MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Burkholderia sp. KJ006 chromosome 2

Total Repeats: 2488

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017921	GACGC	2	10	715	724	20 %	0 %	40 %	40 %	387903682
2	NC_017921	CGAGC	2	10	1064	1073	20 %	0 %	40 %	40 %	387903682
3	NC_017921	GCGCG	2	10	1498	1507	0 %	0 %	60 %	40 %	387903682
4	NC_017921	TCGCG	2	10	1950	1959	0 %	20 %	40 %	40 %	387903682
5	NC_017921	GCGTC	2	10	2047	2056	0 %	20 %	40 %	40 %	387903682
6	NC_017921	TCGCC	2	10	2942	2951	0 %	20 %	20 %	60 %	387903683
7	NC_017921	CGCGC	2	10	2952	2961	0 %	0 %	40 %	60 %	387903683
8	NC_017921	TGCGC	2	10	7830	7839	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
9	NC_017921	CCCGG	2	10	8065	8074	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
10	NC_017921	TCGGG	2	10	9553	9562	0 %	20 %	60 %	20 %	387903687
11	NC_017921	GCAAC	2	10	9963	9972	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
12	NC_017921	GCCCC	2	10	13721	13730	0 %	0 %	20 %	80 %	387903690
13	NC_017921	CGGCG	2	10	14187	14196	0 %	0 %	60 %	40 %	387903690
14	NC_017921	CGATG	2	10	14888	14897	20 %	20 %	40 %	20 %	387903690
15	NC_017921	TCTCT	2	10	15454	15463	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
16	NC_017921	TCGGC	2	10	15614	15623	0 %	20 %	40 %	40 %	387903691
17	NC_017921	GCCGC	2	10	16076	16085	0 %	0 %	40 %	60 %	387903691
18	NC_017921	GCGAC	2	10	16097	16106	20 %	0 %	40 %	40 %	387903691
19	NC_017921	GCATC	2	10	17303	17312	20 %	20 %	20 %	40 %	387903692
20	NC_017921	CGACG	2	10	18539	18548	20 %	0 %	40 %	40 %	387903693
21	NC_017921	CCGTT	2	10	18954	18963	0 %	40 %	20 %	40 %	387903693
22	NC_017921	TGCGC	2	10	19741	19750	0 %	20 %	40 %	40 %	387903694
23	NC_017921	GGTCG	2	10	19834	19843	0 %	20 %	60 %	20 %	387903694
24	NC_017921	GACGC	2	10	20591	20600	20 %	0 %	40 %	40 %	387903694
25	NC_017921	TGCAT	2	10	21504	21513	20 %	40 %	20 %	20 %	387903695
26	NC_017921	GCGCC	2	10	25229	25238	0 %	0 %	40 %	60 %	387903699
27	NC_017921	GCCGC	2	10	27572	27581	0 %	0 %	40 %	60 %	387903702
28	NC_017921	CGCGC	2	10	27850	27859	0 %	0 %	40 %	60 %	387903702
29	NC_017921	GCCCG	2	10	28992	29001	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
30	NC_017921	CGACG	2	10	29104	29113	20 %	0 %	40 %	40 %	387903703
31	NC_017921	TTTTC	2	10	31484	31493	0 %	80 %	0 %	20 %	387903704
32	NC_017921	GCGCC	2	10	32625	32634	0 %	0 %	40 %	60 %	387903705
33	NC_017921	CGGCC	2	10	33577	33586	0 %	0 %	40 %	60 %	387903706
34	NC_017921	CGGCG	2	10	33829	33838	0 %	0 %	60 %	40 %	387903706
35	NC_017921	GGGCC	2	10	35056	35065	0 %	0 %	60 %	40 %	387903707
36	NC_017921	CGCGC	2	10	37439	37448	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
37	NC_017921	CGCGC	2	10	38105	38114	0 %	0 %	40 %	60 %	387903711
38	NC_017921	CGCTG	2	10	38443	38452	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
39	NC_017921	ACACG	2	10	40087	40096	40 %	0 %	20 %	40 %	387903714
40	NC_017921	CCGCC	2	10	40233	40242	0 %	0 %	20 %	80 %	387903714
41	NC_017921	TGCCG	2	10	41789	41798	0 %	20 %	40 %	40 %	387903715
42	NC_017921	GCGTC	2	10	41844	41853	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
43	NC_017921	GCGCC	2	10	42290	42299	0 %	0 %	40 %	60 %	387903716
44	NC_017921	CGGCG	2	10	42474	42483	0 %	0 %	60 %	40 %	387903716
45	NC_017921	TCGCA	2	10	46895	46904	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
