MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis B420 chromosome

Total Repeats: 43425

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017866	AGCC	2	8	213340	213347	25 %	0 %	25 %	50 %	387820105
5002	NC_017866	CAG	2	6	213348	213353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387820105
5003	NC_017866	GCT	2	6	213374	213379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387820105
5004	NC_017866	TGA	2	6	213389	213394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387820105
5005	NC_017866	CTT	2	6	213429	213434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387820105
5006	NC_017866	CGT	2	6	213536	213541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387820105
5007	NC_017866	GAT	2	6	213609	213614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387820105
5008	NC_017866	GCG	2	6	213633	213638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387820105
5009	NC_017866	CG	3	6	213718	213723	0 %	0 %	50 %	50 %	387820105
5010	NC_017866	GGC	2	6	213726	213731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387820105
5011	NC_017866	TCGC	2	8	213736	213743	0 %	25 %	25 %	50 %	387820105
5012	NC_017866	GCC	2	6	213799	213804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387820105
5013	NC_017866	CCGTG	2	10	213830	213839	0 %	20 %	40 %	40 %	387820105
5014	NC_017866	ATGGTG	2	12	213840	213851	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	387820105
5015	NC_017866	TCGTGG	2	12	213865	213876	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	387820105
5016	NC_017866	CGA	2	6	213906	213911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387820105
5017	NC_017866	TCG	2	6	213937	213942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387820105
5018	NC_017866	CGT	2	6	213965	213970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387820105
5019	NC_017866	CAC	2	6	213987	213992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387820105
5020	NC_017866	CCG	2	6	214022	214027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387820105
5021	NC_017866	TGA	2	6	214067	214072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387820105
5022	NC_017866	GCC	2	6	214095	214100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387820105
5023	NC_017866	GCT	2	6	214103	214108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387820105
5024	NC_017866	GCGA	2	8	214111	214118	25 %	0 %	50 %	25 %	387820105
5025	NC_017866	ACG	2	6	214141	214146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387820105
5026	NC_017866	GTG	2	6	214153	214158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387820105
5027	NC_017866	GGT	2	6	214170	214175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387820105
5028	NC_017866	TGCGGC	2	12	214182	214193	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	387820105
5029	NC_017866	GTT	2	6	214215	214220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387820105
5030	NC_017866	GGC	2	6	214242	214247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387820105
5031	NC_017866	CGGC	2	8	214299	214306	0 %	0 %	50 %	50 %	387820105
5032	NC_017866	TCT	2	6	214384	214389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5033	NC_017866	AAT	2	6	214447	214452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_017866	CAG	2	6	214483	214488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5035	NC_017866	TGG	2	6	214490	214495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_017866	GC	3	6	214526	214531	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5037	NC_017866	CGT	2	6	214580	214585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387820106
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5039	NC_017866	GC	3	6	214730	214735	0 %	0 %	50 %	50 %	387820106
5040	NC_017866	GCC	2	6	214753	214758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387820106
5041	NC_017866	CAT	2	6	214779	214784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387820106
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5043	NC_017866	GAC	2	6	214842	214847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387820106
5044	NC_017866	CGGAA	2	10	214879	214888	40 %	0 %	40 %	20 %	387820106
5045	NC_017866	GGCA	2	8	214954	214961	25 %	0 %	50 %	25 %	387820106
5046	NC_017866	CGT	2	6	214979	214984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387820106
5047	NC_017866	CGGTGA	2	12	215042	215053	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	387820106
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5050	NC_017866	GCGG	2	8	215225	215232	0 %	0 %	75 %	25 %	387820106
5051	NC_017866	CGG	2	6	215273	215278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387820106
5052	NC_017866	AGT	2	6	215321	215326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387820106
5053	NC_017866	GCC	3	9	215358	215366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387820106
5054	NC_017866	GCG	2	6	215391	215396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387820106
5055	NC_017866	CTG	2	6	215421	215426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387820106
5056	NC_017866	ATGA	2	8	215486	215493	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_017866	GC	3	6	215510	215515	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5058	NC_017866	T	6	6	215540	215545	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_017866	ACG	2	6	215587	215592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387820107
