MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis Bi-07 chromosome

Total Repeats: 43429

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017867	GCG	2	6	173672	173677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4002	NC_017867	ATT	2	6	173745	173750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_017867	ATC	2	6	173757	173762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4004	NC_017867	ACA	2	6	173832	173837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4005	NC_017867	GAA	2	6	173852	173857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_017867	AAG	2	6	173869	173874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387821732
4007	NC_017867	GGC	2	6	173916	173921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387821732
4008	NC_017867	CTT	2	6	173970	173975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387821732
4009	NC_017867	GGA	2	6	174012	174017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387821732
4010	NC_017867	ACGA	2	8	174091	174098	50 %	0 %	25 %	25 %	387821732
4011	NC_017867	GCA	2	6	174159	174164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387821732
4012	NC_017867	CGA	2	6	174168	174173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387821732
4013	NC_017867	CGC	2	6	174186	174191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387821732
4014	NC_017867	GAG	2	6	174217	174222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387821732
4015	NC_017867	AAC	2	6	174244	174249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387821732
4016	NC_017867	TGCCG	2	10	174261	174270	0 %	20 %	40 %	40 %	387821732
4017	NC_017867	CGA	2	6	174273	174278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387821732
4018	NC_017867	CCG	2	6	174371	174376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387821732
4019	NC_017867	TCACCG	2	12	174389	174400	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	387821732
4020	NC_017867	CGTG	2	8	174411	174418	0 %	25 %	50 %	25 %	387821732
4021	NC_017867	CGA	2	6	174444	174449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387821732
4022	NC_017867	GCT	2	6	174480	174485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387821732
4023	NC_017867	CGC	3	9	174546	174554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387821732
4024	NC_017867	TGC	2	6	174560	174565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387821732
4025	NC_017867	CG	3	6	174678	174683	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4026	NC_017867	CG	3	6	174701	174706	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4027	NC_017867	AT	3	6	174722	174727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_017867	TG	3	6	174736	174741	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_017867	GT	3	6	174906	174911	0 %	50 %	50 %	0 %	387821733
4030	NC_017867	CG	3	6	174966	174971	0 %	0 %	50 %	50 %	387821733
4031	NC_017867	TGC	2	6	174978	174983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387821733
4032	NC_017867	GC	3	6	174989	174994	0 %	0 %	50 %	50 %	387821733
4033	NC_017867	TCGC	2	8	175028	175035	0 %	25 %	25 %	50 %	387821733
4034	NC_017867	CGCGCA	2	12	175041	175052	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	387821733
4035	NC_017867	GCT	2	6	175084	175089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387821733
4036	NC_017867	CAT	2	6	175105	175110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387821733
4037	NC_017867	ACT	2	6	175152	175157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387821733
4038	NC_017867	GCT	2	6	175159	175164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387821733
4039	NC_017867	GATG	2	8	175177	175184	25 %	25 %	50 %	0 %	387821733
4040	NC_017867	ACG	3	9	175185	175193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387821733
4041	NC_017867	GCT	4	12	175240	175251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387821733
4042	NC_017867	TGA	2	6	175284	175289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387821733
4043	NC_017867	TCG	2	6	175328	175333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387821733
4044	NC_017867	TGA	2	6	175356	175361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387821733
4045	NC_017867	CGA	2	6	175363	175368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387821733
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4047	NC_017867	GAT	2	6	175387	175392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387821733
4048	NC_017867	CG	4	8	175426	175433	0 %	0 %	50 %	50 %	387821733
4049	NC_017867	GGA	2	6	175444	175449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387821733
4050	NC_017867	CGC	2	6	175474	175479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387821733
4051	NC_017867	CAC	2	6	175492	175497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387821733
4052	NC_017867	CTGC	2	8	175519	175526	0 %	25 %	25 %	50 %	387821733
4053	NC_017867	CCA	2	6	175560	175565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387821733
4054	NC_017867	ATC	2	6	175601	175606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387821733
4055	NC_017867	ACG	2	6	175614	175619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387821733
4056	NC_017867	ATC	2	6	175685	175690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387821733
4057	NC_017867	ATTC	2	8	175701	175708	25 %	50 %	0 %	25 %	387821733
4058	NC_017867	CGC	2	6	175717	175722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387821733
4059	NC_017867	CCG	2	6	175727	175732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387821733
4060	NC_017867	CGC	2	6	175774	175779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387821733
4061	NC_017867	GGA	2	6	175825	175830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387821733
4062	NC_017867	GCC	2	6	175831	175836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387821733
4063	NC_017867	GC	3	6	175852	175857	0 %	0 %	50 %	50 %	387821733
4064	NC_017867	GT	3	6	175906	175911	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_017867	TGC	2	6	175917	175922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4066	NC_017867	ATT	2	6	175935	175940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_017867	CAA	2	6	176025	176030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4068	NC_017867	GAG	2	6	176143	176148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_017867	GCG	2	6	176193	176198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387821734
4070	NC_017867	CGC	3	9	176228	176236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387821734
4071	NC_017867	AGC	2	6	176290	176295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387821734
4072	NC_017867	CGA	3	9	176321	176329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387821734
