MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis HD-771 plasmid p02

Total Repeats: 425

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018501	AT	3	6	205	210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018501	TA	3	6	958	963	50 %	50 %	0 %	0 %	402558406
3	NC_018501	TA	3	6	1126	1131	50 %	50 %	0 %	0 %	402558406
4	NC_018501	AC	3	6	1353	1358	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_018501	GT	3	6	1384	1389	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018501	CT	3	6	2255	2260	0 %	50 %	0 %	50 %	402558407
7	NC_018501	AT	3	6	2382	2387	50 %	50 %	0 %	0 %	402558407
8	NC_018501	TA	3	6	2968	2973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018501	AC	3	6	2998	3003	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_018501	GT	3	6	3029	3034	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018501	AC	3	6	3141	3146	50 %	0 %	0 %	50 %	402558408
12	NC_018501	AT	3	6	4151	4156	50 %	50 %	0 %	0 %	402558409
13	NC_018501	AT	3	6	4662	4667	50 %	50 %	0 %	0 %	402558409
14	NC_018501	TA	3	6	4807	4812	50 %	50 %	0 %	0 %	402558409
15	NC_018501	AT	3	6	5279	5284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018501	AT	3	6	5311	5316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018501	GT	3	6	5443	5448	0 %	50 %	50 %	0 %	402558410
18	NC_018501	TA	4	8	5695	5702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018501	AT	3	6	5761	5766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018501	TA	4	8	5889	5896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018501	GA	3	6	6047	6052	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018501	TA	3	6	7038	7043	50 %	50 %	0 %	0 %	402558412
23	NC_018501	AT	3	6	7292	7297	50 %	50 %	0 %	0 %	402558413
24	NC_018501	TA	3	6	7550	7555	50 %	50 %	0 %	0 %	402558413
25	NC_018501	AT	3	6	7618	7623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018501	AT	3	6	8001	8006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018501	TA	4	8	8121	8128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018501	TA	3	6	9444	9449	50 %	50 %	0 %	0 %	402558415
29	NC_018501	AT	3	6	10364	10369	50 %	50 %	0 %	0 %	402558416
30	NC_018501	GT	3	6	10734	10739	0 %	50 %	50 %	0 %	402558416
31	NC_018501	AT	5	10	12570	12579	50 %	50 %	0 %	0 %	402558419
32	NC_018501	TC	3	6	12622	12627	0 %	50 %	0 %	50 %	402558419
33	NC_018501	TG	3	6	12654	12659	0 %	50 %	50 %	0 %	402558419
34	NC_018501	CT	3	6	12975	12980	0 %	50 %	0 %	50 %	402558419
35	NC_018501	GA	4	8	14040	14047	50 %	0 %	50 %	0 %	402558421
36	NC_018501	TA	3	6	14207	14212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018501	CA	3	6	14502	14507	50 %	0 %	0 %	50 %	402558422
38	NC_018501	AT	4	8	15398	15405	50 %	50 %	0 %	0 %	402558423
39	NC_018501	GA	3	6	16167	16172	50 %	0 %	50 %	0 %	402558424
40	NC_018501	AG	4	8	17732	17739	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018501	CT	4	8	17756	17763	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_018501	AG	3	6	18300	18305	50 %	0 %	50 %	0 %	402558428
43	NC_018501	AT	3	6	19659	19664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018501	AT	3	6	19783	19788	50 %	50 %	0 %	0 %	402558429
45	NC_018501	TA	3	6	19931	19936	50 %	50 %	0 %	0 %	402558429
46	NC_018501	TG	3	6	20677	20682	0 %	50 %	50 %	0 %	402558431
47	NC_018501	AT	3	6	21368	21373	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018501	TA	3	6	21558	21563	50 %	50 %	0 %	0 %	402558432
