MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium bifidum BGN4 chromosome

Total Repeats: 52924

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017999	GC	3	6	216022	216027	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5002	NC_017999	CAC	2	6	216090	216095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390936094
5003	NC_017999	CAT	2	6	216135	216140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936094
5004	NC_017999	TCG	3	9	216188	216196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936094
5005	NC_017999	CG	3	6	216215	216220	0 %	0 %	50 %	50 %	390936094
5006	NC_017999	TCA	2	6	216233	216238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936094
5007	NC_017999	CGA	2	6	216261	216266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936094
5008	NC_017999	GAAG	2	8	216303	216310	50 %	0 %	50 %	0 %	390936094
5009	NC_017999	ACC	2	6	216373	216378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390936094
5010	NC_017999	GGC	2	6	216420	216425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936094
5011	NC_017999	CGGG	2	8	216429	216436	0 %	0 %	75 %	25 %	390936094
5012	NC_017999	GCCG	2	8	216456	216463	0 %	0 %	50 %	50 %	390936094
5013	NC_017999	CGG	2	6	216468	216473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936094
5014	NC_017999	GAG	2	6	216481	216486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390936094
5015	NC_017999	CAC	2	6	216516	216521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390936094
5016	NC_017999	CG	3	6	216522	216527	0 %	0 %	50 %	50 %	390936094
5017	NC_017999	CTT	2	6	216553	216558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390936094
5018	NC_017999	CGA	2	6	216606	216611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936094
5019	NC_017999	TGG	2	6	216616	216621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390936094
5020	NC_017999	CGA	2	6	216666	216671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936094
5021	NC_017999	CGA	2	6	216705	216710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936094
5022	NC_017999	ACA	2	6	216872	216877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390936094
5023	NC_017999	CGC	2	6	216878	216883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936094
5024	NC_017999	GC	3	6	216882	216887	0 %	0 %	50 %	50 %	390936094
5025	NC_017999	ACG	2	6	216917	216922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936094
5026	NC_017999	ACC	2	6	216947	216952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390936094
5027	NC_017999	GAC	2	6	216964	216969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936094
5028	NC_017999	CGA	2	6	217077	217082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936094
5029	NC_017999	CA	3	6	217084	217089	50 %	0 %	0 %	50 %	390936094
5030	NC_017999	CG	3	6	217174	217179	0 %	0 %	50 %	50 %	390936094
5031	NC_017999	CG	3	6	217277	217282	0 %	0 %	50 %	50 %	390936094
5032	NC_017999	CAT	2	6	217314	217319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936094
5033	NC_017999	CGC	2	6	217320	217325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936094
5034	NC_017999	CGC	2	6	217410	217415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936094
5035	NC_017999	CGA	2	6	217419	217424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936094
5036	NC_017999	CG	3	6	217431	217436	0 %	0 %	50 %	50 %	390936094
5037	NC_017999	CGA	2	6	217449	217454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936094
5038	NC_017999	GGCCGC	2	12	217455	217466	0 %	0 %	50 %	50 %	390936094
5039	NC_017999	GGC	2	6	217488	217493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936094
5040	NC_017999	CAT	2	6	217533	217538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936094
5041	NC_017999	ACG	2	6	217553	217558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936094
5042	NC_017999	CGC	3	9	217575	217583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936094
5043	NC_017999	AGACCG	2	12	217610	217621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936094
5044	NC_017999	GCT	2	6	217626	217631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936094
5045	NC_017999	ATGAAG	2	12	217657	217668	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	390936094
5046	NC_017999	GCC	2	6	217728	217733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5047	NC_017999	AAGC	2	8	217749	217756	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5048	NC_017999	TGA	2	6	217786	217791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390936095
5049	NC_017999	CTA	2	6	217792	217797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936095
5050	NC_017999	GAG	2	6	217800	217805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390936095
5051	NC_017999	CCAG	2	8	217810	217817	25 %	0 %	25 %	50 %	390936095
5052	NC_017999	AAG	2	6	217830	217835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390936095
5053	NC_017999	CGCGC	2	10	217880	217889	0 %	0 %	40 %	60 %	390936095
5054	NC_017999	CCG	2	6	217915	217920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936095
5055	NC_017999	CGC	2	6	217924	217929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936095
5056	NC_017999	CG	3	6	217939	217944	0 %	0 %	50 %	50 %	390936095
5057	NC_017999	ACG	3	9	217959	217967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936095
5058	NC_017999	CCG	2	6	218011	218016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936095
5059	NC_017999	TGC	2	6	218017	218022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936095
5060	NC_017999	CCG	3	9	218044	218052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936095
5061	NC_017999	GCG	2	6	218074	218079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936095
5062	NC_017999	ACCC	2	8	218094	218101	25 %	0 %	0 %	75 %	390936095
5063	NC_017999	GCC	2	6	218136	218141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936095
5064	NC_017999	CGC	3	9	218144	218152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936095
5065	NC_017999	CG	3	6	218221	218226	0 %	0 %	50 %	50 %	390936095
5066	NC_017999	CGCT	2	8	218244	218251	0 %	25 %	25 %	50 %	390936095
5067	NC_017999	AAC	2	6	218280	218285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390936095
5068	NC_017999	TCG	2	6	218332	218337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936095
5069	NC_017999	GATG	2	8	218351	218358	25 %	25 %	50 %	0 %	390936095
5070	NC_017999	GAT	2	6	218381	218386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390936095
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5072	NC_017999	TCG	2	6	218602	218607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936095
5073	NC_017999	GC	3	6	218671	218676	0 %	0 %	50 %	50 %	390936095
5074	NC_017999	CGG	2	6	218689	218694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936095
5075	NC_017999	TCG	2	6	218695	218700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936095
5076	NC_017999	TGA	2	6	218723	218728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390936095
5077	NC_017999	TGGCG	2	10	218737	218746	0 %	20 %	60 %	20 %	390936095
5078	NC_017999	CAT	2	6	218879	218884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936095
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5080	NC_017999	TCG	2	6	218938	218943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936095
