MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Burkholderia pseudomallei BPC006 chromosome II

Total Repeats: 4030

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018529	TGCGC	2	10	45	54	0 %	20 %	40 %	40 %	403521295
2	NC_018529	TGGCT	2	10	1289	1298	0 %	40 %	40 %	20 %	403521296
3	NC_018529	GTGCG	2	10	1500	1509	0 %	20 %	60 %	20 %	403521296
4	NC_018529	GCGCC	2	10	1839	1848	0 %	0 %	40 %	60 %	403521296
5	NC_018529	CGGCA	2	10	2527	2536	20 %	0 %	40 %	40 %	403521297
6	NC_018529	CGGGC	2	10	4972	4981	0 %	0 %	60 %	40 %	403521300
7	NC_018529	CGCAT	2	10	6064	6073	20 %	20 %	20 %	40 %	403521301
8	NC_018529	TCGAA	2	10	7219	7228	40 %	20 %	20 %	20 %	403521303
9	NC_018529	ACGCG	2	10	7616	7625	20 %	0 %	40 %	40 %	403521303
10	NC_018529	CGACG	2	10	10157	10166	20 %	0 %	40 %	40 %	403521306
11	NC_018529	GTGCC	2	10	10383	10392	0 %	20 %	40 %	40 %	403521306
12	NC_018529	GCACG	2	10	10532	10541	20 %	0 %	40 %	40 %	403521306
13	NC_018529	CAGCG	2	10	14541	14550	20 %	0 %	40 %	40 %	403521312
14	NC_018529	CGGCG	2	10	14584	14593	0 %	0 %	60 %	40 %	403521312
15	NC_018529	CGCGG	2	10	15491	15500	0 %	0 %	60 %	40 %	403521313
16	NC_018529	TGCGA	2	10	19519	19528	20 %	20 %	40 %	20 %	403521320
17	NC_018529	GCGCG	2	10	19536	19545	0 %	0 %	60 %	40 %	403521320
18	NC_018529	CGATG	2	10	19664	19673	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_018529	ACGCG	2	10	19718	19727	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
20	NC_018529	CGCGC	2	10	20124	20133	0 %	0 %	40 %	60 %	403521321
21	NC_018529	CGATT	2	10	23127	23136	20 %	40 %	20 %	20 %	403521323
22	NC_018529	GCGTC	2	10	23423	23432	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
23	NC_018529	GCCGC	2	10	23731	23740	0 %	0 %	40 %	60 %	403521325
24	NC_018529	CGCGG	2	10	24768	24777	0 %	0 %	60 %	40 %	403521327
25	NC_018529	CGCAA	2	10	25027	25036	40 %	0 %	20 %	40 %	403521327
26	NC_018529	GCCGC	2	10	27345	27354	0 %	0 %	40 %	60 %	403521328
27	NC_018529	CGCGC	2	10	28788	28797	0 %	0 %	40 %	60 %	403521330
28	NC_018529	GCCGA	2	10	29804	29813	20 %	0 %	40 %	40 %	403521331
29	NC_018529	CGAGC	2	10	30554	30563	20 %	0 %	40 %	40 %	403521332
30	NC_018529	TCGCC	2	10	31419	31428	0 %	20 %	20 %	60 %	403521333
31	NC_018529	GCGTG	2	10	31634	31643	0 %	20 %	60 %	20 %	403521333
32	NC_018529	AGGCG	2	10	32339	32348	20 %	0 %	60 %	20 %	403521335
33	NC_018529	GCGCC	2	10	34443	34452	0 %	0 %	40 %	60 %	403521337
34	NC_018529	GCGAC	2	10	35736	35745	20 %	0 %	40 %	40 %	403521339
35	NC_018529	GCGCG	2	10	36278	36287	0 %	0 %	60 %	40 %	403521341
36	NC_018529	CACGG	2	10	38063	38072	20 %	0 %	40 %	40 %	403521344
37	NC_018529	CGCGA	2	10	39291	39300	20 %	0 %	40 %	40 %	403521345
38	NC_018529	GCCGC	2	10	40664	40673	0 %	0 %	40 %	60 %	403521347
39	NC_018529	GTGCG	2	10	40937	40946	0 %	20 %	60 %	20 %	403521347
40	NC_018529	ATTGC	2	10	41238	41247	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_018529	CGGAT	2	10	41753	41762	20 %	20 %	40 %	20 %	403521348
42	NC_018529	AGGCG	2	10	42941	42950	20 %	0 %	60 %	20 %	403521349
43	NC_018529	CGACG	2	10	44103	44112	20 %	0 %	40 %	40 %	403521350
44	NC_018529	CGCAC	2	10	44699	44708	20 %	0 %	20 %	60 %	403521352
45	NC_018529	CGACG	2	10	45351	45360	20 %	0 %	40 %	40 %	403521352
46	NC_018529	GCGCG	2	10	45686	45695	0 %	0 %	60 %	40 %	403521353
47	NC_018529	GCGCA	2	10	46786	46795	20 %	0 %	40 %	40 %	403521354
48	NC_018529	GCATC	2	10	46947	46956	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
49	NC_018529	CGATC	2	10	48641	48650	20 %	20 %	20 %	40 %	403521356
50	NC_018529	CGGGC	2	10	49318	49327	0 %	0 %	60 %	40 %	403521357
51	NC_018529	GAGCG	2	10	51102	51111	20 %	0 %	60 %	20 %	403521359
52	NC_018529	ATCGT	2	10	53162	53171	20 %	40 %	20 %	20 %	403521361
