MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bartonella quintana RM-11 chromosome

Total Repeats: 35817

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_018533	AGC	2	6	207224	207229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4502	NC_018533	GGA	2	6	207236	207241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_018533	TAA	2	6	207277	207282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_018533	AAG	2	6	207322	207327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_018533	AGA	2	6	207329	207334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_018533	AAG	2	6	207361	207366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_018533	T	6	6	207383	207388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_018533	TTC	2	6	207518	207523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4509	NC_018533	ATG	2	6	207531	207536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_018533	ATA	2	6	207563	207568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_018533	ACA	2	6	207608	207613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4512	NC_018533	TGG	2	6	207629	207634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_018533	GTTT	2	8	207640	207647	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_018533	TGA	2	6	207664	207669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_018533	A	6	6	207677	207682	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_018533	TTG	2	6	207687	207692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_018533	T	6	6	207712	207717	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_018533	ATTTT	2	10	207765	207774	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_018533	AAAC	2	8	207777	207784	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4520	NC_018533	TTG	2	6	207798	207803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_018533	GAA	2	6	207823	207828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_018533	TGTAT	2	10	207862	207871	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_018533	TCG	2	6	207909	207914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4524	NC_018533	TG	3	6	207923	207928	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4525	NC_018533	AG	3	6	207929	207934	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_018533	GTG	2	6	207956	207961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_018533	ATA	2	6	207965	207970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_018533	ATT	2	6	207991	207996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4529	NC_018533	ATA	2	6	208069	208074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530078
4530	NC_018533	ATG	2	6	208077	208082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530078
4531	NC_018533	GCT	2	6	208143	208148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530078
4532	NC_018533	TTA	2	6	208223	208228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530078
4533	NC_018533	T	7	7	208253	208259	0 %	100 %	0 %	0 %	403530078
4534	NC_018533	CGA	2	6	208260	208265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530078
4535	NC_018533	ATT	2	6	208277	208282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_018533	AGC	2	6	208307	208312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4537	NC_018533	GAA	2	6	208350	208355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530079
4538	NC_018533	A	7	7	208354	208360	100 %	0 %	0 %	0 %	403530079
4539	NC_018533	TGT	2	6	208364	208369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530079
4540	NC_018533	ATT	2	6	208444	208449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530079
4541	NC_018533	GCA	2	6	208499	208504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530079
4542	NC_018533	CTTC	2	8	208704	208711	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4543	NC_018533	TGC	2	6	208759	208764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4544	NC_018533	GTTT	2	8	208839	208846	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_018533	TAG	2	6	208872	208877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_018533	CAA	2	6	208914	208919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4547	NC_018533	TCC	2	6	208981	208986	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4548	NC_018533	AT	3	6	208998	209003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_018533	TGC	2	6	209020	209025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4550	NC_018533	TTA	2	6	209029	209034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_018533	GAA	2	6	209084	209089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_018533	TA	3	6	209175	209180	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_018533	GAT	2	6	209215	209220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_018533	ACG	2	6	209245	209250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4555	NC_018533	TTA	2	6	209365	209370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_018533	CAT	2	6	209398	209403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530080
4557	NC_018533	GAAA	2	8	209406	209413	75 %	0 %	25 %	0 %	403530080
4558	NC_018533	CAC	2	6	209452	209457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403530080
4559	NC_018533	T	7	7	209460	209466	0 %	100 %	0 %	0 %	403530080
4560	NC_018533	TATTT	2	10	209481	209490	20 %	80 %	0 %	0 %	403530080
4561	NC_018533	TGT	2	6	209506	209511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530080
4562	NC_018533	TGAG	2	8	209590	209597	25 %	25 %	50 %	0 %	403530080
4563	NC_018533	TAAA	2	8	209655	209662	75 %	25 %	0 %	0 %	403530080
4564	NC_018533	TTTG	2	8	209672	209679	0 %	75 %	25 %	0 %	403530080
