MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. animalis ATCC 25527 chromosome

Total Repeats: 42919

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017834	CTG	2	6	174336	174341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866346
4002	NC_017834	AGG	2	6	174344	174349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386866346
4003	NC_017834	GCG	2	6	174355	174360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866346
4004	NC_017834	TCGCG	2	10	174389	174398	0 %	20 %	40 %	40 %	386866346
4005	NC_017834	CAG	2	6	174438	174443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866346
4006	NC_017834	GCTC	2	8	174446	174453	0 %	25 %	25 %	50 %	386866346
4007	NC_017834	GCC	2	6	174474	174479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866346
4008	NC_017834	ACG	2	6	174493	174498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866346
4009	NC_017834	GCT	2	6	174533	174538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866346
4010	NC_017834	AGT	2	6	174545	174550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386866346
4011	NC_017834	GCG	2	6	174578	174583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866346
4012	NC_017834	CGG	2	6	174587	174592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866346
4013	NC_017834	GATT	2	8	174623	174630	25 %	50 %	25 %	0 %	386866346
4014	NC_017834	GCA	2	6	174659	174664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866346
4015	NC_017834	CCT	2	6	174689	174694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386866346
4016	NC_017834	TGT	2	6	174707	174712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386866346
4017	NC_017834	GCC	2	6	174738	174743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866346
4018	NC_017834	CGT	2	6	174770	174775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866346
4019	NC_017834	TCG	2	6	174787	174792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866346
4020	NC_017834	CCG	2	6	174793	174798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866346
4021	NC_017834	CAT	2	6	174863	174868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386866346
4022	NC_017834	CG	3	6	174889	174894	0 %	0 %	50 %	50 %	386866346
4023	NC_017834	CCTGCC	2	12	174899	174910	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	386866346
4024	NC_017834	TTG	2	6	174973	174978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386866346
4025	NC_017834	GCA	2	6	174983	174988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866346
4026	NC_017834	GGC	2	6	175008	175013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866346
4027	NC_017834	GC	3	6	175046	175051	0 %	0 %	50 %	50 %	386866346
4028	NC_017834	CGT	2	6	175052	175057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866346
4029	NC_017834	GTT	2	6	175144	175149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_017834	GCT	2	6	175179	175184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4031	NC_017834	CGGG	2	8	175197	175204	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4032	NC_017834	GCC	2	6	175254	175259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4033	NC_017834	CAG	2	6	175265	175270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4034	NC_017834	TGG	2	6	175293	175298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_017834	GGGT	2	8	175408	175415	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_017834	CCA	2	6	175516	175521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4037	NC_017834	CGAA	2	8	175561	175568	50 %	0 %	25 %	25 %	386866347
4038	NC_017834	TCCTCG	2	12	175599	175610	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	386866347
4039	NC_017834	AAT	2	6	175651	175656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386866347
4040	NC_017834	TG	3	6	175662	175667	0 %	50 %	50 %	0 %	386866347
4041	NC_017834	CAC	2	6	175691	175696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386866347
4042	NC_017834	TCG	2	6	175698	175703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866347
4043	NC_017834	CG	3	6	175706	175711	0 %	0 %	50 %	50 %	386866347
4044	NC_017834	TGC	2	6	175728	175733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866347
4045	NC_017834	GTC	2	6	175740	175745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866347
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4048	NC_017834	ACC	2	6	175896	175901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386866347
4049	NC_017834	GTC	3	9	175907	175915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866347
4050	NC_017834	AGC	2	6	176025	176030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866347
4051	NC_017834	GC	3	6	176032	176037	0 %	0 %	50 %	50 %	386866347
4052	NC_017834	GAT	2	6	176048	176053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386866347
4053	NC_017834	GC	3	6	176071	176076	0 %	0 %	50 %	50 %	386866347
4054	NC_017834	GCG	2	6	176079	176084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866347
4055	NC_017834	CGC	2	6	176176	176181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866347
4056	NC_017834	GCG	2	6	176210	176215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866347
4057	NC_017834	CGT	3	9	176251	176259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866347
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4059	NC_017834	CGG	2	6	176392	176397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866347
4060	NC_017834	CACG	2	8	176428	176435	25 %	0 %	25 %	50 %	386866347
4061	NC_017834	GAT	2	6	176453	176458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386866347
4062	NC_017834	GAGG	2	8	176510	176517	25 %	0 %	75 %	0 %	386866347
4063	NC_017834	TTC	2	6	176574	176579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386866347
4064	NC_017834	TGC	2	6	176638	176643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866347
4065	NC_017834	CTG	2	6	176657	176662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4066	NC_017834	CTTT	2	8	176878	176885	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4067	NC_017834	AG	3	6	176942	176947	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_017834	GGA	2	6	176952	176957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_017834	TTG	2	6	176969	176974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_017834	GGAGG	2	10	177000	177009	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_017834	AGTA	2	8	177042	177049	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_017834	AATG	2	8	177050	177057	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_017834	CG	3	6	177077	177082	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4074	NC_017834	AGG	2	6	177127	177132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_017834	ATGACG	2	12	177141	177152	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386866348
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4079	NC_017834	GCT	2	6	177458	177463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866348
