MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium bifidum BGN4 chromosome

Total Repeats: 52924

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_017999	GCG	2	6	131045	131050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936025
3003	NC_017999	CGA	2	6	131066	131071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936025
3004	NC_017999	ACG	3	9	131077	131085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936025
3005	NC_017999	GCC	2	6	131086	131091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936025
3006	NC_017999	ATG	2	6	131117	131122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390936025
3007	NC_017999	TGG	2	6	131242	131247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_017999	GTG	2	6	131254	131259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_017999	TGT	2	6	131273	131278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_017999	TTG	2	6	131280	131285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_017999	AGT	2	6	131310	131315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_017999	GAT	2	6	131318	131323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_017999	T	6	6	131413	131418	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_017999	GAT	2	6	131444	131449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_017999	GTC	2	6	131524	131529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3016	NC_017999	TCG	2	6	131534	131539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3017	NC_017999	GCG	2	6	131596	131601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3018	NC_017999	GCC	2	6	131627	131632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3019	NC_017999	AGG	2	6	131655	131660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_017999	CGA	2	6	131724	131729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3021	NC_017999	CGGCTT	2	12	131730	131741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3022	NC_017999	CGA	2	6	131790	131795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3023	NC_017999	GGCCG	2	10	131814	131823	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3024	NC_017999	CGC	2	6	131867	131872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3025	NC_017999	GC	3	6	131917	131922	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3026	NC_017999	CGG	2	6	131961	131966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3027	NC_017999	TCC	2	6	131968	131973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3028	NC_017999	TCA	2	6	132008	132013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3029	NC_017999	CAT	2	6	132060	132065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3030	NC_017999	CCA	2	6	132114	132119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390936026
3031	NC_017999	GGC	2	6	132137	132142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936026
3032	NC_017999	TGG	2	6	132153	132158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390936026
3033	NC_017999	CGAGGC	2	12	132169	132180	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	390936026
3034	NC_017999	CCA	3	9	132297	132305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390936026
3035	NC_017999	GGA	2	6	132313	132318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390936026
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3037	NC_017999	CGCC	2	8	132385	132392	0 %	0 %	25 %	75 %	390936026
3038	NC_017999	TGC	2	6	132458	132463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3039	NC_017999	CCG	2	6	132512	132517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3040	NC_017999	GGC	2	6	132545	132550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3041	NC_017999	CGG	2	6	132595	132600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3042	NC_017999	TAT	2	6	132673	132678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_017999	GCC	2	6	132697	132702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3044	NC_017999	GCG	2	6	132775	132780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936027
3045	NC_017999	GTGGC	2	10	132898	132907	0 %	20 %	60 %	20 %	390936027
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3047	NC_017999	CGC	2	6	132938	132943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936027
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3052	NC_017999	CGG	2	6	133112	133117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936027
3053	NC_017999	CTC	2	6	133122	133127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390936027
3054	NC_017999	GA	3	6	133140	133145	50 %	0 %	50 %	0 %	390936027
3055	NC_017999	T	6	6	133177	133182	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_017999	GCG	2	6	133226	133231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3057	NC_017999	CAT	2	6	133355	133360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3058	NC_017999	TTG	2	6	133424	133429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390936028
3059	NC_017999	CCG	2	6	133449	133454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936028
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3062	NC_017999	AGC	2	6	133585	133590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936028
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3065	NC_017999	GGCGAT	2	12	133623	133634	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	390936028
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3068	NC_017999	CGAA	2	8	133708	133715	50 %	0 %	25 %	25 %	390936028
3069	NC_017999	ATG	2	6	133776	133781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3071	NC_017999	CG	3	6	133882	133887	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3072	NC_017999	GCC	2	6	133946	133951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3073	NC_017999	TTG	2	6	134006	134011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_017999	TGGC	2	8	134015	134022	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3075	NC_017999	TTG	2	6	134025	134030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_017999	GAC	2	6	134084	134089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3077	NC_017999	T	6	6	134125	134130	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_017999	CAT	2	6	134143	134148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3079	NC_017999	CAT	2	6	134274	134279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936029
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3081	NC_017999	AGT	2	6	134325	134330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390936029
3082	NC_017999	TCC	2	6	134345	134350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390936029
3083	NC_017999	GTC	2	6	134362	134367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936029
3084	NC_017999	TGCT	2	8	134436	134443	0 %	50 %	25 %	25 %	390936029
3085	NC_017999	TCA	2	6	134465	134470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3086	NC_017999	ATG	2	6	134594	134599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390936030
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3091	NC_017999	GTA	2	6	134926	134931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390936030
3092	NC_017999	TGAAG	2	10	134964	134973	40 %	20 %	40 %	0 %	390936030
3093	NC_017999	GTC	2	6	134980	134985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936030
3094	NC_017999	CG	3	6	135000	135005	0 %	0 %	50 %	50 %	390936030
3095	NC_017999	GAC	2	6	135016	135021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936030
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3097	NC_017999	AGC	2	6	135059	135064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936030
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3099	NC_017999	CGC	2	6	135187	135192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936030
