MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis B420 chromosome

Total Repeats: 43425

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43001	NC_017866	GAA	2	6	1920769	1920774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387821478
43002	NC_017866	TCG	2	6	1920853	1920858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387821478
43003	NC_017866	CTGTTC	2	12	1920859	1920870	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	387821478
43004	NC_017866	GGT	2	6	1920877	1920882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387821478
43005	NC_017866	GTG	2	6	1920925	1920930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387821478
43006	NC_017866	GCA	2	6	1920959	1920964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387821478
43007	NC_017866	CG	3	6	1920998	1921003	0 %	0 %	50 %	50 %	387821478
43008	NC_017866	GTG	2	6	1921072	1921077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387821478
43009	NC_017866	CAC	2	6	1921116	1921121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387821478
43010	NC_017866	GATG	2	8	1921194	1921201	25 %	25 %	50 %	0 %	387821478
43011	NC_017866	TGG	2	6	1921217	1921222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387821478
43012	NC_017866	AC	3	6	1921353	1921358	50 %	0 %	0 %	50 %	387821478
43013	NC_017866	CGCT	2	8	1921423	1921430	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
43014	NC_017866	CGG	2	6	1921432	1921437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43015	NC_017866	CGA	2	6	1921441	1921446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43016	NC_017866	GC	3	6	1921496	1921501	0 %	0 %	50 %	50 %	387821479
43017	NC_017866	CCA	2	6	1921608	1921613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387821479
43018	NC_017866	TCG	2	6	1921649	1921654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387821479
43019	NC_017866	TCC	2	6	1921685	1921690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387821479
43020	NC_017866	TCC	2	6	1921715	1921720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387821479
43021	NC_017866	CATC	2	8	1921725	1921732	25 %	25 %	0 %	50 %	387821479
43022	NC_017866	GTG	2	6	1921769	1921774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387821479
43023	NC_017866	GCG	2	6	1921834	1921839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387821479
43024	NC_017866	CGG	2	6	1921842	1921847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387821479
43025	NC_017866	CCA	2	6	1921917	1921922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387821479
43026	NC_017866	TGG	2	6	1921925	1921930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387821479
43027	NC_017866	AGCGC	2	10	1921935	1921944	20 %	0 %	40 %	40 %	387821479
43028	NC_017866	CACC	2	8	1921971	1921978	25 %	0 %	0 %	75 %	387821479
43029	NC_017866	GTG	3	9	1921984	1921992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387821479
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43031	NC_017866	GCA	2	6	1922067	1922072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387821479
43032	NC_017866	GGGC	2	8	1922082	1922089	0 %	0 %	75 %	25 %	387821479
43033	NC_017866	CG	3	6	1922122	1922127	0 %	0 %	50 %	50 %	387821479
43034	NC_017866	ATC	2	6	1922138	1922143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387821479
43035	NC_017866	CCA	2	6	1922238	1922243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387821479
43036	NC_017866	AGC	3	9	1922276	1922284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387821479
43037	NC_017866	CGGT	2	8	1922330	1922337	0 %	25 %	50 %	25 %	387821479
43038	NC_017866	CGG	2	6	1922355	1922360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387821479
43039	NC_017866	CAT	2	6	1922410	1922415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387821479
43040	NC_017866	TCG	2	6	1922429	1922434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387821479
43041	NC_017866	GCA	2	6	1922463	1922468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387821479
43042	NC_017866	TTG	2	6	1922474	1922479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387821479
43043	NC_017866	CCG	2	6	1922492	1922497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387821479
43044	NC_017866	CGG	2	6	1922558	1922563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387821479
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43046	NC_017866	GGT	2	6	1922641	1922646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387821479
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43048	NC_017866	GCA	3	9	1922814	1922822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387821479
43049	NC_017866	GCC	2	6	1922836	1922841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387821479
43050	NC_017866	CGC	2	6	1922919	1922924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387821479
43051	NC_017866	GCCC	2	8	1922938	1922945	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
43052	NC_017866	GCG	2	6	1922994	1922999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43053	NC_017866	GCA	2	6	1923035	1923040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43054	NC_017866	GCAT	2	8	1923130	1923137	25 %	25 %	25 %	25 %	387821480
43055	NC_017866	CGA	2	6	1923170	1923175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387821480
43056	NC_017866	ACC	2	6	1923225	1923230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387821480
43057	NC_017866	CA	3	6	1923311	1923316	50 %	0 %	0 %	50 %	387821480
