MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus thuringiensis HD-771 chromosome

Total Repeats: 141345

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_018500	GA	3	6	209476	209481	50 %	0 %	50 %	0 %	402559021
5003	NC_018500	CAG	2	6	209526	209531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402559021
5004	NC_018500	ACC	2	6	209545	209550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	402559021
5005	NC_018500	GTT	2	6	209582	209587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402559021
5006	NC_018500	TGA	2	6	209617	209622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402559021
5007	NC_018500	AAT	2	6	209634	209639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402559021
5008	NC_018500	TAG	2	6	209644	209649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402559021
5009	NC_018500	TAAG	2	8	209691	209698	50 %	25 %	25 %	0 %	402559021
5010	NC_018500	TAA	2	6	209719	209724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402559021
5011	NC_018500	TAA	2	6	209773	209778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402559021
5012	NC_018500	ACC	2	6	209794	209799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	402559021
5013	NC_018500	AAT	2	6	209851	209856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402559021
5014	NC_018500	T	8	8	209907	209914	0 %	100 %	0 %	0 %	402559021
5015	NC_018500	TAG	2	6	209985	209990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402559022
5016	NC_018500	ATA	2	6	210040	210045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402559022
5017	NC_018500	AAAAT	2	10	210119	210128	80 %	20 %	0 %	0 %	402559022
5018	NC_018500	TAA	2	6	210138	210143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402559022
5019	NC_018500	A	6	6	210142	210147	100 %	0 %	0 %	0 %	402559022
5020	NC_018500	T	6	6	210171	210176	0 %	100 %	0 %	0 %	402559022
5021	NC_018500	TAA	3	9	210201	210209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402559022
5022	NC_018500	A	7	7	210208	210214	100 %	0 %	0 %	0 %	402559022
5023	NC_018500	CCA	2	6	210315	210320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	402559022
5024	NC_018500	ACC	2	6	210333	210338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5025	NC_018500	TCTT	2	8	210339	210346	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5026	NC_018500	T	7	7	210345	210351	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_018500	A	6	6	210365	210370	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_018500	CTA	2	6	210384	210389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5029	NC_018500	TTCA	2	8	210394	210401	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5030	NC_018500	AT	3	6	210415	210420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_018500	TTA	2	6	210431	210436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_018500	AT	3	6	210437	210442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_018500	TGT	3	9	210506	210514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402559023
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5040	NC_018500	A	7	7	210683	210689	100 %	0 %	0 %	0 %	402559023
5041	NC_018500	AGAA	2	8	210819	210826	75 %	0 %	25 %	0 %	402559023
5042	NC_018500	ATT	2	6	210938	210943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402559023
5043	NC_018500	TATT	2	8	211054	211061	25 %	75 %	0 %	0 %	402559023
5044	NC_018500	AAG	2	6	211141	211146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402559023
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5048	NC_018500	TA	3	6	211243	211248	50 %	50 %	0 %	0 %	402559023
5049	NC_018500	TTG	2	6	211270	211275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402559023
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5051	NC_018500	CTA	2	6	211320	211325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402559023
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5053	NC_018500	AAGAA	2	10	211350	211359	80 %	0 %	20 %	0 %	402559023
5054	NC_018500	TAGAAG	2	12	211360	211371	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	402559023
5055	NC_018500	TTA	2	6	211427	211432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_018500	T	7	7	211482	211488	0 %	100 %	0 %	0 %	402559024
5057	NC_018500	TCA	2	6	211552	211557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402559024
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5060	NC_018500	T	6	6	211633	211638	0 %	100 %	0 %	0 %	402559024
5061	NC_018500	GATTG	2	10	211642	211651	20 %	40 %	40 %	0 %	402559024
5062	NC_018500	TAG	2	6	211652	211657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402559024
5063	NC_018500	TGG	2	6	211677	211682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	402559024
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5076	NC_018500	T	7	7	212111	212117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5078	NC_018500	TAG	2	6	212199	212204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5100	NC_018500	GAAA	2	8	212897	212904	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_018500	TATTT	2	10	212905	212914	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_018500	ACGT	2	8	212930	212937	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5103	NC_018500	T	6	6	212940	212945	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5105	NC_018500	A	6	6	213026	213031	100 %	0 %	0 %	0 %	402559026
