MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus amyloliquefaciens Y2 chromosome

Total Repeats: 91290

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017912	CCTC	2	8	72	79	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2	NC_017912	CTTA	2	8	103	110	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017912	TGC	2	6	120	125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017912	CAG	2	6	143	148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387896524
5	NC_017912	ATA	2	6	169	174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387896524
6	NC_017912	T	7	7	221	227	0 %	100 %	0 %	0 %	387896524
7	NC_017912	A	8	8	235	242	100 %	0 %	0 %	0 %	387896524
8	NC_017912	A	6	6	257	262	100 %	0 %	0 %	0 %	387896524
9	NC_017912	T	7	7	287	293	0 %	100 %	0 %	0 %	387896524
10	NC_017912	ACA	2	6	314	319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017912	CAA	2	6	356	361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017912	ATATT	2	10	418	427	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017912	CA	3	6	503	508	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017912	TTG	2	6	520	525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017912	CTA	2	6	562	567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017912	GT	3	6	590	595	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017912	T	7	7	620	626	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017912	AGG	2	6	667	672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017912	AT	3	6	693	698	50 %	50 %	0 %	0 %	387896525
20	NC_017912	CGA	2	6	774	779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387896525
21	NC_017912	CTGG	2	8	841	848	0 %	25 %	50 %	25 %	387896525
22	NC_017912	AT	3	6	881	886	50 %	50 %	0 %	0 %	387896525
23	NC_017912	GAA	2	6	899	904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387896525
24	NC_017912	GAA	2	6	941	946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387896525
25	NC_017912	A	6	6	971	976	100 %	0 %	0 %	0 %	387896525
26	NC_017912	ATCGG	2	10	1049	1058	20 %	20 %	40 %	20 %	387896525
27	NC_017912	GCA	2	6	1076	1081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387896525
28	NC_017912	TTTA	2	8	1123	1130	25 %	75 %	0 %	0 %	387896525
29	NC_017912	TA	3	6	1129	1134	50 %	50 %	0 %	0 %	387896525
30	NC_017912	GTG	2	6	1214	1219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387896525
31	NC_017912	TCT	2	6	1226	1231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387896525
32	NC_017912	TCA	2	6	1251	1256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387896525
33	NC_017912	GAT	2	6	1325	1330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387896525
34	NC_017912	AACA	2	8	1353	1360	75 %	0 %	0 %	25 %	387896525
35	NC_017912	GAA	2	6	1397	1402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387896525
36	NC_017912	CAAA	2	8	1405	1412	75 %	0 %	0 %	25 %	387896525
37	NC_017912	CCG	2	6	1433	1438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387896525
38	NC_017912	GATT	2	8	1488	1495	25 %	50 %	25 %	0 %	387896525
39	NC_017912	CCG	2	6	1508	1513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387896525
40	NC_017912	GAAA	2	8	1542	1549	75 %	0 %	25 %	0 %	387896525
41	NC_017912	ATT	2	6	1718	1723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387896525
42	NC_017912	CAG	2	6	1778	1783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387896525
43	NC_017912	TTC	2	6	1882	1887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387896525
44	NC_017912	GAA	2	6	1904	1909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387896525
45	NC_017912	GGC	2	6	1913	1918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387896525
46	NC_017912	CTG	2	6	1964	1969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387896525
47	NC_017912	TGA	2	6	1972	1977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387896525
48	NC_017912	AGC	2	6	1980	1985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387896525
49	NC_017912	CAG	3	9	1988	1996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387896525
50	NC_017912	GAAA	2	8	1999	2006	75 %	0 %	25 %	0 %	387896525
51	NC_017912	ATA	2	6	2023	2028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387896525
52	NC_017912	CTA	2	6	2150	2155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017912	TAC	2	6	2157	2162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017912	AT	3	6	2176	2181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017912	ATTAT	2	10	2184	2193	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017912	AGG	2	6	2199	2204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017912	TCG	2	6	2314	2319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387896526
58	NC_017912	TCAT	2	8	2373	2380	25 %	50 %	0 %	25 %	387896526