5081	NC_017999	CTG	2	6	219000	219005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936095
5082	NC_017999	GTGG	2	8	219017	219024	0 %	25 %	75 %	0 %	390936095
5083	NC_017999	TGC	2	6	219058	219063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936095
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5085	NC_017999	GAT	2	6	219099	219104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390936095
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5087	NC_017999	GAA	2	6	219218	219223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390936095
5088	NC_017999	CAC	2	6	219266	219271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390936095
5089	NC_017999	ACC	2	6	219279	219284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390936095
5090	NC_017999	GCC	2	6	219321	219326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5091	NC_017999	GCG	3	9	219359	219367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5092	NC_017999	CAT	2	6	219416	219421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5093	NC_017999	TA	3	6	219486	219491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_017999	TG	3	6	219501	219506	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_017999	TG	3	6	219524	219529	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_017999	TG	3	6	219543	219548	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_017999	TG	3	6	219615	219620	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_017999	GGT	2	6	219638	219643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_017999	CA	3	6	219646	219651	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5100	NC_017999	GCG	2	6	219675	219680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5101	NC_017999	CCG	2	6	219710	219715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936096
5102	NC_017999	GGT	2	6	219730	219735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390936096
5103	NC_017999	TCG	2	6	219881	219886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936096
5104	NC_017999	GCC	2	6	219889	219894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936096
5105	NC_017999	ATC	2	6	219910	219915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936096
5106	NC_017999	CAGC	2	8	219931	219938	25 %	0 %	25 %	50 %	390936096
5107	NC_017999	GGC	2	6	219979	219984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936096
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5110	NC_017999	GTTC	2	8	220065	220072	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5111	NC_017999	CGG	2	6	220092	220097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5112	NC_017999	TG	3	6	220116	220121	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_017999	CAAT	2	8	220176	220183	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5114	NC_017999	ATTG	2	8	220192	220199	25 %	50 %	25 %	0 %	390936097
5115	NC_017999	TGA	2	6	220206	220211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390936097
5116	NC_017999	TCA	2	6	220239	220244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936097
5117	NC_017999	TGA	2	6	220257	220262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390936097
5118	NC_017999	CTG	2	6	220268	220273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936097
5119	NC_017999	TTC	2	6	220313	220318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390936097
5120	NC_017999	CCGG	2	8	220369	220376	0 %	0 %	50 %	50 %	390936097
5121	NC_017999	GC	3	6	220382	220387	0 %	0 %	50 %	50 %	390936097
5122	NC_017999	TGGA	2	8	220388	220395	25 %	25 %	50 %	0 %	390936097
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5124	NC_017999	CGT	2	6	220464	220469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936097
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5247	NC_017999	CGA	2	6	225174	225179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936101
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5253	NC_017999	GCCGAT	2	12	225310	225321	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	390936101
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5265	NC_017999	CGGC	2	8	225743	225750	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5266	NC_017999	TAGA	2	8	225786	225793	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5369	NC_017999	GCG	2	6	230110	230115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936104
5370	NC_017999	CAA	2	6	230231	230236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390936104
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5372	NC_017999	ACT	2	6	230314	230319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936104
5373	NC_017999	GAT	2	6	230375	230380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390936104
5374	NC_017999	TCGACA	2	12	230425	230436	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	390936104
5375	NC_017999	GACC	2	8	230555	230562	25 %	0 %	25 %	50 %	390936104
5376	NC_017999	GTC	2	6	230571	230576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936104
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5379	NC_017999	CTG	2	6	230616	230621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936104
5380	NC_017999	CTG	2	6	230649	230654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936104
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5391	NC_017999	CCG	2	6	231025	231030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5392	NC_017999	TCGT	2	8	231092	231099	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5393	NC_017999	CCG	2	6	231174	231179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5394	NC_017999	CTC	2	6	231195	231200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5395	NC_017999	CCG	2	6	231228	231233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5396	NC_017999	ACG	2	6	231281	231286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5397	NC_017999	TTC	2	6	231313	231318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5399	NC_017999	TGGT	2	8	231431	231438	0 %	50 %	50 %	0 %	390936105
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5404	NC_017999	GCC	2	6	231647	231652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936105
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5421	NC_017999	TTGG	2	8	232362	232369	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5422	NC_017999	TCG	2	6	232393	232398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5426	NC_017999	CTA	2	6	232823	232828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5428	NC_017999	TAC	2	6	232976	232981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5490	NC_017999	GC	3	6	235968	235973	0 %	0 %	50 %	50 %	390936108
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5494	NC_017999	ATC	2	6	236114	236119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936108
5495	NC_017999	CGG	3	9	236134	236142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936108
5496	NC_017999	GGCGA	2	10	236168	236177	20 %	0 %	60 %	20 %	390936108
5497	NC_017999	GGCG	2	8	236230	236237	0 %	0 %	75 %	25 %	390936108
5498	NC_017999	GAC	2	6	236360	236365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936108
5499	NC_017999	AACC	2	8	236428	236435	50 %	0 %	0 %	50 %	390936108
5500	NC_017999	CCA	2	6	236493	236498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390936108

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