MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus thuringiensis HD-771 plasmid p04

Total Repeats: 1589

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_018488	AAAT	2	8	41863	41870	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_018488	A	6	6	41871	41876	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_018488	ATT	2	6	41878	41883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_018488	AT	3	6	41887	41892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_018488	A	6	6	41900	41905	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_018488	ATAA	3	12	41916	41927	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_018488	TAA	2	6	41978	41983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558381
1008	NC_018488	A	6	6	42061	42066	100 %	0 %	0 %	0 %	402558381
1009	NC_018488	TGTAA	2	10	42067	42076	40 %	40 %	20 %	0 %	402558381
1010	NC_018488	TTA	2	6	42091	42096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558381
1011	NC_018488	A	7	7	42233	42239	100 %	0 %	0 %	0 %	402558381
1012	NC_018488	AT	3	6	42278	42283	50 %	50 %	0 %	0 %	402558382
1013	NC_018488	A	7	7	42351	42357	100 %	0 %	0 %	0 %	402558382
1014	NC_018488	ATG	2	6	42379	42384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558382
1015	NC_018488	CATA	2	8	42417	42424	50 %	25 %	0 %	25 %	402558382
1016	NC_018488	A	6	6	42455	42460	100 %	0 %	0 %	0 %	402558382
1017	NC_018488	ATTCAT	2	12	42469	42480	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	402558382
1018	NC_018488	A	7	7	42532	42538	100 %	0 %	0 %	0 %	402558382
1019	NC_018488	TA	3	6	42544	42549	50 %	50 %	0 %	0 %	402558382
1020	NC_018488	TA	3	6	42646	42651	50 %	50 %	0 %	0 %	402558382
1021	NC_018488	AAGTC	2	10	42663	42672	40 %	20 %	20 %	20 %	402558382
1022	NC_018488	AAG	2	6	42677	42682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558382
1023	NC_018488	TTG	2	6	42690	42695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558382
1024	NC_018488	CAAA	2	8	42793	42800	75 %	0 %	0 %	25 %	402558383
1025	NC_018488	GTTC	2	8	42813	42820	0 %	50 %	25 %	25 %	402558383
1026	NC_018488	AAG	2	6	42847	42852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558383
1027	NC_018488	TGA	2	6	42869	42874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558383
1028	NC_018488	AGAAAG	2	12	42884	42895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558383
1029	NC_018488	TA	3	6	42920	42925	50 %	50 %	0 %	0 %	402558383
1030	NC_018488	TTA	2	6	42943	42948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_018488	CTA	2	6	42951	42956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_018488	TGAT	2	8	42957	42964	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_018488	T	7	7	42974	42980	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_018488	T	10	10	43023	43032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_018488	GGT	2	6	43063	43068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_018488	AAAT	2	8	43111	43118	75 %	25 %	0 %	0 %	402558384
1037	NC_018488	TGAAGG	2	12	43214	43225	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	402558384
1038	NC_018488	TAA	2	6	43262	43267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558384
1039	NC_018488	A	6	6	43314	43319	100 %	0 %	0 %	0 %	402558384
1040	NC_018488	TAT	2	6	43337	43342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558384
1041	NC_018488	GA	3	6	43343	43348	50 %	0 %	50 %	0 %	402558384
1042	NC_018488	TCA	2	6	43363	43368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558384
1043	NC_018488	TGC	2	6	43417	43422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	402558384
1044	NC_018488	AT	3	6	43457	43462	50 %	50 %	0 %	0 %	402558384
1045	NC_018488	GAAA	2	8	43473	43480	75 %	0 %	25 %	0 %	402558384
1046	NC_018488	AGA	2	6	43490	43495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558384
1047	NC_018488	AATT	2	8	43570	43577	50 %	50 %	0 %	0 %	402558384
1048	NC_018488	CAA	2	6	43594	43599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558384
1049	NC_018488	CA	3	6	43654	43659	50 %	0 %	0 %	50 %	402558384
1050	NC_018488	AAAT	2	8	43728	43735	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_018488	TA	3	6	43740	43745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_018488	ATA	2	6	43748	43753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_018488	TTA	2	6	43761	43766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_018488	G	7	7	43803	43809	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_018488	ATCC	2	8	43842	43849	25 %	25 %	0 %	50 %	402558385
1056	NC_018488	T	7	7	43850	43856	0 %	100 %	0 %	0 %	402558385
1057	NC_018488	T	7	7	43898	43904	0 %	100 %	0 %	0 %	402558385
1058	NC_018488	T	6	6	43923	43928	0 %	100 %	0 %	0 %	402558385
1059	NC_018488	TTG	2	6	43964	43969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558385
1060	NC_018488	TAT	2	6	44086	44091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558385
1061	NC_018488	GAA	2	6	44100	44105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558385
1062	NC_018488	GAA	2	6	44120	44125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558385
1063	NC_018488	AC	3	6	44157	44162	50 %	0 %	0 %	50 %	402558385
1064	NC_018488	TTA	2	6	44169	44174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558385
1065	NC_018488	TCT	2	6	44235	44240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402558385
1066	NC_018488	TTTG	2	8	44249	44256	0 %	75 %	25 %	0 %	402558385
