MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus thuringiensis HD-789 plasmid p01

Total Repeats: 7458

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_018516	TCT	2	6	281770	281775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380247
6002	NC_018516	AT	3	6	281795	281800	50 %	50 %	0 %	0 %	434380247
6003	NC_018516	CT	3	6	281839	281844	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6004	NC_018516	CAT	2	6	281858	281863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6005	NC_018516	TAC	2	6	281877	281882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6006	NC_018516	ATT	2	6	281908	281913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_018516	CT	3	6	281937	281942	0 %	50 %	0 %	50 %	434380248
6008	NC_018516	GAA	2	6	281974	281979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434380248
6009	NC_018516	TCTT	2	8	281987	281994	0 %	75 %	0 %	25 %	434380248
6010	NC_018516	GTA	2	6	282010	282015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380248
6011	NC_018516	TGT	2	6	282049	282054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434380248
6012	NC_018516	TTGA	2	8	282061	282068	25 %	50 %	25 %	0 %	434380248
6013	NC_018516	TTGTT	2	10	282193	282202	0 %	80 %	20 %	0 %	434380248
6014	NC_018516	ATA	2	6	282203	282208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380248
6015	NC_018516	TCTAC	2	10	282239	282248	20 %	40 %	0 %	40 %	434380248
6016	NC_018516	CCA	2	6	282287	282292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434380248
6017	NC_018516	TTG	2	6	282376	282381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434380248
6018	NC_018516	AGA	2	6	282414	282419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434380248
6019	NC_018516	TAC	2	6	282427	282432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380248
6020	NC_018516	CTA	2	6	282450	282455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380248
6021	NC_018516	TCCT	2	8	282505	282512	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6022	NC_018516	TCT	2	6	282522	282527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380249
6023	NC_018516	CAC	2	6	282562	282567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434380249
6024	NC_018516	AAC	2	6	282599	282604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434380249
6025	NC_018516	ACC	2	6	282626	282631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434380249
6026	NC_018516	TAT	2	6	282667	282672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380249
6027	NC_018516	TGA	2	6	282693	282698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380249
6028	NC_018516	TCATAC	2	12	282720	282731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380249
6029	NC_018516	TCT	2	6	282777	282782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380249
6030	NC_018516	TTTCC	2	10	282837	282846	0 %	60 %	0 %	40 %	434380249
6031	NC_018516	TTA	2	6	282894	282899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380249
6032	NC_018516	CCT	2	6	282951	282956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	434380249
6033	NC_018516	TGCTTT	2	12	283070	283081	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	434380249
6034	NC_018516	ACA	2	6	283149	283154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434380249
6035	NC_018516	CTT	2	6	283301	283306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6036	NC_018516	CTA	2	6	283314	283319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6037	NC_018516	CAA	2	6	283559	283564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434380250
6038	NC_018516	CTT	2	6	283641	283646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380250
6039	NC_018516	TAA	2	6	283656	283661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380250
6040	NC_018516	GGGT	2	8	283665	283672	0 %	25 %	75 %	0 %	434380250
6041	NC_018516	TTTG	2	8	283719	283726	0 %	75 %	25 %	0 %	434380250
6042	NC_018516	CAT	2	6	283797	283802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380250
6043	NC_018516	CTG	2	6	283808	283813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434380250
6044	NC_018516	CTA	2	6	283840	283845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380250
6045	NC_018516	TG	3	6	283886	283891	0 %	50 %	50 %	0 %	434380250
6046	NC_018516	AACC	2	8	283927	283934	50 %	0 %	0 %	50 %	434380250
6047	NC_018516	TA	3	6	283979	283984	50 %	50 %	0 %	0 %	434380250
6048	NC_018516	TTG	2	6	283994	283999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434380250
6049	NC_018516	CTT	2	6	284039	284044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380250
6050	NC_018516	AATA	2	8	284072	284079	75 %	25 %	0 %	0 %	434380250
6051	NC_018516	CTT	2	6	284243	284248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380250
6052	NC_018516	TCA	2	6	284260	284265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380250
6053	NC_018516	CTT	2	6	284384	284389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380250
6054	NC_018516	TTC	2	6	284400	284405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380250
6055	NC_018516	TCT	2	6	284408	284413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380250
6056	NC_018516	CTA	2	6	284420	284425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380250
6057	NC_018516	TCT	2	6	284452	284457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380250
6058	NC_018516	TTC	2	6	284475	284480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380250
6059	NC_018516	CTT	2	6	284496	284501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380250
6060	NC_018516	TCT	2	6	284515	284520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380250
6061	NC_018516	ACT	2	6	284521	284526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380250
6062	NC_018516	CTT	2	6	284540	284545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380250
6063	NC_018516	CTT	2	6	284573	284578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380250
6064	NC_018516	TTTA	2	8	284595	284602	25 %	75 %	0 %	0 %	434380250
