MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bacillus amyloliquefaciens Y2 chromosome

Total Repeats: 3382

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017912	ATATT	2	10	418	427	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017912	ATCGG	2	10	1049	1058	20 %	20 %	40 %	20 %	387896525
3	NC_017912	ATTAT	2	10	2184	2193	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017912	AATTT	2	10	2545	2554	40 %	60 %	0 %	0 %	387896526
5	NC_017912	AGTGA	2	10	4816	4825	40 %	20 %	40 %	0 %	387896528
6	NC_017912	TTGCA	2	10	5917	5926	20 %	40 %	20 %	20 %	387896530
7	NC_017912	GGGAC	2	10	6458	6467	20 %	0 %	60 %	20 %	387896530
8	NC_017912	TTCGG	2	10	7604	7613	0 %	40 %	40 %	20 %	387896531
9	NC_017912	ACGAT	2	10	8937	8946	40 %	20 %	20 %	20 %	387896531
10	NC_017912	TCGTG	2	10	11111	11120	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017912	CATTC	2	10	11660	11669	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
12	NC_017912	GGACG	2	10	11812	11821	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
13	NC_017912	CTTCA	2	10	15493	15502	20 %	40 %	0 %	40 %	387896532
14	NC_017912	AATAA	2	10	15810	15819	80 %	20 %	0 %	0 %	387896532
15	NC_017912	CCTTT	2	10	15864	15873	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
16	NC_017912	CTGAA	2	10	16784	16793	40 %	20 %	20 %	20 %	387896533
17	NC_017912	AAGAG	2	10	17331	17340	60 %	0 %	40 %	0 %	387896533
18	NC_017912	AGCAC	2	10	18396	18405	40 %	0 %	20 %	40 %	387896534
19	NC_017912	CGGAA	2	10	18408	18417	40 %	0 %	40 %	20 %	387896534
20	NC_017912	AGAGA	2	10	21043	21052	60 %	0 %	40 %	0 %	387896537
21	NC_017912	CCAAG	2	10	21957	21966	40 %	0 %	20 %	40 %	387896537
22	NC_017912	ATCTG	2	10	22523	22532	20 %	40 %	20 %	20 %	387896538
23	NC_017912	CCCGC	2	10	22988	22997	0 %	0 %	20 %	80 %	387896538
24	NC_017912	GAAAT	2	10	23511	23520	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017912	ACTCC	2	10	24920	24929	20 %	20 %	0 %	60 %	387896540
26	NC_017912	GTTTT	2	10	25884	25893	0 %	80 %	20 %	0 %	387896541
27	NC_017912	ATGAC	2	10	30106	30115	40 %	20 %	20 %	20 %	387896546
28	NC_017912	AGGCA	2	10	30791	30800	40 %	0 %	40 %	20 %	387896548
29	NC_017912	GAAGC	2	10	30983	30992	40 %	0 %	40 %	20 %	387896548
30	NC_017912	TTGCT	2	10	31125	31134	0 %	60 %	20 %	20 %	387896549
31	NC_017912	TCGTG	2	10	32677	32686	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017912	CATTC	2	10	33226	33235	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
33	NC_017912	GGACG	2	10	33378	33387	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
34	NC_017912	ACAAA	2	10	36477	36486	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_017912	AAGAA	2	10	37136	37145	80 %	0 %	20 %	0 %	387896551
36	NC_017912	TGCTC	2	10	37373	37382	0 %	40 %	20 %	40 %	387896551
37	NC_017912	AAAGA	2	10	37780	37789	80 %	0 %	20 %	0 %	387896552
38	NC_017912	CTGAT	2	10	37816	37825	20 %	40 %	20 %	20 %	387896552
39	NC_017912	TGTGC	2	10	40467	40476	0 %	40 %	40 %	20 %	387896554
40	NC_017912	GAAAA	2	10	41767	41776	80 %	0 %	20 %	0 %	387896557
41	NC_017912	GCAGA	2	10	43751	43760	40 %	0 %	40 %	20 %	387896559
42	NC_017912	GCGAT	2	10	46753	46762	20 %	20 %	40 %	20 %	387896564
43	NC_017912	TGACA	2	10	48930	48939	40 %	20 %	20 %	20 %	387896565
44	NC_017912	AGATC	2	10	50567	50576	40 %	20 %	20 %	20 %	387896566
45	NC_017912	TCAAA	2	10	51584	51593	60 %	20 %	0 %	20 %	387896567
46	NC_017912	TTTTG	2	10	54072	54081	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017912	TGAAG	2	10	58398	58407	40 %	20 %	40 %	0 %	387896576