1067	NC_018488	ATT	2	6	44265	44270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558385
1068	NC_018488	CTTC	2	8	44313	44320	0 %	50 %	0 %	50 %	402558385
1069	NC_018488	AT	3	6	44344	44349	50 %	50 %	0 %	0 %	402558385
1070	NC_018488	ATA	2	6	44490	44495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558385
1071	NC_018488	CCT	2	6	44539	44544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1072	NC_018488	ACA	2	6	44558	44563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_018488	TTA	2	6	44584	44589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_018488	AATTT	2	10	44622	44631	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_018488	T	6	6	44629	44634	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_018488	TATTC	2	10	44670	44679	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1077	NC_018488	TAA	2	6	44703	44708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_018488	A	6	6	44712	44717	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_018488	TGA	2	6	44789	44794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_018488	AAC	2	6	44797	44802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_018488	TTTA	2	8	44824	44831	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_018488	TA	3	6	44847	44852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_018488	GAT	2	6	44921	44926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_018488	TAT	2	6	44934	44939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_018488	ATTT	2	8	44966	44973	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_018488	GTT	2	6	44983	44988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_018488	ATA	2	6	45005	45010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_018488	AT	3	6	45016	45021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_018488	A	7	7	45026	45032	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_018488	A	7	7	45036	45042	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_018488	A	6	6	45050	45055	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_018488	GAT	2	6	45057	45062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_018488	CAT	2	6	45071	45076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_018488	CAT	2	6	45078	45083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_018488	AGT	2	6	45084	45089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_018488	CAT	3	9	45134	45142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_018488	TG	3	6	45160	45165	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_018488	T	6	6	45195	45200	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_018488	GTT	2	6	45248	45253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_018488	CTG	2	6	45256	45261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_018488	A	6	6	45263	45268	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_018488	AAC	2	6	45275	45280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_018488	T	6	6	45283	45288	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_018488	GTT	2	6	45289	45294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_018488	GAT	2	6	45429	45434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558386
1106	NC_018488	AG	3	6	45439	45444	50 %	0 %	50 %	0 %	402558386
1107	NC_018488	AG	3	6	45465	45470	50 %	0 %	50 %	0 %	402558386
1108	NC_018488	GTT	2	6	45477	45482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558386
1109	NC_018488	ACT	2	6	45489	45494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558386
1110	NC_018488	AC	3	6	45573	45578	50 %	0 %	0 %	50 %	402558386
1111	NC_018488	AAT	2	6	45612	45617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558386
1112	NC_018488	A	7	7	45675	45681	100 %	0 %	0 %	0 %	402558386
1113	NC_018488	GAA	2	6	45690	45695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558386
1114	NC_018488	GCA	3	9	45705	45713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402558386
1115	NC_018488	GAA	2	6	45834	45839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558386
1116	NC_018488	AGGA	2	8	45883	45890	50 %	0 %	50 %	0 %	402558386
1117	NC_018488	ATA	2	6	45967	45972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558386
1118	NC_018488	CTTTA	2	10	45975	45984	20 %	60 %	0 %	20 %	402558386
1119	NC_018488	CTT	2	6	46069	46074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402558386
1120	NC_018488	CAT	2	6	46100	46105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558386
1121	NC_018488	TAT	2	6	46127	46132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558386
1122	NC_018488	TAA	2	6	46175	46180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558386
1123	NC_018488	TATT	2	8	46186	46193	25 %	75 %	0 %	0 %	402558386
1124	NC_018488	ATGA	2	8	46320	46327	50 %	25 %	25 %	0 %	402558386
1125	NC_018488	AGA	2	6	46358	46363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558386
1126	NC_018488	ATT	2	6	46441	46446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558386
1127	NC_018488	AGC	2	6	46480	46485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402558386
1128	NC_018488	TTAT	2	8	46505	46512	25 %	75 %	0 %	0 %	402558386
1129	NC_018488	CT	3	6	46517	46522	0 %	50 %	0 %	50 %	402558386
1130	NC_018488	A	6	6	46537	46542	100 %	0 %	0 %	0 %	402558386
1131	NC_018488	A	6	6	46611	46616	100 %	0 %	0 %	0 %	402558386
1132	NC_018488	A	6	6	46637	46642	100 %	0 %	0 %	0 %	402558386
1133	NC_018488	AT	3	6	46661	46666	50 %	50 %	0 %	0 %	402558386
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