59	NC_017912	AGA	3	9	2387	2395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387896526
60	NC_017912	CGAT	2	8	2413	2420	25 %	25 %	25 %	25 %	387896526
61	NC_017912	TGC	2	6	2437	2442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387896526
62	NC_017912	TTC	2	6	2451	2456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387896526
63	NC_017912	A	6	6	2469	2474	100 %	0 %	0 %	0 %	387896526
64	NC_017912	AATTT	2	10	2545	2554	40 %	60 %	0 %	0 %	387896526
65	NC_017912	ATT	2	6	2729	2734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387896526
66	NC_017912	TTC	2	6	2928	2933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387896526
67	NC_017912	GCT	2	6	2939	2944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387896526
68	NC_017912	TCG	2	6	3001	3006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387896526
69	NC_017912	CTT	2	6	3043	3048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387896526
70	NC_017912	AAC	2	6	3069	3074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387896526
71	NC_017912	CGG	2	6	3097	3102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387896526
72	NC_017912	TCA	2	6	3117	3122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387896526
73	NC_017912	GCTG	2	8	3158	3165	0 %	25 %	50 %	25 %	387896526
74	NC_017912	TTCA	2	8	3194	3201	25 %	50 %	0 %	25 %	387896526
75	NC_017912	AT	3	6	3209	3214	50 %	50 %	0 %	0 %	387896526
76	NC_017912	ATG	2	6	3301	3306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387896526
77	NC_017912	TGC	2	6	3360	3365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017912	TCA	2	6	3391	3396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017912	T	6	6	3434	3439	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017912	ATA	2	6	3477	3482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387896527
81	NC_017912	CGG	2	6	3559	3564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387896527
82	NC_017912	GAGC	2	8	3583	3590	25 %	0 %	50 %	25 %	387896527
83	NC_017912	CAA	2	6	3604	3609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387896527
84	NC_017912	CGC	2	6	3623	3628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387896527
85	NC_017912	GTC	2	6	3686	3691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387896527
86	NC_017912	GC	3	6	3757	3762	0 %	0 %	50 %	50 %	387896528
87	NC_017912	ATC	2	6	3794	3799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387896528
88	NC_017912	GAAG	2	8	3923	3930	50 %	0 %	50 %	0 %	387896528
89	NC_017912	TGA	2	6	3933	3938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387896528
90	NC_017912	A	6	6	3977	3982	100 %	0 %	0 %	0 %	387896528
91	NC_017912	AGC	2	6	4011	4016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387896528
92	NC_017912	TCAG	2	8	4023	4030	25 %	25 %	25 %	25 %	387896528
93	NC_017912	GAG	3	9	4102	4110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387896528
94	NC_017912	A	6	6	4173	4178	100 %	0 %	0 %	0 %	387896528
95	NC_017912	AGC	2	6	4273	4278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387896528
96	NC_017912	GAA	2	6	4367	4372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387896528
97	NC_017912	AAAAGA	2	12	4465	4476	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	387896528
98	NC_017912	ATT	2	6	4495	4500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387896528
99	NC_017912	GAT	2	6	4514	4519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387896528
100	NC_017912	T	6	6	4524	4529	0 %	100 %	0 %	0 %	387896528
101	NC_017912	CAG	2	6	4571	4576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387896528
102	NC_017912	ACG	2	6	4580	4585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387896528
103	NC_017912	GAA	2	6	4625	4630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387896528
104	NC_017912	GAT	2	6	4658	4663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387896528
105	NC_017912	GAT	2	6	4679	4684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387896528
106	NC_017912	CAC	2	6	4738	4743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387896528
107	NC_017912	AGTGA	2	10	4816	4825	40 %	20 %	40 %	0 %	387896528
108	NC_017912	GAC	2	6	4861	4866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387896529
109	NC_017912	TCG	2	6	4889	4894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387896529
110	NC_017912	GAA	2	6	4933	4938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387896529
111	NC_017912	GACA	2	8	4945	4952	50 %	0 %	25 %	25 %	387896529
112	NC_017912	GAAA	2	8	4953	4960	75 %	0 %	25 %	0 %	387896529
113	NC_017912	AGT	2	6	4962	4967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387896529
114	NC_017912	CCGT	2	8	4969	4976	0 %	25 %	25 %	50 %	387896529
