MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis HD-771 chromosome

Total Repeats: 5372

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018500	AAGAG	2	10	2571	2580	60 %	0 %	40 %	0 %	402558826
2	NC_018500	AACAA	2	10	2760	2769	80 %	0 %	0 %	20 %	402558826
3	NC_018500	ATTAG	2	10	5406	5415	40 %	40 %	20 %	0 %	402558828
4	NC_018500	AGCAA	2	10	5696	5705	60 %	0 %	20 %	20 %	402558829
5	NC_018500	CGATG	2	10	6093	6102	20 %	20 %	40 %	20 %	402558829
6	NC_018500	AACAA	2	10	10128	10137	80 %	0 %	0 %	20 %	402558836
7	NC_018500	TCTTT	2	10	10835	10844	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_018500	AATGT	2	10	11775	11784	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018500	ACAAA	2	10	13094	13103	80 %	0 %	0 %	20 %	402558839
10	NC_018500	GTATC	2	10	13467	13476	20 %	40 %	20 %	20 %	402558839
11	NC_018500	TTGGA	2	10	17896	17905	20 %	40 %	40 %	0 %	402558842
12	NC_018500	ATTAC	2	10	18301	18310	40 %	40 %	0 %	20 %	402558842
13	NC_018500	TGGCG	2	10	19730	19739	0 %	20 %	60 %	20 %	402558844
14	NC_018500	TGGAT	2	10	26773	26782	20 %	40 %	40 %	0 %	402558852
15	NC_018500	TACAA	2	10	27326	27335	60 %	20 %	0 %	20 %	402558852
16	NC_018500	CGATT	2	10	28686	28695	20 %	40 %	20 %	20 %	402558854
17	NC_018500	GTTCA	2	10	32597	32606	20 %	40 %	20 %	20 %	402558856
18	NC_018500	CATGT	2	10	36076	36085	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_018500	TGCGG	2	10	36505	36514	0 %	20 %	60 %	20 %	402558857
20	NC_018500	GATTC	2	10	37912	37921	20 %	40 %	20 %	20 %	402558858
21	NC_018500	AAAGC	2	10	38321	38330	60 %	0 %	20 %	20 %	402558860
22	NC_018500	AAGAG	2	10	43162	43171	60 %	0 %	40 %	0 %	402558865
23	NC_018500	TATGT	2	10	43291	43300	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018500	ACTGC	2	10	45325	45334	20 %	20 %	20 %	40 %	402558867
25	NC_018500	TTCAT	2	10	45604	45613	20 %	60 %	0 %	20 %	402558867
26	NC_018500	TACGT	2	10	47600	47609	20 %	40 %	20 %	20 %	402558869
27	NC_018500	TACAT	2	10	48813	48822	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_018500	AACGA	2	10	51217	51226	60 %	0 %	20 %	20 %	402558873
29	NC_018500	AAAAG	2	10	52820	52829	80 %	0 %	20 %	0 %	402558874
30	NC_018500	TACGC	2	10	53880	53889	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
31	NC_018500	TAATT	2	10	54424	54433	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018500	TCATA	2	10	54440	54449	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_018500	GAAAA	2	10	56076	56085	80 %	0 %	20 %	0 %	402558876
34	NC_018500	TATAA	2	10	57400	57409	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018500	CAAAA	2	10	57585	57594	80 %	0 %	0 %	20 %	402558879
36	NC_018500	TGAAA	2	10	57973	57982	60 %	20 %	20 %	0 %	402558879
37	NC_018500	GAAAA	2	10	58235	58244	80 %	0 %	20 %	0 %	402558879
38	NC_018500	GCAAC	2	10	59444	59453	40 %	0 %	20 %	40 %	402558879
39	NC_018500	GAAAA	2	10	62312	62321	80 %	0 %	20 %	0 %	402558881
40	NC_018500	TTGCA	2	10	67086	67095	20 %	40 %	20 %	20 %	402558885
41	NC_018500	GAAAA	2	10	68273	68282	80 %	0 %	20 %	0 %	402558886
42	NC_018500	AAAAG	2	10	68344	68353	80 %	0 %	20 %	0 %	402558886
43	NC_018500	GAGCA	2	10	69112	69121	40 %	0 %	40 %	20 %	402558887
44	NC_018500	ATATA	2	10	70056	70065	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018500	ATAAC	2	10	70300	70309	60 %	20 %	0 %	20 %	402558889
46	NC_018500	ATTAT	2	10	70783	70792	40 %	60 %	0 %	0 %	402558889
47	NC_018500	GATTG	2	10	72041	72050	20 %	40 %	40 %	0 %	402558891
48	NC_018500	GATTT	2	10	73192	73201	20 %	60 %	20 %	0 %	402558892
49	NC_018500	CAGAA	2	10	73553	73562	60 %	0 %	20 %	20 %	402558892
50	NC_018500	ATTGA	2	10	73802	73811	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018500	TGCAA	2	10	75963	75972	40 %	20 %	20 %	20 %	402558894
52	NC_018500	ATAAA	2	10	76979	76988	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018500	AACTC	2	10	80958	80967	40 %	20 %	0 %	40 %	402558898
54	NC_018500	GTATT	2	10	83225	83234	20 %	60 %	20 %	0 %	402558900
55	NC_018500	ATTAC	2	10	83325	83334	40 %	40 %	0 %	20 %	402558900
56	NC_018500	TTTAC	2	10	85213	85222	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_018500	CGTTA	2	10	86643	86652	20 %	40 %	20 %	20 %	402558903