53	NC_018529	GAGCC	2	10	54467	54476	20 %	0 %	40 %	40 %	403521363
54	NC_018529	GCCGC	2	10	54898	54907	0 %	0 %	40 %	60 %	403521363
55	NC_018529	GCGTC	2	10	56394	56403	0 %	20 %	40 %	40 %	403521365
56	NC_018529	CGGAC	2	10	56903	56912	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
57	NC_018529	TGCGT	2	10	58341	58350	0 %	40 %	40 %	20 %	403521368
58	NC_018529	CGCGG	2	10	58947	58956	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
59	NC_018529	GGCGC	2	10	59580	59589	0 %	0 %	60 %	40 %	403521369
60	NC_018529	CGTCG	2	10	59592	59601	0 %	20 %	40 %	40 %	403521369
61	NC_018529	TCGAA	2	10	60170	60179	40 %	20 %	20 %	20 %	403521369
62	NC_018529	CCCGG	2	10	60799	60808	0 %	0 %	40 %	60 %	403521369
63	NC_018529	GCGCA	2	10	64543	64552	20 %	0 %	40 %	40 %	403521369
64	NC_018529	CGCGG	2	10	64595	64604	0 %	0 %	60 %	40 %	403521369
65	NC_018529	CTGCA	2	10	65243	65252	20 %	20 %	20 %	40 %	403521370
66	NC_018529	GGCTT	2	10	65932	65941	0 %	40 %	40 %	20 %	403521372
67	NC_018529	GCGCA	2	10	66048	66057	20 %	0 %	40 %	40 %	403521372
68	NC_018529	CGGCG	2	10	68873	68882	0 %	0 %	60 %	40 %	403521377
69	NC_018529	GGCGT	2	10	70255	70264	0 %	20 %	60 %	20 %	403521379
70	NC_018529	CGGGA	2	10	72082	72091	20 %	0 %	60 %	20 %	403521380
71	NC_018529	GATTC	2	10	72711	72720	20 %	40 %	20 %	20 %	403521380
72	NC_018529	TCGCG	2	10	72723	72732	0 %	20 %	40 %	40 %	403521380
73	NC_018529	GGCAT	2	10	72852	72861	20 %	20 %	40 %	20 %	403521380
74	NC_018529	TCCGC	2	10	73445	73454	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
75	NC_018529	CTTTT	2	10	73629	73638	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_018529	GCCGA	2	10	74171	74180	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
77	NC_018529	TCGAT	2	10	77011	77020	20 %	40 %	20 %	20 %	403521385
78	NC_018529	GCACG	2	10	77695	77704	20 %	0 %	40 %	40 %	403521386
79	NC_018529	CGGCT	2	10	77795	77804	0 %	20 %	40 %	40 %	403521386
80	NC_018529	CTTCC	2	10	78060	78069	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
81	NC_018529	TGCGC	2	10	79755	79764	0 %	20 %	40 %	40 %	403521388
82	NC_018529	CGATC	2	10	81622	81631	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
83	NC_018529	CGCGC	2	10	81940	81949	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
84	NC_018529	GGCGC	2	10	82206	82215	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
85	NC_018529	TACGC	2	10	88376	88385	20 %	20 %	20 %	40 %	403521396
86	NC_018529	GGGCA	2	10	90630	90639	20 %	0 %	60 %	20 %	403521396
87	NC_018529	ATGGA	2	10	91898	91907	40 %	20 %	40 %	0 %	403521397
88	NC_018529	GGCCG	2	10	92182	92191	0 %	0 %	60 %	40 %	403521397
89	NC_018529	GCTCG	2	10	92943	92952	0 %	20 %	40 %	40 %	403521397
90	NC_018529	CAAAC	2	10	94504	94513	60 %	0 %	0 %	40 %	403521398
91	NC_018529	ACGGC	2	10	95000	95009	20 %	0 %	40 %	40 %	403521398
92	NC_018529	GCGTG	2	10	95082	95091	0 %	20 %	60 %	20 %	403521399
93	NC_018529	CTCGT	2	10	95308	95317	0 %	40 %	20 %	40 %	403521399
94	NC_018529	GTGCG	2	10	97798	97807	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
95	NC_018529	CGTCA	2	10	97872	97881	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
96	NC_018529	GTCGG	2	10	97951	97960	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
97	NC_018529	ATCGC	2	10	98007	98016	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
98	NC_018529	CGTGA	2	10	98405	98414	20 %	20 %	40 %	20 %	403521406
99	NC_018529	GCCGC	2	10	99334	99343	0 %	0 %	40 %	60 %	403521407
100	NC_018529	CGATG	2	10	101006	101015	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
101	NC_018529	CCGCG	2	10	101104	101113	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