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5061	NC_017866	TGC	2	6	215626	215631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387820107
5062	NC_017866	CG	3	6	215661	215666	0 %	0 %	50 %	50 %	387820107
5063	NC_017866	TGG	2	6	215668	215673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387820107
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5080	NC_017866	GTGAG	2	10	216466	216475	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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5103	NC_017866	C	7	7	217392	217398	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5104	NC_017866	GCT	2	6	217435	217440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5105	NC_017866	GC	3	6	217537	217542	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5106	NC_017866	AGT	2	6	217545	217550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5109	NC_017866	ATC	2	6	217613	217618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387820109
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5112	NC_017866	CG	3	6	217860	217865	0 %	0 %	50 %	50 %	387820109
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5121	NC_017866	CGG	2	6	218110	218115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387820109
5122	NC_017866	GC	3	6	218129	218134	0 %	0 %	50 %	50 %	387820109
5123	NC_017866	GAC	2	6	218144	218149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387820109
5124	NC_017866	CGC	2	6	218155	218160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387820109
5125	NC_017866	CGA	2	6	218197	218202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387820109
5126	NC_017866	CAA	2	6	218221	218226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387820109
5127	NC_017866	GCA	2	6	218314	218319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387820109
5128	NC_017866	ACA	2	6	218370	218375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387820109
5129	NC_017866	CGA	2	6	218416	218421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387820109
5130	NC_017866	GCCG	2	8	218431	218438	0 %	0 %	50 %	50 %	387820109
5131	NC_017866	GC	3	6	218474	218479	0 %	0 %	50 %	50 %	387820109
5132	NC_017866	CGG	2	6	218574	218579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387820109
5133	NC_017866	TGCA	2	8	218633	218640	25 %	25 %	25 %	25 %	387820109
5134	NC_017866	CGCC	2	8	218655	218662	0 %	0 %	25 %	75 %	387820109
5135	NC_017866	CAC	2	6	218707	218712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387820109
5136	NC_017866	ACGG	2	8	218849	218856	25 %	0 %	50 %	25 %	387820109
5137	NC_017866	GCGA	2	8	218951	218958	25 %	0 %	50 %	25 %	387820109
5138	NC_017866	ACG	2	6	219071	219076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387820109
5139	NC_017866	GCT	2	6	219295	219300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5140	NC_017866	TCC	2	6	219356	219361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387820110
5141	NC_017866	GCC	2	6	219389	219394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387820110
5142	NC_017866	TTC	2	6	219395	219400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387820110
5143	NC_017866	GCG	2	6	219479	219484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387820110
5144	NC_017866	GCT	2	6	219486	219491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387820110
5145	NC_017866	GCTTCT	2	12	219588	219599	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	387820110
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5148	NC_017866	TA	3	6	219727	219732	50 %	50 %	0 %	0 %	387820110
5149	NC_017866	CCA	2	6	219801	219806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387820110
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5151	NC_017866	ACC	3	9	219839	219847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387820110
5152	NC_017866	GCC	2	6	219865	219870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387820110
5153	NC_017866	TCC	2	6	219920	219925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387820110
5154	NC_017866	GGC	2	6	219949	219954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387820110
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5157	NC_017866	AT	5	10	220060	220069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5158	NC_017866	CG	3	6	220107	220112	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5159	NC_017866	ATC	2	6	220183	220188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387820111
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5163	NC_017866	CG	3	6	220290	220295	0 %	0 %	50 %	50 %	387820111
5164	NC_017866	CG	3	6	220309	220314	0 %	0 %	50 %	50 %	387820111
5165	NC_017866	AGG	2	6	220325	220330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387820111
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5189	NC_017866	AAGAC	2	10	221027	221036	60 %	0 %	20 %	20 %	387820111
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5211	NC_017866	AG	3	6	221797	221802	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5212	NC_017866	CGC	2	6	221836	221841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387820112