58	NC_018500	ACAAG	2	10	87905	87914	60 %	0 %	20 %	20 %	402558903
59	NC_018500	GTACC	2	10	89579	89588	20 %	20 %	20 %	40 %	402558904
60	NC_018500	TTTGC	2	10	89873	89882	0 %	60 %	20 %	20 %	402558904
61	NC_018500	CGAAA	2	10	90205	90214	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_018500	TTTAG	2	10	92523	92532	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018500	TAACG	2	10	94779	94788	40 %	20 %	20 %	20 %	402558906
64	NC_018500	TAAAT	2	10	95564	95573	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018500	GGCTG	2	10	96665	96674	0 %	20 %	60 %	20 %	402558907
66	NC_018500	GTTAA	2	10	98972	98981	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018500	AGTGA	2	10	101151	101160	40 %	20 %	40 %	0 %	402558912
68	NC_018500	TTTGG	2	10	102387	102396	0 %	60 %	40 %	0 %	402558913
69	NC_018500	GAACA	2	10	103506	103515	60 %	0 %	20 %	20 %	402558914
70	NC_018500	TTATT	2	10	104513	104522	20 %	80 %	0 %	0 %	402558915
71	NC_018500	TTCAC	2	10	105333	105342	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
72	NC_018500	TAATT	2	10	105433	105442	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018500	TTTAT	2	10	105570	105579	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018500	GTTTA	2	10	106010	106019	20 %	60 %	20 %	0 %	402558917
75	NC_018500	TACTT	2	10	108458	108467	20 %	60 %	0 %	20 %	402558919
76	NC_018500	AGAAA	2	10	108555	108564	80 %	0 %	20 %	0 %	402558919
77	NC_018500	TAAAA	2	10	109069	109078	80 %	20 %	0 %	0 %	402558919
78	NC_018500	ATTAA	2	10	109646	109655	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018500	ATCAA	2	10	111140	111149	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_018500	AAAAT	2	10	111170	111179	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018500	ATGGA	2	10	111819	111828	40 %	20 %	40 %	0 %	402558923
82	NC_018500	AGAAA	2	10	111880	111889	80 %	0 %	20 %	0 %	402558923
83	NC_018500	CTTTT	2	10	113055	113064	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_018500	ATTTT	2	10	113811	113820	20 %	80 %	0 %	0 %	402558925
85	NC_018500	TATAA	2	10	114558	114567	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018500	AAATA	2	10	114809	114818	80 %	20 %	0 %	0 %	402558926
87	NC_018500	AAATT	2	10	117101	117110	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018500	AATGA	2	10	117421	117430	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018500	ATTTT	2	10	117452	117461	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018500	TTCAT	2	10	121510	121519	20 %	60 %	0 %	20 %	402558933
91	NC_018500	TAATT	2	10	121601	121610	40 %	60 %	0 %	0 %	402558933
92	NC_018500	AAATC	2	10	122211	122220	60 %	20 %	0 %	20 %	402558933
93	NC_018500	AATAA	2	10	123944	123953	80 %	20 %	0 %	0 %	402558934
94	NC_018500	ACATT	2	10	124089	124098	40 %	40 %	0 %	20 %	402558934
95	NC_018500	TGTAG	2	10	125150	125159	20 %	40 %	40 %	0 %	402558935
96	NC_018500	ATAAA	2	10	127364	127373	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018500	GTGTA	2	10	127397	127406	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018500	TTATA	2	10	129528	129537	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018500	ATATA	2	10	130734	130743	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018500	AGAAA	2	10	131037	131046	80 %	0 %	20 %	0 %	402558939
101	NC_018500	AATGA	2	10	132411	132420	60 %	20 %	20 %	0 %	402558939
102	NC_018500	ATGGA	2	10	133368	133377	40 %	20 %	40 %	0 %	402558942
103	NC_018500	GCGAT	2	10	133975	133984	20 %	20 %	40 %	20 %	402558942
104	NC_018500	GTACT	2	10	134161	134170	20 %	40 %	20 %	20 %	402558942
105	NC_018500	GAAAG	2	10	134618	134627	60 %	0 %	40 %	0 %	402558942
106	NC_018500	TCTTT	2	10	135078	135087	0 %	80 %	0 %	20 %	402558943
107	NC_018500	TCGGT	2	10	135810	135819	0 %	40 %	40 %	20 %	402558944
108	NC_018500	GTAAA	2	10	137487	137496	60 %	20 %	20 %	0 %	402558946
109	NC_018500	CTGTT	2	10	137730	137739	0 %	60 %	20 %	20 %	402558946
110	NC_018500	TTTAT	2	10	138072	138081	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018500	TGAAA	2	10	138170	138179	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018500	AGGTT	2	10	140122	140131	20 %	40 %	40 %	0 %	402558948