102	NC_018529	GGGGA	2	10	101303	101312	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018529	GCCGT	2	10	103850	103859	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
104	NC_018529	CGAGG	2	10	104457	104466	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
105	NC_018529	GGGCC	2	10	104601	104610	0 %	0 %	60 %	40 %	403521412
106	NC_018529	CGGCG	2	10	106440	106449	0 %	0 %	60 %	40 %	403521414
107	NC_018529	CGCGC	2	10	107022	107031	0 %	0 %	40 %	60 %	403521414
108	NC_018529	AAAAG	2	10	107812	107821	80 %	0 %	20 %	0 %	403521415
109	NC_018529	CGCAG	2	10	109036	109045	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
110	NC_018529	TCGGC	2	10	110847	110856	0 %	20 %	40 %	40 %	403521419
111	NC_018529	TTGCG	2	10	113116	113125	0 %	40 %	40 %	20 %	403521419
112	NC_018529	GGCGC	2	10	113216	113225	0 %	0 %	60 %	40 %	403521420
113	NC_018529	TCGAG	2	10	113775	113784	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
114	NC_018529	CGAAC	2	10	114935	114944	40 %	0 %	20 %	40 %	403521422
115	NC_018529	CGGAG	2	10	115586	115595	20 %	0 %	60 %	20 %	403521422
116	NC_018529	GGCCG	2	10	120653	120662	0 %	0 %	60 %	40 %	403521428
117	NC_018529	GATCG	2	10	121444	121453	20 %	20 %	40 %	20 %	403521429
118	NC_018529	CGCTG	2	10	122000	122009	0 %	20 %	40 %	40 %	403521429
119	NC_018529	GCGGA	2	10	122012	122021	20 %	0 %	60 %	20 %	403521429
120	NC_018529	CGAGC	2	10	124796	124805	20 %	0 %	40 %	40 %	403521430
121	NC_018529	CGGCG	2	10	125444	125453	0 %	0 %	60 %	40 %	403521430
122	NC_018529	CTGCG	2	10	127738	127747	0 %	20 %	40 %	40 %	403521433
123	NC_018529	CGGCC	2	10	128188	128197	0 %	0 %	40 %	60 %	403521433
124	NC_018529	GCGAC	2	10	128912	128921	20 %	0 %	40 %	40 %	403521433
125	NC_018529	ACGTG	2	10	130500	130509	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
126	NC_018529	GCGCG	2	10	131358	131367	0 %	0 %	60 %	40 %	403521435
127	NC_018529	CTTGC	2	10	136141	136150	0 %	40 %	20 %	40 %	403521436
128	NC_018529	GCATC	2	10	137128	137137	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
129	NC_018529	AGCGC	2	10	137358	137367	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
130	NC_018529	GGGTG	2	10	137374	137383	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018529	GCGCG	2	10	137526	137535	0 %	0 %	60 %	40 %	403521437
132	NC_018529	GCGAT	2	10	138216	138225	20 %	20 %	40 %	20 %	403521437
133	NC_018529	AGCTG	2	10	138836	138845	20 %	20 %	40 %	20 %	403521438
134	NC_018529	TTCCG	2	10	139080	139089	0 %	40 %	20 %	40 %	403521438
135	NC_018529	TTCGC	2	10	142266	142275	0 %	40 %	20 %	40 %	403521441
136	NC_018529	CGGCA	2	10	146017	146026	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
137	NC_018529	GGGCC	2	10	146492	146501	0 %	0 %	60 %	40 %	403521445
138	NC_018529	GAATG	2	10	147429	147438	40 %	20 %	40 %	0 %	403521445
139	NC_018529	GCATT	2	10	147938	147947	20 %	40 %	20 %	20 %	403521445
140	NC_018529	AGCGC	2	10	148154	148163	20 %	0 %	40 %	40 %	403521445
141	NC_018529	CGTCG	2	10	148476	148485	0 %	20 %	40 %	40 %	403521445
142	NC_018529	GCCCG	2	10	149938	149947	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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144	NC_018529	CAATC	2	10	151947	151956	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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146	NC_018529	TGCCG	2	10	152569	152578	0 %	20 %	40 %	40 %	403521451
147	NC_018529	TTCCG	2	10	154789	154798	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
148	NC_018529	ATATT	2	10	155581	155590	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018529	GTCAG	2	10	156093	156102	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
150	NC_018529	TGAAA	2	10	158534	158543	60 %	20 %	20 %	0 %	403521455
151	NC_018529	ATGCG	2	10	159109	159118	20 %	20 %	40 %	20 %	403521455