46	NC_017921	GCGCG	2	10	47236	47245	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
47	NC_017921	GGCCG	2	10	47467	47476	0 %	0 %	60 %	40 %	387903724
48	NC_017921	GCACG	2	10	48624	48633	20 %	0 %	40 %	40 %	387903726
49	NC_017921	CCGCG	2	10	49936	49945	0 %	0 %	40 %	60 %	387903729
50	NC_017921	GCACG	2	10	50621	50630	20 %	0 %	40 %	40 %	387903729
51	NC_017921	AGAAA	2	10	51339	51348	80 %	0 %	20 %	0 %	387903730
52	NC_017921	CTCCC	2	10	51490	51499	0 %	20 %	0 %	80 %	387903730
53	NC_017921	TGCGC	2	10	57450	57459	0 %	20 %	40 %	40 %	387903735
54	NC_017921	GCGAG	2	10	59151	59160	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
55	NC_017921	TGCGA	2	10	60697	60706	20 %	20 %	40 %	20 %	387903740
56	NC_017921	CGGCG	2	10	62042	62051	0 %	0 %	60 %	40 %	387903742
57	NC_017921	CGGGT	2	10	62748	62757	0 %	20 %	60 %	20 %	387903743
58	NC_017921	CCGCG	2	10	63343	63352	0 %	0 %	40 %	60 %	387903743
59	NC_017921	TGACT	2	10	63682	63691	20 %	40 %	20 %	20 %	387903743
60	NC_017921	ACGCG	2	10	64347	64356	20 %	0 %	40 %	40 %	387903744
61	NC_017921	CGTGG	2	10	64678	64687	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
62	NC_017921	TCGCG	2	10	65059	65068	0 %	20 %	40 %	40 %	387903745
63	NC_017921	GCCGG	2	10	65157	65166	0 %	0 %	60 %	40 %	387903745
64	NC_017921	ATCCG	2	10	68799	68808	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
65	NC_017921	TTTCA	2	10	68972	68981	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_017921	CGACA	2	10	69180	69189	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
67	NC_017921	CCGCG	2	10	69908	69917	0 %	0 %	40 %	60 %	387903748
68	NC_017921	CACTG	2	10	70375	70384	20 %	20 %	20 %	40 %	387903748
69	NC_017921	CATCG	2	10	71916	71925	20 %	20 %	20 %	40 %	387903750
70	NC_017921	TCCGA	2	10	72064	72073	20 %	20 %	20 %	40 %	387903750
71	NC_017921	GCCGC	2	10	72153	72162	0 %	0 %	40 %	60 %	387903750
72	NC_017921	CGTCG	2	10	72255	72264	0 %	20 %	40 %	40 %	387903750
73	NC_017921	CAGCG	2	10	72678	72687	20 %	0 %	40 %	40 %	387903750
74	NC_017921	CCGGC	2	10	73832	73841	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
75	NC_017921	CGCGA	2	10	74142	74151	20 %	0 %	40 %	40 %	387903752
76	NC_017921	TGCCC	2	10	76830	76839	0 %	20 %	20 %	60 %	387903754
77	NC_017921	CGCGC	2	10	76873	76882	0 %	0 %	40 %	60 %	387903754
78	NC_017921	GCGAC	2	10	76947	76956	20 %	0 %	40 %	40 %	387903754
79	NC_017921	GCCGC	2	10	77428	77437	0 %	0 %	40 %	60 %	387903755
80	NC_017921	CGCGC	2	10	77679	77688	0 %	0 %	40 %	60 %	387903755
81	NC_017921	TCGCG	2	10	77756	77765	0 %	20 %	40 %	40 %	387903755
82	NC_017921	TCGCC	2	10	77855	77864	0 %	20 %	20 %	60 %	387903755
83	NC_017921	CATCG	2	10	78549	78558	20 %	20 %	20 %	40 %	387903755
84	NC_017921	AGCGC	2	10	78898	78907	20 %	0 %	40 %	40 %	387903756
85	NC_017921	GGCCG	2	10	79087	79096	0 %	0 %	60 %	40 %	387903756
86	NC_017921	CTGCG	2	10	79428	79437	0 %	20 %	40 %	40 %	387903756
87	NC_017921	GACGT	2	10	79974	79983	20 %	20 %	40 %	20 %	387903757
88	NC_017921	GACGT	2	10	81408	81417	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
89	NC_017921	CGCGG	2	10	82113	82122	0 %	0 %	60 %	40 %	387903760
90	NC_017921	CGTCG	2	10	82592	82601	0 %	20 %	40 %	40 %	387903760
91	NC_017921	TTCGA	2	10	82710	82719	20 %	40 %	20 %	20 %	387903760
92	NC_017921	CGCGC	2	10	82762	82771	0 %	0 %	40 %	60 %	387903760