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5232	NC_017866	CCGCTG	2	12	222579	222590	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	387820112
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5237	NC_017866	GCTC	2	8	222765	222772	0 %	25 %	25 %	50 %	387820112
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5242	NC_017866	CTT	2	6	222856	222861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387820112
5243	NC_017866	ATC	2	6	222920	222925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387820112
5244	NC_017866	CAT	2	6	222928	222933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387820112
5245	NC_017866	CAC	2	6	222958	222963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387820112
5246	NC_017866	ATC	2	6	222965	222970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387820112
5247	NC_017866	TGGC	2	8	222994	223001	0 %	25 %	50 %	25 %	387820112
5248	NC_017866	TTA	2	6	223089	223094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387820112
5249	NC_017866	CGA	2	6	223148	223153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387820113
5250	NC_017866	AGG	2	6	223159	223164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387820113
5251	NC_017866	CCG	2	6	223174	223179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387820113
5252	NC_017866	GCC	2	6	223219	223224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387820113
5253	NC_017866	GAT	2	6	223305	223310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387820113
5254	NC_017866	CCG	2	6	223348	223353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387820113
5255	NC_017866	TGG	2	6	223402	223407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387820113
5256	NC_017866	CCG	2	6	223435	223440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387820113
5257	NC_017866	CACG	2	8	223493	223500	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5258	NC_017866	CGG	2	6	223510	223515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5259	NC_017866	CG	3	6	223529	223534	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5260	NC_017866	CTC	2	6	223566	223571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5261	NC_017866	TGCA	2	8	223710	223717	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5262	NC_017866	CAA	2	6	223725	223730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5263	NC_017866	CAG	2	6	223780	223785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387820114
5264	NC_017866	GAGC	2	8	223797	223804	25 %	0 %	50 %	25 %	387820114
5265	NC_017866	GCTC	2	8	223955	223962	0 %	25 %	25 %	50 %	387820114
5266	NC_017866	CGACCT	2	12	223989	224000	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	387820114
5267	NC_017866	CCG	2	6	224012	224017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387820114
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5269	NC_017866	CTCGAC	2	12	224092	224103	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	387820114
5270	NC_017866	GACC	2	8	224139	224146	25 %	0 %	25 %	50 %	387820114
5271	NC_017866	GGCT	2	8	224167	224174	0 %	25 %	50 %	25 %	387820114
5272	NC_017866	CCACGG	2	12	224216	224227	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	387820114
5273	NC_017866	GGC	2	6	224250	224255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387820114
5274	NC_017866	GC	3	6	224254	224259	0 %	0 %	50 %	50 %	387820114
5275	NC_017866	CTG	2	6	224275	224280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387820114
5276	NC_017866	CG	3	6	224351	224356	0 %	0 %	50 %	50 %	387820114
5277	NC_017866	CTC	2	6	224377	224382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387820114
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5280	NC_017866	GAC	2	6	224431	224436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387820114
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5282	NC_017866	GAC	2	6	224593	224598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387820114
5283	NC_017866	GCT	2	6	224607	224612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387820114
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5285	NC_017866	ACGC	2	8	224670	224677	25 %	0 %	25 %	50 %	387820114
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5288	NC_017866	CG	3	6	224723	224728	0 %	0 %	50 %	50 %	387820114
5289	NC_017866	CGG	2	6	224730	224735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387820114
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5294	NC_017866	TGC	2	6	225194	225199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387820114
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5300	NC_017866	TGG	2	6	225416	225421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387820114
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5302	NC_017866	GTC	2	6	225474	225479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387820114
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5304	NC_017866	GGTGG	2	10	225516	225525	0 %	20 %	80 %	0 %	387820114
5305	NC_017866	GC	4	8	225534	225541	0 %	0 %	50 %	50 %	387820114
