MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus thuringiensis HD-789 plasmid p02

Total Repeats: 5338

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_018509	TCAA	2	8	220958	220965	50 %	25 %	0 %	25 %	434379499
5002	NC_018509	TC	3	6	220966	220971	0 %	50 %	0 %	50 %	434379499
5003	NC_018509	TCT	2	6	220976	220981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379499
5004	NC_018509	GA	3	6	221066	221071	50 %	0 %	50 %	0 %	434379499
5005	NC_018509	TGT	2	6	221074	221079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434379499
5006	NC_018509	TGTA	2	8	221105	221112	25 %	50 %	25 %	0 %	434379499
5007	NC_018509	ATT	2	6	221186	221191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379499
5008	NC_018509	T	6	6	221219	221224	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_018509	GAAT	2	8	221235	221242	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_018509	AAG	2	6	221355	221360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_018509	TGA	2	6	221364	221369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_018509	AAG	2	6	221417	221422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434379500
5013	NC_018509	TTAC	2	8	221484	221491	25 %	50 %	0 %	25 %	434379500
5014	NC_018509	TAG	2	6	221569	221574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379500
5015	NC_018509	GAA	2	6	221613	221618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434379500
5016	NC_018509	TCA	2	6	221650	221655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379500
5017	NC_018509	TGAGT	2	10	221659	221668	20 %	40 %	40 %	0 %	434379500
5018	NC_018509	AAAG	2	8	221696	221703	75 %	0 %	25 %	0 %	434379500
5019	NC_018509	AGA	2	6	221707	221712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434379500
5020	NC_018509	GGAT	2	8	221757	221764	25 %	25 %	50 %	0 %	434379501
5021	NC_018509	AAG	2	6	221786	221791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434379501
5022	NC_018509	ATT	2	6	221879	221884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379501
5023	NC_018509	GGA	2	6	221910	221915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434379501
5024	NC_018509	GCT	2	6	221938	221943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434379501
5025	NC_018509	GCT	2	6	221977	221982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434379501
5026	NC_018509	ACT	2	6	221999	222004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379501
5027	NC_018509	AGA	2	6	222036	222041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434379501
5028	NC_018509	TGC	2	6	222054	222059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434379501
5029	NC_018509	AAAG	2	8	222093	222100	75 %	0 %	25 %	0 %	434379501
5030	NC_018509	TTAG	2	8	222190	222197	25 %	50 %	25 %	0 %	434379501
5031	NC_018509	TGG	2	6	222276	222281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434379501
5032	NC_018509	GCT	2	6	222346	222351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434379501
5033	NC_018509	GTG	2	6	222353	222358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434379501
5034	NC_018509	GGA	2	6	222381	222386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434379501
5035	NC_018509	A	7	7	222483	222489	100 %	0 %	0 %	0 %	434379501
5036	NC_018509	TTC	2	6	222553	222558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379501
5037	NC_018509	AACAA	2	10	222569	222578	80 %	0 %	0 %	20 %	434379501
5038	NC_018509	AGTT	2	8	222665	222672	25 %	50 %	25 %	0 %	434379501
5039	NC_018509	GTTA	2	8	222723	222730	25 %	50 %	25 %	0 %	434379501
5040	NC_018509	AAAC	2	8	222779	222786	75 %	0 %	0 %	25 %	434379501
5041	NC_018509	AAC	2	6	222794	222799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434379501
5042	NC_018509	GGC	2	6	222817	222822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434379501
5043	NC_018509	AAG	2	6	222974	222979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434379501
5044	NC_018509	AGA	2	6	223140	223145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434379501
5045	NC_018509	AAAG	2	8	223219	223226	75 %	0 %	25 %	0 %	434379501
5046	NC_018509	AAC	2	6	223293	223298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434379501
5047	NC_018509	CAA	2	6	223355	223360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434379501
5048	NC_018509	ACT	2	6	223525	223530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379501
5049	NC_018509	CTTA	2	8	223544	223551	25 %	50 %	0 %	25 %	434379501
5050	NC_018509	TTC	2	6	223564	223569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379501
5051	NC_018509	TTA	2	6	223704	223709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379501
5052	NC_018509	AGAAA	2	10	223719	223728	80 %	0 %	20 %	0 %	434379501
5053	NC_018509	AGA	2	6	223773	223778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434379501
5054	NC_018509	AG	4	8	223800	223807	50 %	0 %	50 %	0 %	434379501
5055	NC_018509	AGT	3	9	223809	223817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_018509	ATACA	2	10	223875	223884	60 %	20 %	0 %	20 %	434379502
5057	NC_018509	CAA	2	6	223918	223923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434379502
5058	NC_018509	GAAG	2	8	223992	223999	50 %	0 %	50 %	0 %	434379502
5059	NC_018509	AAAG	2	8	224094	224101	75 %	0 %	25 %	0 %	434379502
5060	NC_018509	ATG	2	6	224122	224127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379502
5061	NC_018509	GAA	2	6	224182	224187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434379502
5062	NC_018509	AAAG	2	8	224232	224239	75 %	0 %	25 %	0 %	434379502
5063	NC_018509	TTA	2	6	224269	224274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379502
5064	NC_018509	TA	3	6	224300	224305	50 %	50 %	0 %	0 %	434379502
5065	NC_018509	TAG	2	6	224312	224317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379502