93	NC_017921	ACGGC	2	10	89390	89399	20 %	0 %	40 %	40 %	387903768
94	NC_017921	AAGGC	2	10	89450	89459	40 %	0 %	40 %	20 %	387903768
95	NC_017921	GTGCT	2	10	90133	90142	0 %	40 %	40 %	20 %	387903768
96	NC_017921	TCGGG	2	10	91097	91106	0 %	20 %	60 %	20 %	387903768
97	NC_017921	CAGCG	2	10	91549	91558	20 %	0 %	40 %	40 %	387903769
98	NC_017921	CCGGC	2	10	92323	92332	0 %	0 %	40 %	60 %	387903769
99	NC_017921	TGCAA	2	10	92727	92736	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
100	NC_017921	GCCGC	2	10	92825	92834	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
101	NC_017921	GCGAC	2	10	93243	93252	20 %	0 %	40 %	40 %	387903770
102	NC_017921	TCGAC	2	10	94080	94089	20 %	20 %	20 %	40 %	387903772
103	NC_017921	GCGCT	2	10	94572	94581	0 %	20 %	40 %	40 %	387903772
104	NC_017921	TCGAT	2	10	95676	95685	20 %	40 %	20 %	20 %	387903774
105	NC_017921	CGCAC	2	10	97649	97658	20 %	0 %	20 %	60 %	387903776
106	NC_017921	TCGCG	2	10	100115	100124	0 %	20 %	40 %	40 %	387903779
107	NC_017921	CGGCG	2	10	101064	101073	0 %	0 %	60 %	40 %	387903780
108	NC_017921	ATTGC	2	10	105148	105157	20 %	40 %	20 %	20 %	387903784
109	NC_017921	ACGAC	2	10	106157	106166	40 %	0 %	20 %	40 %	387903785
110	NC_017921	GAACG	2	10	106772	106781	40 %	0 %	40 %	20 %	387903786
111	NC_017921	GCTCG	2	10	107058	107067	0 %	20 %	40 %	40 %	387903787
112	NC_017921	GCGCG	2	10	107211	107220	0 %	0 %	60 %	40 %	387903787
113	NC_017921	CGCGC	2	10	107872	107881	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
114	NC_017921	GCGCC	2	10	109040	109049	0 %	0 %	40 %	60 %	387903789
115	NC_017921	CGCGG	2	10	109799	109808	0 %	0 %	60 %	40 %	387903789
116	NC_017921	GCGAT	2	10	110042	110051	20 %	20 %	40 %	20 %	387903789
117	NC_017921	GCGTC	2	10	111504	111513	0 %	20 %	40 %	40 %	387903790
118	NC_017921	ACGCG	2	10	111852	111861	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
119	NC_017921	AGCAG	2	10	111927	111936	40 %	0 %	40 %	20 %	387903791
120	NC_017921	CGGGC	2	10	113148	113157	0 %	0 %	60 %	40 %	387903792
121	NC_017921	CGCGC	2	10	113175	113184	0 %	0 %	40 %	60 %	387903792
122	NC_017921	GCCGC	2	10	116192	116201	0 %	0 %	40 %	60 %	387903794
123	NC_017921	GCGCA	2	10	116675	116684	20 %	0 %	40 %	40 %	387903795
124	NC_017921	CCGTG	2	10	117178	117187	0 %	20 %	40 %	40 %	387903795
125	NC_017921	GCCGG	2	10	117880	117889	0 %	0 %	60 %	40 %	387903795
126	NC_017921	GCTTC	2	10	120728	120737	0 %	40 %	20 %	40 %	387903797
127	NC_017921	TCGGT	2	10	121059	121068	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
128	NC_017921	GTGCA	2	10	123670	123679	20 %	20 %	40 %	20 %	387903800
129	NC_017921	CGGCT	2	10	124449	124458	0 %	20 %	40 %	40 %	387903801
130	NC_017921	CTTTT	2	10	124904	124913	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_017921	AGCGG	2	10	125113	125122	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
132	NC_017921	GCACC	2	10	125457	125466	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
133	NC_017921	CCCGG	2	10	126349	126358	0 %	0 %	40 %	60 %	387903802
134	NC_017921	CGGCG	2	10	127019	127028	0 %	0 %	60 %	40 %	387903803
135	NC_017921	CGATG	2	10	127238	127247	20 %	20 %	40 %	20 %	387903803
136	NC_017921	CGCTG	2	10	127775	127784	0 %	20 %	40 %	40 %	387903803
137	NC_017921	TCGCG	2	10	128056	128065	0 %	20 %	40 %	40 %	387903803
