MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. animalis ATCC 25527 chromosome

Total Repeats: 42919

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017834	TGC	2	6	154609	154614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3502	NC_017834	TGG	2	6	154668	154673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_017834	GTT	2	6	154714	154719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_017834	GGT	2	6	154721	154726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_017834	TGG	2	6	154764	154769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_017834	G	6	6	154781	154786	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_017834	TGT	2	6	154787	154792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_017834	GTC	2	6	154793	154798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3509	NC_017834	TTG	2	6	154801	154806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_017834	CGG	2	6	154905	154910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3511	NC_017834	TGG	2	6	154938	154943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_017834	GCT	2	6	154959	154964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3513	NC_017834	CTGT	2	8	155016	155023	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3514	NC_017834	CA	3	6	155091	155096	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3515	NC_017834	CGCACT	2	12	155153	155164	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3516	NC_017834	CG	3	6	155171	155176	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3517	NC_017834	GGGT	2	8	155193	155200	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_017834	GCC	2	6	155204	155209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3519	NC_017834	CGC	2	6	155235	155240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3520	NC_017834	TCG	2	6	155303	155308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3521	NC_017834	TGCG	2	8	155347	155354	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3522	NC_017834	AGG	2	6	155473	155478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_017834	GAA	2	6	155485	155490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386866335
3524	NC_017834	TTC	2	6	155606	155611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386866335
3525	NC_017834	CGCC	2	8	155668	155675	0 %	0 %	25 %	75 %	386866335
3526	NC_017834	CAT	2	6	155719	155724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386866335
3527	NC_017834	TAC	2	6	155804	155809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386866335
3528	NC_017834	GAG	3	9	155855	155863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386866335
3529	NC_017834	CCGC	2	8	155878	155885	0 %	0 %	25 %	75 %	386866335
3530	NC_017834	CGC	2	6	155952	155957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866335
3531	NC_017834	AGG	2	6	156078	156083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386866335
3532	NC_017834	GCT	2	6	156093	156098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866335
3533	NC_017834	GAG	2	6	156140	156145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386866335
3534	NC_017834	TAC	2	6	156188	156193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386866335
3535	NC_017834	AAG	2	6	156194	156199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386866335
3536	NC_017834	CGC	2	6	156211	156216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866335
3537	NC_017834	GCT	3	9	156253	156261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866335
3538	NC_017834	AAC	2	6	156320	156325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386866335
3539	NC_017834	ACG	2	6	156348	156353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866335
3540	NC_017834	ACA	2	6	156429	156434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386866335
3541	NC_017834	GAA	2	6	156451	156456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386866335
3542	NC_017834	GCC	2	6	156488	156493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866335
3543	NC_017834	CG	4	8	156571	156578	0 %	0 %	50 %	50 %	386866335
3544	NC_017834	TTC	2	6	156587	156592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386866335
3545	NC_017834	TAC	2	6	156614	156619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386866335
3546	NC_017834	GC	3	6	156624	156629	0 %	0 %	50 %	50 %	386866335
3547	NC_017834	GCT	2	6	156652	156657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866335
3548	NC_017834	GGT	2	6	156736	156741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386866335
3549	NC_017834	CTC	2	6	156856	156861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386866335
3550	NC_017834	GCACC	2	10	156952	156961	20 %	0 %	20 %	60 %	386866335
3551	NC_017834	GAC	2	6	156962	156967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866335
3552	NC_017834	CCCG	2	8	156979	156986	0 %	0 %	25 %	75 %	386866335
3553	NC_017834	GGAG	2	8	157084	157091	25 %	0 %	75 %	0 %	386866336
3554	NC_017834	CGA	2	6	157134	157139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866336
3555	NC_017834	GAA	2	6	157212	157217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386866336
3556	NC_017834	GCC	2	6	157222	157227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866336
3557	NC_017834	CAG	2	6	157230	157235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866336
3558	NC_017834	CGA	2	6	157242	157247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866336
3559	NC_017834	CGC	2	6	157311	157316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866336
3560	NC_017834	CCA	2	6	157397	157402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386866336
3561	NC_017834	GTGG	2	8	157464	157471	0 %	25 %	75 %	0 %	386866336
