MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium bifidum BGN4 chromosome

Total Repeats: 52924

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017999	TGA	2	6	42444	42449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390935953
1002	NC_017999	CGTG	2	8	42526	42533	0 %	25 %	50 %	25 %	390935953
1003	NC_017999	ACG	2	6	42543	42548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935953
1004	NC_017999	TCA	2	6	42606	42611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390935953
1005	NC_017999	CGG	2	6	42619	42624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935953
1006	NC_017999	AAG	2	6	42647	42652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390935953
1007	NC_017999	AAT	2	6	42727	42732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_017999	ATT	2	6	42768	42773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_017999	TGC	2	6	42798	42803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935954
1010	NC_017999	TCG	2	6	42870	42875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935954
1011	NC_017999	TGG	2	6	42882	42887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390935954
1012	NC_017999	GGC	2	6	42985	42990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935954
1013	NC_017999	CAA	2	6	43000	43005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390935954
1014	NC_017999	GTC	2	6	43061	43066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935954
1015	NC_017999	CAG	2	6	43081	43086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935954
1016	NC_017999	CAG	2	6	43088	43093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935954
1017	NC_017999	CCA	2	6	43101	43106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390935954
1018	NC_017999	GC	3	6	43146	43151	0 %	0 %	50 %	50 %	390935954
1019	NC_017999	TCA	2	6	43182	43187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390935954
1020	NC_017999	CAG	2	6	43199	43204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935954
1021	NC_017999	GC	3	6	43221	43226	0 %	0 %	50 %	50 %	390935954
1022	NC_017999	GC	3	6	43268	43273	0 %	0 %	50 %	50 %	390935954
1023	NC_017999	TTG	2	6	43319	43324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390935954
1024	NC_017999	TGA	3	9	43330	43338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390935954
1025	NC_017999	GGC	2	6	43379	43384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935954
1026	NC_017999	CTG	2	6	43406	43411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935954
1027	NC_017999	CCG	2	6	43458	43463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390935954
1028	NC_017999	TTC	2	6	43511	43516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390935954
1029	NC_017999	ATC	2	6	43623	43628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390935954
1030	NC_017999	GGC	2	6	43642	43647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935954
1031	NC_017999	GAC	2	6	43706	43711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935954
1032	NC_017999	AAC	2	6	43763	43768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390935954
1033	NC_017999	CGG	2	6	43824	43829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935954
1034	NC_017999	GTG	2	6	43851	43856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390935954
1035	NC_017999	AT	3	6	43865	43870	50 %	50 %	0 %	0 %	390935954
1036	NC_017999	ATT	2	6	43905	43910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390935954
1037	NC_017999	GGT	2	6	43930	43935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390935954
1038	NC_017999	TGA	2	6	43977	43982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390935954
1039	NC_017999	TGC	2	6	44046	44051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935954
1040	NC_017999	TGG	2	6	44151	44156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390935954
1041	NC_017999	GC	3	6	44196	44201	0 %	0 %	50 %	50 %	390935954
1042	NC_017999	TA	3	6	44205	44210	50 %	50 %	0 %	0 %	390935954
1043	NC_017999	GAT	2	6	44216	44221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390935954
1044	NC_017999	CGG	2	6	44261	44266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935954
1045	NC_017999	GCG	2	6	44306	44311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935954
1046	NC_017999	TGA	2	6	44325	44330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390935954
1047	NC_017999	GCT	2	6	44332	44337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935954
1048	NC_017999	AAT	2	6	44475	44480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_017999	CGG	2	6	44533	44538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_017999	C	6	6	44595	44600	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1051	NC_017999	GCC	2	6	44766	44771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390935955
1052	NC_017999	GCTGAT	2	12	44787	44798	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	390935955
1053	NC_017999	GCG	2	6	44839	44844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935955
1054	NC_017999	ACGA	2	8	44878	44885	50 %	0 %	25 %	25 %	390935955
1055	NC_017999	CGTG	2	8	44939	44946	0 %	25 %	50 %	25 %	390935955
1056	NC_017999	AGC	2	6	44980	44985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935955
1057	NC_017999	ACC	2	6	45003	45008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390935955
1058	NC_017999	TGA	2	6	45023	45028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390935955
1059	NC_017999	TTG	2	6	45064	45069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390935955
1060	NC_017999	GCA	2	6	45089	45094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935955
1061	NC_017999	ATG	2	6	45112	45117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390935955
1062	NC_017999	GGT	2	6	45152	45157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390935955
