MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis HD-771 plasmid p01

Total Repeats: 439

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018486	AT	3	6	127	132	50 %	50 %	0 %	0 %	402558637
2	NC_018486	AG	3	6	216	221	50 %	0 %	50 %	0 %	402558637
3	NC_018486	GA	3	6	627	632	50 %	0 %	50 %	0 %	402558637
4	NC_018486	TA	3	6	1022	1027	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018486	AT	7	14	1048	1061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018486	AT	3	6	1600	1605	50 %	50 %	0 %	0 %	402558638
7	NC_018486	GT	3	6	2069	2074	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018486	AT	3	6	3155	3160	50 %	50 %	0 %	0 %	402558641
9	NC_018486	AT	3	6	3293	3298	50 %	50 %	0 %	0 %	402558642
10	NC_018486	TA	3	6	3669	3674	50 %	50 %	0 %	0 %	402558642
11	NC_018486	TA	3	6	5510	5515	50 %	50 %	0 %	0 %	402558643
12	NC_018486	AC	3	6	9700	9705	50 %	0 %	0 %	50 %	402558644
13	NC_018486	GA	3	6	10185	10190	50 %	0 %	50 %	0 %	402558644
14	NC_018486	GC	3	6	10449	10454	0 %	0 %	50 %	50 %	402558645
15	NC_018486	TG	5	10	10604	10613	0 %	50 %	50 %	0 %	402558645
16	NC_018486	TG	3	6	11143	11148	0 %	50 %	50 %	0 %	402558645
17	NC_018486	GT	3	6	11690	11695	0 %	50 %	50 %	0 %	402558645
18	NC_018486	CA	3	6	12305	12310	50 %	0 %	0 %	50 %	402558645
19	NC_018486	AT	3	6	12795	12800	50 %	50 %	0 %	0 %	402558646
20	NC_018486	AT	3	6	12968	12973	50 %	50 %	0 %	0 %	402558646
21	NC_018486	TA	3	6	13286	13291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018486	TA	3	6	14033	14038	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018486	TA	3	6	14052	14057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018486	AT	3	6	14433	14438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018486	AC	3	6	15615	15620	50 %	0 %	0 %	50 %	402558651
26	NC_018486	AC	3	6	15891	15896	50 %	0 %	0 %	50 %	402558651
27	NC_018486	TA	3	6	16316	16321	50 %	50 %	0 %	0 %	402558651
28	NC_018486	AT	4	8	17165	17172	50 %	50 %	0 %	0 %	402558653
29	NC_018486	TA	4	8	17184	17191	50 %	50 %	0 %	0 %	402558653
30	NC_018486	AG	3	6	17665	17670	50 %	0 %	50 %	0 %	402558654
31	NC_018486	TA	5	10	17760	17769	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018486	TA	3	6	18302	18307	50 %	50 %	0 %	0 %	402558655
33	NC_018486	TA	3	6	19027	19032	50 %	50 %	0 %	0 %	402558657
34	NC_018486	TA	4	8	19189	19196	50 %	50 %	0 %	0 %	402558657
35	NC_018486	AT	3	6	19458	19463	50 %	50 %	0 %	0 %	402558657
36	NC_018486	GA	3	6	19689	19694	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018486	AT	3	6	19846	19851	50 %	50 %	0 %	0 %	402558658
38	NC_018486	AC	3	6	19991	19996	50 %	0 %	0 %	50 %	402558658
39	NC_018486	AT	3	6	20112	20117	50 %	50 %	0 %	0 %	402558658
40	NC_018486	AT	3	6	20823	20828	50 %	50 %	0 %	0 %	402558660
41	NC_018486	TA	3	6	20836	20841	50 %	50 %	0 %	0 %	402558660
42	NC_018486	AT	3	6	21334	21339	50 %	50 %	0 %	0 %	402558661
43	NC_018486	TA	3	6	21821	21826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018486	AT	3	6	22158	22163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018486	AT	3	6	22246	22251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018486	AT	3	6	22448	22453	50 %	50 %	0 %	0 %	402558663
47	NC_018486	AT	3	6	22566	22571	50 %	50 %	0 %	0 %	402558663
48	NC_018486	GA	3	6	22707	22712	50 %	0 %	50 %	0 %	402558663
49	NC_018486	TA	3	6	22826	22831	50 %	50 %	0 %	0 %	402558663
50	NC_018486	AT	3	6	22956	22961	50 %	50 %	0 %	0 %	402558663