4565	NC_018533	GTT	2	6	209722	209727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530080
4566	NC_018533	TCA	2	6	209770	209775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530080
4567	NC_018533	TCC	2	6	209805	209810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403530080
4568	NC_018533	CTTG	2	8	209825	209832	0 %	50 %	25 %	25 %	403530080
4569	NC_018533	T	6	6	209855	209860	0 %	100 %	0 %	0 %	403530080
4570	NC_018533	CCCA	2	8	209893	209900	25 %	0 %	0 %	75 %	403530080
4571	NC_018533	TTTG	2	8	209951	209958	0 %	75 %	25 %	0 %	403530080
4572	NC_018533	GTTT	2	8	210059	210066	0 %	75 %	25 %	0 %	403530080
4573	NC_018533	AAG	2	6	210098	210103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530080
4574	NC_018533	TAT	2	6	210140	210145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530080
4575	NC_018533	ATG	3	9	210148	210156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530080
4576	NC_018533	TAT	2	6	210164	210169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530080
4577	NC_018533	CAG	2	6	210200	210205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530080
4578	NC_018533	T	7	7	210249	210255	0 %	100 %	0 %	0 %	403530080
4579	NC_018533	TG	3	6	210262	210267	0 %	50 %	50 %	0 %	403530080
4580	NC_018533	T	6	6	210269	210274	0 %	100 %	0 %	0 %	403530080
4581	NC_018533	GTT	2	6	210293	210298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530080
4582	NC_018533	T	6	6	210305	210310	0 %	100 %	0 %	0 %	403530080
4583	NC_018533	TGG	2	6	210324	210329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530080
4584	NC_018533	TTG	2	6	210330	210335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530080
4585	NC_018533	TTGT	2	8	210339	210346	0 %	75 %	25 %	0 %	403530080
4586	NC_018533	TCG	2	6	210374	210379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4587	NC_018533	AG	3	6	210418	210423	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4588	NC_018533	AT	3	6	210441	210446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_018533	ACA	2	6	210461	210466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4590	NC_018533	ATT	2	6	210479	210484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530081
4591	NC_018533	GAGAA	2	10	210492	210501	60 %	0 %	40 %	0 %	403530081
4592	NC_018533	AG	3	6	210511	210516	50 %	0 %	50 %	0 %	403530081
4593	NC_018533	TAA	2	6	210610	210615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530081
4594	NC_018533	TTG	2	6	210760	210765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530081
4595	NC_018533	TAA	2	6	210773	210778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530081
4596	NC_018533	T	6	6	210787	210792	0 %	100 %	0 %	0 %	403530081
4597	NC_018533	TTGC	2	8	210839	210846	0 %	50 %	25 %	25 %	403530081
4598	NC_018533	T	6	6	210934	210939	0 %	100 %	0 %	0 %	403530081
4599	NC_018533	AGGTT	2	10	210973	210982	20 %	40 %	40 %	0 %	403530081
4600	NC_018533	GAA	2	6	210998	211003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530081
4601	NC_018533	AGC	2	6	211008	211013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530081
4602	NC_018533	CGT	2	6	211051	211056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530081
4603	NC_018533	CAC	2	6	211163	211168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403530081
4604	NC_018533	CG	3	6	211204	211209	0 %	0 %	50 %	50 %	403530081
4605	NC_018533	T	6	6	211221	211226	0 %	100 %	0 %	0 %	403530081
4606	NC_018533	GA	3	6	211248	211253	50 %	0 %	50 %	0 %	403530081
4607	NC_018533	GAA	2	6	211328	211333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530081
4608	NC_018533	TGA	2	6	211366	211371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530081
4609	NC_018533	T	6	6	211377	211382	0 %	100 %	0 %	0 %	403530081
4610	NC_018533	CAT	2	6	211421	211426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530081
4611	NC_018533	TTG	2	6	211555	211560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530081
4612	NC_018533	TGTT	2	8	211569	211576	0 %	75 %	25 %	0 %	403530081
4613	NC_018533	ATG	2	6	211622	211627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530081
4614	NC_018533	A	6	6	211629	211634	100 %	0 %	0 %	0 %	403530081
4615	NC_018533	A	6	6	211639	211644	100 %	0 %	0 %	0 %	403530081
4616	NC_018533	AGAA	2	8	211647	211654	75 %	0 %	25 %	0 %	403530081
4617	NC_018533	GAA	2	6	211702	211707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530081
4618	NC_018533	A	7	7	211706	211712	100 %	0 %	0 %	0 %	403530081
4619	NC_018533	T	6	6	211727	211732	0 %	100 %	0 %	0 %	403530081
4620	NC_018533	TAAT	2	8	211798	211805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_018533	GAT	2	6	211839	211844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_018533	GAG	2	6	211852	211857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4623	NC_018533	T	6	6	211933	211938	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4624	NC_018533	TAAA	2	8	211961	211968	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4625	NC_018533	AGG	2	6	211992	211997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403530082
4626	NC_018533	TTC	2	6	212057	212062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530082
4627	NC_018533	CAA	2	6	212066	212071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530082
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4629	NC_018533	TGT	2	6	212124	212129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530082
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4997	NC_018533	GATA	2	8	229242	229249	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4998	NC_018533	ATG	2	6	229270	229275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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