MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium bifidum BGN4 chromosome

Total Repeats: 52924

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_017999	ATCGG	2	10	257450	257459	20 %	20 %	40 %	20 %	390936125
6002	NC_017999	GT	3	6	257488	257493	0 %	50 %	50 %	0 %	390936125
6003	NC_017999	CGT	2	6	257523	257528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936125
6004	NC_017999	ATA	2	6	257533	257538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390936125
6005	NC_017999	CGG	2	6	257578	257583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936125
6006	NC_017999	AGA	2	6	257595	257600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390936125
6007	NC_017999	TTGC	2	8	257735	257742	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6008	NC_017999	GCGA	2	8	257749	257756	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6009	NC_017999	GTCT	2	8	257788	257795	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6010	NC_017999	CCA	2	6	257833	257838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6011	NC_017999	T	6	6	257869	257874	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_017999	ATCT	2	8	257921	257928	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6013	NC_017999	AGAT	2	8	258040	258047	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_017999	GCG	2	6	258096	258101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6015	NC_017999	CGG	2	6	258113	258118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6016	NC_017999	CTT	2	6	258146	258151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390936126
6017	NC_017999	GGT	2	6	258158	258163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390936126
6018	NC_017999	GAC	2	6	258173	258178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936126
6019	NC_017999	CG	3	6	258225	258230	0 %	0 %	50 %	50 %	390936126
6020	NC_017999	GGCT	2	8	258273	258280	0 %	25 %	50 %	25 %	390936126
6021	NC_017999	TGG	2	6	258283	258288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390936126
6022	NC_017999	CGA	2	6	258334	258339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936126
6023	NC_017999	CGT	2	6	258406	258411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936126
6024	NC_017999	GGC	2	6	258440	258445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936126
6025	NC_017999	TGA	2	6	258604	258609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390936126
6026	NC_017999	TGA	2	6	258634	258639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390936126
6027	NC_017999	CCG	2	6	258660	258665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936126
6028	NC_017999	T	6	6	258760	258765	0 %	100 %	0 %	0 %	390936126
6029	NC_017999	CAG	2	6	258785	258790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936126
6030	NC_017999	CCCG	2	8	258853	258860	0 %	0 %	25 %	75 %	390936126
6031	NC_017999	GTGATG	2	12	258867	258878	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	390936126
6032	NC_017999	ATC	2	6	258918	258923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936126
6033	NC_017999	GTG	2	6	258984	258989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390936126
6034	NC_017999	GA	3	6	258992	258997	50 %	0 %	50 %	0 %	390936126
6035	NC_017999	TCC	2	6	259014	259019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390936126
6036	NC_017999	GC	3	6	259034	259039	0 %	0 %	50 %	50 %	390936126
6037	NC_017999	TGA	2	6	259072	259077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390936126
6038	NC_017999	T	6	6	259136	259141	0 %	100 %	0 %	0 %	390936126
6039	NC_017999	GT	3	6	259190	259195	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_017999	CGTT	2	8	259199	259206	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6041	NC_017999	GAAA	2	8	259249	259256	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_017999	ATG	2	6	259296	259301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_017999	CAT	2	6	259357	259362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936127
6044	NC_017999	TCGGAC	2	12	259409	259420	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	390936127
6045	NC_017999	CGT	2	6	259455	259460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936127
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6047	NC_017999	GCG	3	9	259490	259498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6048	NC_017999	ACG	2	6	259526	259531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6049	NC_017999	TGGC	2	8	259538	259545	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6050	NC_017999	TCG	2	6	259568	259573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6051	NC_017999	CGA	2	6	259596	259601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6052	NC_017999	GC	3	6	259605	259610	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6053	NC_017999	GGA	2	6	259659	259664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390936128
6054	NC_017999	GC	3	6	259700	259705	0 %	0 %	50 %	50 %	390936128
6055	NC_017999	GCC	2	6	259722	259727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936128
6056	NC_017999	CAT	2	6	259751	259756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936128
6057	NC_017999	CG	3	6	259810	259815	0 %	0 %	50 %	50 %	390936128
6058	NC_017999	CAA	2	6	259856	259861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390936128
6059	NC_017999	CGG	2	6	259889	259894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936128
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6061	NC_017999	GCC	2	6	260085	260090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936128
6062	NC_017999	CAA	2	6	260155	260160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6063	NC_017999	CAT	2	6	260173	260178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936129
6064	NC_017999	GTC	2	6	260201	260206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936129
6065	NC_017999	CGG	2	6	260215	260220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936129
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6094	NC_017999	C	10	10	261347	261356	0 %	0 %	0 %	100 %	390936130
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6097	NC_017999	CGA	2	6	261405	261410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936130
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6099	NC_017999	CGT	2	6	261481	261486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6101	NC_017999	CAC	2	6	261496	261501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6102	NC_017999	GAT	2	6	261502	261507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_017999	GGCCGG	2	12	261548	261559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6104	NC_017999	CGC	2	6	261627	261632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6105	NC_017999	AGA	2	6	261645	261650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6106	NC_017999	GAC	2	6	261797	261802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936131
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6108	NC_017999	CTG	2	6	261905	261910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936131
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6111	NC_017999	CCGA	2	8	262052	262059	25 %	0 %	25 %	50 %	390936131
6112	NC_017999	CAT	2	6	262147	262152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936131
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6119	NC_017999	CG	3	6	262547	262552	0 %	0 %	50 %	50 %	390936131
6120	NC_017999	GAA	2	6	262558	262563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390936131
6121	NC_017999	ATG	2	6	262601	262606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390936131
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6123	NC_017999	CAC	2	6	262699	262704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390936131
6124	NC_017999	CTT	2	6	262765	262770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390936131
6125	NC_017999	CGT	2	6	262835	262840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936131
6126	NC_017999	CGG	2	6	262876	262881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936131
6127	NC_017999	GGC	2	6	262978	262983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936131
6128	NC_017999	CTG	2	6	263014	263019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936131
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6143	NC_017999	GCT	2	6	263605	263610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936131
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6145	NC_017999	CGG	2	6	263620	263625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936131
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6147	NC_017999	TCG	2	6	263771	263776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936131
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6242	NC_017999	CGT	2	6	267500	267505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936135
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6248	NC_017999	CGC	2	6	267758	267763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936135
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6354	NC_017999	ACGG	2	8	272052	272059	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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6357	NC_017999	CGC	2	6	272134	272139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6360	NC_017999	GCT	2	6	272324	272329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6361	NC_017999	GCG	2	6	272396	272401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6362	NC_017999	ATTC	2	8	272408	272415	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6363	NC_017999	CCGGC	2	10	272438	272447	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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6489	NC_017999	CCG	2	6	277513	277518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6490	NC_017999	GCC	2	6	277537	277542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6491	NC_017999	CGG	2	6	277718	277723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936144
6492	NC_017999	CGGC	2	8	277738	277745	0 %	0 %	50 %	50 %	390936144
6493	NC_017999	CCG	2	6	277765	277770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936144
6494	NC_017999	GCT	2	6	277862	277867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936144
6495	NC_017999	CAT	2	6	277883	277888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936144
6496	NC_017999	CGGAC	2	10	277948	277957	20 %	0 %	40 %	40 %	390936144
6497	NC_017999	CGG	2	6	278020	278025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936144
6498	NC_017999	GAT	2	6	278045	278050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390936144
6499	NC_017999	GCG	2	6	278085	278090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936144
6500	NC_017999	CATCGC	2	12	278171	278182	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	390936144

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