MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bartonella quintana RM-11 chromosome

Total Repeats: 35817

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_018533	CCA	2	6	229389	229394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403530095
5002	NC_018533	GCT	2	6	229467	229472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530095
5003	NC_018533	ATA	3	9	229608	229616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530095
5004	NC_018533	T	6	6	229623	229628	0 %	100 %	0 %	0 %	403530095
5005	NC_018533	T	6	6	229698	229703	0 %	100 %	0 %	0 %	403530095
5006	NC_018533	TTG	2	6	229721	229726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530095
5007	NC_018533	CTG	2	6	229809	229814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530095
5008	NC_018533	TGA	2	6	229818	229823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530095
5009	NC_018533	TGT	2	6	229824	229829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530095
5010	NC_018533	GAG	2	6	229861	229866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403530095
5011	NC_018533	AAG	2	6	229889	229894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530095
5012	NC_018533	TGA	2	6	229954	229959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530095
5013	NC_018533	ATA	2	6	229962	229967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530095
5014	NC_018533	CCT	2	6	230064	230069	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403530095
5015	NC_018533	T	6	6	230073	230078	0 %	100 %	0 %	0 %	403530095
5016	NC_018533	TAT	2	6	230122	230127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530095
5017	NC_018533	AG	3	6	230164	230169	50 %	0 %	50 %	0 %	403530095
5018	NC_018533	TTG	2	6	230186	230191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530095
5019	NC_018533	AAT	2	6	230192	230197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530095
5020	NC_018533	ATT	2	6	230207	230212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_018533	CGC	2	6	230255	230260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403530096
5022	NC_018533	CG	3	6	230269	230274	0 %	0 %	50 %	50 %	403530096
5023	NC_018533	AGA	2	6	230292	230297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530096
5024	NC_018533	TAAA	2	8	230298	230305	75 %	25 %	0 %	0 %	403530096
5025	NC_018533	GCA	2	6	230310	230315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530096
5026	NC_018533	AAAG	2	8	230352	230359	75 %	0 %	25 %	0 %	403530096
5027	NC_018533	ATC	2	6	230457	230462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530096
5028	NC_018533	TAC	2	6	230519	230524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530096
5029	NC_018533	AT	3	6	230539	230544	50 %	50 %	0 %	0 %	403530096
5030	NC_018533	AG	3	6	230564	230569	50 %	0 %	50 %	0 %	403530096
5031	NC_018533	A	6	6	230576	230581	100 %	0 %	0 %	0 %	403530096
5032	NC_018533	CTA	2	6	230599	230604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530096
5033	NC_018533	TTG	2	6	230725	230730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530096
5034	NC_018533	TCT	2	6	230799	230804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530096
5035	NC_018533	CAA	2	6	230845	230850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530096
5036	NC_018533	A	6	6	230902	230907	100 %	0 %	0 %	0 %	403530096
5037	NC_018533	AGC	2	6	230912	230917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530096
5038	NC_018533	AGGA	2	8	230927	230934	50 %	0 %	50 %	0 %	403530096
5039	NC_018533	AGA	2	6	231015	231020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530096
5040	NC_018533	A	6	6	231074	231079	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_018533	TAT	2	6	231090	231095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530097
5042	NC_018533	TGT	2	6	231161	231166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530097
5043	NC_018533	TGT	2	6	231209	231214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530097
5044	NC_018533	ATT	2	6	231249	231254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530097
5045	NC_018533	TG	3	6	231327	231332	0 %	50 %	50 %	0 %	403530097
5046	NC_018533	AAG	2	6	231341	231346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530097
5047	NC_018533	ATA	2	6	231396	231401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530097
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5049	NC_018533	TTG	2	6	231626	231631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530097
5050	NC_018533	TTC	2	6	231654	231659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530097
5051	NC_018533	CAG	2	6	231710	231715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530097
5052	NC_018533	T	6	6	231786	231791	0 %	100 %	0 %	0 %	403530097
5053	NC_018533	TAT	2	6	231860	231865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_018533	TAA	2	6	231884	231889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_018533	CAA	2	6	231902	231907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5056	NC_018533	ATT	2	6	231912	231917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_018533	AAT	2	6	231971	231976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_018533	AG	4	8	231998	232005	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_018533	TA	4	8	232015	232022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_018533	GT	3	6	232069	232074	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_018533	A	6	6	232112	232117	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_018533	CTG	2	6	232147	232152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5063	NC_018533	GAG	2	6	232216	232221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_018533	AGG	2	6	232266	232271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_018533	AGC	2	6	232285	232290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5066	NC_018533	AAT	2	6	232331	232336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_018533	ATT	2	6	232363	232368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_018533	TGA	2	6	232369	232374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_018533	T	8	8	232501	232508	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_018533	ATTA	2	8	232606	232613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_018533	GTT	2	6	232618	232623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_018533	TGA	2	6	232635	232640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_018533	TAT	2	6	232770	232775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530098