43058	NC_017866	CGG	2	6	1923337	1923342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387821480
43059	NC_017866	GC	3	6	1923420	1923425	0 %	0 %	50 %	50 %	387821480
43060	NC_017866	CGT	2	6	1923432	1923437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387821480
43061	NC_017866	GCC	2	6	1923465	1923470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387821480
43062	NC_017866	GCA	2	6	1923474	1923479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387821480
43063	NC_017866	ATG	2	6	1923483	1923488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387821480
43064	NC_017866	ATG	2	6	1923612	1923617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387821480
43065	NC_017866	GCG	2	6	1923623	1923628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387821480
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43067	NC_017866	CTCG	2	8	1923656	1923663	0 %	25 %	25 %	50 %	387821480
43068	NC_017866	GGT	2	6	1923680	1923685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387821480
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43070	NC_017866	ATC	2	6	1923738	1923743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387821480
43071	NC_017866	TGCC	2	8	1923777	1923784	0 %	25 %	25 %	50 %	387821480
43072	NC_017866	CAG	2	6	1923816	1923821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387821480
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43076	NC_017866	CAT	2	6	1923936	1923941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387821480
43077	NC_017866	GCG	2	6	1923961	1923966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387821480
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43084	NC_017866	GCC	2	6	1924274	1924279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387821481
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43088	NC_017866	CTGC	2	8	1924553	1924560	0 %	25 %	25 %	50 %	387821481
43089	NC_017866	GAG	2	6	1924565	1924570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387821481
43090	NC_017866	GC	3	6	1924635	1924640	0 %	0 %	50 %	50 %	387821481
43091	NC_017866	CGA	2	6	1924756	1924761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387821481
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43100	NC_017866	CCG	2	6	1925349	1925354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387821481
43101	NC_017866	CTG	2	6	1925423	1925428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387821481
43102	NC_017866	CGC	2	6	1925464	1925469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387821481
43103	NC_017866	AGG	2	6	1925487	1925492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387821481
43104	NC_017866	GCG	2	6	1925550	1925555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387821481
43105	NC_017866	ATG	2	6	1925556	1925561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387821481
43106	NC_017866	ACC	3	9	1925579	1925587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387821481
43107	NC_017866	ACA	2	6	1925609	1925614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387821481
43108	NC_017866	CA	3	6	1925645	1925650	50 %	0 %	0 %	50 %	387821481
43109	NC_017866	TGC	2	6	1925682	1925687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387821481
43110	NC_017866	GCA	2	6	1925697	1925702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387821481
43111	NC_017866	CGGG	2	8	1925706	1925713	0 %	0 %	75 %	25 %	387821481
43112	NC_017866	CAA	2	6	1925737	1925742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387821481
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43115	NC_017866	ACG	2	6	1925862	1925867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387821481
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43117	NC_017866	GC	3	6	1925910	1925915	0 %	0 %	50 %	50 %	387821481
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43204	NC_017866	GAAC	2	8	1929480	1929487	50 %	0 %	25 %	25 %	387821482
43205	NC_017866	GCGT	2	8	1929533	1929540	0 %	25 %	50 %	25 %	387821482
43206	NC_017866	CG	3	6	1929560	1929565	0 %	0 %	50 %	50 %	387821482
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43220	NC_017866	TCG	2	6	1929833	1929838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387821482
43221	NC_017866	GGC	2	6	1929874	1929879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387821482
43222	NC_017866	TTCGGC	2	12	1929886	1929897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387821482
43223	NC_017866	GAA	2	6	1930035	1930040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387821482
43224	NC_017866	CAG	2	6	1930102	1930107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387821482
43225	NC_017866	AAG	2	6	1930135	1930140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387821482
43226	NC_017866	TCA	2	6	1930160	1930165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387821482
43227	NC_017866	GGC	2	6	1930180	1930185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387821482
43228	NC_017866	GGC	2	6	1930261	1930266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387821482
43229	NC_017866	ACC	2	6	1930267	1930272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387821482
43230	NC_017866	CCG	2	6	1930440	1930445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43231	NC_017866	AAT	2	6	1930588	1930593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43232	NC_017866	ACAGC	2	10	1930625	1930634	40 %	0 %	20 %	40 %	387821483
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.