MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium bifidum BGN4 chromosome

Total Repeats: 52924

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017999	CGA	2	6	22099	22104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935938
502	NC_017999	GAGCCC	2	12	22112	22123	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	390935938
503	NC_017999	CCG	2	6	22125	22130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390935938
504	NC_017999	AGC	2	6	22131	22136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935938
505	NC_017999	GCT	2	6	22147	22152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935938
506	NC_017999	CAC	2	6	22197	22202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
507	NC_017999	GAA	2	6	22372	22377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_017999	GC	3	6	22395	22400	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
509	NC_017999	GGC	2	6	22467	22472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_017999	GC	3	6	22471	22476	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
511	NC_017999	CAA	2	6	22488	22493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_017999	ACG	2	6	22573	22578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935939
513	NC_017999	TTGTC	2	10	22695	22704	0 %	60 %	20 %	20 %	390935939
514	NC_017999	TGG	2	6	22715	22720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390935939
515	NC_017999	GCT	2	6	22721	22726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935939
516	NC_017999	TCAGGC	2	12	22796	22807	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	390935939
517	NC_017999	CCTT	2	8	22823	22830	0 %	50 %	0 %	50 %	390935939
518	NC_017999	ACG	2	6	22838	22843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935939
519	NC_017999	CAT	2	6	22929	22934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390935939
520	NC_017999	CGG	2	6	22935	22940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935939
521	NC_017999	CGC	2	6	22948	22953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390935939
522	NC_017999	AGCG	2	8	22954	22961	25 %	0 %	50 %	25 %	390935939
523	NC_017999	TCC	2	6	22973	22978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390935939
524	NC_017999	CGT	2	6	22980	22985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935939
525	NC_017999	ACCG	2	8	23020	23027	25 %	0 %	25 %	50 %	390935939
526	NC_017999	TGA	2	6	23049	23054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390935939
527	NC_017999	GCA	2	6	23078	23083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935939
528	NC_017999	CGT	2	6	23101	23106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935939
529	NC_017999	GCG	2	6	23115	23120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935939
530	NC_017999	CGC	2	6	23140	23145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390935939
531	NC_017999	GCT	2	6	23158	23163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935939
532	NC_017999	TGC	2	6	23215	23220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935939
533	NC_017999	CAGA	2	8	23250	23257	50 %	0 %	25 %	25 %	390935939
534	NC_017999	GC	3	6	23292	23297	0 %	0 %	50 %	50 %	390935939
535	NC_017999	GAT	2	6	23311	23316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390935939
536	NC_017999	CAT	3	9	23331	23339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390935939
537	NC_017999	CAGA	2	8	23355	23362	50 %	0 %	25 %	25 %	390935939
538	NC_017999	CGAGC	2	10	23392	23401	20 %	0 %	40 %	40 %	390935939
539	NC_017999	GAA	2	6	23470	23475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390935939
540	NC_017999	CTG	2	6	23539	23544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935939
541	NC_017999	CGAG	2	8	23553	23560	25 %	0 %	50 %	25 %	390935939
542	NC_017999	GCT	2	6	23569	23574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935939
543	NC_017999	GC	3	6	23679	23684	0 %	0 %	50 %	50 %	390935939
544	NC_017999	TGA	2	6	23712	23717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390935939
545	NC_017999	TGCC	2	8	23727	23734	0 %	25 %	25 %	50 %	390935939
546	NC_017999	CGCC	2	8	23769	23776	0 %	0 %	25 %	75 %	390935939
547	NC_017999	CTT	2	6	23785	23790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390935939
548	NC_017999	CGT	3	9	23796	23804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935939
549	NC_017999	CGT	2	6	23862	23867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935939
550	NC_017999	TGA	2	6	23901	23906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390935939
551	NC_017999	CCGT	2	8	23954	23961	0 %	25 %	25 %	50 %	390935939
552	NC_017999	GGT	2	6	23989	23994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390935939
553	NC_017999	CTG	2	6	24058	24063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935939
554	NC_017999	GC	3	6	24108	24113	0 %	0 %	50 %	50 %	390935939
555	NC_017999	CGG	2	6	24153	24158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935939
556	NC_017999	GTC	2	6	24166	24171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935939
557	NC_017999	GTTC	2	8	24186	24193	0 %	50 %	25 %	25 %	390935939
558	NC_017999	ACGCTG	2	12	24215	24226	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	390935939
559	NC_017999	TTG	2	6	24230	24235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390935939
560	NC_017999	ACGA	2	8	24242	24249	50 %	0 %	25 %	25 %	390935939
561	NC_017999	GTC	2	6	24253	24258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935939
562	NC_017999	TCG	2	6	24272	24277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935939
563	NC_017999	TCC	2	6	24365	24370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390935939
564	NC_017999	GCC	2	6	24406	24411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390935939
565	NC_017999	GCC	2	6	24433	24438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390935939
