MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium bifidum BGN4 chromosome

Total Repeats: 52924

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017999	CGT	2	6	173277	173282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936061
4002	NC_017999	TCGC	2	8	173288	173295	0 %	25 %	25 %	50 %	390936061
4003	NC_017999	TCGTCC	2	12	173321	173332	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	390936061
4004	NC_017999	ATC	2	6	173344	173349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936061
4005	NC_017999	CCA	2	6	173373	173378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390936061
4006	NC_017999	TCG	2	6	173426	173431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936061
4007	NC_017999	CAT	2	6	173478	173483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936061
4008	NC_017999	CAG	2	6	173584	173589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936061
4009	NC_017999	TCC	2	6	173633	173638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390936061
4010	NC_017999	CAC	2	6	173654	173659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390936061
4011	NC_017999	CAGCAC	2	12	173662	173673	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	390936061
4012	NC_017999	TCC	2	6	173693	173698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390936061
4013	NC_017999	CGA	2	6	173751	173756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936061
4014	NC_017999	CA	3	6	173771	173776	50 %	0 %	0 %	50 %	390936061
4015	NC_017999	CGC	2	6	173862	173867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936061
4016	NC_017999	CGG	2	6	173890	173895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936061
4017	NC_017999	GAACGG	2	12	173899	173910	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	390936061
4018	NC_017999	TGG	2	6	173930	173935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390936061
4019	NC_017999	CGT	3	9	173974	173982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936061
4020	NC_017999	CCG	2	6	173991	173996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936061
4021	NC_017999	GGC	2	6	174010	174015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936061
4022	NC_017999	GT	3	6	174039	174044	0 %	50 %	50 %	0 %	390936061
4023	NC_017999	CCG	2	6	174050	174055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936061
4024	NC_017999	CGGC	2	8	174080	174087	0 %	0 %	50 %	50 %	390936061
4025	NC_017999	GC	3	6	174089	174094	0 %	0 %	50 %	50 %	390936061
4026	NC_017999	ATA	2	6	174133	174138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390936061
4027	NC_017999	CAG	2	6	174160	174165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936061
4028	NC_017999	CG	3	6	174235	174240	0 %	0 %	50 %	50 %	390936061
4029	NC_017999	GTA	2	6	174280	174285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390936061
4030	NC_017999	ATG	2	6	174299	174304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390936061
4031	NC_017999	CCT	2	6	174309	174314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4032	NC_017999	GGT	2	6	174424	174429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_017999	TGG	2	6	174510	174515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390936062
4034	NC_017999	CG	3	6	174554	174559	0 %	0 %	50 %	50 %	390936062
4035	NC_017999	GCG	2	6	174561	174566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936062
4036	NC_017999	CAG	2	6	174642	174647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936063
4037	NC_017999	CCACA	2	10	174657	174666	40 %	0 %	0 %	60 %	390936063
4038	NC_017999	CAC	2	6	174711	174716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390936063
4039	NC_017999	GCC	2	6	174838	174843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936063
4040	NC_017999	ATC	2	6	174877	174882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936063
4041	NC_017999	ACC	2	6	174958	174963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390936063
4042	NC_017999	CCTG	2	8	175055	175062	0 %	25 %	25 %	50 %	390936063
4043	NC_017999	ACA	2	6	175073	175078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390936063
4044	NC_017999	TCA	2	6	175115	175120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936063
4045	NC_017999	AC	3	6	175131	175136	50 %	0 %	0 %	50 %	390936063
4046	NC_017999	CGG	2	6	175151	175156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936063
4047	NC_017999	CACC	2	8	175166	175173	25 %	0 %	0 %	75 %	390936063
4048	NC_017999	CAC	2	6	175227	175232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390936063
4049	NC_017999	GAT	2	6	175281	175286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390936063
4050	NC_017999	TCG	2	6	175292	175297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936063
4051	NC_017999	CG	3	6	175296	175301	0 %	0 %	50 %	50 %	390936063
4052	NC_017999	TC	3	6	175328	175333	0 %	50 %	0 %	50 %	390936063
4053	NC_017999	GCC	2	6	175359	175364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936063
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4055	NC_017999	TGC	2	6	175426	175431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936063
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4057	NC_017999	CGA	2	6	175538	175543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936063
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4059	NC_017999	TGA	2	6	175568	175573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390936063
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4062	NC_017999	ACG	2	6	175636	175641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936063
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4065	NC_017999	CCA	2	6	175718	175723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390936063
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4070	NC_017999	AGA	2	6	175943	175948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390936063
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4073	NC_017999	TGCCGG	2	12	176036	176047	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	390936063
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4075	NC_017999	GGGCC	2	10	176202	176211	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4076	NC_017999	CGC	2	6	176225	176230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4077	NC_017999	CAC	2	6	176357	176362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4078	NC_017999	TCG	2	6	176386	176391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4079	NC_017999	ATCT	2	8	176451	176458	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4080	NC_017999	AGAT	2	8	176570	176577	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_017999	GAA	2	6	176719	176724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_017999	GGGT	2	8	176806	176813	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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4089	NC_017999	AGC	2	6	177036	177041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936064
4090	NC_017999	CGG	2	6	177061	177066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936064
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4093	NC_017999	AGC	2	6	177165	177170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936064
4094	NC_017999	AGC	2	6	177222	177227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936064
4095	NC_017999	TGC	2	6	177304	177309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936064
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4098	NC_017999	GTTG	2	8	177469	177476	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_017999	GTT	2	6	177492	177497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_017999	ATG	2	6	177538	177543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390936065
