MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia sp. KJ006 chromosome 1

Total Repeats: 95267

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017920	GCG	2	6	23678	23683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_017920	CGA	3	9	23742	23750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_017920	GC	3	6	23757	23762	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
504	NC_017920	GC	3	6	23800	23805	0 %	0 %	50 %	50 %	387900774
505	NC_017920	CGA	2	6	23820	23825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387900774
506	NC_017920	GC	3	6	23847	23852	0 %	0 %	50 %	50 %	387900774
507	NC_017920	GCC	2	6	23870	23875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387900774
508	NC_017920	CGA	2	6	23877	23882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387900774
509	NC_017920	AGCGC	2	10	23939	23948	20 %	0 %	40 %	40 %	387900774
510	NC_017920	GCT	2	6	23964	23969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387900774
511	NC_017920	CGA	2	6	23982	23987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387900774
512	NC_017920	CCG	2	6	24008	24013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387900774
513	NC_017920	CGC	2	6	24024	24029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387900774
514	NC_017920	GC	4	8	24028	24035	0 %	0 %	50 %	50 %	387900774
515	NC_017920	CGGC	2	8	24051	24058	0 %	0 %	50 %	50 %	387900774
516	NC_017920	CGA	2	6	24063	24068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387900774
517	NC_017920	GCAGC	2	10	24069	24078	20 %	0 %	40 %	40 %	387900774
518	NC_017920	CTG	3	9	24079	24087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387900774
519	NC_017920	TCG	2	6	24089	24094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387900774
520	NC_017920	TC	3	6	24223	24228	0 %	50 %	0 %	50 %	387900774
521	NC_017920	TGA	2	6	24233	24238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387900774
522	NC_017920	CGA	2	6	24257	24262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387900775
523	NC_017920	CGA	3	9	24296	24304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387900775
524	NC_017920	GC	4	8	24306	24313	0 %	0 %	50 %	50 %	387900775
525	NC_017920	GCA	2	6	24371	24376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387900775
526	NC_017920	CCG	2	6	24421	24426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387900775
527	NC_017920	TTCG	2	8	24454	24461	0 %	50 %	25 %	25 %	387900775
528	NC_017920	CGC	2	6	24462	24467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387900775
529	NC_017920	TTCG	2	8	24503	24510	0 %	50 %	25 %	25 %	387900775
530	NC_017920	CGG	2	6	24536	24541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387900775
531	NC_017920	GC	3	6	24549	24554	0 %	0 %	50 %	50 %	387900775
532	NC_017920	CGC	3	9	24565	24573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387900775
533	NC_017920	GAT	2	6	24611	24616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387900775
534	NC_017920	GGT	2	6	24617	24622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387900775
535	NC_017920	CGA	2	6	24652	24657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387900775
536	NC_017920	GC	3	6	24748	24753	0 %	0 %	50 %	50 %	387900775
537	NC_017920	GTT	2	6	24755	24760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387900775
538	NC_017920	GCG	2	6	24772	24777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387900775
539	NC_017920	GCT	2	6	24860	24865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387900775
540	NC_017920	GGT	2	6	24935	24940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387900775
541	NC_017920	CAG	2	6	24990	24995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387900775
542	NC_017920	G	6	6	25002	25007	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
543	NC_017920	CGG	2	6	25014	25019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_017920	TGG	2	6	25026	25031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
545	NC_017920	CA	3	6	25109	25114	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
546	NC_017920	GTCTC	2	10	25119	25128	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
547	NC_017920	TCT	2	6	25184	25189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_017920	GC	3	6	25190	25195	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
549	NC_017920	TGCA	2	8	25224	25231	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
550	NC_017920	TCG	2	6	25237	25242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_017920	GCG	2	6	25286	25291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_017920	CA	3	6	25297	25302	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
553	NC_017920	GCA	2	6	25458	25463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_017920	GGC	2	6	25466	25471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_017920	GCCC	2	8	25476	25483	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
556	NC_017920	CG	3	6	25501	25506	0 %	0 %	50 %	50 %	387900776
557	NC_017920	CGC	2	6	25579	25584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387900776
558	NC_017920	GCA	2	6	25599	25604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387900776
559	NC_017920	GCC	2	6	25609	25614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387900776
560	NC_017920	CGTC	2	8	25620	25627	0 %	25 %	25 %	50 %	387900776
561	NC_017920	TCG	2	6	25730	25735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387900776
562	NC_017920	GAT	2	6	25738	25743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387900776
563	NC_017920	GCC	2	6	25776	25781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387900776
564	NC_017920	GC	3	6	25827	25832	0 %	0 %	50 %	50 %	387900776
565	NC_017920	AGC	2	6	25857	25862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387900776
566	NC_017920	GTT	2	6	25864	25869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387900776
567	NC_017920	ACC	2	6	25973	25978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387900776
568	NC_017920	CAG	3	9	26068	26076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387900776
569	NC_017920	CCGA	2	8	26078	26085	25 %	0 %	25 %	50 %	387900776
570	NC_017920	GCA	2	6	26154	26159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387900776
571	NC_017920	CGG	2	6	26182	26187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387900776
572	NC_017920	AGC	2	6	26194	26199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387900776
573	NC_017920	A	6	6	26234	26239	100 %	0 %	0 %	0 %	387900776