51	NC_018486	TA	3	6	24137	24142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018486	AT	3	6	24308	24313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018486	AG	3	6	24845	24850	50 %	0 %	50 %	0 %	402558665
54	NC_018486	AT	4	8	24893	24900	50 %	50 %	0 %	0 %	402558665
55	NC_018486	AT	3	6	25013	25018	50 %	50 %	0 %	0 %	402558665
56	NC_018486	AT	3	6	25039	25044	50 %	50 %	0 %	0 %	402558665
57	NC_018486	TA	3	6	25458	25463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018486	CT	3	6	25464	25469	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_018486	AT	3	6	26355	26360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018486	TA	3	6	26462	26467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018486	AT	4	8	26510	26517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018486	TA	3	6	26597	26602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018486	TA	3	6	27649	27654	50 %	50 %	0 %	0 %	402558666
64	NC_018486	TA	3	6	27671	27676	50 %	50 %	0 %	0 %	402558666
65	NC_018486	AT	3	6	28164	28169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018486	TA	3	6	28853	28858	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018486	TA	3	6	28944	28949	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018486	AT	3	6	28954	28959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018486	TA	3	6	28976	28981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018486	AT	3	6	29610	29615	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018486	AG	3	6	29785	29790	50 %	0 %	50 %	0 %	402558671
72	NC_018486	TA	3	6	30085	30090	50 %	50 %	0 %	0 %	402558672
73	NC_018486	AT	3	6	30837	30842	50 %	50 %	0 %	0 %	402558673
74	NC_018486	AT	3	6	30983	30988	50 %	50 %	0 %	0 %	402558673
75	NC_018486	AG	3	6	31264	31269	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018486	TA	3	6	31411	31416	50 %	50 %	0 %	0 %	402558675
77	NC_018486	AG	3	6	31864	31869	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018486	TA	3	6	32076	32081	50 %	50 %	0 %	0 %	402558677
79	NC_018486	GA	3	6	32106	32111	50 %	0 %	50 %	0 %	402558677
80	NC_018486	TA	3	6	32139	32144	50 %	50 %	0 %	0 %	402558677
81	NC_018486	AT	4	8	32393	32400	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018486	TA	3	6	32857	32862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018486	TA	3	6	32959	32964	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018486	TA	3	6	33449	33454	50 %	50 %	0 %	0 %	402558678
85	NC_018486	AT	3	6	33593	33598	50 %	50 %	0 %	0 %	402558678
86	NC_018486	AT	3	6	34170	34175	50 %	50 %	0 %	0 %	402558678
87	NC_018486	GA	3	6	34437	34442	50 %	0 %	50 %	0 %	402558678
88	NC_018486	AT	3	6	34655	34660	50 %	50 %	0 %	0 %	402558679
89	NC_018486	TA	3	6	34661	34666	50 %	50 %	0 %	0 %	402558679
90	NC_018486	CT	3	6	34838	34843	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_018486	AT	3	6	35172	35177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018486	TA	3	6	35370	35375	50 %	50 %	0 %	0 %	402558680
93	NC_018486	CT	3	6	36230	36235	0 %	50 %	0 %	50 %	402558680
94	NC_018486	GA	4	8	37092	37099	50 %	0 %	50 %	0 %	402558681
95	NC_018486	AC	3	6	37322	37327	50 %	0 %	0 %	50 %	402558681
96	NC_018486	TG	3	6	37612	37617	0 %	50 %	50 %	0 %	402558681
97	NC_018486	TA	3	6	37899	37904	50 %	50 %	0 %	0 %	402558681
98	NC_018486	AT	3	6	38028	38033	50 %	50 %	0 %	0 %	402558681
99	NC_018486	AC	3	6	38724	38729	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_018486	TA	3	6	38941	38946	50 %	50 %	0 %	0 %	402558683