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4081	NC_017834	GTG	2	6	177647	177652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386866348
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4083	NC_017834	GCCTG	2	10	177689	177698	0 %	20 %	40 %	40 %	386866348
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4087	NC_017834	CTA	2	6	177902	177907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386866348
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4091	NC_017834	CACCG	2	10	178079	178088	20 %	0 %	20 %	60 %	386866348
4092	NC_017834	CA	4	8	178128	178135	50 %	0 %	0 %	50 %	386866348
4093	NC_017834	ACG	2	6	178189	178194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866348
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4096	NC_017834	ACG	2	6	178285	178290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866348
4097	NC_017834	CG	3	6	178335	178340	0 %	0 %	50 %	50 %	386866348
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4102	NC_017834	GGC	2	6	178778	178783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866349
4103	NC_017834	CTT	2	6	178832	178837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386866349
4104	NC_017834	GGA	2	6	178874	178879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386866349
4105	NC_017834	ACGA	2	8	178953	178960	50 %	0 %	25 %	25 %	386866349
4106	NC_017834	GCA	2	6	179021	179026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866349
4107	NC_017834	CGA	2	6	179030	179035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866349
4108	NC_017834	CGC	2	6	179048	179053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866349
4109	NC_017834	GAG	2	6	179079	179084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386866349
4110	NC_017834	AAC	2	6	179106	179111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386866349
4111	NC_017834	TGCCG	2	10	179123	179132	0 %	20 %	40 %	40 %	386866349
4112	NC_017834	CGA	2	6	179135	179140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866349
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4114	NC_017834	TCACCG	2	12	179251	179262	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386866349
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4116	NC_017834	CGA	2	6	179306	179311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866349
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4119	NC_017834	TGC	2	6	179422	179427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866349
4120	NC_017834	CG	3	6	179540	179545	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4121	NC_017834	CG	3	6	179563	179568	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4122	NC_017834	AT	3	6	179584	179589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_017834	TG	3	6	179598	179603	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_017834	GT	3	6	179768	179773	0 %	50 %	50 %	0 %	386866350
4125	NC_017834	CG	3	6	179828	179833	0 %	0 %	50 %	50 %	386866350
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4373	NC_017834	ACCG	2	8	188928	188935	25 %	0 %	25 %	50 %	386866358
4374	NC_017834	GC	3	6	188936	188941	0 %	0 %	50 %	50 %	386866358
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4401	NC_017834	GTAC	2	8	190379	190386	25 %	25 %	25 %	25 %	386866359
4402	NC_017834	GCTC	2	8	190414	190421	0 %	25 %	25 %	50 %	386866359
4403	NC_017834	TCGA	2	8	190437	190444	25 %	25 %	25 %	25 %	386866359
4404	NC_017834	TGA	3	9	190489	190497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386866359
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4441	NC_017834	CAT	2	6	192359	192364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386866360
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4462	NC_017834	TCCG	2	8	193072	193079	0 %	25 %	25 %	50 %	386866360
4463	NC_017834	TCGCC	2	10	193096	193105	0 %	20 %	20 %	60 %	386866360
4464	NC_017834	TCA	2	6	193108	193113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386866360
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4468	NC_017834	GCC	3	9	193176	193184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866360
4469	NC_017834	GCT	2	6	193199	193204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866360
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4471	NC_017834	GC	4	8	193299	193306	0 %	0 %	50 %	50 %	386866360
4472	NC_017834	ATC	2	6	193308	193313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386866360
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4474	NC_017834	GAT	2	6	193352	193357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386866360
4475	NC_017834	CG	3	6	193360	193365	0 %	0 %	50 %	50 %	386866360
4476	NC_017834	TCG	2	6	193389	193394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866360
4477	NC_017834	CGT	2	6	193396	193401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866360
4478	NC_017834	ATC	2	6	193410	193415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386866360
4479	NC_017834	GAT	2	6	193433	193438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386866360
4480	NC_017834	CGC	2	6	193462	193467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866360
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4482	NC_017834	TTC	2	6	193530	193535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386866360
4483	NC_017834	GTG	2	6	193608	193613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386866360
4484	NC_017834	CGG	2	6	193616	193621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866360
4485	NC_017834	TGC	2	6	193630	193635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866360
4486	NC_017834	GC	3	6	193750	193755	0 %	0 %	50 %	50 %	386866361
4487	NC_017834	TGG	2	6	193840	193845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386866361
4488	NC_017834	ACC	2	6	193875	193880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386866361
4489	NC_017834	GA	3	6	193929	193934	50 %	0 %	50 %	0 %	386866361
4490	NC_017834	TGG	2	6	194031	194036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4491	NC_017834	TCG	2	6	194042	194047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4492	NC_017834	TGC	2	6	194079	194084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4493	NC_017834	GAG	2	6	194194	194199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4494	NC_017834	CCG	2	6	194271	194276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4495	NC_017834	TTG	2	6	194277	194282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4496	NC_017834	CGT	2	6	194307	194312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4497	NC_017834	GCG	2	6	194345	194350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4498	NC_017834	GTC	2	6	194380	194385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4499	NC_017834	GC	3	6	194405	194410	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4500	NC_017834	GCG	2	6	194465	194470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

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