152	NC_018529	GGGCG	2	10	160085	160094	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
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157	NC_018529	CGACC	2	10	164751	164760	20 %	0 %	20 %	60 %	403521461
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166	NC_018529	CGCGC	2	10	173581	173590	0 %	0 %	40 %	60 %	403521469
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168	NC_018529	CGATT	2	10	175726	175735	20 %	40 %	20 %	20 %	403521472
169	NC_018529	TTGGA	2	10	176242	176251	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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173	NC_018529	CGCGG	2	10	182998	183007	0 %	0 %	60 %	40 %	403521481
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179	NC_018529	CGGCG	2	10	185385	185394	0 %	0 %	60 %	40 %	403521483
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183	NC_018529	CGAGC	2	10	190966	190975	20 %	0 %	40 %	40 %	403521489
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186	NC_018529	TGCGC	2	10	192643	192652	0 %	20 %	40 %	40 %	403521490
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189	NC_018529	GGCCG	2	10	195618	195627	0 %	0 %	60 %	40 %	403521492
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191	NC_018529	GGCGA	2	10	197276	197285	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
192	NC_018529	CGGCG	2	10	197678	197687	0 %	0 %	60 %	40 %	403521495
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202	NC_018529	GCGAG	2	10	203188	203197	20 %	0 %	60 %	20 %	403521501
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242	NC_018529	GGCCG	2	10	230311	230320	0 %	0 %	60 %	40 %	403521525
243	NC_018529	TCGTC	2	10	231319	231328	0 %	40 %	20 %	40 %	403521525
244	NC_018529	CGGCG	2	10	232637	232646	0 %	0 %	60 %	40 %	403521525
245	NC_018529	AAGCG	2	10	233425	233434	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
246	NC_018529	CGGCG	2	10	233947	233956	0 %	0 %	60 %	40 %	403521526
247	NC_018529	CGGCC	2	10	234488	234497	0 %	0 %	40 %	60 %	403521527
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249	NC_018529	CGCGC	2	10	235423	235432	0 %	0 %	40 %	60 %	403521528
250	NC_018529	TCGCG	2	10	236331	236340	0 %	20 %	40 %	40 %	403521529
251	NC_018529	GCGCG	2	10	236511	236520	0 %	0 %	60 %	40 %	403521529
252	NC_018529	CGATC	2	10	238031	238040	20 %	20 %	20 %	40 %	403521530
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254	NC_018529	CGCGC	2	10	238103	238112	0 %	0 %	40 %	60 %	403521530
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256	NC_018529	CGCGC	2	10	239125	239134	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
257	NC_018529	GCCGA	2	10	239750	239759	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
258	NC_018529	CGAGC	2	10	239968	239977	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
259	NC_018529	TGCCG	2	10	240210	240219	0 %	20 %	40 %	40 %	403521531
260	NC_018529	GCGAC	2	10	241793	241802	20 %	0 %	40 %	40 %	403521531
261	NC_018529	ACGGC	2	10	242258	242267	20 %	0 %	40 %	40 %	403521531
262	NC_018529	CCGCG	2	10	242871	242880	0 %	0 %	40 %	60 %	403521532
263	NC_018529	ACGCG	2	10	243913	243922	20 %	0 %	40 %	40 %	403521532
264	NC_018529	GCGTC	2	10	244017	244026	0 %	20 %	40 %	40 %	403521532
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266	NC_018529	GCGCG	2	10	244852	244861	0 %	0 %	60 %	40 %	403521532
267	NC_018529	GCGGT	2	10	244967	244976	0 %	20 %	60 %	20 %	403521532
268	NC_018529	GGCGC	2	10	246060	246069	0 %	0 %	60 %	40 %	403521533
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399	NC_018529	CGGCC	2	10	349524	349533	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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