5066	NC_018509	TTC	2	6	224356	224361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379502
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5068	NC_018509	CAATT	2	10	224528	224537	40 %	40 %	0 %	20 %	434379502
5069	NC_018509	GAAT	2	8	224556	224563	50 %	25 %	25 %	0 %	434379502
5070	NC_018509	ATG	2	6	224576	224581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379502
5071	NC_018509	GAA	2	6	224611	224616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434379502
5072	NC_018509	ATG	2	6	224653	224658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379502
5073	NC_018509	TGA	3	9	224682	224690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379502
5074	NC_018509	ACAA	2	8	224721	224728	75 %	0 %	0 %	25 %	434379502
5075	NC_018509	ACA	2	6	224736	224741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434379502
5076	NC_018509	TCT	2	6	224747	224752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379502
5077	NC_018509	GAA	2	6	224791	224796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434379502
5078	NC_018509	CAT	2	6	224831	224836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379502
5079	NC_018509	TTAA	2	8	224844	224851	50 %	50 %	0 %	0 %	434379502
5080	NC_018509	AGA	3	9	224978	224986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434379503
5081	NC_018509	AGC	2	6	224996	225001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434379503
5082	NC_018509	ACG	2	6	225007	225012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434379503
5083	NC_018509	TAC	2	6	225068	225073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379503
5084	NC_018509	ATG	2	6	225128	225133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379503
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5086	NC_018509	GTAG	2	8	225179	225186	25 %	25 %	50 %	0 %	434379504
5087	NC_018509	TTC	2	6	225260	225265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379504
5088	NC_018509	TGC	3	9	225286	225294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434379504
5089	NC_018509	TTTTA	2	10	225340	225349	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_018509	ACAAA	2	10	225384	225393	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
5091	NC_018509	TAG	3	9	225439	225447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_018509	GAA	2	6	225452	225457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_018509	ACC	3	9	225473	225481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5094	NC_018509	AGA	2	6	225522	225527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_018509	TAA	2	6	225558	225563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_018509	ATT	2	6	225583	225588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379505
5097	NC_018509	ACG	2	6	225646	225651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434379505
5098	NC_018509	TGT	2	6	225653	225658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434379505
5099	NC_018509	CAAA	2	8	225750	225757	75 %	0 %	0 %	25 %	434379505
5100	NC_018509	GAAA	2	8	225758	225765	75 %	0 %	25 %	0 %	434379505
5101	NC_018509	AT	3	6	225791	225796	50 %	50 %	0 %	0 %	434379505
5102	NC_018509	TGA	2	6	225803	225808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379505
5103	NC_018509	TGAAAA	2	12	225882	225893	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	434379505
5104	NC_018509	GAA	2	6	225913	225918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434379506
5105	NC_018509	CTAT	2	8	225985	225992	25 %	50 %	0 %	25 %	434379506
5106	NC_018509	TA	3	6	226079	226084	50 %	50 %	0 %	0 %	434379506
5107	NC_018509	AGG	2	6	226154	226159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434379506
5108	NC_018509	TG	3	6	226170	226175	0 %	50 %	50 %	0 %	434379507
5109	NC_018509	TGC	2	6	226211	226216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434379507
5110	NC_018509	AGA	2	6	226263	226268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434379507
5111	NC_018509	GAT	2	6	226277	226282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379507
5112	NC_018509	ATC	2	6	226293	226298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379507
5113	NC_018509	ATG	2	6	226332	226337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379507
5114	NC_018509	CAT	2	6	226355	226360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379507
5115	NC_018509	AGA	2	6	226461	226466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434379508
5116	NC_018509	ACAGAT	2	12	226510	226521	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	434379508
5117	NC_018509	CCA	2	6	226555	226560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434379508
5118	NC_018509	ACA	2	6	226598	226603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434379508
5119	NC_018509	GGT	2	6	226609	226614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434379508
5120	NC_018509	GAT	2	6	226636	226641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379508
5121	NC_018509	CAT	2	6	226653	226658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379508
5122	NC_018509	TAA	2	6	226701	226706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434379508
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5124	NC_018509	A	6	6	226797	226802	100 %	0 %	0 %	0 %	434379508
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5244	NC_018509	AT	3	6	232015	232020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5245	NC_018509	TAT	2	6	232036	232041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5248	NC_018509	ATC	2	6	232191	232196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5337	NC_018509	TCA	2	6	235368	235373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5338	NC_018509	TAA	2	6	235384	235389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

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