MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia sp. KJ006 chromosome 3

Total Repeats: 31924

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017922	ATC	2	6	16443	16448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387905826
502	NC_017922	GAC	2	6	16459	16464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387905826
503	NC_017922	CCG	2	6	16480	16485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387905826
504	NC_017922	GTA	2	6	16487	16492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387905826
505	NC_017922	GAA	2	6	16502	16507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387905826
506	NC_017922	TCA	2	6	16513	16518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387905826
507	NC_017922	CGC	2	6	16529	16534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387905826
508	NC_017922	CGG	2	6	16567	16572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387905826
509	NC_017922	CGT	2	6	16579	16584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387905826
510	NC_017922	TGCG	2	8	16586	16593	0 %	25 %	50 %	25 %	387905826
511	NC_017922	GCT	2	6	16630	16635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387905826
512	NC_017922	CG	3	6	16636	16641	0 %	0 %	50 %	50 %	387905826
513	NC_017922	CGG	3	9	16645	16653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387905826
514	NC_017922	CT	4	8	16727	16734	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
515	NC_017922	GCG	2	6	16814	16819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_017922	CTG	2	6	16825	16830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_017922	CGA	2	6	16863	16868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387905827
518	NC_017922	GTA	2	6	16890	16895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387905827
519	NC_017922	TGC	3	9	16933	16941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387905827
520	NC_017922	GCG	2	6	16952	16957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387905827
521	NC_017922	GAACGC	2	12	16983	16994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387905827
522	NC_017922	TGG	2	6	17014	17019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387905827
523	NC_017922	GCA	2	6	17020	17025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387905827
524	NC_017922	GCC	2	6	17056	17061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387905827
525	NC_017922	CG	3	6	17067	17072	0 %	0 %	50 %	50 %	387905827
526	NC_017922	TCC	2	6	17089	17094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387905827
527	NC_017922	CCA	2	6	17114	17119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387905827
528	NC_017922	TCG	2	6	17188	17193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387905827
529	NC_017922	CAG	2	6	17196	17201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387905827
530	NC_017922	AAC	2	6	17317	17322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387905827
531	NC_017922	CCT	2	6	17324	17329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387905827
532	NC_017922	GC	4	8	17371	17378	0 %	0 %	50 %	50 %	387905827
533	NC_017922	GCGAT	2	10	17380	17389	20 %	20 %	40 %	20 %	387905827
534	NC_017922	CGT	2	6	17402	17407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387905827
535	NC_017922	CGCT	2	8	17451	17458	0 %	25 %	25 %	50 %	387905827
536	NC_017922	GT	3	6	17483	17488	0 %	50 %	50 %	0 %	387905827
537	NC_017922	GAAA	2	8	17499	17506	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
538	NC_017922	TTC	2	6	17602	17607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387905828
539	NC_017922	CGG	2	6	17654	17659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387905828
540	NC_017922	CACAA	2	10	17665	17674	60 %	0 %	0 %	40 %	387905828
541	NC_017922	ACG	2	6	17694	17699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387905828
542	NC_017922	CAA	2	6	17756	17761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387905828
543	NC_017922	GCG	2	6	17884	17889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387905828
544	NC_017922	CGAG	2	8	17918	17925	25 %	0 %	50 %	25 %	387905828
545	NC_017922	GCC	2	6	17966	17971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387905828
546	NC_017922	CCG	2	6	17991	17996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387905828
547	NC_017922	GCG	2	6	18001	18006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387905828
548	NC_017922	GC	3	6	18055	18060	0 %	0 %	50 %	50 %	387905828
549	NC_017922	ACG	2	6	18087	18092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387905828
550	NC_017922	TGG	2	6	18156	18161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387905828
551	NC_017922	CGCC	2	8	18199	18206	0 %	0 %	25 %	75 %	387905828
552	NC_017922	CGT	2	6	18256	18261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387905828
553	NC_017922	GAC	2	6	18273	18278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387905828
554	NC_017922	TCG	2	6	18367	18372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387905828
555	NC_017922	GGA	2	6	18419	18424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387905828
556	NC_017922	GTCG	2	8	18539	18546	0 %	25 %	50 %	25 %	387905828
557	NC_017922	GGT	2	6	18619	18624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387905828
558	NC_017922	GGC	2	6	18647	18652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387905828
559	NC_017922	AAG	2	6	18660	18665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387905828
560	NC_017922	GGC	2	6	18722	18727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_017922	A	6	6	18789	18794	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_017922	CTG	2	6	18851	18856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_017922	GTC	2	6	18865	18870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_017922	GATTCG	2	12	18895	18906	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
565	NC_017922	GCA	2	6	18907	18912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_017922	CCG	2	6	18968	18973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
567	NC_017922	TCGG	2	8	18977	18984	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
568	NC_017922	GC	3	6	18995	19000	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
569	NC_017922	TGT	2	6	19009	19014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_017922	CCGC	2	8	19057	19064	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
571	NC_017922	ATA	2	6	19085	19090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_017922	AATG	2	8	19103	19110	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
573	NC_017922	ACA	2	6	19201	19206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_017922	TCG	2	6	19310	19315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_017922	CTGG	2	8	19373	19380	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