1063	NC_017999	CGGC	2	8	45181	45188	0 %	0 %	50 %	50 %	390935955
1064	NC_017999	GAT	2	6	45225	45230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390935955
1065	NC_017999	GGC	3	9	45240	45248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935955
1066	NC_017999	TGATGT	2	12	45344	45355	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	390935955
1067	NC_017999	CG	3	6	45402	45407	0 %	0 %	50 %	50 %	390935955
1068	NC_017999	TGA	2	6	45455	45460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390935955
1069	NC_017999	GAA	2	6	45471	45476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390935955
1070	NC_017999	CAT	2	6	45477	45482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390935955
1071	NC_017999	GAA	2	6	45507	45512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390935955
1072	NC_017999	CGGCGA	2	12	45587	45598	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	390935955
1073	NC_017999	AC	3	6	45707	45712	50 %	0 %	0 %	50 %	390935955
1074	NC_017999	TTC	2	6	45802	45807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390935955
1075	NC_017999	CCA	2	6	45809	45814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390935955
1076	NC_017999	GAA	2	6	45846	45851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390935955
1077	NC_017999	GCGA	2	8	45856	45863	25 %	0 %	50 %	25 %	390935955
1078	NC_017999	GCT	2	6	45914	45919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935955
1079	NC_017999	GAT	2	6	45975	45980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390935955
1080	NC_017999	CTCA	2	8	46080	46087	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1081	NC_017999	CAT	2	6	46093	46098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_017999	CTA	2	6	46189	46194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_017999	TGG	2	6	46209	46214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_017999	GAT	2	6	46222	46227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_017999	TGAT	2	8	46286	46293	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_017999	G	10	10	46295	46304	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_017999	AGGGC	2	10	46326	46335	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1088	NC_017999	TCG	2	6	46373	46378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_017999	TGC	2	6	46390	46395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_017999	GC	4	8	46406	46413	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1091	NC_017999	CGG	2	6	46524	46529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935956
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1093	NC_017999	CTG	2	6	46573	46578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935956
1094	NC_017999	CTT	2	6	46606	46611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390935956
1095	NC_017999	AACGC	2	10	46620	46629	40 %	0 %	20 %	40 %	390935956
1096	NC_017999	CGGATG	2	12	46670	46681	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	390935956
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1098	NC_017999	TCG	2	6	46718	46723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935956
1099	NC_017999	TGG	2	6	46746	46751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390935956
1100	NC_017999	TCG	2	6	46763	46768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935956
1101	NC_017999	CTT	2	6	46774	46779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390935956
1102	NC_017999	TGT	2	6	46857	46862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390935956
1103	NC_017999	GCG	2	6	46958	46963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935956
1104	NC_017999	GC	3	6	46972	46977	0 %	0 %	50 %	50 %	390935956
1105	NC_017999	GTC	2	6	47014	47019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935956
1106	NC_017999	CGGG	2	8	47050	47057	0 %	0 %	75 %	25 %	390935956
1107	NC_017999	GCA	2	6	47067	47072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935956
1108	NC_017999	GCG	2	6	47088	47093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935956
1109	NC_017999	CAG	2	6	47131	47136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935956
1110	NC_017999	TCT	2	6	47214	47219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390935956
1111	NC_017999	GCA	2	6	47238	47243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935956
1112	NC_017999	CGG	2	6	47250	47255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935956
1113	NC_017999	CG	3	6	47374	47379	0 %	0 %	50 %	50 %	390935956
1114	NC_017999	CGAC	2	8	47399	47406	25 %	0 %	25 %	50 %	390935956
1115	NC_017999	CCA	2	6	47411	47416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390935956
1116	NC_017999	CGA	2	6	47463	47468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935956
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1118	NC_017999	GGT	2	6	47503	47508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390935956
1119	NC_017999	TTG	2	6	47558	47563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390935956
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1122	NC_017999	GAT	2	6	47758	47763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390935956
1123	NC_017999	GCG	2	6	47767	47772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935956
1124	NC_017999	GGC	2	6	47773	47778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935956
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1126	NC_017999	GC	3	6	47898	47903	0 %	0 %	50 %	50 %	390935956
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1247	NC_017999	T	6	6	53318	53323	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1248	NC_017999	GCAGC	2	10	53479	53488	20 %	0 %	40 %	40 %	390935960
1249	NC_017999	GCC	2	6	53497	53502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390935960
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