MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Bordetella pertussis 18323

Total Repeats: 74341

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018518	TCG	2	6	29	34	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408414083
2	NC_018518	TGG	2	6	36	41	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408414083
3	NC_018518	TGC	2	6	98	103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408414083
4	NC_018518	GCG	2	6	200	205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408414083
5	NC_018518	CGA	2	6	222	227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408414083
6	NC_018518	CAG	2	6	364	369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408414083
7	NC_018518	GGT	2	6	402	407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408414083
8	NC_018518	GTG	2	6	451	456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408414083
9	NC_018518	TCC	2	6	531	536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408414083
10	NC_018518	GCC	2	6	584	589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408414083
11	NC_018518	CGC	3	9	602	610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408414083
12	NC_018518	AGC	2	6	650	655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408414083
13	NC_018518	ATC	2	6	763	768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408414083
14	NC_018518	CCA	2	6	941	946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408414083
15	NC_018518	TTC	2	6	1099	1104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408414083
16	NC_018518	GGC	3	9	1140	1148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408414083
17	NC_018518	CTG	2	6	1156	1161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408414083
18	NC_018518	GCC	2	6	1174	1179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408414083
19	NC_018518	GCC	2	6	1358	1363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408414083
20	NC_018518	TGG	2	6	1373	1378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408414083
21	NC_018518	ACG	2	6	1379	1384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408414083
22	NC_018518	GCC	2	6	1483	1488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408414083
23	NC_018518	CTG	2	6	1495	1500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408414083
24	NC_018518	CGA	2	6	1587	1592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408414083
25	NC_018518	AGC	3	9	1721	1729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408414083
26	NC_018518	ACG	2	6	1751	1756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408414083
27	NC_018518	CGG	2	6	1940	1945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408414084
28	NC_018518	CAG	3	9	2004	2012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408414084
29	NC_018518	GCT	2	6	2015	2020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408414084
30	NC_018518	GCA	2	6	2099	2104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408414084
31	NC_018518	CGC	2	6	2153	2158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408414084
32	NC_018518	CGG	3	9	2198	2206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408414084
33	NC_018518	GTG	2	6	2217	2222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408414084
34	NC_018518	CAT	2	6	2228	2233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408414084
35	NC_018518	GAA	2	6	2273	2278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408414084
36	NC_018518	GTG	2	6	2376	2381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408414084
37	NC_018518	GGT	2	6	2445	2450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408414084
38	NC_018518	TCG	2	6	2455	2460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408414084
39	NC_018518	TGG	2	6	2542	2547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408414084
40	NC_018518	GCG	2	6	2664	2669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408414085
41	NC_018518	ACC	3	9	2678	2686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408414085
42	NC_018518	AGC	2	6	2721	2726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408414085
43	NC_018518	TGC	2	6	2730	2735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408414085
44	NC_018518	CCA	2	6	2763	2768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408414085
45	NC_018518	CGG	2	6	2866	2871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408414085
46	NC_018518	ACG	2	6	2874	2879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408414085
47	NC_018518	GCC	2	6	2957	2962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408414085
48	NC_018518	GCT	2	6	3022	3027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408414085
49	NC_018518	TCA	2	6	3060	3065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408414085
50	NC_018518	CAA	2	6	3145	3150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408414085
51	NC_018518	TTG	2	6	3170	3175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408414085
52	NC_018518	GCA	3	9	3205	3213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408414085
53	NC_018518	CAC	2	6	3256	3261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408414085
54	NC_018518	GGT	2	6	3262	3267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408414085
55	NC_018518	GTG	2	6	3317	3322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408414085
56	NC_018518	GCC	2	6	3434	3439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408414086
57	NC_018518	GGC	2	6	3484	3489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408414086
58	NC_018518	CCA	2	6	3498	3503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408414086
59	NC_018518	TCG	2	6	3729	3734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408414086
60	NC_018518	GGC	2	6	3757	3762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408414086
61	NC_018518	CGT	2	6	3766	3771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408414086
62	NC_018518	GGC	2	6	3856	3861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408414086
63	NC_018518	GCT	2	6	3880	3885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408414086
64	NC_018518	GCG	2	6	3900	3905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408414086
65	NC_018518	GGC	2	6	3925	3930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408414086
66	NC_018518	CGC	2	6	3972	3977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408414086
67	NC_018518	GCG	2	6	3979	3984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408414086
68	NC_018518	GCG	2	6	3996	4001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408414086
69	NC_018518	CGG	2	6	4002	4007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408414086
70	NC_018518	GCC	2	6	4085	4090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408414086
