MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus thuringiensis HD-789 plasmid p01

Total Repeats: 7458

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018516	A	9	9	21812	21820	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_018516	CT	3	6	21838	21843	0 %	50 %	0 %	50 %	434379941
503	NC_018516	TGAT	2	8	21847	21854	25 %	50 %	25 %	0 %	434379941
504	NC_018516	A	6	6	21860	21865	100 %	0 %	0 %	0 %	434379941
505	NC_018516	TCT	2	6	21904	21909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379941
506	NC_018516	ATACT	2	10	21997	22006	40 %	40 %	0 %	20 %	434379941
507	NC_018516	TCT	2	6	22039	22044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379941
508	NC_018516	ACT	2	6	22066	22071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379941
509	NC_018516	CTAT	2	8	22117	22124	25 %	50 %	0 %	25 %	434379941
510	NC_018516	ACA	2	6	22152	22157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434379941
511	NC_018516	CTT	2	6	22184	22189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379941
512	NC_018516	AAC	2	6	22231	22236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434379941
513	NC_018516	TCT	2	6	22270	22275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379941
514	NC_018516	TTA	2	6	22351	22356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_018516	ATAAA	2	10	22388	22397	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_018516	TACCC	2	10	22410	22419	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
517	NC_018516	TA	3	6	22428	22433	50 %	50 %	0 %	0 %	434379942
518	NC_018516	CAA	2	6	22459	22464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434379942
519	NC_018516	TTG	2	6	22528	22533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434379942
520	NC_018516	ACA	2	6	22566	22571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434379942
521	NC_018516	CAC	2	6	22573	22578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434379942
522	NC_018516	TCT	2	6	22617	22622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379942
523	NC_018516	CTT	2	6	22639	22644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379942
524	NC_018516	CTT	2	6	22867	22872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379942
525	NC_018516	AT	3	6	22939	22944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_018516	TAT	2	6	22975	22980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_018516	GGTT	2	8	23159	23166	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
528	NC_018516	TC	3	6	23309	23314	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
529	NC_018516	AC	3	6	23367	23372	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
530	NC_018516	TAT	2	6	23421	23426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_018516	CCT	2	6	23468	23473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
532	NC_018516	TAAA	2	8	23498	23505	75 %	25 %	0 %	0 %	434379943
533	NC_018516	CTA	2	6	23564	23569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379943
534	NC_018516	GAA	2	6	23721	23726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434379943
535	NC_018516	TCT	3	9	23746	23754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379943
536	NC_018516	TTTC	2	8	23761	23768	0 %	75 %	0 %	25 %	434379943
537	NC_018516	TG	3	6	23903	23908	0 %	50 %	50 %	0 %	434379943
538	NC_018516	TGT	2	6	23974	23979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434379943
539	NC_018516	CAT	2	6	24011	24016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379943
540	NC_018516	TCT	2	6	24020	24025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379943
541	NC_018516	AAC	2	6	24066	24071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434379943
542	NC_018516	CCA	2	6	24094	24099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434379943
543	NC_018516	AGT	2	6	24143	24148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379943
544	NC_018516	TTC	3	9	24159	24167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379943
545	NC_018516	CTTG	2	8	24172	24179	0 %	50 %	25 %	25 %	434379943
546	NC_018516	ATT	2	6	24180	24185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379943
547	NC_018516	TC	3	6	24189	24194	0 %	50 %	0 %	50 %	434379943
548	NC_018516	TC	3	6	24226	24231	0 %	50 %	0 %	50 %	434379943
549	NC_018516	TTC	2	6	24300	24305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379943
550	NC_018516	TCAT	2	8	24364	24371	25 %	50 %	0 %	25 %	434379943
551	NC_018516	TTTGG	2	10	24470	24479	0 %	60 %	40 %	0 %	434379943
552	NC_018516	TGTGGT	2	12	24514	24525	0 %	50 %	50 %	0 %	434379943
553	NC_018516	CAT	2	6	24543	24548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379943
554	NC_018516	TTC	2	6	24555	24560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379943
555	NC_018516	TCT	2	6	24637	24642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379943
556	NC_018516	TCT	2	6	24664	24669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379943
557	NC_018516	AGA	2	6	24720	24725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434379943
558	NC_018516	TTG	2	6	24731	24736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434379943
559	NC_018516	CTCTTC	2	12	24765	24776	0 %	50 %	0 %	50 %	434379943
560	NC_018516	CTA	2	6	24884	24889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379943
561	NC_018516	AAG	2	6	24931	24936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434379943
562	NC_018516	TGA	2	6	24964	24969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379943
563	NC_018516	AGT	2	6	25055	25060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379943
564	NC_018516	ATT	2	6	25239	25244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379943
565	NC_018516	TAAG	2	8	25251	25258	50 %	25 %	25 %	0 %	434379943
566	NC_018516	GAA	2	6	25263	25268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434379943
567	NC_018516	TACT	2	8	25289	25296	25 %	50 %	0 %	25 %	434379943
568	NC_018516	CTT	2	6	25352	25357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379943