113	NC_018500	CTGGA	2	10	140298	140307	20 %	20 %	40 %	20 %	402558949
114	NC_018500	TCCAT	2	10	141961	141970	20 %	40 %	0 %	40 %	402558951
115	NC_018500	GAAGC	2	10	144367	144376	40 %	0 %	40 %	20 %	402558951
116	NC_018500	TTTTA	2	10	144782	144791	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018500	AAAAT	2	10	147395	147404	80 %	20 %	0 %	0 %	402558955
118	NC_018500	AAAAT	2	10	148622	148631	80 %	20 %	0 %	0 %	402558956
119	NC_018500	GATTA	2	10	151718	151727	40 %	40 %	20 %	0 %	402558959
120	NC_018500	TCGTA	2	10	151975	151984	20 %	40 %	20 %	20 %	402558959
121	NC_018500	GTTAG	2	10	153869	153878	20 %	40 %	40 %	0 %	402558961
122	NC_018500	GAAAT	2	10	157879	157888	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018500	AAAAG	2	10	158231	158240	80 %	0 %	20 %	0 %	402558966
124	NC_018500	AAATG	2	10	161004	161013	60 %	20 %	20 %	0 %	402558970
125	NC_018500	TTTAT	2	10	161131	161140	20 %	80 %	0 %	0 %	402558970
126	NC_018500	TATTT	2	10	162069	162078	20 %	80 %	0 %	0 %	402558970
127	NC_018500	AAAGA	2	10	162280	162289	80 %	0 %	20 %	0 %	402558970
128	NC_018500	TTAAA	2	10	163037	163046	60 %	40 %	0 %	0 %	402558970
129	NC_018500	AAATA	2	10	164626	164635	80 %	20 %	0 %	0 %	402558973
130	NC_018500	TTAAT	2	10	167450	167459	40 %	60 %	0 %	0 %	402558976
131	NC_018500	TTGTT	2	10	168349	168358	0 %	80 %	20 %	0 %	402558977
132	NC_018500	TTATT	2	10	169193	169202	20 %	80 %	0 %	0 %	402558977
133	NC_018500	GTTTC	2	10	169482	169491	0 %	60 %	20 %	20 %	402558978
134	NC_018500	TGTCT	2	10	169947	169956	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
135	NC_018500	TGAAA	2	10	170643	170652	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018500	TATGG	2	10	171277	171286	20 %	40 %	40 %	0 %	402558981
137	NC_018500	AGAAA	2	10	171882	171891	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018500	TGGAG	2	10	173347	173356	20 %	20 %	60 %	0 %	402558983
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151	NC_018500	AGAAA	2	10	182730	182739	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
152	NC_018500	TTTCG	2	10	182794	182803	0 %	60 %	20 %	20 %	402558993
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157	NC_018500	TGAAA	2	10	188142	188151	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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197	NC_018500	ATTTT	2	10	231024	231033	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
198	NC_018500	TTTAT	2	10	233265	233274	20 %	80 %	0 %	0 %	402559046
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271	NC_018500	AACAT	2	10	298151	298160	60 %	20 %	0 %	20 %	402559112
272	NC_018500	GTAAT	2	10	300373	300382	40 %	40 %	20 %	0 %	402559113
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274	NC_018500	AACGT	2	10	303497	303506	40 %	20 %	20 %	20 %	402559115
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292	NC_018500	ATGTA	2	10	326572	326581	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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371	NC_018500	ACAAA	2	10	397294	397303	80 %	0 %	0 %	20 %	402559192
372	NC_018500	CAAAG	2	10	397694	397703	60 %	0 %	20 %	20 %	402559192
373	NC_018500	ATGGT	2	10	397751	397760	20 %	40 %	40 %	0 %	402559192
374	NC_018500	ATAGT	2	10	399222	399231	40 %	40 %	20 %	0 %	402559194
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396	NC_018500	TTGTT	2	10	412650	412659	0 %	80 %	20 %	0 %	402559202
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400	NC_018500	GGGAT	2	10	414483	414492	20 %	20 %	60 %	0 %	402559204
401	NC_018500	GAAAT	2	10	415654	415663	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
402	NC_018500	AATAT	2	10	415767	415776	60 %	40 %	0 %	0 %	402559205
403	NC_018500	ATTTA	2	10	416052	416061	40 %	60 %	0 %	0 %	402559205
404	NC_018500	TTTTC	2	10	418089	418098	0 %	80 %	0 %	20 %	402559206
405	NC_018500	TTTGA	2	10	418600	418609	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
406	NC_018500	ATTTT	2	10	421751	421760	20 %	80 %	0 %	0 %	402559209
407	NC_018500	TAAGT	2	10	422226	422235	40 %	40 %	20 %	0 %	402559209
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