MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis HD-771 plasmid p04

Total Repeats: 38

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018488	ACAGCA	2	12	808	819	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	402558331
2	NC_018488	TTTGGT	2	12	985	996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558331
3	NC_018488	GGGGAA	2	12	2087	2098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018488	AATGGA	2	12	2553	2564	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	402558332
5	NC_018488	CAAGTT	2	12	4781	4792	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402558333
6	NC_018488	TGAATT	2	12	6695	6706	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	402558335
7	NC_018488	GAAAAA	2	12	6871	6882	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	402558336
8	NC_018488	AAGAGA	2	12	7699	7710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558336
9	NC_018488	AAGATG	2	12	8929	8940	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	402558337
10	NC_018488	TGGAAC	2	12	9830	9841	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	402558338
11	NC_018488	TGAGTA	2	12	10849	10860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558340
12	NC_018488	TGGTTT	2	12	11678	11689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018488	TTTTGT	2	12	12161	12172	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	402558342
14	NC_018488	TTTAAT	2	12	12214	12225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558342
15	NC_018488	TCAAAA	2	12	12290	12301	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	402558342
16	NC_018488	ATCTAA	2	12	21182	21193	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_018488	ATCTAA	2	12	22811	22822	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	402558359
18	NC_018488	ATTTAT	2	12	28891	28902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018488	TGTAAA	2	12	29073	29084	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	402558363
20	NC_018488	TTTTGT	2	12	31162	31173	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018488	CTAAAG	2	12	31692	31703	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	402558366
22	NC_018488	GCAGCT	2	12	32603	32614	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_018488	AAAAGT	2	12	35343	35354	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	402558373
24	NC_018488	TTAAAA	2	12	37984	37995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558377
25	NC_018488	TAAATT	2	12	39900	39911	50 %	50 %	0 %	0 %	402558379
26	NC_018488	GCAGCT	2	12	40594	40605	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_018488	ATTCAT	2	12	42469	42480	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	402558382
28	NC_018488	AGAAAG	2	12	42884	42895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558383
29	NC_018488	TGAAGG	2	12	43214	43225	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	402558384
30	NC_018488	ATAAAT	2	12	50683	50694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018488	GCAGCT	2	12	51622	51633	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_018488	ATAAAA	2	12	52837	52848	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	402558393
33	NC_018488	AGAACA	2	12	55785	55796	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	402558394
34	NC_018488	GGATCA	2	12	59837	59848	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	402558399
35	NC_018488	AAATAT	2	12	61975	61986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018488	ACAGGA	2	12	62687	62698	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	402558401
37	NC_018488	TTATTT	2	12	62826	62837	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	402558401
38	NC_018488	GCAATG	2	12	64689	64700	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	402558403

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.