MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. animalis ATCC 25527 chromosome

Total Repeats: 1456

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017834	ACCAC	2	10	1764	1773	40 %	0 %	0 %	60 %	386866199
2	NC_017834	GAACG	2	10	1932	1941	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_017834	CCGGC	2	10	2781	2790	0 %	0 %	40 %	60 %	386866200
4	NC_017834	CGATC	2	10	5832	5841	20 %	20 %	20 %	40 %	386866203
5	NC_017834	AAGGC	2	10	7646	7655	40 %	0 %	40 %	20 %	386866203
6	NC_017834	GGCCG	2	10	14143	14152	0 %	0 %	60 %	40 %	386866208
7	NC_017834	GCACG	2	10	14305	14314	20 %	0 %	40 %	40 %	386866208
8	NC_017834	GGTGG	2	10	14950	14959	0 %	20 %	80 %	0 %	386866208
9	NC_017834	GCGAG	2	10	15682	15691	20 %	0 %	60 %	20 %	386866209
10	NC_017834	GATTG	2	10	16603	16612	20 %	40 %	40 %	0 %	386866209
11	NC_017834	TTCGA	2	10	17006	17015	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017834	ACCGA	2	10	17664	17673	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_017834	GACGG	2	10	20721	20730	20 %	0 %	60 %	20 %	386866214
14	NC_017834	TCTGT	2	10	21264	21273	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017834	CGCAC	2	10	24064	24073	20 %	0 %	20 %	60 %	386866217
16	NC_017834	AGCGC	2	10	25194	25203	20 %	0 %	40 %	40 %	386866217
17	NC_017834	GCCGT	2	10	25543	25552	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
18	NC_017834	GGGGA	2	10	26609	26618	20 %	0 %	80 %	0 %	386866218
19	NC_017834	GAGAA	2	10	26746	26755	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017834	TGCAG	2	10	28980	28989	20 %	20 %	40 %	20 %	386866221
21	NC_017834	GAGAA	2	10	31912	31921	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017834	AGACA	2	10	33945	33954	60 %	0 %	20 %	20 %	386866228
23	NC_017834	ACTTG	2	10	36808	36817	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_017834	GAGCG	2	10	37410	37419	20 %	0 %	60 %	20 %	386866231
25	NC_017834	TATCG	2	10	41276	41285	20 %	40 %	20 %	20 %	386866236
26	NC_017834	TCGGT	2	10	42760	42769	0 %	40 %	40 %	20 %	386866236
27	NC_017834	TCGCG	2	10	43066	43075	0 %	20 %	40 %	40 %	386866237
28	NC_017834	GTCCA	2	10	43298	43307	20 %	20 %	20 %	40 %	386866237
29	NC_017834	AGGGC	2	10	43861	43870	20 %	0 %	60 %	20 %	386866237
30	NC_017834	TTCAC	2	10	45319	45328	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
31	NC_017834	GGCGG	2	10	46944	46953	0 %	0 %	80 %	20 %	386866240
32	NC_017834	GGAAG	2	10	47264	47273	40 %	0 %	60 %	0 %	386866240
33	NC_017834	TTTGA	2	10	48108	48117	20 %	60 %	20 %	0 %	386866240
34	NC_017834	GAGTT	2	10	48172	48181	20 %	40 %	40 %	0 %	386866240
35	NC_017834	GCTAT	2	10	48238	48247	20 %	40 %	20 %	20 %	386866240
36	NC_017834	CAAGC	2	10	51359	51368	40 %	0 %	20 %	40 %	386866245
37	NC_017834	GTGCT	2	10	52711	52720	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_017834	GAATG	2	10	55031	55040	40 %	20 %	40 %	0 %	386866249
39	NC_017834	GCCTT	2	10	59228	59237	0 %	40 %	20 %	40 %	386866253
40	NC_017834	TGCCG	2	10	61687	61696	0 %	20 %	40 %	40 %	386866257
41	NC_017834	CGAGG	2	10	61756	61765	20 %	0 %	60 %	20 %	386866257
42	NC_017834	GCCTT	2	10	62911	62920	0 %	40 %	20 %	40 %	386866258
43	NC_017834	GCGAG	2	10	63182	63191	20 %	0 %	60 %	20 %	386866258
44	NC_017834	TTCGA	2	10	64677	64686	20 %	40 %	20 %	20 %	386866259
45	NC_017834	TGTGC	2	10	66034	66043	0 %	40 %	40 %	20 %	386866260
46	NC_017834	ATCGC	2	10	68914	68923	20 %	20 %	20 %	40 %	386866263
47	NC_017834	TGGGG	2	10	69613	69622	0 %	20 %	80 %	0 %	386866264
48	NC_017834	GGGTT	2	10	71156	71165	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017834	TGGTG	2	10	71283	71292	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017834	CAATA	2	10	71807	71816	60 %	20 %	0 %	20 %	386866265
51	NC_017834	GCTCG	2	10	75281	75290	0 %	20 %	40 %	40 %	386866267
52	NC_017834	GCTGA	2	10	77671	77680	20 %	20 %	40 %	20 %	386866269
53	NC_017834	CATCG	2	10	79471	79480	20 %	20 %	20 %	40 %	386866269
54	NC_017834	TTGTA	2	10	79882	79891	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017834	CGCAT	2	10	80294	80303	20 %	20 %	20 %	40 %	386866270
56	NC_017834	CGGTG	2	10	82060	82069	0 %	20 %	60 %	20 %	386866271