49	NC_018501	TA	3	6	22786	22791	50 %	50 %	0 %	0 %	402558433
50	NC_018501	AT	4	8	23017	23024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018501	TA	3	6	23027	23032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018501	TA	4	8	23251	23258	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018501	AG	3	6	23742	23747	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018501	AT	3	6	24006	24011	50 %	50 %	0 %	0 %	402558434
55	NC_018501	AG	3	6	24171	24176	50 %	0 %	50 %	0 %	402558434
56	NC_018501	TA	3	6	24334	24339	50 %	50 %	0 %	0 %	402558434
57	NC_018501	AT	3	6	24909	24914	50 %	50 %	0 %	0 %	402558434
58	NC_018501	AT	3	6	25499	25504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018501	AG	3	6	25573	25578	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018501	AT	3	6	26095	26100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018501	AG	4	8	26183	26190	50 %	0 %	50 %	0 %	402558436
62	NC_018501	TA	3	6	26629	26634	50 %	50 %	0 %	0 %	402558436
63	NC_018501	TA	3	6	26820	26825	50 %	50 %	0 %	0 %	402558436
64	NC_018501	AT	3	6	26861	26866	50 %	50 %	0 %	0 %	402558436
65	NC_018501	AT	3	6	26958	26963	50 %	50 %	0 %	0 %	402558436
66	NC_018501	AT	3	6	27021	27026	50 %	50 %	0 %	0 %	402558436
67	NC_018501	TA	3	6	28455	28460	50 %	50 %	0 %	0 %	402558437
68	NC_018501	GA	3	6	28954	28959	50 %	0 %	50 %	0 %	402558437
69	NC_018501	AT	3	6	29391	29396	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018501	AT	3	6	29442	29447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018501	AT	3	6	29846	29851	50 %	50 %	0 %	0 %	402558438
72	NC_018501	TG	3	6	29901	29906	0 %	50 %	50 %	0 %	402558438
73	NC_018501	AT	3	6	29997	30002	50 %	50 %	0 %	0 %	402558438
74	NC_018501	TA	3	6	30531	30536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018501	AT	3	6	30597	30602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018501	AT	3	6	31005	31010	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018501	TA	4	8	31134	31141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018501	TA	3	6	31499	31504	50 %	50 %	0 %	0 %	402558440
79	NC_018501	AT	3	6	31781	31786	50 %	50 %	0 %	0 %	402558441
80	NC_018501	TA	3	6	31887	31892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018501	AG	4	8	32797	32804	50 %	0 %	50 %	0 %	402558442
82	NC_018501	GA	3	6	35200	35205	50 %	0 %	50 %	0 %	402558444
83	NC_018501	TA	3	6	36880	36885	50 %	50 %	0 %	0 %	402558445
84	NC_018501	CG	3	6	37212	37217	0 %	0 %	50 %	50 %	402558445
85	NC_018501	AT	3	6	37362	37367	50 %	50 %	0 %	0 %	402558445
86	NC_018501	AT	3	6	37880	37885	50 %	50 %	0 %	0 %	402558446
87	NC_018501	GT	3	6	38076	38081	0 %	50 %	50 %	0 %	402558446
88	NC_018501	AT	3	6	38183	38188	50 %	50 %	0 %	0 %	402558446
89	NC_018501	GT	3	6	38724	38729	0 %	50 %	50 %	0 %	402558447
90	NC_018501	AT	3	6	38748	38753	50 %	50 %	0 %	0 %	402558447
91	NC_018501	TA	4	8	38977	38984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018501	TA	3	6	39108	39113	50 %	50 %	0 %	0 %	402558448
93	NC_018501	TA	3	6	39225	39230	50 %	50 %	0 %	0 %	402558448
94	NC_018501	AT	5	10	39525	39534	50 %	50 %	0 %	0 %	402558448
95	NC_018501	AT	3	6	39796	39801	50 %	50 %	0 %	0 %	402558449
96	NC_018501	AT	3	6	40344	40349	50 %	50 %	0 %	0 %	402558450
97	NC_018501	AT	4	8	41271	41278	50 %	50 %	0 %	0 %	402558451
98	NC_018501	AT	3	6	41386	41391	50 %	50 %	0 %	0 %	402558452
99	NC_018501	TA	3	6	41731	41736	50 %	50 %	0 %	0 %	402558453