5106	NC_018500	GTAT	2	8	213039	213046	25 %	50 %	25 %	0 %	402559026
5107	NC_018500	TGT	2	6	213062	213067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402559026
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5109	NC_018500	AAG	2	6	213162	213167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402559026
5110	NC_018500	ATA	2	6	213174	213179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402559026
5111	NC_018500	ATGA	2	8	213200	213207	50 %	25 %	25 %	0 %	402559026
5112	NC_018500	CA	3	6	213208	213213	50 %	0 %	0 %	50 %	402559026
5113	NC_018500	CTT	2	6	213215	213220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402559026
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5116	NC_018500	T	7	7	213439	213445	0 %	100 %	0 %	0 %	402559026
5117	NC_018500	CAAA	2	8	213474	213481	75 %	0 %	0 %	25 %	402559026
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5125	NC_018500	CAAAA	2	10	214043	214052	80 %	0 %	0 %	20 %	402559026
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5127	NC_018500	GTT	2	6	214166	214171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402559026
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5240	NC_018500	TTA	2	6	218984	218989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5241	NC_018500	GAG	2	6	219092	219097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5248	NC_018500	ATAC	2	8	219264	219271	50 %	25 %	0 %	25 %	402559032
5249	NC_018500	TATT	2	8	219301	219308	25 %	75 %	0 %	0 %	402559032
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5252	NC_018500	ATC	2	6	219390	219395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402559032
5253	NC_018500	ATT	2	6	219408	219413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402559032
5254	NC_018500	GCA	2	6	219516	219521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402559032
5255	NC_018500	AGC	2	6	219569	219574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402559032
5256	NC_018500	TTA	2	6	219655	219660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402559032
5257	NC_018500	GGA	2	6	219708	219713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	402559032
5258	NC_018500	TAT	2	6	219716	219721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402559032
5259	NC_018500	TCT	2	6	219736	219741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402559032
5260	NC_018500	TGG	2	6	219791	219796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	402559032
5261	NC_018500	TAT	2	6	219813	219818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5262	NC_018500	A	6	6	219885	219890	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5263	NC_018500	GTT	2	6	219912	219917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402559033
5264	NC_018500	AGC	2	6	219974	219979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402559033
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5266	NC_018500	CCA	2	6	220014	220019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	402559033
5267	NC_018500	T	6	6	220020	220025	0 %	100 %	0 %	0 %	402559033
5268	NC_018500	ATGT	2	8	220044	220051	25 %	50 %	25 %	0 %	402559033
5269	NC_018500	CAG	2	6	220075	220080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402559033
5270	NC_018500	TTA	2	6	220126	220131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402559033
5271	NC_018500	ATTT	2	8	220164	220171	25 %	75 %	0 %	0 %	402559033
5272	NC_018500	TTC	2	6	220281	220286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402559033
5273	NC_018500	GAT	2	6	220301	220306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402559033
5274	NC_018500	AGA	2	6	220367	220372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402559033
5275	NC_018500	T	6	6	220456	220461	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5276	NC_018500	ATA	2	6	220469	220474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5277	NC_018500	AAT	2	6	220509	220514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402559034
5278	NC_018500	T	7	7	220520	220526	0 %	100 %	0 %	0 %	402559034
5279	NC_018500	T	6	6	220534	220539	0 %	100 %	0 %	0 %	402559034
5280	NC_018500	AT	3	6	220577	220582	50 %	50 %	0 %	0 %	402559034
5281	NC_018500	TAA	2	6	220587	220592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402559034
5282	NC_018500	TC	3	6	220742	220747	0 %	50 %	0 %	50 %	402559034
5283	NC_018500	TTTA	2	8	220750	220757	25 %	75 %	0 %	0 %	402559034
5284	NC_018500	TTC	2	6	220765	220770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402559034
5285	NC_018500	TCT	2	6	220793	220798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402559034
5286	NC_018500	TAA	2	6	220858	220863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402559034
5287	NC_018500	AGCA	2	8	220907	220914	50 %	0 %	25 %	25 %	402559034
5288	NC_018500	C	6	6	220918	220923	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5289	NC_018500	TA	3	6	220954	220959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5290	NC_018500	GTT	2	6	221029	221034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402559035
5291	NC_018500	ATT	3	9	221045	221053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402559035
5292	NC_018500	AAT	2	6	221072	221077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402559035
5293	NC_018500	AAG	2	6	221125	221130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402559035
