MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus amyloliquefaciens Y2 chromosome

Total Repeats: 91290

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017912	GCT	2	6	242225	242230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387896738
5002	NC_017912	GAA	2	6	242241	242246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387896738
5003	NC_017912	GAA	2	6	242370	242375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387896738
5004	NC_017912	GCG	2	6	242385	242390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387896738
5005	NC_017912	CGTG	2	8	242407	242414	0 %	25 %	50 %	25 %	387896738
5006	NC_017912	TGA	2	6	242425	242430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387896738
5007	NC_017912	GCT	2	6	242482	242487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387896738
5008	NC_017912	GGC	2	6	242505	242510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387896738
5009	NC_017912	ATTC	2	8	242543	242550	25 %	50 %	0 %	25 %	387896738
5010	NC_017912	GC	3	6	242582	242587	0 %	0 %	50 %	50 %	387896738
5011	NC_017912	GC	3	6	242608	242613	0 %	0 %	50 %	50 %	387896738
5012	NC_017912	TCA	2	6	242663	242668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387896738
5013	NC_017912	CAG	2	6	242679	242684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387896738
5014	NC_017912	CGG	2	6	242729	242734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387896738
5015	NC_017912	CG	3	6	242868	242873	0 %	0 %	50 %	50 %	387896738
5016	NC_017912	T	6	6	243176	243181	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_017912	TA	3	6	243194	243199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_017912	TCAG	2	8	243242	243249	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5019	NC_017912	CAT	2	6	243330	243335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5020	NC_017912	TCAT	2	8	243344	243351	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5021	NC_017912	GCA	2	6	243373	243378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5022	NC_017912	A	6	6	243446	243451	100 %	0 %	0 %	0 %	387896739
5023	NC_017912	AGATT	2	10	243463	243472	40 %	40 %	20 %	0 %	387896739
5024	NC_017912	TAA	2	6	243497	243502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387896739
5025	NC_017912	TA	3	6	243622	243627	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_017912	ATTC	2	8	243673	243680	25 %	50 %	0 %	25 %	387896740
5027	NC_017912	ATA	2	6	243692	243697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387896740
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5030	NC_017912	TA	3	6	243866	243871	50 %	50 %	0 %	0 %	387896740
5031	NC_017912	GAT	2	6	243921	243926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387896740
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5033	NC_017912	TCT	2	6	244038	244043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387896740
5034	NC_017912	A	6	6	244105	244110	100 %	0 %	0 %	0 %	387896740
5035	NC_017912	AGA	2	6	244135	244140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387896740
5036	NC_017912	AT	3	6	244175	244180	50 %	50 %	0 %	0 %	387896741
5037	NC_017912	TAT	2	6	244208	244213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387896741
5038	NC_017912	ATG	2	6	244239	244244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387896741
5039	NC_017912	GAT	2	6	244328	244333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387896741
5040	NC_017912	GCCG	3	12	244359	244370	0 %	0 %	50 %	50 %	387896741
5041	NC_017912	TAA	2	6	244376	244381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387896741
5042	NC_017912	GAA	2	6	244439	244444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387896741
5043	NC_017912	ATT	2	6	244461	244466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387896741
5044	NC_017912	CGC	2	6	244553	244558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387896741
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5046	NC_017912	ATTG	2	8	244656	244663	25 %	50 %	25 %	0 %	387896742
5047	NC_017912	TAA	2	6	244671	244676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387896742
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5049	NC_017912	CGT	2	6	244893	244898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387896742
5050	NC_017912	CGG	2	6	245004	245009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387896742
5051	NC_017912	ACC	2	6	245045	245050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387896742
5052	NC_017912	A	6	6	245157	245162	100 %	0 %	0 %	0 %	387896742
5053	NC_017912	CAG	2	6	245197	245202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387896742
5054	NC_017912	CTGA	2	8	245359	245366	25 %	25 %	25 %	25 %	387896742
5055	NC_017912	ATC	2	6	245392	245397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387896742
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5057	NC_017912	GCT	2	6	245439	245444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5058	NC_017912	T	6	6	245449	245454	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_017912	GAA	2	6	245482	245487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387896743
5060	NC_017912	TCT	2	6	245616	245621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387896743
5061	NC_017912	TAT	2	6	245652	245657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387896743
5062	NC_017912	CGGC	2	8	245675	245682	0 %	0 %	50 %	50 %	387896743
5063	NC_017912	CAG	2	6	245728	245733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387896743
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5065	NC_017912	ACGG	2	8	245769	245776	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5066	NC_017912	TAG	2	6	245812	245817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_017912	TAT	2	6	245886	245891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387896744
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5069	NC_017912	GAG	2	6	245916	245921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387896744
5070	NC_017912	ACGGT	2	10	245998	246007	20 %	20 %	40 %	20 %	387896744
5071	NC_017912	A	6	6	246135	246140	100 %	0 %	0 %	0 %	387896744
5072	NC_017912	GAT	2	6	246165	246170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387896744
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5075	NC_017912	GGC	2	6	246399	246404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387896744
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5083	NC_017912	A	7	7	246657	246663	100 %	0 %	0 %	0 %	387896744
5084	NC_017912	GAAT	2	8	246680	246687	50 %	25 %	25 %	0 %	387896744
5085	NC_017912	ACGA	2	8	246723	246730	50 %	0 %	25 %	25 %	387896744
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5089	NC_017912	GCG	2	6	246813	246818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387896744
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5091	NC_017912	GGT	2	6	246847	246852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_017912	T	6	6	246854	246859	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_017912	GGTCT	2	10	246885	246894	0 %	40 %	40 %	20 %	387896745
5094	NC_017912	ACG	2	6	246940	246945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387896745
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5096	NC_017912	ACG	2	6	247072	247077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387896745
5097	NC_017912	GACGG	2	10	247087	247096	20 %	0 %	60 %	20 %	387896745
5098	NC_017912	TCA	2	6	247115	247120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387896745
5099	NC_017912	CAT	2	6	247131	247136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387896745
5100	NC_017912	GCT	2	6	247142	247147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387896745
5101	NC_017912	GAC	2	6	247260	247265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387896745
5102	NC_017912	GGC	2	6	247512	247517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387896745
5103	NC_017912	ACCATC	2	12	247549	247560	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	387896745
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5105	NC_017912	GAA	2	6	247596	247601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387896745
5106	NC_017912	A	7	7	247663	247669	100 %	0 %	0 %	0 %	387896745
5107	NC_017912	ATG	2	6	247705	247710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387896745
5108	NC_017912	ATA	2	6	247720	247725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387896745
5109	NC_017912	AAG	2	6	247728	247733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387896745
5110	NC_017912	ACT	2	6	247750	247755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387896745
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5112	NC_017912	GA	3	6	247802	247807	50 %	0 %	50 %	0 %	387896745
5113	NC_017912	CGT	2	6	247869	247874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387896745
5114	NC_017912	AAT	2	6	247890	247895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387896745
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5116	NC_017912	CTGCCG	2	12	247930	247941	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	387896745
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5119	NC_017912	GGC	2	6	248162	248167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5120	NC_017912	ACC	2	6	248169	248174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5121	NC_017912	ATT	2	6	248200	248205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_017912	GAAA	2	8	248214	248221	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_017912	A	7	7	248278	248284	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5125	NC_017912	TGATA	2	10	248366	248375	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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5437	NC_017912	CTTTT	2	10	263542	263551	0 %	80 %	0 %	20 %	387896762
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