3562	NC_017834	CG	3	6	157493	157498	0 %	0 %	50 %	50 %	386866336
3563	NC_017834	AGG	2	6	157526	157531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386866336
3564	NC_017834	CAT	2	6	157584	157589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386866336
3565	NC_017834	GCG	2	6	157652	157657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866336
3566	NC_017834	ATC	2	6	157660	157665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386866336
3567	NC_017834	ATC	2	6	157714	157719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386866336
3568	NC_017834	ACA	2	6	157748	157753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386866336
3569	NC_017834	GCTCG	2	10	157857	157866	0 %	20 %	40 %	40 %	386866336
3570	NC_017834	CTC	2	6	157906	157911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386866336
3571	NC_017834	GAT	2	6	157920	157925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386866336
3572	NC_017834	TCG	3	9	157958	157966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866336
3573	NC_017834	GCT	2	6	157991	157996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866336
3574	NC_017834	GAG	2	6	157999	158004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386866336
3575	NC_017834	GCC	2	6	158049	158054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866336
3576	NC_017834	CTA	2	6	158073	158078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386866336
3577	NC_017834	TCG	2	6	158084	158089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866336
3578	NC_017834	ATG	2	6	158101	158106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386866336
3579	NC_017834	GAT	2	6	158118	158123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386866336
3580	NC_017834	GGC	2	6	158190	158195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866336
3581	NC_017834	ATC	2	6	158200	158205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386866336
3582	NC_017834	CCA	2	6	158207	158212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386866336
3583	NC_017834	TCG	2	6	158228	158233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866336
3584	NC_017834	CGC	2	6	158244	158249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866336
3585	NC_017834	ACCG	2	8	158269	158276	25 %	0 %	25 %	50 %	386866336
3586	NC_017834	TTC	2	6	158347	158352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386866336
3587	NC_017834	AT	3	6	158368	158373	50 %	50 %	0 %	0 %	386866336
3588	NC_017834	CGC	2	6	158379	158384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866336
3589	NC_017834	TGC	2	6	158444	158449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866336
3590	NC_017834	GAAG	2	8	158457	158464	50 %	0 %	50 %	0 %	386866336
3591	NC_017834	CTCG	2	8	158532	158539	0 %	25 %	25 %	50 %	386866336
3592	NC_017834	CCA	2	6	158573	158578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386866336
3593	NC_017834	CCG	2	6	158582	158587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866336
3594	NC_017834	GATCGT	2	12	158616	158627	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386866336
3595	NC_017834	CGC	2	6	158631	158636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866336
3596	NC_017834	TCA	2	6	158645	158650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386866336
3597	NC_017834	CT	3	6	158682	158687	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3598	NC_017834	TTG	2	6	158752	158757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_017834	GCG	2	6	158765	158770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3600	NC_017834	ATG	2	6	158771	158776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_017834	TAA	2	6	158782	158787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_017834	TGA	2	6	158788	158793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_017834	TAA	2	6	158798	158803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_017834	ATG	2	6	158867	158872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386866337
3605	NC_017834	CGA	2	6	158875	158880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866337
3606	NC_017834	GCA	2	6	158901	158906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866337
3607	NC_017834	CTG	2	6	158915	158920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866337
3608	NC_017834	GTATC	2	10	159043	159052	20 %	40 %	20 %	20 %	386866337
3609	NC_017834	TCA	2	6	159060	159065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386866337
3610	NC_017834	TCG	2	6	159099	159104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866337
3611	NC_017834	GCA	2	6	159109	159114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866337
3612	NC_017834	CCG	2	6	159202	159207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866337
3613	NC_017834	GC	3	6	159368	159373	0 %	0 %	50 %	50 %	386866337
3614	NC_017834	ACA	2	6	159454	159459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386866337
3615	NC_017834	GCG	2	6	159466	159471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866337
3616	NC_017834	CGCAT	2	10	159524	159533	20 %	20 %	20 %	40 %	386866337
3617	NC_017834	GGAG	2	8	159543	159550	25 %	0 %	75 %	0 %	386866337
3618	NC_017834	CGG	2	6	159562	159567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866337
3619	NC_017834	GGATTC	2	12	159571	159582	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386866337
3620	NC_017834	CGT	2	6	159708	159713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866337
3621	NC_017834	TTC	2	6	159755	159760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386866337
3622	NC_017834	CAG	2	6	159794	159799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866337
3623	NC_017834	CATG	2	8	159802	159809	25 %	25 %	25 %	25 %	386866337