5294	NC_018500	GAA	2	6	221192	221197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402559035
5295	NC_018500	TTGT	3	12	221237	221248	0 %	75 %	25 %	0 %	402559035
5296	NC_018500	GCG	2	6	221252	221257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	402559035
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5299	NC_018500	TGTA	2	8	221328	221335	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5300	NC_018500	ATT	2	6	221336	221341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5301	NC_018500	TTA	2	6	221374	221379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5302	NC_018500	A	6	6	221393	221398	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5303	NC_018500	ATT	2	6	221427	221432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5304	NC_018500	CGTC	2	8	221437	221444	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5305	NC_018500	ATAAGA	2	12	221473	221484	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5306	NC_018500	GAT	2	6	221490	221495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5307	NC_018500	AT	4	8	221494	221501	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5308	NC_018500	TAT	2	6	221529	221534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5309	NC_018500	GGCAT	2	10	221563	221572	20 %	20 %	40 %	20 %	402559036
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5312	NC_018500	GA	3	6	221635	221640	50 %	0 %	50 %	0 %	402559036
5313	NC_018500	TA	3	6	221652	221657	50 %	50 %	0 %	0 %	402559036
5314	NC_018500	AAG	2	6	221717	221722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402559036
5315	NC_018500	A	6	6	221738	221743	100 %	0 %	0 %	0 %	402559036
5316	NC_018500	GTT	2	6	221791	221796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402559036
5317	NC_018500	T	6	6	221837	221842	0 %	100 %	0 %	0 %	402559036
5318	NC_018500	TA	3	6	221897	221902	50 %	50 %	0 %	0 %	402559036
5319	NC_018500	T	6	6	221930	221935	0 %	100 %	0 %	0 %	402559036
5320	NC_018500	A	6	6	221970	221975	100 %	0 %	0 %	0 %	402559036
5321	NC_018500	TGA	2	6	222006	222011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402559036
5322	NC_018500	TAG	2	6	222023	222028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402559036
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5324	NC_018500	CAT	2	6	222227	222232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402559037
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5328	NC_018500	GGC	2	6	222425	222430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	402559037
5329	NC_018500	A	6	6	222530	222535	100 %	0 %	0 %	0 %	402559037
5330	NC_018500	GAA	2	6	222546	222551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402559037
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5332	NC_018500	GCAT	2	8	222587	222594	25 %	25 %	25 %	25 %	402559037
5333	NC_018500	ATA	2	6	222646	222651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402559037
5334	NC_018500	GTA	2	6	222678	222683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402559037
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5336	NC_018500	T	6	6	222739	222744	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5337	NC_018500	GA	3	6	222793	222798	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5338	NC_018500	TTG	2	6	222806	222811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5339	NC_018500	TCT	2	6	222815	222820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5340	NC_018500	ATG	2	6	222916	222921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402559038
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5352	NC_018500	TTC	2	6	223393	223398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402559038
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5359	NC_018500	AT	3	6	223815	223820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5360	NC_018500	AAT	2	6	223842	223847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5361	NC_018500	GA	3	6	223858	223863	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5362	NC_018500	TGT	2	6	223909	223914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402559039
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5368	NC_018500	TTAG	2	8	224325	224332	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5369	NC_018500	T	6	6	224346	224351	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5370	NC_018500	GTCT	2	8	224361	224368	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5371	NC_018500	AGG	2	6	224400	224405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5372	NC_018500	A	7	7	224406	224412	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5373	NC_018500	AC	3	6	224432	224437	50 %	0 %	0 %	50 %	402559040
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5378	NC_018500	GAA	2	6	224688	224693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402559040
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5495	NC_018500	TAA	2	6	229952	229957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5496	NC_018500	GTT	2	6	229966	229971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5499	NC_018500	ATAAA	2	10	230035	230044	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5500	NC_018500	A	6	6	230054	230059	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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