MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis HD-789 plasmid p04

Total Repeats: 52

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018517	TCTT	2	8	150	157	0 %	75 %	0 %	25 %	434380363
2	NC_018517	CAAT	2	8	209	216	50 %	25 %	0 %	25 %	434380363
3	NC_018517	TTGA	2	8	1706	1713	25 %	50 %	25 %	0 %	434380364
4	NC_018517	CTTG	2	8	1866	1873	0 %	50 %	25 %	25 %	434380365
5	NC_018517	TAAA	2	8	1991	1998	75 %	25 %	0 %	0 %	434380365
6	NC_018517	TTCA	2	8	2010	2017	25 %	50 %	0 %	25 %	434380365
7	NC_018517	TTCC	2	8	2084	2091	0 %	50 %	0 %	50 %	434380365
8	NC_018517	AGAT	2	8	2613	2620	50 %	25 %	25 %	0 %	434380365
9	NC_018517	CTTT	2	8	3315	3322	0 %	75 %	0 %	25 %	434380367
10	NC_018517	CTCC	2	8	3458	3465	0 %	25 %	0 %	75 %	434380367
11	NC_018517	CTTC	2	8	3479	3486	0 %	50 %	0 %	50 %	434380367
12	NC_018517	CCGC	2	8	3581	3588	0 %	0 %	25 %	75 %	434380367
13	NC_018517	AAAT	2	8	3793	3800	75 %	25 %	0 %	0 %	434380367
14	NC_018517	GCCC	2	8	4113	4120	0 %	0 %	25 %	75 %	434380368
15	NC_018517	ATTA	2	8	4170	4177	50 %	50 %	0 %	0 %	434380368
16	NC_018517	TCTT	2	8	4249	4256	0 %	75 %	0 %	25 %	434380368
17	NC_018517	AAAT	2	8	4947	4954	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018517	CGTT	2	8	5258	5265	0 %	50 %	25 %	25 %	434380370
19	NC_018517	TTTC	2	8	5517	5524	0 %	75 %	0 %	25 %	434380370
20	NC_018517	ATTG	2	8	5752	5759	25 %	50 %	25 %	0 %	434380371
21	NC_018517	AATT	2	8	5860	5867	50 %	50 %	0 %	0 %	434380371
22	NC_018517	GTCT	2	8	5998	6005	0 %	50 %	25 %	25 %	434380372
23	NC_018517	TGTT	2	8	7155	7162	0 %	75 %	25 %	0 %	434380373
24	NC_018517	GCTT	2	8	7287	7294	0 %	50 %	25 %	25 %	434380374
25	NC_018517	AATA	2	8	8195	8202	75 %	25 %	0 %	0 %	434380375
26	NC_018517	TCCG	2	8	8474	8481	0 %	25 %	25 %	50 %	434380376
27	NC_018517	GCTT	2	8	8507	8514	0 %	50 %	25 %	25 %	434380376
28	NC_018517	AACG	2	8	8635	8642	50 %	0 %	25 %	25 %	434380376
29	NC_018517	CTCG	2	8	8702	8709	0 %	25 %	25 %	50 %	434380376
30	NC_018517	TTGA	2	8	8814	8821	25 %	50 %	25 %	0 %	434380377
31	NC_018517	CTTT	2	8	8960	8967	0 %	75 %	0 %	25 %	434380377
32	NC_018517	CTTC	2	8	9655	9662	0 %	50 %	0 %	50 %	434380378
33	NC_018517	TGTT	2	8	10004	10011	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018517	ACGA	2	8	10032	10039	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_018517	TTTA	2	8	10913	10920	25 %	75 %	0 %	0 %	434380380
36	NC_018517	AATT	2	8	10951	10958	50 %	50 %	0 %	0 %	434380380
37	NC_018517	TTCA	2	8	10979	10986	25 %	50 %	0 %	25 %	434380380
38	NC_018517	TTGG	2	8	11203	11210	0 %	50 %	50 %	0 %	434380380
39	NC_018517	AAAT	2	8	11653	11660	75 %	25 %	0 %	0 %	434380380
40	NC_018517	AAAG	2	8	11904	11911	75 %	0 %	25 %	0 %	434380380
41	NC_018517	TCTT	2	8	12135	12142	0 %	75 %	0 %	25 %	434380380
42	NC_018517	CTTT	2	8	12814	12821	0 %	75 %	0 %	25 %	434380381
43	NC_018517	TACT	2	8	13315	13322	25 %	50 %	0 %	25 %	434380381
44	NC_018517	CTTT	2	8	13394	13401	0 %	75 %	0 %	25 %	434380381
45	NC_018517	TTTC	2	8	13442	13449	0 %	75 %	0 %	25 %	434380381
46	NC_018517	CTTT	2	8	13593	13600	0 %	75 %	0 %	25 %	434380382
47	NC_018517	TCAT	2	8	13861	13868	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_018517	TTTC	2	8	14084	14091	0 %	75 %	0 %	25 %	434380383
49	NC_018517	AGAT	2	8	14273	14280	50 %	25 %	25 %	0 %	434380383
50	NC_018517	TATT	2	8	14315	14322	25 %	75 %	0 %	0 %	434380383
51	NC_018517	TTTG	2	8	14463	14470	0 %	75 %	25 %	0 %	434380384
52	NC_018517	CAGT	2	8	14558	14565	25 %	25 %	25 %	25 %	434380384

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.