6065	NC_018516	TCT	3	9	284632	284640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380250
6066	NC_018516	GT	3	6	284693	284698	0 %	50 %	50 %	0 %	434380250
6067	NC_018516	AGT	2	6	284725	284730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380250
6068	NC_018516	TAAT	2	8	284774	284781	50 %	50 %	0 %	0 %	434380250
6069	NC_018516	TTC	2	6	284782	284787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380250
6070	NC_018516	TATC	2	8	284825	284832	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6071	NC_018516	ATTAC	2	10	284847	284856	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6072	NC_018516	TAT	2	6	284857	284862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6073	NC_018516	TTA	2	6	284901	284906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_018516	CTA	2	6	284916	284921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6075	NC_018516	AGA	2	6	284937	284942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_018516	TCT	2	6	284947	284952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6077	NC_018516	ACAG	2	8	284958	284965	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6078	NC_018516	CTAT	2	8	285029	285036	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6079	NC_018516	TAT	2	6	285092	285097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_018516	TCTTA	2	10	285104	285113	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6081	NC_018516	ATA	2	6	285134	285139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_018516	AG	3	6	285174	285179	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_018516	TC	3	6	285201	285206	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6084	NC_018516	TAT	2	6	285219	285224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380251
6085	NC_018516	GAATAC	2	12	285245	285256	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	434380251
6086	NC_018516	CCA	2	6	285258	285263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434380251
6087	NC_018516	CAATG	2	10	285269	285278	40 %	20 %	20 %	20 %	434380251
6088	NC_018516	GTA	2	6	285300	285305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380251
6089	NC_018516	GTT	2	6	285373	285378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434380251
6090	NC_018516	CAT	2	6	285427	285432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380251
6091	NC_018516	CTA	2	6	285451	285456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380251
6092	NC_018516	TAC	2	6	285485	285490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380251
6093	NC_018516	GTTT	2	8	285610	285617	0 %	75 %	25 %	0 %	434380251
6094	NC_018516	TTTG	2	8	285707	285714	0 %	75 %	25 %	0 %	434380251
6095	NC_018516	TAG	2	6	285745	285750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380251
6096	NC_018516	ACA	2	6	285855	285860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434380251
6097	NC_018516	CTT	2	6	285862	285867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380251
6098	NC_018516	TTTC	2	8	285919	285926	0 %	75 %	0 %	25 %	434380251
6099	NC_018516	CTG	2	6	285946	285951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434380251
6100	NC_018516	CTT	2	6	285955	285960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380251
6101	NC_018516	AAG	2	6	285971	285976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434380251
6102	NC_018516	GTTT	2	8	285979	285986	0 %	75 %	25 %	0 %	434380251
6103	NC_018516	TAC	2	6	286013	286018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380251
6104	NC_018516	TTTG	2	8	286076	286083	0 %	75 %	25 %	0 %	434380251
6105	NC_018516	TG	3	6	286082	286087	0 %	50 %	50 %	0 %	434380251
6106	NC_018516	ACC	2	6	286097	286102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434380251
6107	NC_018516	ACA	2	6	286224	286229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434380251
6108	NC_018516	CAG	2	6	286297	286302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434380251
6109	NC_018516	CTT	2	6	286324	286329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380251
6110	NC_018516	CTA	2	6	286336	286341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380251
6111	NC_018516	TAG	2	6	286354	286359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380251
6112	NC_018516	TAC	2	6	286382	286387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380251
6113	NC_018516	GAAT	2	8	286452	286459	50 %	25 %	25 %	0 %	434380251
6114	NC_018516	TCT	2	6	286473	286478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380251
6115	NC_018516	TAG	2	6	286483	286488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380251
6116	NC_018516	CTA	2	6	286558	286563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380251
6117	NC_018516	TAC	2	6	286592	286597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380251
6118	NC_018516	CTT	2	6	286828	286833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380251
6119	NC_018516	TAG	2	6	286852	286857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380251
6120	NC_018516	TGT	2	6	286859	286864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434380251
6121	NC_018516	TA	3	6	286945	286950	50 %	50 %	0 %	0 %	434380251
6122	NC_018516	ACT	2	6	286965	286970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380251
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6494	NC_018516	TCA	2	6	304340	304345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380269
6495	NC_018516	CTT	2	6	304353	304358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380269
6496	NC_018516	TCT	2	6	304367	304372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380269
6497	NC_018516	TTC	2	6	304399	304404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380269
6498	NC_018516	TTG	2	6	304422	304427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434380269
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6500	NC_018516	TAC	2	6	304519	304524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380269

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