57	NC_017834	TCATT	2	10	82976	82985	20 %	60 %	0 %	20 %	386866271
58	NC_017834	CCAAA	2	10	83459	83468	60 %	0 %	0 %	40 %	386866272
59	NC_017834	CCGGG	2	10	83951	83960	0 %	0 %	60 %	40 %	386866273
60	NC_017834	CGAAC	2	10	90923	90932	40 %	0 %	20 %	40 %	386866278
61	NC_017834	GCTCG	2	10	92275	92284	0 %	20 %	40 %	40 %	386866280
62	NC_017834	ATACA	2	10	92879	92888	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_017834	AGGAG	2	10	95129	95138	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017834	GGTGC	2	10	97456	97465	0 %	20 %	60 %	20 %	386866284
65	NC_017834	CCATG	2	10	98992	99001	20 %	20 %	20 %	40 %	386866285
66	NC_017834	GTCTT	2	10	103940	103949	0 %	60 %	20 %	20 %	386866289
67	NC_017834	TGTGC	2	10	106074	106083	0 %	40 %	40 %	20 %	386866290
68	NC_017834	GCGCC	2	10	108127	108136	0 %	0 %	40 %	60 %	386866291
69	NC_017834	CGCCC	2	10	108615	108624	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
70	NC_017834	GCCGC	2	10	109083	109092	0 %	0 %	40 %	60 %	386866292
71	NC_017834	AGGAA	2	10	109878	109887	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017834	GGCCG	2	10	112237	112246	0 %	0 %	60 %	40 %	386866295
73	NC_017834	TGTTT	2	10	113766	113775	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017834	CCGTG	2	10	113892	113901	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
75	NC_017834	GCAAA	2	10	114190	114199	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_017834	TGCGA	2	10	117086	117095	20 %	20 %	40 %	20 %	386866299
77	NC_017834	TGGCG	2	10	117601	117610	0 %	20 %	60 %	20 %	386866299
78	NC_017834	ACGGC	2	10	117693	117702	20 %	0 %	40 %	40 %	386866299
79	NC_017834	GACGA	2	10	117749	117758	40 %	0 %	40 %	20 %	386866299
80	NC_017834	ACCGA	2	10	117974	117983	40 %	0 %	20 %	40 %	386866299
81	NC_017834	TCGCC	2	10	118218	118227	0 %	20 %	20 %	60 %	386866299
82	NC_017834	GCCCG	2	10	120127	120136	0 %	0 %	40 %	60 %	386866300
83	NC_017834	AGTCG	2	10	120475	120484	20 %	20 %	40 %	20 %	386866300
84	NC_017834	CGCGT	2	10	120923	120932	0 %	20 %	40 %	40 %	386866301
85	NC_017834	GTGCG	2	10	121513	121522	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
86	NC_017834	TGGTG	2	10	122723	122732	0 %	40 %	60 %	0 %	386866302
87	NC_017834	GTTCG	2	10	124905	124914	0 %	40 %	40 %	20 %	386866304
88	NC_017834	TCGAA	2	10	126521	126530	40 %	20 %	20 %	20 %	386866305
89	NC_017834	AGGTG	2	10	126631	126640	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017834	GCGGT	2	10	127854	127863	0 %	20 %	60 %	20 %	386866306
91	NC_017834	TCATG	2	10	128176	128185	20 %	40 %	20 %	20 %	386866307
92	NC_017834	GCGAG	2	10	128293	128302	20 %	0 %	60 %	20 %	386866307
93	NC_017834	GCCGA	2	10	129419	129428	20 %	0 %	40 %	40 %	386866310
94	NC_017834	TCGCG	2	10	130319	130328	0 %	20 %	40 %	40 %	386866311
95	NC_017834	CGCAT	2	10	135324	135333	20 %	20 %	20 %	40 %	386866317
96	NC_017834	TGGAT	2	10	136871	136880	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017834	TGAGG	2	10	138138	138147	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017834	TGCTC	2	10	139282	139291	0 %	40 %	20 %	40 %	386866322
99	NC_017834	CGGCT	2	10	141128	141137	0 %	20 %	40 %	40 %	386866324
100	NC_017834	TCCAG	2	10	141342	141351	20 %	20 %	20 %	40 %	386866324
101	NC_017834	GTGCG	2	10	141736	141745	0 %	20 %	60 %	20 %	386866324
102	NC_017834	TCTCA	2	10	144156	144165	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
103	NC_017834	CGGCC	2	10	144641	144650	0 %	0 %	40 %	60 %	386866326
104	NC_017834	GGCCA	2	10	144909	144918	20 %	0 %	40 %	40 %	386866326
105	NC_017834	TCTCA	2	10	147071	147080	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
106	NC_017834	TGGCA	2	10	147478	147487	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
107	NC_017834	CTCGC	2	10	147489	147498	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
108	NC_017834	AACAG	2	10	147641	147650	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_017834	CAAGA	2	10	147928	147937	60 %	0 %	20 %	20 %	386866329
110	NC_017834	GACAA	2	10	150152	150161	60 %	0 %	20 %	20 %	386866331
111	NC_017834	CCCGA	2	10	150329	150338	20 %	0 %	20 %	60 %	386866331