569	NC_018516	TA	3	6	25454	25459	50 %	50 %	0 %	0 %	434379943
570	NC_018516	CCT	2	6	25510	25515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	434379943
571	NC_018516	CTT	2	6	25607	25612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379943
572	NC_018516	TTAA	2	8	25720	25727	50 %	50 %	0 %	0 %	434379943
573	NC_018516	AGTT	2	8	25901	25908	25 %	50 %	25 %	0 %	434379943
574	NC_018516	ACC	2	6	25953	25958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434379943
575	NC_018516	AGTAAA	2	12	26005	26016	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	434379943
576	NC_018516	GAT	2	6	26028	26033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379943
577	NC_018516	CAC	2	6	26086	26091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434379943
578	NC_018516	GCC	2	6	26236	26241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434379943
579	NC_018516	ATGT	2	8	26528	26535	25 %	50 %	25 %	0 %	434379943
580	NC_018516	CCA	2	6	26599	26604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434379943
581	NC_018516	CCAT	2	8	26620	26627	25 %	25 %	0 %	50 %	434379943
582	NC_018516	ATA	2	6	26638	26643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434379943
583	NC_018516	TTG	2	6	26663	26668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434379943
584	NC_018516	ACA	2	6	26827	26832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434379943
585	NC_018516	TCT	2	6	26854	26859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379943
586	NC_018516	TTA	2	6	26896	26901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379943
587	NC_018516	ACC	2	6	26958	26963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434379943
588	NC_018516	ATA	2	6	27042	27047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434379943
589	NC_018516	TCT	2	6	27073	27078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379943
590	NC_018516	ACC	2	6	27249	27254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434379943
591	NC_018516	TGAA	2	8	27313	27320	50 %	25 %	25 %	0 %	434379943
592	NC_018516	TTC	2	6	27336	27341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379943
593	NC_018516	TCT	2	6	27358	27363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379943
594	NC_018516	TTG	2	6	27417	27422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434379943
595	NC_018516	AAGT	2	8	27459	27466	50 %	25 %	25 %	0 %	434379943
596	NC_018516	CTT	2	6	27488	27493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379943
597	NC_018516	ACC	2	6	27510	27515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434379943
598	NC_018516	TCT	2	6	27541	27546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379943
599	NC_018516	CAAA	2	8	27596	27603	75 %	0 %	0 %	25 %	434379943
600	NC_018516	AAG	2	6	27634	27639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434379943
601	NC_018516	TTC	2	6	27654	27659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379943
602	NC_018516	TTC	2	6	27684	27689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379943
603	NC_018516	TGT	2	6	27753	27758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434379943
604	NC_018516	CTGTTT	2	12	27794	27805	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	434379943
605	NC_018516	CCT	2	6	27822	27827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
606	NC_018516	TTTC	2	8	27884	27891	0 %	75 %	0 %	25 %	434379944
607	NC_018516	GTTT	2	8	27921	27928	0 %	75 %	25 %	0 %	434379944
608	NC_018516	TTTA	2	8	28014	28021	25 %	75 %	0 %	0 %	434379944
609	NC_018516	TTAA	2	8	28042	28049	50 %	50 %	0 %	0 %	434379944
610	NC_018516	CTT	3	9	28070	28078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379944
611	NC_018516	TGG	2	6	28207	28212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434379944
612	NC_018516	TCT	2	6	28216	28221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379944
613	NC_018516	TTC	2	6	28227	28232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379944
614	NC_018516	TCT	2	6	28237	28242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379944
615	NC_018516	CAT	2	6	28271	28276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379944
616	NC_018516	TCT	2	6	28300	28305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379944
617	NC_018516	TTC	3	9	28320	28328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379944
618	NC_018516	TC	3	6	28356	28361	0 %	50 %	0 %	50 %	434379944
619	NC_018516	CTGT	2	8	28428	28435	0 %	50 %	25 %	25 %	434379944
620	NC_018516	TTA	2	6	28444	28449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379944
621	NC_018516	GAA	2	6	28469	28474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434379944
622	NC_018516	CT	3	6	28582	28587	0 %	50 %	0 %	50 %	434379944
623	NC_018516	CTGCT	2	10	28590	28599	0 %	40 %	20 %	40 %	434379944
624	NC_018516	ATTTC	2	10	28636	28645	20 %	60 %	0 %	20 %	434379944
625	NC_018516	TCAA	2	8	28732	28739	50 %	25 %	0 %	25 %	434379944
626	NC_018516	CTG	2	6	28841	28846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434379944
627	NC_018516	TGGT	2	8	28926	28933	0 %	50 %	50 %	0 %	434379944
628	NC_018516	TAAG	2	8	29022	29029	50 %	25 %	25 %	0 %	434379944
629	NC_018516	TCT	2	6	29068	29073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379944
630	NC_018516	TCT	2	6	29077	29082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379944
631	NC_018516	TAC	2	6	29126	29131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379944
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886	NC_018516	AGA	2	6	41440	41445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
887	NC_018516	A	7	7	41451	41457	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
888	NC_018516	TTA	2	6	41511	41516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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891	NC_018516	AAC	2	6	41715	41720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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