115	NC_017912	AT	4	8	5015	5022	50 %	50 %	0 %	0 %	387896529
116	NC_017912	GAA	2	6	5049	5054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387896529
117	NC_017912	AT	3	6	5105	5110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017912	CAG	2	6	5151	5156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387896530
119	NC_017912	ATG	2	6	5167	5172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387896530
120	NC_017912	CAC	2	6	5259	5264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387896530
121	NC_017912	TCG	2	6	5278	5283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387896530
122	NC_017912	ACA	2	6	5284	5289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387896530
123	NC_017912	CGGT	2	8	5386	5393	0 %	25 %	50 %	25 %	387896530
124	NC_017912	GCC	2	6	5410	5415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387896530
125	NC_017912	TCA	2	6	5428	5433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387896530
126	NC_017912	CGG	2	6	5450	5455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387896530
127	NC_017912	CGG	2	6	5486	5491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387896530
128	NC_017912	CGTC	2	8	5509	5516	0 %	25 %	25 %	50 %	387896530
129	NC_017912	TCCGGA	2	12	5660	5671	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	387896530
130	NC_017912	AAC	2	6	5684	5689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387896530
131	NC_017912	AAG	2	6	5854	5859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387896530
132	NC_017912	TTGCA	2	10	5917	5926	20 %	40 %	20 %	20 %	387896530
133	NC_017912	ATA	2	6	5968	5973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387896530
134	NC_017912	AAG	2	6	6047	6052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387896530
135	NC_017912	GAT	2	6	6093	6098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387896530
136	NC_017912	GA	3	6	6101	6106	50 %	0 %	50 %	0 %	387896530
137	NC_017912	ATT	2	6	6120	6125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387896530
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154	NC_017912	CTA	2	6	7150	7155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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276	NC_017912	GAG	2	6	14429	14434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
277	NC_017912	GTT	2	6	14483	14488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
278	NC_017912	C	6	6	14556	14561	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
279	NC_017912	GAT	2	6	14607	14612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
280	NC_017912	ATCG	2	8	14668	14675	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
281	NC_017912	GA	3	6	14720	14725	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
282	NC_017912	TGG	2	6	14741	14746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
283	NC_017912	CGC	2	6	14844	14849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
284	NC_017912	T	6	6	14891	14896	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
285	NC_017912	CGG	2	6	14966	14971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387896532
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303	NC_017912	ATA	2	6	15937	15942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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407	NC_017912	GAT	2	6	21288	21293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387896537
408	NC_017912	CG	3	6	21456	21461	0 %	0 %	50 %	50 %	387896537
409	NC_017912	TGA	2	6	21491	21496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387896537
410	NC_017912	TCC	2	6	21518	21523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387896537
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439	NC_017912	GCG	2	6	23141	23146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387896538
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451	NC_017912	GGA	2	6	23585	23590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
452	NC_017912	TCC	2	6	23668	23673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
453	NC_017912	AT	3	6	23708	23713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
454	NC_017912	T	6	6	23751	23756	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
455	NC_017912	A	7	7	23763	23769	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
456	NC_017912	T	6	6	23843	23848	0 %	100 %	0 %	0 %	387896539
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493	NC_017912	TA	3	6	26458	26463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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497	NC_017912	CGG	2	6	26540	26545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387896542
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