MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis HD-771 chromosome

Total Repeats: 86428

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018500	CAA	2	6	181	186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018500	GCT	2	6	187	192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_018500	AAC	2	6	218	223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_018500	AGG	2	6	360	365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018500	GTA	2	6	460	465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558826
6	NC_018500	GTG	2	6	545	550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	402558826
7	NC_018500	GGA	2	6	558	563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	402558826
8	NC_018500	TAT	2	6	564	569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558826
9	NC_018500	GAG	2	6	588	593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	402558826
10	NC_018500	AAT	2	6	628	633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558826
11	NC_018500	CGT	2	6	679	684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	402558826
12	NC_018500	TAA	2	6	717	722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558826
13	NC_018500	ATT	2	6	793	798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558826
14	NC_018500	AGT	2	6	826	831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558826
15	NC_018500	AGA	2	6	837	842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558826
16	NC_018500	GAA	2	6	859	864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558826
17	NC_018500	AGT	2	6	970	975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558826
18	NC_018500	AGA	2	6	1032	1037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558826
19	NC_018500	GAA	2	6	1078	1083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558826
20	NC_018500	ATA	2	6	1124	1129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558826
21	NC_018500	GAA	2	6	1135	1140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558826
22	NC_018500	GAA	2	6	1171	1176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558826
23	NC_018500	AAG	2	6	1235	1240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558826
24	NC_018500	CTT	3	9	1243	1251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402558826
25	NC_018500	GTT	2	6	1290	1295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558826
26	NC_018500	ACG	2	6	1318	1323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402558826
27	NC_018500	TTG	2	6	1349	1354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558826
28	NC_018500	CAA	2	6	1546	1551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558826
29	NC_018500	GAA	2	6	1582	1587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558826
30	NC_018500	AGA	2	6	1742	1747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558826
31	NC_018500	GGC	2	6	1752	1757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	402558826
32	NC_018500	AAG	2	6	1865	1870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558826
33	NC_018500	ATT	2	6	1871	1876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558826
34	NC_018500	GCA	2	6	2016	2021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402558826
35	NC_018500	TTG	2	6	2024	2029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558826
36	NC_018500	TTA	2	6	2114	2119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558826
37	NC_018500	GGC	2	6	2184	2189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	402558826
38	NC_018500	AAT	2	6	2206	2211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558826
39	NC_018500	TTA	2	6	2236	2241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558826
40	NC_018500	TTG	2	6	2252	2257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558826
41	NC_018500	AAC	2	6	2291	2296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558826
42	NC_018500	TGG	2	6	2361	2366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	402558826
43	NC_018500	TCT	2	6	2386	2391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402558826
44	NC_018500	TTA	2	6	2392	2397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558826
45	NC_018500	GAA	2	6	2446	2451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558826
46	NC_018500	AAG	2	6	2507	2512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558826
47	NC_018500	AGA	2	6	2598	2603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558826
48	NC_018500	TTC	2	6	2784	2789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402558826
49	NC_018500	CAA	2	6	2845	2850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558826
50	NC_018500	AGA	2	6	2898	2903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558826
51	NC_018500	GTG	2	6	2975	2980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	402558826
52	NC_018500	GAA	2	6	3006	3011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558826
53	NC_018500	TCG	2	6	3051	3056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	402558826
54	NC_018500	AAC	2	6	3059	3064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558826
55	NC_018500	AAG	2	6	3158	3163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558826
56	NC_018500	ACA	2	6	3204	3209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558826
57	NC_018500	AGA	2	6	3276	3281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558826
58	NC_018500	AGA	2	6	3318	3323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558826
59	NC_018500	TGA	2	6	3351	3356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558826
60	NC_018500	AGA	2	6	3411	3416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558826
61	NC_018500	TTA	2	6	3440	3445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558826
62	NC_018500	GAA	2	6	3457	3462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558826
63	NC_018500	GAA	2	6	3618	3623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558826
64	NC_018500	GCC	2	6	3739	3744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	402558826
65	NC_018500	TGA	2	6	3747	3752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558826
66	NC_018500	TGA	2	6	3795	3800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558826
67	NC_018500	TGT	2	6	3854	3859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558826
68	NC_018500	GAA	2	6	3922	3927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558826
69	NC_018500	TTC	2	6	4111	4116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402558827
70	NC_018500	AGA	2	6	4125	4130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558827
71	NC_018500	AGA	2	6	4191	4196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558827
72	NC_018500	CGT	2	6	4204	4209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	402558827
73	NC_018500	AAG	2	6	4226	4231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558827
74	NC_018500	TAG	2	6	4256	4261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558827
75	NC_018500	AAG	2	6	4307	4312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558827
76	NC_018500	GTT	2	6	4324	4329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558827
77	NC_018500	TTG	2	6	4334	4339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558827
78	NC_018500	ACG	2	6	4360	4365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402558827
79	NC_018500	GGC	2	6	4419	4424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	402558827
80	NC_018500	GCG	2	6	4522	4527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	402558827
81	NC_018500	CAG	2	6	4589	4594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402558827
82	NC_018500	CTC	2	6	4673	4678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	402558827
83	NC_018500	CAA	2	6	4703	4708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558827
84	NC_018500	GGT	2	6	4801	4806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	402558827
85	NC_018500	TTG	2	6	4850	4855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558827
86	NC_018500	GCA	2	6	4881	4886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402558827
87	NC_018500	TAG	2	6	4928	4933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558827
88	NC_018500	AGA	2	6	4938	4943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558827
89	NC_018500	AAG	2	6	4955	4960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018500	CTT	2	6	4972	4977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_018500	GAT	2	6	5072	5077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018500	GTT	2	6	5133	5138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558828