5306	NC_017866	CAT	2	6	225664	225669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5307	NC_017866	GCGCCC	2	12	225722	225733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5308	NC_017866	TCAT	2	8	225747	225754	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5309	NC_017866	GTA	2	6	225791	225796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5310	NC_017866	AT	3	6	225822	225827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5311	NC_017866	GAG	2	6	225937	225942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5312	NC_017866	TGA	2	6	225969	225974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387820115
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5314	NC_017866	GAG	2	6	226060	226065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387820115
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5316	NC_017866	CG	3	6	226233	226238	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5317	NC_017866	CAA	2	6	226294	226299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387820116
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5319	NC_017866	ACG	2	6	226356	226361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387820116
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5322	NC_017866	CGCAGG	2	12	226725	226736	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	387820116
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5324	NC_017866	GGCG	2	8	226870	226877	0 %	0 %	75 %	25 %	387820116
5325	NC_017866	CGA	2	6	226900	226905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387820116
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5328	NC_017866	CG	3	6	226990	226995	0 %	0 %	50 %	50 %	387820116
5329	NC_017866	CCG	2	6	226998	227003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387820116
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5331	NC_017866	GCGCA	2	10	227063	227072	20 %	0 %	40 %	40 %	387820116
5332	NC_017866	CGG	2	6	227079	227084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387820116
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5348	NC_017866	GAC	2	6	227725	227730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5349	NC_017866	AGGC	2	8	227743	227750	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5350	NC_017866	GCAC	3	12	227790	227801	25 %	0 %	25 %	50 %	387820117
5351	NC_017866	CGG	2	6	227869	227874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387820117
5352	NC_017866	GGT	2	6	227893	227898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387820117
5353	NC_017866	GTG	2	6	227954	227959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387820117
5354	NC_017866	ACC	4	12	227984	227995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387820117
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5356	NC_017866	TCG	2	6	228080	228085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387820117
5357	NC_017866	CGA	2	6	228145	228150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387820117
5358	NC_017866	GCT	3	9	228196	228204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387820117
5359	NC_017866	ACA	2	6	228246	228251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387820117
5360	NC_017866	CTT	2	6	228260	228265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387820117
5361	NC_017866	CG	3	6	228285	228290	0 %	0 %	50 %	50 %	387820117
5362	NC_017866	GTG	2	6	228296	228301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387820117
5363	NC_017866	GTG	2	6	228341	228346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387820117
5364	NC_017866	ATT	2	6	228396	228401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387820117
5365	NC_017866	CGA	3	9	228409	228417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387820117
5366	NC_017866	ACC	2	6	228422	228427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387820117
5367	NC_017866	TCG	2	6	228486	228491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387820117
5368	NC_017866	ACC	2	6	228558	228563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387820117
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5373	NC_017866	CA	3	6	228767	228772	50 %	0 %	0 %	50 %	387820117
5374	NC_017866	CGCCGA	2	12	228775	228786	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	387820117
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5489	NC_017866	GCT	2	6	233473	233478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387820121
5490	NC_017866	TGC	2	6	233487	233492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387820121
5491	NC_017866	GTG	2	6	233495	233500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387820121
5492	NC_017866	ATC	2	6	233516	233521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387820121
5493	NC_017866	GAC	2	6	233555	233560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387820121
5494	NC_017866	CGA	2	6	233563	233568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387820121
5495	NC_017866	GCC	2	6	233588	233593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387820121
5496	NC_017866	TGG	2	6	233622	233627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387820121
5497	NC_017866	GCC	2	6	233642	233647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387820121
5498	NC_017866	GAA	2	6	233716	233721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387820121
5499	NC_017866	CCCG	2	8	233766	233773	0 %	0 %	25 %	75 %	387820121
5500	NC_017866	AACGGC	2	12	233798	233809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387820121

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