101	NC_018486	AT	3	6	39308	39313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018486	CT	3	6	39373	39378	0 %	50 %	0 %	50 %	402558684
103	NC_018486	TA	3	6	40409	40414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018486	GA	3	6	40763	40768	50 %	0 %	50 %	0 %	402558685
105	NC_018486	AG	3	6	41599	41604	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018486	TA	3	6	41670	41675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018486	TA	4	8	42297	42304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018486	AT	4	8	42320	42327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018486	TA	3	6	42402	42407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018486	CA	3	6	42702	42707	50 %	0 %	0 %	50 %	402558688
111	NC_018486	AT	3	6	42810	42815	50 %	50 %	0 %	0 %	402558688
112	NC_018486	TG	3	6	43010	43015	0 %	50 %	50 %	0 %	402558688
113	NC_018486	AG	3	6	43267	43272	50 %	0 %	50 %	0 %	402558688
114	NC_018486	AT	3	6	43430	43435	50 %	50 %	0 %	0 %	402558688
115	NC_018486	CA	3	6	43491	43496	50 %	0 %	0 %	50 %	402558688
116	NC_018486	TG	3	6	44050	44055	0 %	50 %	50 %	0 %	402558689
117	NC_018486	TA	4	8	44831	44838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018486	TA	3	6	44882	44887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018486	TA	3	6	44907	44912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018486	AT	3	6	44934	44939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018486	TC	3	6	45265	45270	0 %	50 %	0 %	50 %	402558691
122	NC_018486	AT	3	6	45369	45374	50 %	50 %	0 %	0 %	402558691
123	NC_018486	TA	3	6	45733	45738	50 %	50 %	0 %	0 %	402558691
124	NC_018486	AT	3	6	46051	46056	50 %	50 %	0 %	0 %	402558691
125	NC_018486	TA	4	8	47087	47094	50 %	50 %	0 %	0 %	402558692
126	NC_018486	TA	3	6	47388	47393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018486	TA	3	6	48118	48123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018486	TA	4	8	48397	48404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018486	TA	3	6	48612	48617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018486	GA	3	6	48957	48962	50 %	0 %	50 %	0 %	402558693
131	NC_018486	TA	3	6	49054	49059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018486	TA	3	6	49311	49316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018486	AT	3	6	50362	50367	50 %	50 %	0 %	0 %	402558695
134	NC_018486	AT	3	6	50679	50684	50 %	50 %	0 %	0 %	402558695
135	NC_018486	GA	3	6	51148	51153	50 %	0 %	50 %	0 %	402558695
136	NC_018486	AT	3	6	51671	51676	50 %	50 %	0 %	0 %	402558696
137	NC_018486	CA	3	6	51686	51691	50 %	0 %	0 %	50 %	402558696
138	NC_018486	GT	3	6	52162	52167	0 %	50 %	50 %	0 %	402558696
139	NC_018486	TA	3	6	52909	52914	50 %	50 %	0 %	0 %	402558696
140	NC_018486	AC	3	6	54954	54959	50 %	0 %	0 %	50 %	402558697
141	NC_018486	AT	3	6	55504	55509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018486	AG	3	6	56056	56061	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018486	TA	3	6	56290	56295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018486	GA	3	6	56348	56353	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018486	TA	3	6	58229	58234	50 %	50 %	0 %	0 %	402558699
146	NC_018486	TA	3	6	58518	58523	50 %	50 %	0 %	0 %	402558699
147	NC_018486	AT	3	6	58930	58935	50 %	50 %	0 %	0 %	402558699
148	NC_018486	TA	3	6	59347	59352	50 %	50 %	0 %	0 %	402558699
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.