80 %	0 %	20 %	403530115
5519	NC_018533	TCA	2	6	253196	253201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530115
5520	NC_018533	CTT	2	6	253233	253238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530115
5521	NC_018533	AAC	2	6	253240	253245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530115
5522	NC_018533	GTT	2	6	253250	253255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530115
5523	NC_018533	TGT	2	6	253270	253275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530115
5524	NC_018533	GA	3	6	253281	253286	50 %	0 %	50 %	0 %	403530115
5525	NC_018533	ACC	2	6	253369	253374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403530115
5526	NC_018533	CAA	2	6	253389	253394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530115
5527	NC_018533	TGC	2	6	253414	253419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530115
5528	NC_018533	GCC	2	6	253519	253524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403530115
5529	NC_018533	TCA	2	6	253598	253603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530115
5530	NC_018533	T	6	6	253739	253744	0 %	100 %	0 %	0 %	403530115
5531	NC_018533	GAT	2	6	253776	253781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530115
5532	NC_018533	CAGA	2	8	253800	253807	50 %	0 %	25 %	25 %	403530115
5533	NC_018533	CTT	2	6	253824	253829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530115
5534	NC_018533	CACGC	2	10	254010	254019	20 %	0 %	20 %	60 %	403530115
5535	NC_018533	GCG	2	6	254041	254046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403530115
5536	NC_018533	TGG	2	6	254086	254091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530115
5537	NC_018533	AGG	2	6	254105	254110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403530115
5538	NC_018533	TTGC	2	8	254331	254338	0 %	50 %	25 %	25 %	403530115
5539	NC_018533	TCT	2	6	254387	254392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530115
5540	NC_018533	TGA	2	6	254412	254417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530115
5541	NC_018533	AG	3	6	254527	254532	50 %	0 %	50 %	0 %	403530115
5542	NC_018533	TGA	2	6	254583	254588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530115
5543	NC_018533	ATG	2	6	254642	254647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530115
5544	NC_018533	CAA	3	9	254706	254714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530115
5545	NC_018533	TCA	2	6	254738	254743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530115
5546	NC_018533	AGA	2	6	254839	254844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530115
5547	NC_018533	ATT	2	6	254869	254874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530115
5548	NC_018533	ACC	2	6	255016	255021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403530115
5549	NC_018533	AGTG	2	8	255064	255071	25 %	25 %	50 %	0 %	403530115
5550	NC_018533	A	6	6	255073	255078	100 %	0 %	0 %	0 %	403530115
5551	NC_018533	CTGGT	2	10	255082	255091	0 %	40 %	40 %	20 %	403530115
5552	NC_018533	T	6	6	255098	255103	0 %	100 %	0 %	0 %	403530115
5553	NC_018533	T	6	6	255243	255248	0 %	100 %	0 %	0 %	403530115
5554	NC_018533	ACA	2	6	255327	255332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5555	NC_018533	AG	3	6	255356	255361	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_018533	ATG	2	6	255408	255413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_018533	TCA	2	6	255419	255424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5558	NC_018533	AGC	2	6	255447	255452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5559	NC_018533	A	6	6	255459	255464	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5560	NC_018533	ACC	2	6	255485	255490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5561	NC_018533	ACG	2	6	255613	255618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530116
5562	NC_018533	TAT	2	6	255777	255782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_018533	A	6	6	255789	255794	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_018533	GAA	2	6	255796	255801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_018533	A	6	6	255800	255805	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_018533	AAG	2	6	255852	255857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_018533	AGG	2	6	255897	255902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_018533	TCT	2	6	255936	255941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5569	NC_018533	TAA	2	6	255943	255948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_018533	ATTT	2	8	255967	255974	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5571	NC_018533	TAA	2	6	255975	255980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5572	NC_018533	TG	4	8	256045	256052	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_018533	A	7	7	256055	256061	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5574	NC_018533	G	6	6	256172	256177	0 %	0 %	100 %	0 %	403530117
5575	NC_018533	GGTT	2	8	256199	256206	0 %	50 %	50 %	0 %	403530117
5576	NC_018533	TTC	2	6	256222	256227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530117
5577	NC_018533	ACA	2	6	256259	256264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530117
5578	NC_018533	TGT	2	6	256332	256337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530117
5579	NC_018533	ATG	3	9	256349	256357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530117
5580	NC_018533	TAT	2	6	256416	256421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530117
5581	NC_018533	GGCA	2	8	256470	256477	25 %	0 %	50 %	25 %	403530117
5582	NC_018533	CTG	2	6	256512	256517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530117
5583	NC_018533	TGG	2	6	256573	256578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530117
5584	NC_018533	CAT	2	6	256582	256587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530117
5585	NC_018533	T	6	6	256612	256617	0 %	100 %	0 %	0 %	403530117
5586	NC_018533	GA	3	6	256700	256705	50 %	0 %	50 %	0 %	403530117
5587	NC_018533	TGT	2	6	256738	256743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530117
5588	NC_018533	TCT	2	6	256756	256761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530117
5589	NC_018533	TAT	2	6	256765	256770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530117
5590	NC_018533	CGATTT	2	12	256800	256811	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	403530117
5591	NC_018533	TTG	2	6	256827	256832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530117
5592	NC_018533	GGA	2	6	256847	256852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403530117
5593	NC_018533	CTT	2	6	256859	256864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530117
5594	NC_018533	GTT	2	6	256881	256886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530117
5595	NC_018533	CAG	2	6	256905	256910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530117
5596	NC_018533	TTA	2	6	256914	256919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530117
5597	NC_018533	ATT	2	6	256935	256940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530117
5598	NC_018533	ATT	2	6	256955	256960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530117
5599	NC_018533	T	8	8	256994	257001	0 %	100 %	0 %	0 %	403530117
5600	NC_018533	GTT	2	6	257117	257122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530117
5601	NC_018533	G	8	8	257187	257194	0 %	0 %	100 %	0 %	403530117
5602	NC_018533	AAG	2	6	257359	257364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530117
5603	NC_018533	ATGATT	2	12	257375	257386	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	403530117
5604	NC_018533	GAA	2	6	257414	257419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530117
5605	NC_018533	TGA	2	6	257430	257435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530117
5606	NC_018533	CGT	3	9	257438	257446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530117
5607	NC_018533	ATT	2	6	257547	257552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530117
5608	NC_018533	CTG	2	6	257700	257705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530117
5609	NC_018533	GA	3	6	257767	257772	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5610	NC_018533	A	6	6	257792	257797	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5611	NC_018533	GA	4	8	257980	257987	50 %	0 %	50 %	0 %	403530118
5612	NC_018533	GCG	2	6	257997	258002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403530118
5613	NC_018533	TCA	2	6	258021	258026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530118
5614	NC_018533	TTTC	2	8	258039	258046	0 %	75 %	0 %	25 %	403530118
5615	NC_018533	TCATTT	2	12	258057	258068	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	403530118
5616	NC_018533	TTC	2	6	258101	258106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530118
5617	NC_018533	ATC	2	6	258119	258124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530118
5618	NC_018533	AAC	2	6	258175	258180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530118
5619	NC_018533	GTG	2	6	258307	258312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530118
5620	NC_018533	CAA	2	6	258319	258324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530118
5621	NC_018533	TCT	2	6	258438	258443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530118
5622	NC_018533	AGA	2	6	258458	258463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530118
5623	NC_018533	ATC	2	6	258488	258493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530118
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5625	NC_018533	CCAG	2	8	258716	258723	25 %	0 %	25 %	50 %	403530118
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