138	NC_017921	GCGCC	2	10	129634	129643	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
139	NC_017921	CGACG	2	10	129808	129817	20 %	0 %	40 %	40 %	387903805
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156	NC_017921	GCCCG	2	10	149725	149734	0 %	0 %	40 %	60 %	387903825
157	NC_017921	CGTGT	2	10	150144	150153	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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252	NC_017921	GCGCC	2	10	249355	249364	0 %	0 %	40 %	60 %	387903906
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254	NC_017921	GCCCC	2	10	250089	250098	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
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258	NC_017921	GGTCG	2	10	251455	251464	0 %	20 %	60 %	20 %	387903909
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269	NC_017921	GCGCC	2	10	265513	265522	0 %	0 %	40 %	60 %	387903920
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271	NC_017921	CTCCC	2	10	269536	269545	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
272	NC_017921	CACGA	2	10	271028	271037	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
273	NC_017921	ACCGC	2	10	272453	272462	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
274	NC_017921	CCGCG	2	10	272476	272485	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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402	NC_017921	CGACG	2	10	388503	388512	20 %	0 %	40 %	40 %	387904036
403	NC_017921	GGTCG	2	10	388929	388938	0 %	20 %	60 %	20 %	387904036
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405	NC_017921	GCGTC	2	10	392475	392484	0 %	20 %	40 %	40 %	387904040
406	NC_017921	GCCGT	2	10	392916	392925	0 %	20 %	40 %	40 %	387904041
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408	NC_017921	GCCGG	2	10	394952	394961	0 %	0 %	60 %	40 %	387904043
409	NC_017921	CGCGA	2	10	395138	395147	20 %	0 %	40 %	40 %	387904043
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433	NC_017921	GCGTC	2	10	414138	414147	0 %	20 %	40 %	40 %	387904058
434	NC_017921	TCGCA	2	10	415288	415297	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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443	NC_017921	AAATG	2	10	425551	425560	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
444	NC_017921	CGGCG	2	10	426708	426717	0 %	0 %	60 %	40 %	387904068
445	NC_017921	TGTTC	2	10	427663	427672	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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447	NC_017921	GCCGC	2	10	433213	433222	0 %	0 %	40 %	60 %	387904072
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449	NC_017921	CGGCG	2	10	434279	434288	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
450	NC_017921	TGCGA	2	10	434427	434436	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
451	NC_017921	AAAAC	2	10	434566	434575	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
452	NC_017921	GAAGA	2	10	435067	435076	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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456	NC_017921	GGTCG	2	10	438725	438734	0 %	20 %	60 %	20 %	387904077
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500	NC_017921	CGGCG	2	10	481547	481556	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding

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