4101	NC_017999	CAC	2	6	177591	177596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390936065
4102	NC_017999	CCG	2	6	177626	177631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936065
4103	NC_017999	GGC	2	6	177700	177705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936065
4104	NC_017999	GTC	2	6	177733	177738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936065
4105	NC_017999	GGC	2	6	177739	177744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936065
4106	NC_017999	CGG	2	6	177787	177792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936065
4107	NC_017999	CGG	2	6	177960	177965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936065
4108	NC_017999	CAG	2	6	177970	177975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936065
4109	NC_017999	GC	4	8	177988	177995	0 %	0 %	50 %	50 %	390936065
4110	NC_017999	AAG	2	6	178003	178008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390936065
4111	NC_017999	GCT	3	9	178014	178022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936065
4112	NC_017999	CGA	2	6	178026	178031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936065
4113	NC_017999	GC	3	6	178040	178045	0 %	0 %	50 %	50 %	390936065
4114	NC_017999	AGG	2	6	178064	178069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390936065
4115	NC_017999	CTG	2	6	178078	178083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936065
4116	NC_017999	TCA	3	9	178118	178126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936065
4117	NC_017999	CGCT	2	8	178139	178146	0 %	25 %	25 %	50 %	390936065
4118	NC_017999	GTC	2	6	178162	178167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936065
4119	NC_017999	GGT	2	6	178185	178190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390936065
4120	NC_017999	GCC	2	6	178310	178315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936066
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4122	NC_017999	GGC	2	6	178380	178385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936066
4123	NC_017999	GCT	2	6	178487	178492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936066
4124	NC_017999	TGA	2	6	178504	178509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390936066
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4226	NC_017999	CCTT	2	8	181988	181995	0 %	50 %	0 %	50 %	390936067
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4228	NC_017999	GAT	2	6	182059	182064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390936067
4229	NC_017999	GGA	2	6	182188	182193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4230	NC_017999	CGT	2	6	182209	182214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4231	NC_017999	ACT	2	6	182215	182220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4232	NC_017999	ACG	2	6	182235	182240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4233	NC_017999	TG	3	6	182321	182326	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4234	NC_017999	ATCA	2	8	182397	182404	50 %	25 %	0 %	25 %	390936068
4235	NC_017999	GAC	3	9	182488	182496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936068
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4237	NC_017999	ATG	2	6	182558	182563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390936068
4238	NC_017999	GTGG	2	8	182605	182612	0 %	25 %	75 %	0 %	390936068
4239	NC_017999	GCC	2	6	182626	182631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936068
4240	NC_017999	CTG	2	6	182707	182712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936068
4241	NC_017999	TCG	2	6	182726	182731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936068
4242	NC_017999	CGG	2	6	182757	182762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936068
4243	NC_017999	GAT	2	6	182821	182826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390936068
4244	NC_017999	GGGGC	2	10	182828	182837	0 %	0 %	80 %	20 %	390936068
4245	NC_017999	CGA	2	6	182889	182894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936068
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4247	NC_017999	GGT	2	6	183015	183020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390936068
4248	NC_017999	TGGA	2	8	183071	183078	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4249	NC_017999	CGA	2	6	183159	183164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4250	NC_017999	GCA	2	6	183225	183230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936069
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4253	NC_017999	ACG	2	6	183308	183313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936069
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4272	NC_017999	CCA	2	6	184126	184131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4273	NC_017999	CGT	2	6	184139	184144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4274	NC_017999	CG	3	6	184155	184160	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4275	NC_017999	AGGCG	2	10	184199	184208	20 %	0 %	60 %	20 %	390936071
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4300	NC_017999	TGG	2	6	184858	184863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390936071
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4314	NC_017999	TGGCA	2	10	185697	185706	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4315	NC_017999	TCT	2	6	185837	185842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390936073
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4332	NC_017999	TCC	2	6	186715	186720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4333	NC_017999	CCGC	2	8	186738	186745	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4334	NC_017999	TCT	2	6	186748	186753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4335	NC_017999	CCG	3	9	186763	186771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4343	NC_017999	CGG	2	6	187021	187026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4344	NC_017999	CGG	2	6	187070	187075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4345	NC_017999	ACG	2	6	187161	187166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4347	NC_017999	GCG	2	6	187225	187230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4348	NC_017999	ATG	2	6	187249	187254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4349	NC_017999	TCG	2	6	187284	187289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4354	NC_017999	CAG	2	6	187470	187475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936074
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4362	NC_017999	AGC	2	6	187687	187692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936074
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4366	NC_017999	TAC	2	6	187782	187787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936074
4367	NC_017999	GCC	2	6	187926	187931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936074
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4370	NC_017999	GTG	2	6	188055	188060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390936074
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4379	NC_017999	GGCA	2	8	188515	188522	25 %	0 %	50 %	25 %	390936074
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4401	NC_017999	GGCA	2	8	189497	189504	25 %	0 %	50 %	25 %	390936074
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4500	NC_017999	T	6	6	194975	194980	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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