576	NC_017922	ACG	2	6	19438	19443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_017922	ATC	2	6	19459	19464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_017922	CGA	2	6	19564	19569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_017922	GTT	2	6	19573	19578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
580	NC_017922	GC	4	8	19632	19639	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
581	NC_017922	GCC	2	6	19680	19685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
582	NC_017922	GCA	2	6	19760	19765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_017922	AGA	2	6	19950	19955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
584	NC_017922	CCG	2	6	19979	19984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
585	NC_017922	TCTCG	2	10	20073	20082	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
586	NC_017922	TC	3	6	20093	20098	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
587	NC_017922	AT	3	6	20121	20126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_017922	GA	3	6	20143	20148	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
589	NC_017922	GAC	2	6	20200	20205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387905829
590	NC_017922	GCC	2	6	20225	20230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387905829
591	NC_017922	GGC	2	6	20240	20245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387905829
592	NC_017922	CGGC	2	8	20346	20353	0 %	0 %	50 %	50 %	387905829
593	NC_017922	A	6	6	20375	20380	100 %	0 %	0 %	0 %	387905829
594	NC_017922	TCG	3	9	20403	20411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387905829
595	NC_017922	GTCGCC	2	12	20485	20496	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	387905829
596	NC_017922	TCTT	2	8	20566	20573	0 %	75 %	0 %	25 %	387905829
597	NC_017922	GA	3	6	20614	20619	50 %	0 %	50 %	0 %	387905829
598	NC_017922	AGA	2	6	20644	20649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387905829
599	NC_017922	ACG	2	6	20720	20725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387905829
600	NC_017922	AGG	2	6	20760	20765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387905829
601	NC_017922	CG	3	6	20768	20773	0 %	0 %	50 %	50 %	387905829
602	NC_017922	CG	3	6	20820	20825	0 %	0 %	50 %	50 %	387905829
603	NC_017922	AAG	2	6	20865	20870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387905830
604	NC_017922	CTG	2	6	20901	20906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387905830
605	NC_017922	CGC	2	6	20927	20932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387905830
606	NC_017922	CGG	2	6	20959	20964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387905830
607	NC_017922	CCG	2	6	20974	20979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387905830
608	NC_017922	GAC	2	6	21011	21016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387905830
609	NC_017922	TCG	2	6	21202	21207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387905830
610	NC_017922	CGC	2	6	21222	21227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387905830
611	NC_017922	TGCG	2	8	21229	21236	0 %	25 %	50 %	25 %	387905830
612	NC_017922	CGA	2	6	21251	21256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387905830
613	NC_017922	AGC	2	6	21295	21300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387905830
614	NC_017922	CG	3	6	21318	21323	0 %	0 %	50 %	50 %	387905830
615	NC_017922	ACCACG	2	12	21325	21336	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	387905830
616	NC_017922	CGA	2	6	21383	21388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387905830
617	NC_017922	AC	3	6	21409	21414	50 %	0 %	0 %	50 %	387905830
618	NC_017922	CTC	2	6	21486	21491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387905830
619	NC_017922	ACG	2	6	21511	21516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387905830
620	NC_017922	CCG	2	6	21595	21600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387905830
621	NC_017922	CAA	2	6	21662	21667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387905830
622	NC_017922	ACGC	2	8	21677	21684	25 %	0 %	25 %	50 %	387905830
623	NC_017922	CG	4	8	21718	21725	0 %	0 %	50 %	50 %	387905830
624	NC_017922	CGGA	2	8	21748	21755	25 %	0 %	50 %	25 %	387905830
625	NC_017922	ACCACG	2	12	21882	21893	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
626	NC_017922	GCCG	2	8	21914	21921	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
627	NC_017922	TCG	2	6	21967	21972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387905831
628	NC_017922	GCT	2	6	21977	21982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387905831
629	NC_017922	CAG	2	6	21986	21991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387905831
630	NC_017922	GCCA	2	8	22038	22045	25 %	0 %	25 %	50 %	387905831
631	NC_017922	GAA	2	6	22049	22054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387905831
632	NC_017922	GCTT	2	8	22069	22076	0 %	50 %	25 %	25 %	387905831
633	NC_017922	CTT	3	9	22079	22087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387905831
634	NC_017922	TCG	2	6	22155	22160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387905831
635	NC_017922	TCG	2	6	22191	22196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387905831
636	NC_017922	TGCT	2	8	22233	22240	0 %	50 %	25 %	25 %	387905831
637	NC_017922	CGGCG	2	10	22259	22268	0 %	0 %	60 %	40 %	387905831
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641	NC_017922	CTT	2	6	22501	22506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387905831
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643	NC_017922	CCT	2	6	22615	22620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387905831
644	NC_017922	GATGCC	2	12	22736	22747	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	387905831
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652	NC_017922	AATC	2	8	23402	23409	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
653	NC_017922	CCATAT	2	12	23433	23444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
654	NC_017922	GTG	2	6	23581	23586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
655	NC_017922	GCA	2	6	23591	23596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
656	NC_017922	CGT	2	6	23669	23674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
657	NC_017922	AGG	2	6	23744	23749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
658	NC_017922	TGG	2	6	23757	23762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
659	NC_017922	GGGC	2	8	23776	23783	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
660	NC_017922	TCG	2	6	23811	23816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