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3101	NC_017999	TG	3	6	135327	135332	0 %	50 %	50 %	0 %	390936030
3102	NC_017999	CAG	2	6	135368	135373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936030
3103	NC_017999	CGTT	2	8	135415	135422	0 %	50 %	25 %	25 %	390936030
3104	NC_017999	GTAAA	2	10	135464	135473	60 %	20 %	20 %	0 %	390936030
3105	NC_017999	CAG	2	6	135508	135513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936030
3106	NC_017999	TGA	2	6	135606	135611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390936030
3107	NC_017999	GAA	2	6	135711	135716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390936030
3108	NC_017999	GCT	2	6	135830	135835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936031
3109	NC_017999	GTA	2	6	135901	135906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390936031
3110	NC_017999	CTC	2	6	135980	135985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390936031
3111	NC_017999	A	6	6	136013	136018	100 %	0 %	0 %	0 %	390936031
3112	NC_017999	ACG	2	6	136023	136028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936031
3113	NC_017999	ATA	2	6	136050	136055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390936031
3114	NC_017999	GTCT	2	8	136103	136110	0 %	50 %	25 %	25 %	390936031
3115	NC_017999	GA	3	6	136111	136116	50 %	0 %	50 %	0 %	390936031
3116	NC_017999	TAA	2	6	136175	136180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390936031
3117	NC_017999	A	7	7	136320	136326	100 %	0 %	0 %	0 %	390936031
3118	NC_017999	CTT	2	6	136385	136390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390936031
3119	NC_017999	CCT	2	6	136429	136434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390936031
3120	NC_017999	GCC	2	6	136614	136619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936031
3121	NC_017999	TCAGGC	2	12	136654	136665	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	390936031
3122	NC_017999	GGC	2	6	136864	136869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3123	NC_017999	AAT	2	6	136916	136921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_017999	ATC	2	6	136922	136927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3125	NC_017999	TACC	2	8	137010	137017	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3144	NC_017999	CGGG	2	8	138118	138125	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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3252	NC_017999	CAG	2	6	142284	142289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936035
3253	NC_017999	GGT	2	6	142331	142336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390936035
3254	NC_017999	ACC	3	9	142347	142355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390936035
3255	NC_017999	TCA	2	6	142366	142371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936035
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3257	NC_017999	GAC	2	6	142476	142481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936035
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3263	NC_017999	CATCGG	2	12	142691	142702	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	390936035
3264	NC_017999	ATC	2	6	142746	142751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936035
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3280	NC_017999	AAC	2	6	143148	143153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390936035
3281	NC_017999	GGCAAC	2	12	143187	143198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936035
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3286	NC_017999	GTT	2	6	143429	143434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3289	NC_017999	AAT	2	6	143506	143511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3290	NC_017999	TGC	2	6	143554	143559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3292	NC_017999	GACG	2	8	143620	143627	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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3320	NC_017999	TGGT	2	8	144576	144583	0 %	50 %	50 %	0 %	390936036
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3322	NC_017999	CGC	2	6	144647	144652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936036
3323	NC_017999	CACG	2	8	144743	144750	25 %	0 %	25 %	50 %	390936036
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3329	NC_017999	CGG	2	6	144945	144950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936036
3330	NC_017999	GAG	2	6	144954	144959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390936036
3331	NC_017999	GTC	2	6	145020	145025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936036
3332	NC_017999	TGA	2	6	145034	145039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390936036
3333	NC_017999	CGGGC	2	10	145153	145162	0 %	0 %	60 %	40 %	390936036
3334	NC_017999	GGC	2	6	145204	145209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936036
3335	NC_017999	GTCG	2	8	145271	145278	0 %	25 %	50 %	25 %	390936036
3336	NC_017999	TCATC	2	10	145283	145292	20 %	40 %	0 %	40 %	390936036
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3351	NC_017999	ACG	2	6	145639	145644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936036
3352	NC_017999	CGC	2	6	145649	145654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936036
3353	NC_017999	GCCATC	2	12	145665	145676	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	390936036
3354	NC_017999	CGC	2	6	145680	145685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936036
3355	NC_017999	TGC	2	6	145699	145704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936036
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3357	NC_017999	CGT	2	6	145772	145777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936036
3358	NC_017999	GCT	2	6	145838	145843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936036
3359	NC_017999	TGAC	2	8	145850	145857	25 %	25 %	25 %	25 %	390936036
3360	NC_017999	ACA	2	6	145949	145954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3361	NC_017999	CCG	2	6	145977	145982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3362	NC_017999	CCG	2	6	146079	146084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936037
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3365	NC_017999	GAG	2	6	146132	146137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390936037
3366	NC_017999	GAC	2	6	146327	146332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936037
3367	NC_017999	CTG	2	6	146333	146338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936037
3368	NC_017999	ACG	2	6	146346	146351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936037
3369	NC_017999	GCC	2	6	146429	146434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936037
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3492	NC_017999	AGC	2	6	151993	151998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936042
3493	NC_017999	CTG	2	6	152007	152012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936042
3494	NC_017999	GTC	2	6	152088	152093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936042
3495	NC_017999	ATG	2	6	152321	152326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390936042
3496	NC_017999	GCC	2	6	152343	152348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936043
3497	NC_017999	TCGCA	2	10	152397	152406	20 %	20 %	20 %	40 %	390936043
3498	NC_017999	CTG	2	6	152444	152449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936043
3499	NC_017999	TCG	2	6	152481	152486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936043
3500	NC_017999	GCCGC	2	10	152579	152588	0 %	0 %	40 %	60 %	390936043

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