71	NC_018518	CTG	2	6	4187	4192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_018518	AAG	2	6	4224	4229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408414087
73	NC_018518	ACA	2	6	4288	4293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408414087
74	NC_018518	CCG	2	6	4326	4331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408414087
75	NC_018518	CAT	2	6	4436	4441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408414087
76	NC_018518	ATC	2	6	4494	4499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408414087
77	NC_018518	AAG	2	6	4543	4548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408414087
78	NC_018518	CGA	2	6	4574	4579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408414087
79	NC_018518	CGC	2	6	4583	4588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408414087
80	NC_018518	CGC	2	6	4656	4661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408414087
81	NC_018518	CGA	2	6	4667	4672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408414087
82	NC_018518	GCC	2	6	4695	4700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408414087
83	NC_018518	CCA	2	6	4726	4731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408414087
84	NC_018518	CTG	2	6	4737	4742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408414087
85	NC_018518	TGC	2	6	4777	4782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408414087
86	NC_018518	GCC	2	6	4833	4838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408414087
87	NC_018518	CGC	2	6	4931	4936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408414087
88	NC_018518	AAG	2	6	4944	4949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408414087
89	NC_018518	ATC	2	6	4999	5004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408414087
90	NC_018518	GCT	2	6	5090	5095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408414087
91	NC_018518	CGG	2	6	5166	5171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_018518	GCG	2	6	5204	5209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_018518	GGC	2	6	5247	5252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_018518	GGC	2	6	5336	5341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_018518	CGC	3	9	5355	5363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_018518	CGA	2	6	5370	5375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_018518	GGT	2	6	5469	5474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018518	GCT	2	6	5475	5480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_018518	TGA	2	6	5591	5596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018518	GCC	2	6	5635	5640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_018518	CGC	2	6	5649	5654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_018518	GCC	2	6	5734	5739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_018518	GCT	2	6	5745	5750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_018518	GCA	2	6	5769	5774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_018518	GGT	2	6	5943	5948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018518	CGA	3	9	5997	6005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_018518	GCC	2	6	6022	6027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_018518	TGC	2	6	6056	6061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_018518	GTT	2	6	6108	6113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018518	GCG	2	6	6133	6138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_018518	CGG	2	6	6154	6159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_018518	GCC	2	6	6164	6169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_018518	GGA	2	6	6236	6241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018518	CCT	2	6	6311	6316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_018518	CCA	2	6	6317	6322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_018518	AGC	2	6	6372	6377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_018518	GGA	2	6	6482	6487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018518	ACG	2	6	6552	6557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_018518	TTC	3	9	6678	6686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_018518	ACG	2	6	6797	6802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408414088
121	NC_018518	CGG	2	6	6807	6812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408414088
122	NC_018518	ACG	2	6	6818	6823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408414088
123	NC_018518	CGG	2	6	6841	6846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408414088
124	NC_018518	GAA	2	6	6988	6993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408414088
125	NC_018518	TGC	2	6	7006	7011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408414088
126	NC_018518	TGG	2	6	7032	7037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408414088
127	NC_018518	CAT	2	6	7111	7116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408414088
128	NC_018518	TGA	2	6	7144	7149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408414088
129	NC_018518	GCT	2	6	7156	7161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408414088
130	NC_018518	TGG	2	6	7167	7172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408414088
131	NC_018518	CTG	2	6	7190	7195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408414088
132	NC_018518	GGT	2	6	7405	7410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408414088
133	NC_018518	GCG	2	6	7428	7433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408414088
134	NC_018518	GAC	2	6	7486	7491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408414088
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140	NC_018518	TGC	2	6	7779	7784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408414088
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147	NC_018518	CGG	2	6	8131	8136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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258	NC_018518	GGC	2	6	14635	14640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408414095
259	NC_018518	CGA	2	6	14727	14732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408414095
260	NC_018518	CCA	2	6	14784	14789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408414095
261	NC_018518	AAG	2	6	14818	14823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408414095
262	NC_018518	CGA	2	6	14835	14840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408414095
263	NC_018518	GCC	2	6	14844	14849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408414095
264	NC_018518	GAT	2	6	14862	14867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408414095
265	NC_018518	GCC	2	6	14891	14896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408414095