48	NC_017912	AAGCA	2	10	58452	58461	60 %	0 %	20 %	20 %	387896576
49	NC_017912	AACAC	2	10	61338	61347	60 %	0 %	0 %	40 %	387896580
50	NC_017912	TTTGC	2	10	63370	63379	0 %	60 %	20 %	20 %	387896581
51	NC_017912	AACGG	2	10	63599	63608	40 %	0 %	40 %	20 %	387896581
52	NC_017912	TAAAG	2	10	65037	65046	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017912	CGGCG	2	10	66122	66131	0 %	0 %	60 %	40 %	387896583
54	NC_017912	ATGAT	2	10	66247	66256	40 %	40 %	20 %	0 %	387896583
55	NC_017912	GACGG	2	10	66585	66594	20 %	0 %	60 %	20 %	387896583
56	NC_017912	GGAGA	2	10	68835	68844	40 %	0 %	60 %	0 %	387896584
57	NC_017912	GAAAG	2	10	71381	71390	60 %	0 %	40 %	0 %	387896590
58	NC_017912	GGCCT	2	10	72001	72010	0 %	20 %	40 %	40 %	387896591
59	NC_017912	TTTCA	2	10	72143	72152	20 %	60 %	0 %	20 %	387896591
60	NC_017912	GTTCG	2	10	73269	73278	0 %	40 %	40 %	20 %	387896591
61	NC_017912	TTATT	2	10	77967	77976	20 %	80 %	0 %	0 %	387896596
62	NC_017912	TGAAG	2	10	82473	82482	40 %	20 %	40 %	0 %	387896599
63	NC_017912	CGGAG	2	10	83001	83010	20 %	0 %	60 %	20 %	387896600
64	NC_017912	GATCA	2	10	83386	83395	40 %	20 %	20 %	20 %	387896600
65	NC_017912	TAAAA	2	10	83724	83733	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017912	CGGAA	2	10	84025	84034	40 %	0 %	40 %	20 %	387896601
67	NC_017912	AGAGC	2	10	85475	85484	40 %	0 %	40 %	20 %	387896602
68	NC_017912	GGCCG	2	10	89212	89221	0 %	0 %	60 %	40 %	387896608
69	NC_017912	TCGTG	2	10	92533	92542	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_017912	CATTC	2	10	93082	93091	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
71	NC_017912	GGACG	2	10	93234	93243	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
72	NC_017912	TCGTG	2	10	98360	98369	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
73	NC_017912	CATTC	2	10	98909	98918	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
74	NC_017912	GGACG	2	10	99061	99070	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
75	NC_017912	GGGAC	2	10	103879	103888	20 %	0 %	60 %	20 %	387896612
76	NC_017912	TCAAA	2	10	104035	104044	60 %	20 %	0 %	20 %	387896612
77	NC_017912	GAACA	2	10	104764	104773	60 %	0 %	20 %	20 %	387896613
78	NC_017912	AAATG	2	10	107762	107771	60 %	20 %	20 %	0 %	387896614
79	NC_017912	CGGAA	2	10	109007	109016	40 %	0 %	40 %	20 %	387896615
80	NC_017912	CCGTA	2	10	109880	109889	20 %	20 %	20 %	40 %	387896616
81	NC_017912	GAAAA	2	10	114023	114032	80 %	0 %	20 %	0 %	387896621
82	NC_017912	CGGAA	2	10	114202	114211	40 %	0 %	40 %	20 %	387896621
83	NC_017912	GTTTG	2	10	115449	115458	0 %	60 %	40 %	0 %	387896622
84	NC_017912	TGAAT	2	10	119135	119144	40 %	40 %	20 %	0 %	387896629
85	NC_017912	TTACG	2	10	120812	120821	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_017912	TAAAA	2	10	121452	121461	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017912	TTGAA	2	10	121532	121541	40 %	40 %	20 %	0 %	387896633
88	NC_017912	GTGAA	2	10	126515	126524	40 %	20 %	40 %	0 %	387896636
89	NC_017912	ACCGG	2	10	127354	127363	20 %	0 %	40 %	40 %	387896636
90	NC_017912	GAAGA	2	10	128197	128206	60 %	0 %	40 %	0 %	387896636
91	NC_017912	CAAAG	2	10	128467	128476	60 %	0 %	20 %	20 %	387896636
92	NC_017912	GTGCT	2	10	129011	129020	0 %	40 %	40 %	20 %	387896636
93	NC_017912	CTGAC	2	10	129551	129560	20 %	20 %	20 %	40 %	387896636
94	NC_017912	GTCCT	2	10	129788	129797	0 %	40 %	20 %	40 %	387896636
95	NC_017912	CAATT	2	10	132031	132040	40 %	40 %	0 %	20 %	387896639
96	NC_017912	CTGAA	2	10	132262	132271	40 %	20 %	20 %	20 %	387896639
