MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus thuringiensis HD-771 plasmid p02

Total Repeats: 4088

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_018501	TGA	2	6	164844	164849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558573
4002	NC_018501	TTG	2	6	164861	164866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558573
4003	NC_018501	GTAC	2	8	164986	164993	25 %	25 %	25 %	25 %	402558573
4004	NC_018501	ACAT	2	8	165002	165009	50 %	25 %	0 %	25 %	402558573
4005	NC_018501	TTG	2	6	165026	165031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558573
4006	NC_018501	T	6	6	165050	165055	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_018501	ATTTTT	2	12	165080	165091	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_018501	A	8	8	165121	165128	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_018501	AATCA	2	10	165133	165142	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4010	NC_018501	AC	3	6	165167	165172	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4011	NC_018501	T	7	7	165201	165207	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_018501	CAA	2	6	165250	165255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4013	NC_018501	CTA	2	6	165256	165261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_018501	AG	3	6	165282	165287	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_018501	AGA	2	6	165326	165331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_018501	ATG	2	6	165397	165402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_018501	A	7	7	165426	165432	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_018501	AAG	2	6	165460	165465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_018501	GAAA	2	8	165483	165490	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_018501	AAAC	2	8	165510	165517	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4021	NC_018501	AAT	2	6	165576	165581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_018501	CAT	2	6	165594	165599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_018501	AGGT	2	8	165622	165629	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_018501	AAC	2	6	165651	165656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_018501	TAC	2	6	165670	165675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4026	NC_018501	ACC	2	6	165757	165762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4027	NC_018501	TTC	2	6	165806	165811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4028	NC_018501	GAA	2	6	165871	165876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_018501	TAA	2	6	165885	165890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_018501	AAG	2	6	166206	166211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_018501	ATT	2	6	166304	166309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_018501	ATT	2	6	166343	166348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_018501	ATAA	2	8	166388	166395	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_018501	AGA	2	6	166432	166437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_018501	TAC	2	6	166547	166552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4036	NC_018501	CTA	2	6	166560	166565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4037	NC_018501	CAA	2	6	166657	166662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4038	NC_018501	ACC	2	6	166689	166694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4039	NC_018501	TATT	2	8	166709	166716	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_018501	TAA	2	6	166758	166763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_018501	ACG	2	6	166770	166775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4042	NC_018501	AGC	2	6	166852	166857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4043	NC_018501	A	7	7	166869	166875	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_018501	ATA	2	6	166914	166919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_018501	CAG	2	6	166953	166958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4046	NC_018501	ACA	2	6	166984	166989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4047	NC_018501	AGA	3	9	167005	167013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_018501	ACG	2	6	167068	167073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4049	NC_018501	GATTTT	2	12	167093	167104	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_018501	GGT	2	6	167123	167128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_018501	GTTC	2	8	167188	167195	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4052	NC_018501	CAT	2	6	167249	167254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_018501	ATT	2	6	167255	167260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_018501	TGT	2	6	167281	167286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_018501	TTTAC	2	10	167396	167405	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4056	NC_018501	ATG	2	6	167451	167456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_018501	AGA	2	6	167488	167493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_018501	GTT	2	6	167585	167590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_018501	AGA	2	6	167701	167706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_018501	CGTCTT	2	12	167765	167776	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4061	NC_018501	GAA	2	6	167833	167838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_018501	GATGA	2	10	167867	167876	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_018501	CAA	2	6	167909	167914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4064	NC_018501	GGA	2	6	167929	167934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_018501	CAG	2	6	167993	167998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4066	NC_018501	ATG	2	6	168009	168014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_018501	GAA	2	6	168035	168040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_018501	TAT	2	6	168052	168057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_018501	CAA	2	6	168065	168070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4070	NC_018501	TCT	2	6	168082	168087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4071	NC_018501	AT	3	6	168127	168132	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_018501	ATA	2	6	168204	168209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_018501	AGA	2	6	168220	168225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_018501	TAC	2	6	168238	168243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4075	NC_018501	CTT	2	6	168322	168327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4076	NC_018501	ACG	2	6	168342	168347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4077	NC_018501	TGT	2	6	168349	168354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_018501	TCTATA	2	12	168383	168394	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4079	NC_018501	AAAGAA	2	12	168476	168487	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_018501	GAAG	2	8	168532	168539	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_018501	CAT	2	6	168667	168672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4082	NC_018501	ATG	2	6	168690	168695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_018501	AGA	2	6	168709	168714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_018501	AAT	2	6	168742	168747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_018501	TTCCAG	2	12	168783	168794	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4086	NC_018501	GAA	2	6	168842	168847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_018501	A	6	6	168937	168942	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_018501	ATG	2	6	168963	168968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.