566	NC_017999	GGT	2	6	24448	24453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390935939
567	NC_017999	GC	3	6	24560	24565	0 %	0 %	50 %	50 %	390935939
568	NC_017999	GCC	2	6	24583	24588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390935939
569	NC_017999	CCG	2	6	24633	24638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390935939
570	NC_017999	GCC	2	6	24742	24747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390935939
571	NC_017999	GTT	2	6	24757	24762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390935939
572	NC_017999	GC	3	6	24794	24799	0 %	0 %	50 %	50 %	390935939
573	NC_017999	TGG	2	6	24807	24812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390935939
574	NC_017999	GTC	2	6	24895	24900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935939
575	NC_017999	GAT	2	6	24954	24959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390935939
576	NC_017999	CG	3	6	25097	25102	0 %	0 %	50 %	50 %	390935939
577	NC_017999	GCG	3	9	25100	25108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935939
578	NC_017999	TGCGCC	2	12	25166	25177	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	390935939
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580	NC_017999	GTT	2	6	25239	25244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390935939
581	NC_017999	GCT	2	6	25283	25288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935939
582	NC_017999	GTC	2	6	25291	25296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935939
583	NC_017999	CAT	2	6	25308	25313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390935939
584	NC_017999	GTC	2	6	25324	25329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935939
585	NC_017999	CAG	2	6	25387	25392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935939
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587	NC_017999	TGC	2	6	25502	25507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935939
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589	NC_017999	TTG	2	6	25529	25534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390935939
590	NC_017999	GTCG	2	8	25543	25550	0 %	25 %	50 %	25 %	390935939
591	NC_017999	CGGC	2	8	25601	25608	0 %	0 %	50 %	50 %	390935939
592	NC_017999	CTG	2	6	25615	25620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935939
593	NC_017999	CGT	2	6	25657	25662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935939
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596	NC_017999	GAT	2	6	25792	25797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390935939
597	NC_017999	GTC	2	6	25804	25809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935939
598	NC_017999	GCT	2	6	25831	25836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935939
599	NC_017999	GCC	2	6	25840	25845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390935939
600	NC_017999	GTT	2	6	25846	25851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390935939
601	NC_017999	GCCG	2	8	25867	25874	0 %	0 %	50 %	50 %	390935939
602	NC_017999	GGT	2	6	25918	25923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390935939
603	NC_017999	GGCGTC	2	12	25936	25947	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	390935939
604	NC_017999	GCT	2	6	25985	25990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935939
605	NC_017999	GCC	2	6	26000	26005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390935939
606	NC_017999	GTGAT	2	10	26040	26049	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
607	NC_017999	CT	3	6	26065	26070	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
608	NC_017999	TG	3	6	26123	26128	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
609	NC_017999	CGG	2	6	26173	26178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_017999	CCG	2	6	26399	26404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
611	NC_017999	GCG	2	6	26407	26412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_017999	A	7	7	26424	26430	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_017999	GGA	2	6	26471	26476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
614	NC_017999	ACC	2	6	26517	26522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
615	NC_017999	T	6	6	26607	26612	0 %	100 %	0 %	0 %	390935940
616	NC_017999	TCG	2	6	26634	26639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935940
617	NC_017999	TG	3	6	26641	26646	0 %	50 %	50 %	0 %	390935940
618	NC_017999	CGG	2	6	26739	26744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_017999	CGA	2	6	26761	26766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_017999	TGT	2	6	26793	26798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
621	NC_017999	GAT	2	6	26874	26879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390935941
622	NC_017999	GAT	2	6	26979	26984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390935941
623	NC_017999	GCG	2	6	26991	26996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935941
624	NC_017999	TGG	2	6	27031	27036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390935941
625	NC_017999	TCA	2	6	27106	27111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390935941
626	NC_017999	CGT	2	6	27182	27187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935941
627	NC_017999	CGG	2	6	27188	27193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935941
628	NC_017999	ATC	2	6	27237	27242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390935941
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723	NC_017999	ATGTCA	2	12	31666	31677	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	390935944
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751	NC_017999	CCA	2	6	32604	32609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390935945
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