97	NC_017912	AAATG	2	10	133274	133283	60 %	20 %	20 %	0 %	387896639
98	NC_017912	GAGGG	2	10	135632	135641	20 %	0 %	80 %	0 %	387896641
99	NC_017912	CAAAA	2	10	136260	136269	80 %	0 %	0 %	20 %	387896642
100	NC_017912	AATCA	2	10	137587	137596	60 %	20 %	0 %	20 %	387896645
101	NC_017912	TGGTA	2	10	139949	139958	20 %	40 %	40 %	0 %	387896648
102	NC_017912	AAAGT	2	10	140864	140873	60 %	20 %	20 %	0 %	387896650
103	NC_017912	CAAAC	2	10	144860	144869	60 %	0 %	0 %	40 %	387896658
104	NC_017912	TAAAT	2	10	147709	147718	60 %	40 %	0 %	0 %	387896662
105	NC_017912	AAACA	2	10	149279	149288	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_017912	TTATC	2	10	150361	150370	20 %	60 %	0 %	20 %	387896664
107	NC_017912	TTAAA	2	10	152040	152049	60 %	40 %	0 %	0 %	387896665
108	NC_017912	CGTTT	2	10	153384	153393	0 %	60 %	20 %	20 %	387896667
109	NC_017912	ATGGA	2	10	153451	153460	40 %	20 %	40 %	0 %	387896667
110	NC_017912	CGAAG	2	10	154511	154520	40 %	0 %	40 %	20 %	387896668
111	NC_017912	GCACC	2	10	154540	154549	20 %	0 %	20 %	60 %	387896668
112	NC_017912	TTGTG	2	10	154685	154694	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017912	TGCTT	2	10	155464	155473	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_017912	ATTCC	2	10	156287	156296	20 %	40 %	0 %	40 %	387896669
115	NC_017912	CGGCC	2	10	159495	159504	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
116	NC_017912	TTTTC	2	10	160197	160206	0 %	80 %	0 %	20 %	387896675
117	NC_017912	TCGTG	2	10	162953	162962	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
118	NC_017912	CATTC	2	10	163502	163511	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
119	NC_017912	GGACG	2	10	163654	163663	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
120	NC_017912	GTTCA	2	10	166949	166958	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_017912	TACAT	2	10	167217	167226	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_017912	TCGTG	2	10	167869	167878	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
123	NC_017912	GGACG	2	10	168744	168753	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
124	NC_017912	TCGTG	2	10	173225	173234	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
125	NC_017912	CATTC	2	10	173774	173783	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
126	NC_017912	GGACG	2	10	173926	173935	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
127	NC_017912	TTTGC	2	10	177074	177083	0 %	60 %	20 %	20 %	387896677
128	NC_017912	ATTAT	2	10	179484	179493	40 %	60 %	0 %	0 %	387896678
129	NC_017912	TTGAA	2	10	180134	180143	40 %	40 %	20 %	0 %	387896679
130	NC_017912	GCGAT	2	10	180176	180185	20 %	20 %	40 %	20 %	387896679
131	NC_017912	CGGAC	2	10	180898	180907	20 %	0 %	40 %	40 %	387896680
132	NC_017912	AATGG	2	10	181102	181111	40 %	20 %	40 %	0 %	387896680
133	NC_017912	TTTTC	2	10	181769	181778	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_017912	TTCCT	2	10	181837	181846	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
135	NC_017912	TGGCT	2	10	184245	184254	0 %	40 %	40 %	20 %	387896682
136	NC_017912	GCGGA	2	10	184740	184749	20 %	0 %	60 %	20 %	387896683
137	NC_017912	CTTTT	2	10	186271	186280	0 %	80 %	0 %	20 %	387896685
138	NC_017912	TCCGA	2	10	186432	186441	20 %	20 %	20 %	40 %	387896685
139	NC_017912	TCCTT	2	10	188131	188140	0 %	60 %	0 %	40 %	387896686
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153	NC_017912	CTGCA	2	10	206015	206024	20 %	20 %	20 %	40 %	387896702
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