266	NC_018518	CAA	2	6	14931	14936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408414095
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279	NC_018518	TGG	2	6	15458	15463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408414095
280	NC_018518	CAG	2	6	15511	15516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408414095
281	NC_018518	GGC	2	6	15523	15528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408414095
282	NC_018518	CGG	2	6	15540	15545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408414095
283	NC_018518	CCT	2	6	15593	15598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408414095
284	NC_018518	CGA	2	6	15630	15635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408414095
285	NC_018518	TGA	2	6	15772	15777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408414095
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287	NC_018518	CGC	2	6	16228	16233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408414096
288	NC_018518	GAC	2	6	16260	16265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408414096
289	NC_018518	CGA	2	6	16292	16297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408414096
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291	NC_018518	GCG	2	6	16378	16383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408414096
292	NC_018518	CCA	2	6	16393	16398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408414096
293	NC_018518	AAG	2	6	16416	16421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408414096
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297	NC_018518	CCG	2	6	16580	16585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408414096
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303	NC_018518	CAA	2	6	16730	16735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408414096
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324	NC_018518	ATC	2	6	18033	18038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408414096
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329	NC_018518	CGC	2	6	18527	18532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408414096
330	NC_018518	CGA	2	6	18731	18736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408414096
331	NC_018518	GCG	2	6	18871	18876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408414096
332	NC_018518	GAA	2	6	18897	18902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408414096
333	NC_018518	CGA	2	6	18926	18931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408414096
334	NC_018518	CAG	2	6	19110	19115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408414096
335	NC_018518	AGA	2	6	19159	19164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408414096
336	NC_018518	CGG	2	6	19178	19183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408414096
337	NC_018518	AGC	2	6	19288	19293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408414096
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341	NC_018518	TCG	2	6	19399	19404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408414096
342	NC_018518	TCG	2	6	19468	19473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408414096
343	NC_018518	TGC	2	6	19549	19554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408414096
344	NC_018518	TCG	2	6	19567	19572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408414096
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348	NC_018518	GCG	2	6	19773	19778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408414096
349	NC_018518	CGA	2	6	19793	19798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408414096
350	NC_018518	TCG	2	6	19825	19830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408414096
351	NC_018518	GCC	2	6	19914	19919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408414096
352	NC_018518	CGG	2	6	19961	19966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408414096
353	NC_018518	GCC	2	6	19983	19988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408414096
354	NC_018518	GAC	2	6	20001	20006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408414096
355	NC_018518	GCC	2	6	20326	20331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408414097
356	NC_018518	CGG	2	6	20353	20358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408414097
357	NC_018518	GCG	2	6	20419	20424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408414097
358	NC_018518	GGA	2	6	20516	20521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408414097
359	NC_018518	ATG	2	6	20530	20535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408414097
360	NC_018518	ATA	2	6	20617	20622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
361	NC_018518	GGC	2	6	20630	20635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
362	NC_018518	GAC	2	6	20671	20676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
363	NC_018518	CGC	2	6	20783	20788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408414098
364	NC_018518	CTG	2	6	20901	20906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408414098
365	NC_018518	GCG	2	6	20956	20961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408414098
366	NC_018518	CTG	2	6	21009	21014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408414098
367	NC_018518	GGC	2	6	21026	21031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408414098
368	NC_018518	GGA	2	6	21086	21091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408414098
369	NC_018518	GCC	3	9	21163	21171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408414098
370	NC_018518	GCG	2	6	21177	21182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408414098
371	NC_018518	ACG	2	6	21199	21204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408414098
372	NC_018518	CCG	2	6	21343	21348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408414098
373	NC_018518	CCG	2	6	21375	21380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408414098
374	NC_018518	CGA	2	6	21386	21391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408414098
375	NC_018518	ACG	2	6	21397	21402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408414098
376	NC_018518	CGG	2	6	21424	21429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408414098
377	NC_018518	GCA	2	6	21433	21438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408414098
378	NC_018518	CTG	2	6	21453	21458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408414098
379	NC_018518	TGG	2	6	21489	21494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408414098
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381	NC_018518	GAC	2	6	21545	21550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408414098
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