93	NC_018500	AAG	2	6	5151	5156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558828
94	NC_018500	TAT	2	6	5170	5175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558828
95	NC_018500	GAT	2	6	5179	5184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558828
96	NC_018500	GAA	2	6	5206	5211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558828
97	NC_018500	GAA	2	6	5269	5274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558828
98	NC_018500	GAA	2	6	5278	5283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558828
99	NC_018500	TTG	2	6	5324	5329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558828
100	NC_018500	GAA	2	6	5353	5358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558828
101	NC_018500	GTT	2	6	5386	5391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558828
102	NC_018500	GGC	2	6	5419	5424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_018500	TGA	2	6	5519	5524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558829
104	NC_018500	AGT	2	6	5568	5573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558829
105	NC_018500	ACA	2	6	5643	5648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558829
106	NC_018500	GAA	2	6	5668	5673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558829
107	NC_018500	TAA	2	6	5718	5723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558829
108	NC_018500	TTA	2	6	5735	5740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558829
109	NC_018500	ACG	2	6	5773	5778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402558829
110	NC_018500	TTG	2	6	5831	5836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558829
111	NC_018500	CAG	2	6	5855	5860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402558829
112	NC_018500	ATC	2	6	5975	5980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558829
113	NC_018500	TGA	2	6	6021	6026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558829
114	NC_018500	AAG	2	6	6056	6061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558829
115	NC_018500	TTG	2	6	6086	6091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558829
116	NC_018500	GGT	2	6	6196	6201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	402558829
117	NC_018500	TGA	2	6	6363	6368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558829
118	NC_018500	AAC	2	6	6434	6439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558829
119	NC_018500	TGA	2	6	6468	6473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558829
120	NC_018500	TGA	2	6	6531	6536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558829
121	NC_018500	ATT	2	6	6562	6567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558829
122	NC_018500	AAC	2	6	6593	6598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558829
123	NC_018500	AAT	2	6	6603	6608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558829
124	NC_018500	TGA	2	6	6704	6709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558829
125	NC_018500	GTT	2	6	6939	6944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558830
126	NC_018500	CGA	2	6	7031	7036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402558830
127	NC_018500	AGC	2	6	7040	7045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402558830
128	NC_018500	GAA	2	6	7168	7173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558831
129	NC_018500	ATC	2	6	7206	7211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558831
130	NC_018500	CAT	2	6	7355	7360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558831
131	NC_018500	ATG	2	6	7362	7367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558831
132	NC_018500	GAG	2	6	7407	7412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018500	AGA	2	6	7600	7605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558832
134	NC_018500	TTA	2	6	7706	7711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558832
135	NC_018500	TAA	2	6	7764	7769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558832
136	NC_018500	TAC	2	6	7811	7816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558832
137	NC_018500	ATT	2	6	7826	7831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558832
138	NC_018500	GAA	2	6	7850	7855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558832
139	NC_018500	ATG	2	6	7902	7907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558832
140	NC_018500	TGA	2	6	7957	7962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558832
141	NC_018500	GTT	2	6	8049	8054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558833
142	NC_018500	TCT	2	6	8083	8088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402558833
143	NC_018500	AAG	2	6	8095	8100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558833
144	NC_018500	GTT	2	6	8131	8136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558833
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153	NC_018500	TTA	2	6	8551	8556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558833
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156	NC_018500	TAT	2	6	8806	8811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_018500	TTA	2	6	8864	8869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_018500	CAA	2	6	8913	8918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558834
159	NC_018500	GTT	2	6	9003	9008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558834
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171	NC_018500	AAG	2	6	9914	9919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
172	NC_018500	TGT	2	6	10002	10007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558836
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245	NC_018500	TCC	2	6	14615	14620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	402558840
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252	NC_018500	ATT	2	6	14911	14916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
253	NC_018500	AGG	2	6	15014	15019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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256	NC_018500	TAG	2	6	15421	15426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558841
257	NC_018500	CAA	2	6	15432	15437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558841
258	NC_018500	TTG	2	6	15460	15465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558841
259	NC_018500	TAT	2	6	15484	15489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558841
260	NC_018500	GAA	2	6	15491	15496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558841
261	NC_018500	ATC	2	6	15549	15554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558841
262	NC_018500	GAA	2	6	15588	15593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558841
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280	NC_018500	TTG	2	6	16663	16668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558841
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282	NC_018500	ATT	2	6	16905	16910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558841
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287	NC_018500	GAA	2	6	17131	17136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
288	NC_018500	ACA	2	6	17157	17162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558842
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294	NC_018500	ATT	2	6	17391	17396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558842
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363	NC_018500	CTC	2	6	22293	22298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
364	NC_018500	GAG	2	6	22303	22308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
365	NC_018500	GTG	2	6	22509	22514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
366	NC_018500	GGA	2	6	22591	22596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
367	NC_018500	AGG	2	6	22612	22617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
368	NC_018500	TAT	2	6	22623	22628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558847
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382	NC_018500	GAA	2	6	23308	23313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558847
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500	NC_018500	GTA	2	6	31670	31675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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