100	NC_018501	TA	3	6	41742	41747	50 %	50 %	0 %	0 %	402558453
101	NC_018501	AT	3	6	42057	42062	50 %	50 %	0 %	0 %	402558453
102	NC_018501	AG	3	6	42347	42352	50 %	0 %	50 %	0 %	402558453
103	NC_018501	AT	3	6	42430	42435	50 %	50 %	0 %	0 %	402558453
104	NC_018501	AT	3	6	42880	42885	50 %	50 %	0 %	0 %	402558453
105	NC_018501	AT	3	6	43908	43913	50 %	50 %	0 %	0 %	402558454
106	NC_018501	TA	3	6	44617	44622	50 %	50 %	0 %	0 %	402558454
107	NC_018501	TA	3	6	44919	44924	50 %	50 %	0 %	0 %	402558454
108	NC_018501	TA	3	6	44998	45003	50 %	50 %	0 %	0 %	402558454
109	NC_018501	AC	3	6	45085	45090	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_018501	AT	4	8	45734	45741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018501	CA	3	6	45842	45847	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_018501	TA	3	6	46017	46022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018501	AC	3	6	46081	46086	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_018501	GT	3	6	46108	46113	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018501	TA	3	6	46551	46556	50 %	50 %	0 %	0 %	402558455
116	NC_018501	TA	3	6	46980	46985	50 %	50 %	0 %	0 %	402558455
117	NC_018501	TA	3	6	47319	47324	50 %	50 %	0 %	0 %	402558455
118	NC_018501	AC	3	6	47587	47592	50 %	0 %	0 %	50 %	402558455
119	NC_018501	TA	3	6	47732	47737	50 %	50 %	0 %	0 %	402558455
120	NC_018501	AT	3	6	48827	48832	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018501	AC	3	6	48897	48902	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_018501	GT	3	6	48924	48929	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018501	AG	3	6	49176	49181	50 %	0 %	50 %	0 %	402558456
124	NC_018501	CA	3	6	49593	49598	50 %	0 %	0 %	50 %	402558457
125	NC_018501	TA	3	6	50605	50610	50 %	50 %	0 %	0 %	402558459
126	NC_018501	TA	4	8	50814	50821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018501	AT	3	6	51283	51288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018501	TA	3	6	52233	52238	50 %	50 %	0 %	0 %	402558462
129	NC_018501	AT	3	6	52396	52401	50 %	50 %	0 %	0 %	402558462
130	NC_018501	TA	3	6	53631	53636	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018501	GA	4	8	54800	54807	50 %	0 %	50 %	0 %	402558464
132	NC_018501	AT	3	6	55161	55166	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018501	TA	3	6	55300	55305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018501	CT	3	6	55506	55511	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_018501	TA	3	6	56953	56958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018501	AT	3	6	57243	57248	50 %	50 %	0 %	0 %	402558468
137	NC_018501	CA	3	6	57644	57649	50 %	0 %	0 %	50 %	402558469
138	NC_018501	GA	3	6	57736	57741	50 %	0 %	50 %	0 %	402558469
139	NC_018501	TA	3	6	57746	57751	50 %	50 %	0 %	0 %	402558469
140	NC_018501	AT	3	6	57827	57832	50 %	50 %	0 %	0 %	402558469
141	NC_018501	AT	3	6	57981	57986	50 %	50 %	0 %	0 %	402558470
142	NC_018501	AT	3	6	58257	58262	50 %	50 %	0 %	0 %	402558470
143	NC_018501	TA	4	8	58289	58296	50 %	50 %	0 %	0 %	402558470
144	NC_018501	AT	3	6	59331	59336	50 %	50 %	0 %	0 %	402558471
145	NC_018501	AT	3	6	59552	59557	50 %	50 %	0 %	0 %	402558471
146	NC_018501	GA	3	6	59815	59820	50 %	0 %	50 %	0 %	402558471
147	NC_018501	AG	3	6	60126	60131	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018501	AG	3	6	60878	60883	50 %	0 %	50 %	0 %	402558472
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.