112	NC_017834	AAATA	2	10	151964	151973	80 %	20 %	0 %	0 %	386866332
113	NC_017834	ATGAG	2	10	152054	152063	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017834	CGACG	2	10	152816	152825	20 %	0 %	40 %	40 %	386866333
115	NC_017834	CAGGC	2	10	153429	153438	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
116	NC_017834	GCACC	2	10	156952	156961	20 %	0 %	20 %	60 %	386866335
117	NC_017834	GCTCG	2	10	157857	157866	0 %	20 %	40 %	40 %	386866336
118	NC_017834	GTATC	2	10	159043	159052	20 %	40 %	20 %	20 %	386866337
119	NC_017834	CGCAT	2	10	159524	159533	20 %	20 %	20 %	40 %	386866337
120	NC_017834	GGGAT	2	10	160321	160330	20 %	20 %	60 %	0 %	386866337
121	NC_017834	TGCCG	2	10	160843	160852	0 %	20 %	40 %	40 %	386866338
122	NC_017834	CGATG	2	10	162495	162504	20 %	20 %	40 %	20 %	386866338
123	NC_017834	CGACC	2	10	163716	163725	20 %	0 %	20 %	60 %	386866340
124	NC_017834	GCTCG	2	10	163940	163949	0 %	20 %	40 %	40 %	386866341
125	NC_017834	GCGTC	2	10	165029	165038	0 %	20 %	40 %	40 %	386866341
126	NC_017834	CACCG	2	10	166243	166252	20 %	0 %	20 %	60 %	386866342
127	NC_017834	GCGCC	2	10	168109	168118	0 %	0 %	40 %	60 %	386866343
128	NC_017834	CCGCG	2	10	168793	168802	0 %	0 %	40 %	60 %	386866343
129	NC_017834	GTGCG	2	10	170938	170947	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
130	NC_017834	GCTCG	2	10	172534	172543	0 %	20 %	40 %	40 %	386866345
131	NC_017834	GTGCC	2	10	172802	172811	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
132	NC_017834	TGACT	2	10	173413	173422	20 %	40 %	20 %	20 %	386866346
133	NC_017834	GCATC	2	10	174254	174263	20 %	20 %	20 %	40 %	386866346
134	NC_017834	TCGCG	2	10	174389	174398	0 %	20 %	40 %	40 %	386866346
135	NC_017834	GGAGG	2	10	177000	177009	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017834	GCCTG	2	10	177689	177698	0 %	20 %	40 %	40 %	386866348
137	NC_017834	CACCG	2	10	178079	178088	20 %	0 %	20 %	60 %	386866348
138	NC_017834	TGCCG	2	10	179123	179132	0 %	20 %	40 %	40 %	386866349
139	NC_017834	CTCAT	2	10	181737	181746	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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143	NC_017834	TGAGA	2	10	184281	184290	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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170	NC_017834	CCGTG	2	10	216461	216470	0 %	20 %	40 %	40 %	386866377
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176	NC_017834	CGACC	2	10	221492	221501	20 %	0 %	20 %	60 %	386866383
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234	NC_017834	GACGA	2	10	302539	302548	40 %	0 %	40 %	20 %	386866445
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236	NC_017834	CATCG	2	10	304026	304035	20 %	20 %	20 %	40 %	386866446
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239	NC_017834	TGCCG	2	10	308100	308109	0 %	20 %	40 %	40 %	386866449
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241	NC_017834	CGTTC	2	10	311136	311145	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
242	NC_017834	CCGAC	2	10	311986	311995	20 %	0 %	20 %	60 %	386866452
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250	NC_017834	GGCGC	2	10	325039	325048	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
251	NC_017834	GCTCG	2	10	325131	325140	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
252	NC_017834	CGCGC	2	10	325612	325621	0 %	0 %	40 %	60 %	386866463
253	NC_017834	TCCCG	2	10	327205	327214	0 %	20 %	20 %	60 %	386866465
254	NC_017834	GCGCG	2	10	327370	327379	0 %	0 %	60 %	40 %	386866465
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260	NC_017834	TGCGC	2	10	334111	334120	0 %	20 %	40 %	40 %	386866471
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265	NC_017834	CTGGT	2	10	341224	341233	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
266	NC_017834	GCCGC	2	10	342199	342208	0 %	0 %	40 %	60 %	386866476
267	NC_017834	GGGAC	2	10	342428	342437	20 %	0 %	60 %	20 %	386866476
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269	NC_017834	AGCCG	2	10	344653	344662	20 %	0 %	40 %	40 %	386866477
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