MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis HD-771 plasmid p05

Total Repeats: 22

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018502	AAAAAC	2	12	2186	2197	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	402558575
2	NC_018502	TCACCT	2	12	10325	10336	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	402558583
3	NC_018502	TTTATC	2	12	17102	17113	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	402558587
4	NC_018502	TGTATT	2	12	18900	18911	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018502	TTTACA	2	12	19652	19663	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	402558592
6	NC_018502	TTTTAT	2	12	20569	20580	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018502	TTTTCT	2	12	21480	21491	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	402558595
8	NC_018502	CTTCCT	2	12	21766	21777	0 %	50 %	0 %	50 %	402558596
9	NC_018502	AATATC	2	12	23897	23908	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	402558597
10	NC_018502	TATCCA	2	12	23936	23947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558597
11	NC_018502	CTTGTT	2	12	25580	25591	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	402558599
12	NC_018502	CCATGG	2	12	32972	32983	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	402558614
13	NC_018502	TTTTCA	2	12	33207	33218	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	402558614
14	NC_018502	CATTCC	2	12	34227	34238	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	402558618
15	NC_018502	TCACGT	2	12	35755	35766	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	402558621
16	NC_018502	TTTCAT	2	12	36830	36841	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	402558623
17	NC_018502	AAGTCA	2	12	42097	42108	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	402558633
18	NC_018502	AAAAGA	2	12	43612	43623	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	402558634
19	NC_018502	GCTAAT	2	12	43874	43885	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402558634
20	NC_018502	AATCAA	2	12	44417	44428	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_018502	ATTAAA	2	12	44965	44976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018502	TCTTTT	2	12	45010	45021	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.