661	NC_017922	AGT	2	6	23825	23830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
662	NC_017922	C	6	6	24119	24124	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
663	NC_017922	AGT	2	6	24162	24167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
664	NC_017922	AAG	2	6	24170	24175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
665	NC_017922	CGT	2	6	24180	24185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
666	NC_017922	AC	3	6	24201	24206	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
667	NC_017922	AACC	2	8	24223	24230	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
668	NC_017922	GCC	2	6	24312	24317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
669	NC_017922	AC	3	6	24367	24372	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
670	NC_017922	C	6	6	24433	24438	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
671	NC_017922	AGC	2	6	24497	24502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
672	NC_017922	GCG	2	6	24514	24519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
673	NC_017922	CGG	2	6	24536	24541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
674	NC_017922	GGA	2	6	24543	24548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
675	NC_017922	GT	3	6	24575	24580	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
676	NC_017922	CCT	2	6	24678	24683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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678	NC_017922	GGC	2	6	24760	24765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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680	NC_017922	TGC	2	6	24798	24803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
681	NC_017922	TCG	2	6	24820	24825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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683	NC_017922	CGG	2	6	24857	24862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
684	NC_017922	GGC	2	6	24876	24881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
685	NC_017922	AAC	2	6	24914	24919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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691	NC_017922	CCGC	2	8	25240	25247	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
692	NC_017922	CG	3	6	25303	25308	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
693	NC_017922	GGCC	2	8	25394	25401	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
694	NC_017922	TCG	2	6	25408	25413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
695	NC_017922	AC	3	6	25438	25443	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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754	NC_017922	GCC	2	6	27637	27642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387905834
755	NC_017922	GC	3	6	27643	27648	0 %	0 %	50 %	50 %	387905834
756	NC_017922	ACCGG	2	10	27671	27680	20 %	0 %	40 %	40 %	387905834
757	NC_017922	ACC	2	6	27709	27714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387905834
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759	NC_017922	ACG	2	6	27835	27840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387905834
760	NC_017922	CG	4	8	27845	27852	0 %	0 %	50 %	50 %	387905834
761	NC_017922	CGG	2	6	27946	27951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387905834
762	NC_017922	CGGC	2	8	27955	27962	0 %	0 %	50 %	50 %	387905834
763	NC_017922	CGG	3	9	28028	28036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387905834
764	NC_017922	GCGAC	2	10	28057	28066	20 %	0 %	40 %	40 %	387905834
765	NC_017922	GCGA	2	8	28069	28076	25 %	0 %	50 %	25 %	387905834
766	NC_017922	CGT	2	6	28122	28127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387905834
767	NC_017922	CGCAG	2	10	28142	28151	20 %	0 %	40 %	40 %	387905834
768	NC_017922	TCGC	2	8	28185	28192	0 %	25 %	25 %	50 %	387905834
769	NC_017922	CGA	2	6	28282	28287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387905834
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772	NC_017922	GCGT	2	8	28527	28534	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
773	NC_017922	GCCGC	2	10	28544	28553	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
774	NC_017922	GC	3	6	28552	28557	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
775	NC_017922	CTG	2	6	28562	28567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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778	NC_017922	CG	3	6	28625	28630	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
779	NC_017922	CTG	2	6	28634	28639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
780	NC_017922	CTG	2	6	28659	28664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
781	NC_017922	CGTGC	2	10	28695	28704	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
782	NC_017922	GAT	2	6	28766	28771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387905835
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787	NC_017922	GGC	2	6	28997	29002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387905835
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841	NC_017922	CGG	3	9	30939	30947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
842	NC_017922	GC	3	6	30952	30957	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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851	NC_017922	GGGGCG	2	12	31439	31450	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
852	NC_017922	CGGA	2	8	31480	31487	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
853	NC_017922	CAG	2	6	31617	31622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
854	NC_017922	TA	3	6	31681	31686	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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857	NC_017922	TA	3	6	32001	32006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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859	NC_017922	CCGG	2	8	32030	32037	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
860	NC_017922	ACAGCG	2	12	32052	32063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
861	NC_017922	AGT	2	6	32066	32071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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864	NC_017922	TCCA	2	8	32181	32188	25 %	25 %	0 %	50 %	387905838
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883	NC_017922	GCGCG	2	10	33142	33151	0 %	0 %	60 %	40 %	387905840
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891	NC_017922	GCG	2	6	33448	33453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387905840
892	NC_017922	CG	3	6	33483	33488	0 %	0 %	50 %	50 %	387905840
893	NC_017922	TGCG	2	8	33498	33505	0 %	25 %	50 %	25 %	387905840
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