574	NC_017920	ATCG	2	8	26259	26266	25 %	25 %	25 %	25 %	387900776
575	NC_017920	CT	3	6	26284	26289	0 %	50 %	0 %	50 %	387900776
576	NC_017920	GAT	2	6	26362	26367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387900776
577	NC_017920	ATC	2	6	26398	26403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387900776
578	NC_017920	AGC	2	6	26501	26506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387900776
579	NC_017920	TCG	2	6	26531	26536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387900776
580	NC_017920	CGT	2	6	26599	26604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_017920	ACG	2	6	26659	26664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_017920	GCCG	2	8	26687	26694	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
583	NC_017920	GCCGC	2	10	26809	26818	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
584	NC_017920	GCA	2	6	26843	26848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_017920	AGCT	2	8	26877	26884	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
586	NC_017920	CGCA	2	8	26973	26980	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
587	NC_017920	CCT	2	6	27094	27099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
588	NC_017920	CGC	2	6	27140	27145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
589	NC_017920	GCA	2	6	27167	27172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_017920	AAC	2	6	27176	27181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_017920	TCG	2	6	27185	27190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_017920	CGA	2	6	27311	27316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_017920	CGC	2	6	27339	27344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
594	NC_017920	A	6	6	27382	27387	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_017920	CT	3	6	27421	27426	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
596	NC_017920	CTT	2	6	27438	27443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_017920	CAC	2	6	27469	27474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
598	NC_017920	TGG	2	6	27482	27487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
599	NC_017920	GCA	2	6	27542	27547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_017920	AGC	2	6	27649	27654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_017920	CGCC	2	8	27672	27679	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
602	NC_017920	GCC	2	6	27681	27686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
603	NC_017920	CGA	2	6	27735	27740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387900777
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605	NC_017920	TGA	2	6	27819	27824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387900777
606	NC_017920	ATGC	2	8	27846	27853	25 %	25 %	25 %	25 %	387900777
607	NC_017920	CG	3	6	27866	27871	0 %	0 %	50 %	50 %	387900777
608	NC_017920	TCA	2	6	27888	27893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387900777
609	NC_017920	GCC	3	9	27937	27945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387900777
610	NC_017920	AGC	2	6	27974	27979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387900777
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612	NC_017920	CGC	2	6	28012	28017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387900777
613	NC_017920	GAA	2	6	28018	28023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387900777
614	NC_017920	GCT	2	6	28047	28052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387900777
615	NC_017920	CG	3	6	28073	28078	0 %	0 %	50 %	50 %	387900777
616	NC_017920	GT	3	6	28087	28092	0 %	50 %	50 %	0 %	387900777
617	NC_017920	GC	3	6	28093	28098	0 %	0 %	50 %	50 %	387900777
618	NC_017920	GGC	2	6	28113	28118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387900777
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620	NC_017920	TCG	2	6	28154	28159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387900777
621	NC_017920	CGT	2	6	28176	28181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387900777
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623	NC_017920	GC	3	6	28196	28201	0 %	0 %	50 %	50 %	387900777
624	NC_017920	GCG	2	6	28206	28211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387900777
625	NC_017920	AGC	3	9	28229	28237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387900777
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627	NC_017920	TCG	2	6	28265	28270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387900777
628	NC_017920	CG	3	6	28319	28324	0 %	0 %	50 %	50 %	387900777
629	NC_017920	TCCA	2	8	28406	28413	25 %	25 %	0 %	50 %	387900777
630	NC_017920	ACGCG	2	10	28473	28482	20 %	0 %	40 %	40 %	387900777
631	NC_017920	ACG	2	6	28492	28497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387900777
632	NC_017920	TCG	2	6	28512	28517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387900777
633	NC_017920	CGT	2	6	28521	28526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387900777
634	NC_017920	CCGC	2	8	28529	28536	0 %	0 %	25 %	75 %	387900777
635	NC_017920	TCA	2	6	28554	28559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387900777
636	NC_017920	CCA	2	6	28562	28567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387900778
637	NC_017920	CGG	2	6	28574	28579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387900778
638	NC_017920	CTTCG	2	10	28584	28593	0 %	40 %	20 %	40 %	387900778
639	NC_017920	AAGCCG	2	12	28609	28620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387900778
640	NC_017920	ATC	2	6	28654	28659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387900778
641	NC_017920	TCC	2	6	28678	28683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387900778
642	NC_017920	GC	4	8	28720	28727	0 %	0 %	50 %	50 %	387900778
643	NC_017920	GCGCG	2	10	28772	28781	0 %	0 %	60 %	40 %	387900778
644	NC_017920	CAG	2	6	28821	28826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387900778
645	NC_017920	GCT	2	6	28835	28840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387900778
646	NC_017920	CG	5	10	28852	28861	0 %	0 %	50 %	50 %	387900778
647	NC_017920	CG	3	6	28911	28916	0 %	0 %	50 %	50 %	387900778
648	NC_017920	GCG	2	6	28960	28965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387900778
649	NC_017920	TCA	2	6	28988	28993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387900778
650	NC_017920	GCGCGG	2	12	28994	29005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387900778