4073	NC_017867	TCG	2	6	176348	176353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387821734
4074	NC_017867	GCA	2	6	176414	176419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387821734
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4076	NC_017867	TGC	2	6	176498	176503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387821734
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4078	NC_017867	CAG	2	6	176562	176567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387821734
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4081	NC_017867	GCC	2	6	176662	176667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387821734
4082	NC_017867	AC	3	6	176675	176680	50 %	0 %	0 %	50 %	387821734
4083	NC_017867	TCA	2	6	176750	176755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387821734
4084	NC_017867	TCC	2	6	176787	176792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387821734
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4086	NC_017867	TGCT	2	8	176872	176879	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4087	NC_017867	CGA	2	6	176950	176955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387821735
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4089	NC_017867	GCG	2	6	176992	176997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387821735
4090	NC_017867	AGC	2	6	177006	177011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387821735
4091	NC_017867	TGCCC	2	10	177031	177040	0 %	20 %	20 %	60 %	387821735
4092	NC_017867	TCG	2	6	177051	177056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387821735
4093	NC_017867	CG	3	6	177070	177075	0 %	0 %	50 %	50 %	387821735
4094	NC_017867	GTC	2	6	177077	177082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387821735
4095	NC_017867	CGG	2	6	177130	177135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387821735
4096	NC_017867	CGT	2	6	177190	177195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387821735
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4100	NC_017867	GAT	2	6	177284	177289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387821735
4101	NC_017867	TTC	2	6	177306	177311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387821735
4102	NC_017867	GTC	2	6	177317	177322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387821735
4103	NC_017867	CCG	3	9	177364	177372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387821735
4104	NC_017867	CGG	2	6	177445	177450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387821735
4105	NC_017867	AGC	2	6	177453	177458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387821735
4106	NC_017867	GTGC	2	8	177470	177477	0 %	25 %	50 %	25 %	387821735
4107	NC_017867	GATCTT	2	12	177518	177529	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387821735
4108	NC_017867	GCG	2	6	177547	177552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387821735
4109	NC_017867	CGA	2	6	177554	177559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387821735
4110	NC_017867	GCT	2	6	177580	177585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387821735
4111	NC_017867	GCT	2	6	177601	177606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387821735
4112	NC_017867	CTCAT	2	10	177634	177643	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
4113	NC_017867	AGTG	2	8	177647	177654	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_017867	TG	3	6	177762	177767	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_017867	AT	3	6	177836	177841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_017867	ACG	2	6	177919	177924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387821736
4117	NC_017867	TGC	2	6	177940	177945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387821736
4118	NC_017867	TCG	2	6	177964	177969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387821736
4119	NC_017867	CCG	2	6	178033	178038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387821736
4120	NC_017867	TGCGC	2	10	178043	178052	0 %	20 %	40 %	40 %	387821736
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4122	NC_017867	GCG	2	6	178095	178100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4246	NC_017867	TTC	2	6	182358	182363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387821740
4247	NC_017867	TCA	2	6	182371	182376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387821740
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4249	NC_017867	TCA	2	6	182434	182439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387821740
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4251	NC_017867	CGG	2	6	182549	182554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387821740
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4284	NC_017867	TA	3	6	183971	183976	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4333	NC_017867	TCGA	2	8	186024	186031	25 %	25 %	25 %	25 %	387821742
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4346	NC_017867	CGTGG	2	10	186642	186651	0 %	20 %	60 %	20 %	387821742
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4350	NC_017867	ACG	2	6	186729	186734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387821742
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4352	NC_017867	CCAATG	2	12	186772	186783	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387821742
4353	NC_017867	GTG	2	6	186810	186815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387821742
4354	NC_017867	GGC	2	6	186897	186902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387821742
4355	NC_017867	ACA	2	6	186928	186933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387821742
4356	NC_017867	CAT	2	6	186938	186943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387821742
4357	NC_017867	CAAGGT	2	12	187025	187036	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387821742
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4359	NC_017867	GCA	2	6	187208	187213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387821742
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4361	NC_017867	TCG	2	6	187336	187341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387821742
4362	NC_017867	ATG	2	6	187452	187457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387821742
4363	NC_017867	GTG	2	6	187568	187573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387821742
4364	NC_017867	CAT	2	6	187580	187585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387821742
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4485	NC_017867	T	6	6	192497	192502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4488	NC_017867	TCT	2	6	192672	192677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4489	NC_017867	GTAA	2	8	192681	192688	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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