5074	NC_018533	A	8	8	232842	232849	100 %	0 %	0 %	0 %	403530098
5075	NC_018533	TGA	2	6	232865	232870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530098
5076	NC_018533	GAAG	2	8	232908	232915	50 %	0 %	50 %	0 %	403530098
5077	NC_018533	AATG	2	8	232950	232957	50 %	25 %	25 %	0 %	403530098
5078	NC_018533	GTG	2	6	232978	232983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530098
5079	NC_018533	TGG	3	9	232988	232996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530098
5080	NC_018533	TAT	2	6	233016	233021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530098
5081	NC_018533	AAG	2	6	233115	233120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530098
5082	NC_018533	ATG	2	6	233217	233222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530099
5083	NC_018533	TGC	2	6	233257	233262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530099
5084	NC_018533	T	8	8	233301	233308	0 %	100 %	0 %	0 %	403530099
5085	NC_018533	A	6	6	233322	233327	100 %	0 %	0 %	0 %	403530099
5086	NC_018533	ACT	2	6	233331	233336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530099
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5088	NC_018533	TTA	2	6	233350	233355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530099
5089	NC_018533	TTTG	2	8	233365	233372	0 %	75 %	25 %	0 %	403530099
5090	NC_018533	AAG	2	6	233396	233401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530099
5091	NC_018533	GC	3	6	233410	233415	0 %	0 %	50 %	50 %	403530099
5092	NC_018533	T	6	6	233443	233448	0 %	100 %	0 %	0 %	403530099
5093	NC_018533	TAT	2	6	233462	233467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530099
5094	NC_018533	ATT	2	6	233594	233599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530099
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5096	NC_018533	T	6	6	233674	233679	0 %	100 %	0 %	0 %	403530099
5097	NC_018533	TTTG	2	8	233766	233773	0 %	75 %	25 %	0 %	403530099
5098	NC_018533	TGA	2	6	233841	233846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530099
5099	NC_018533	AGA	2	6	233854	233859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530099
5100	NC_018533	TTCT	2	8	233860	233867	0 %	75 %	0 %	25 %	403530099
5101	NC_018533	CAT	2	6	233924	233929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530099
5102	NC_018533	TGA	2	6	233971	233976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530099
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5104	NC_018533	TTG	2	6	234141	234146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530099
5105	NC_018533	AAAT	2	8	234171	234178	75 %	25 %	0 %	0 %	403530099
5106	NC_018533	TATTT	2	10	234235	234244	20 %	80 %	0 %	0 %	403530099
5107	NC_018533	GTGA	2	8	234320	234327	25 %	25 %	50 %	0 %	403530099
5108	NC_018533	AT	3	6	234375	234380	50 %	50 %	0 %	0 %	403530099
5109	NC_018533	CTG	2	6	234468	234473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530099
5110	NC_018533	TG	3	6	234497	234502	0 %	50 %	50 %	0 %	403530099
5111	NC_018533	TAT	2	6	234590	234595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530099
5112	NC_018533	GATT	2	8	234610	234617	25 %	50 %	25 %	0 %	403530099
5113	NC_018533	T	7	7	234736	234742	0 %	100 %	0 %	0 %	403530099
5114	NC_018533	AT	3	6	234748	234753	50 %	50 %	0 %	0 %	403530099
5115	NC_018533	AAG	2	6	234848	234853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530099
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5117	NC_018533	TCT	2	6	234938	234943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530099
5118	NC_018533	AAG	2	6	234978	234983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530099
5119	NC_018533	TTA	2	6	235000	235005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530099
5120	NC_018533	ATA	2	6	235023	235028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530099
5121	NC_018533	A	6	6	235071	235076	100 %	0 %	0 %	0 %	403530099
5122	NC_018533	CA	3	6	235099	235104	50 %	0 %	0 %	50 %	403530099
5123	NC_018533	GTT	2	6	235132	235137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530099
5124	NC_018533	T	6	6	235136	235141	0 %	100 %	0 %	0 %	403530099
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5126	NC_018533	TATT	2	8	235210	235217	25 %	75 %	0 %	0 %	403530099
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5251	NC_018533	GAATC	2	10	240913	240922	40 %	20 %	20 %	20 %	403530104
5252	NC_018533	TCA	2	6	240927	240932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530104
5253	NC_018533	ATG	2	6	240944	240949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530104
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5265	NC_018533	TTG	2	6	241581	241586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5267	NC_018533	TTG	2	6	241677	241682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5268	NC_018533	ATT	2	6	241703	241708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5269	NC_018533	TAT	2	6	241807	241812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5270	NC_018533	AGGT	2	8	241830	241837	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5271	NC_018533	T	6	6	241871	241876	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5272	NC_018533	A	8	8	241878	241885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5273	NC_018533	TTTA	2	8	241892	241899	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5274	NC_018533	TTA	2	6	242018	242023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5275	NC_018533	A	6	6	242106	242111	100 %	0 %	0 %	0 %	403530105