651	NC_017920	GAC	2	6	29061	29066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
652	NC_017920	A	7	7	29104	29110	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
653	NC_017920	GCG	2	6	29126	29131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
654	NC_017920	AGCGC	2	10	29181	29190	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
655	NC_017920	CG	3	6	29200	29205	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
656	NC_017920	CGC	2	6	29214	29219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
657	NC_017920	CCGC	2	8	29335	29342	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
658	NC_017920	CGA	2	6	29481	29486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387900779
659	NC_017920	GCA	2	6	29488	29493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387900779
660	NC_017920	CG	3	6	29513	29518	0 %	0 %	50 %	50 %	387900779
661	NC_017920	GCAAC	2	10	29548	29557	40 %	0 %	20 %	40 %	387900779
662	NC_017920	CCT	2	6	29593	29598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387900779
663	NC_017920	GC	3	6	29632	29637	0 %	0 %	50 %	50 %	387900779
664	NC_017920	ACC	2	6	29732	29737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387900780
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666	NC_017920	CGT	2	6	29752	29757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387900780
667	NC_017920	CGA	2	6	29791	29796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387900780
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670	NC_017920	GCA	2	6	29908	29913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387900780
671	NC_017920	GCA	2	6	29929	29934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387900780
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674	NC_017920	CG	3	6	30084	30089	0 %	0 %	50 %	50 %	387900780
675	NC_017920	GC	3	6	30093	30098	0 %	0 %	50 %	50 %	387900780
676	NC_017920	GCG	2	6	30107	30112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387900780
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679	NC_017920	GCTG	2	8	30141	30148	0 %	25 %	50 %	25 %	387900780
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683	NC_017920	CG	3	6	30309	30314	0 %	0 %	50 %	50 %	387900780
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694	NC_017920	TTTC	2	8	30757	30764	0 %	75 %	0 %	25 %	387900780
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696	NC_017920	CG	3	6	30772	30777	0 %	0 %	50 %	50 %	387900780
697	NC_017920	CTGAC	2	10	30814	30823	20 %	20 %	20 %	40 %	387900780
698	NC_017920	CCCG	2	8	30846	30853	0 %	0 %	25 %	75 %	387900781
699	NC_017920	CGC	2	6	30907	30912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387900781
700	NC_017920	GCA	2	6	30913	30918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387900781
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702	NC_017920	CGGC	2	8	30943	30950	0 %	0 %	50 %	50 %	387900781
703	NC_017920	TAC	2	6	30987	30992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387900781
704	NC_017920	CG	3	6	31026	31031	0 %	0 %	50 %	50 %	387900781
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710	NC_017920	CG	3	6	31199	31204	0 %	0 %	50 %	50 %	387900781
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720	NC_017920	CGG	3	9	31391	31399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387900781
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722	NC_017920	ACG	2	6	31456	31461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387900781
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727	NC_017920	GC	3	6	31721	31726	0 %	0 %	50 %	50 %	387900781
728	NC_017920	CCGACG	2	12	31753	31764	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	387900781
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731	NC_017920	CGC	2	6	31825	31830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
732	NC_017920	GCC	2	6	31835	31840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
733	NC_017920	AAT	2	6	31848	31853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
734	NC_017920	TCCGTC	2	12	31855	31866	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
735	NC_017920	CG	3	6	31900	31905	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
736	NC_017920	GCA	2	6	31915	31920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
737	NC_017920	CACG	2	8	32017	32024	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
738	NC_017920	GCG	2	6	32085	32090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387900782
739	NC_017920	GCGTC	2	10	32104	32113	0 %	20 %	40 %	40 %	387900782
740	NC_017920	GTCG	2	8	32129	32136	0 %	25 %	50 %	25 %	387900782
741	NC_017920	CGGCGC	2	12	32161	32172	0 %	0 %	50 %	50 %	387900782
742	NC_017920	CCG	4	12	32187	32198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387900782
743	NC_017920	CGA	3	9	32225	32233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387900782
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745	NC_017920	GCC	2	6	32269	32274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387900782
746	NC_017920	CGG	3	9	32318	32326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387900782
747	NC_017920	ACA	2	6	32368	32373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
748	NC_017920	GAG	2	6	32390	32395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
749	NC_017920	GCC	2	6	32438	32443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387900783
750	NC_017920	GC	3	6	32472	32477	0 %	0 %	50 %	50 %	387900783
751	NC_017920	GCG	2	6	32501	32506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387900783
752	NC_017920	GGC	2	6	32510	32515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387900783
753	NC_017920	GGT	2	6	32545	32550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387900783
754	NC_017920	CGG	2	6	32560	32565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387900783
755	NC_017920	TCG	2	6	32571	32576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387900783
756	NC_017920	GCC	2	6	32577	32582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387900783
757	NC_017920	GAA	2	6	32590	32595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387900783
758	NC_017920	GAGCAG	2	12	32600	32611	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	387900783
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760	NC_017920	GGC	2	6	32626	32631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387900783
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