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5342	NC_018533	TCAT	2	8	245226	245233	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5343	NC_018533	CAA	2	6	245241	245246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5371	NC_018533	CCT	2	6	246296	246301	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5372	NC_018533	ACC	2	6	246415	246420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403530109
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5374	NC_018533	CAA	2	6	246492	246497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530109
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5377	NC_018533	TTG	2	6	246655	246660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530109
5378	NC_018533	GCT	2	6	246719	246724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530109
5379	NC_018533	TCA	2	6	246767	246772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530109
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5382	NC_018533	C	6	6	247036	247041	0 %	0 %	0 %	100 %	403530109
5383	NC_018533	CCAA	2	8	247064	247071	50 %	0 %	0 %	50 %	403530109
5384	NC_018533	GTG	2	6	247119	247124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530109
5385	NC_018533	TGC	2	6	247128	247133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530109
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5389	NC_018533	TGA	2	6	247281	247286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530109
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5391	NC_018533	GAGG	2	8	247372	247379	25 %	0 %	75 %	0 %	403530109
5392	NC_018533	TGC	2	6	247450	247455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530109
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5398	NC_018533	AATG	2	8	247716	247723	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5399	NC_018533	T	6	6	247788	247793	0 %	100 %	0 %	0 %	403530110
5400	NC_018533	AT	3	6	247834	247839	50 %	50 %	0 %	0 %	403530110
5401	NC_018533	AGT	2	6	247911	247916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530110
5402	NC_018533	A	6	6	248036	248041	100 %	0 %	0 %	0 %	403530110
5403	NC_018533	CGAAA	2	10	248045	248054	60 %	0 %	20 %	20 %	403530110
5404	NC_018533	AAT	2	6	248057	248062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530110
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5408	NC_018533	T	6	6	248240	248245	0 %	100 %	0 %	0 %	403530110
5409	NC_018533	T	7	7	248286	248292	0 %	100 %	0 %	0 %	403530110
5410	NC_018533	GAA	2	6	248380	248385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530110
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5418	NC_018533	TGA	2	6	248783	248788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5419	NC_018533	ATAG	2	8	248792	248799	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5420	NC_018533	GATA	2	8	248855	248862	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5421	NC_018533	A	6	6	248932	248937	100 %	0 %	0 %	0 %	403530111
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5445	NC_018533	ACA	2	6	249922	249927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5450	NC_018533	TGA	2	6	250029	250034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5453	NC_018533	ATG	2	6	250378	250383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530112
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5467	NC_018533	AGATTG	2	12	251129	251140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530113
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5469	NC_018533	TGA	3	9	251301	251309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530113
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5471	NC_018533	GATCAA	2	12	251326	251337	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	403530113
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5476	NC_018533	TGG	2	6	251474	251479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530113
5477	NC_018533	AAC	2	6	251484	251489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530113
5478	NC_018533	ACG	2	6	251643	251648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530113
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5480	NC_018533	GGA	2	6	251706	251711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403530113
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5483	NC_018533	GCT	2	6	251887	251892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530113
5484	NC_018533	TGC	2	6	251919	251924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530113
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5487	NC_018533	CAA	2	6	252076	252081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530114
5488	NC_018533	ACC	2	6	252092	252097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403530114
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5490	NC_018533	GT	3	6	252156	252161	0 %	50 %	50 %	0 %	403530114
5491	NC_018533	GCT	2	6	252285	252290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530114
5492	NC_018533	CTT	2	6	252342	252347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530114
5493	NC_018533	GAAA	2	8	252363	252370	75 %	0 %	25 %	0 %	403530114
5494	NC_018533	CCAG	2	8	252374	252381	25 %	0 %	25 %	50 %	403530114
5495	NC_018533	GCA	2	6	252435	252440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530114
5496	NC_018533	GA	3	6	252463	252468	50 %	0 %	50 %	0 %	403530114
5497	NC_018533	ATTT	2	8	252490	252497	25 %	75 %	0 %	0 %	403530114
5498	NC_018533	TGTTT	2	10	252532	252541	0 %	80 %	20 %	0 %	403530114
5499	NC_018533	ATCT	2	8	252542	252549	25 %	50 %	0 %	25 %	403530114
5500	NC_018533	AGA	2	6	252568	252573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530114

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