3624	NC_017834	CTG	2	6	159902	159907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866337
3625	NC_017834	TGC	2	6	159937	159942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866337
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3627	NC_017834	CAA	2	6	160018	160023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386866337
3628	NC_017834	TGC	2	6	160182	160187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866337
3629	NC_017834	TGA	2	6	160207	160212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386866337
3630	NC_017834	TTC	2	6	160239	160244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386866337
3631	NC_017834	GCA	2	6	160264	160269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866337
3632	NC_017834	GCA	2	6	160303	160308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866337
3633	NC_017834	GGGAT	2	10	160321	160330	20 %	20 %	60 %	0 %	386866337
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3639	NC_017834	CGA	2	6	160629	160634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866338
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3645	NC_017834	TGA	2	6	160785	160790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386866338
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3652	NC_017834	GCC	2	6	160970	160975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866338
3653	NC_017834	AT	3	6	161007	161012	50 %	50 %	0 %	0 %	386866338
3654	NC_017834	CGTG	2	8	161091	161098	0 %	25 %	50 %	25 %	386866338
3655	NC_017834	GCC	2	6	161106	161111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866338
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3657	NC_017834	GCG	2	6	161153	161158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866338
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3665	NC_017834	CATG	2	8	161544	161551	25 %	25 %	25 %	25 %	386866338
3666	NC_017834	TGC	2	6	161552	161557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866338
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3669	NC_017834	TGA	2	6	161613	161618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386866338
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3683	NC_017834	TGC	2	6	162194	162199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866338
3684	NC_017834	CGA	2	6	162272	162277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866338
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3687	NC_017834	GCAA	2	8	162350	162357	50 %	0 %	25 %	25 %	386866338
3688	NC_017834	TTCCGC	2	12	162358	162369	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	386866338
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3692	NC_017834	CAA	2	6	162486	162491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386866338
3693	NC_017834	CGATG	2	10	162495	162504	20 %	20 %	40 %	20 %	386866338
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3697	NC_017834	AAGA	2	8	162846	162853	75 %	0 %	25 %	0 %	386866339
3698	NC_017834	AAG	2	6	162965	162970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3700	NC_017834	CG	3	6	163032	163037	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3701	NC_017834	AG	4	8	163049	163056	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3702	NC_017834	ATGG	2	8	163095	163102	25 %	25 %	50 %	0 %	386866340
3703	NC_017834	CGG	2	6	163196	163201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866340
3704	NC_017834	CGA	2	6	163256	163261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866340
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3706	NC_017834	CGG	2	6	163370	163375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866340
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3725	NC_017834	GCTCG	2	10	163940	163949	0 %	20 %	40 %	40 %	386866341
3726	NC_017834	GC	3	6	163959	163964	0 %	0 %	50 %	50 %	386866341
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3734	NC_017834	TCG	2	6	164197	164202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866341
3735	NC_017834	AGGTGC	2	12	164233	164244	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386866341
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3737	NC_017834	TGCT	2	8	164289	164296	0 %	50 %	25 %	25 %	386866341
3738	NC_017834	GCG	2	6	164300	164305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866341
3739	NC_017834	GAG	2	6	164322	164327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386866341
3740	NC_017834	GCC	2	6	164346	164351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866341
3741	NC_017834	GC	3	6	164372	164377	0 %	0 %	50 %	50 %	386866341
3742	NC_017834	CG	3	6	164397	164402	0 %	0 %	50 %	50 %	386866341
3743	NC_017834	TCG	2	6	164434	164439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866341
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3748	NC_017834	CGT	2	6	164675	164680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866341
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3773	NC_017834	GCA	2	6	165603	165608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3774	NC_017834	CGCA	2	8	165637	165644	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3775	NC_017834	CGG	3	9	165654	165662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3777	NC_017834	GCG	2	6	165709	165714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3780	NC_017834	GCA	2	6	165845	165850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3783	NC_017834	GC	3	6	165880	165885	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3784	NC_017834	GCG	3	9	166009	166017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3840	NC_017834	ATT	2	6	167937	167942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3841	NC_017834	AGAA	2	8	168061	168068	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3842	NC_017834	GAAACG	2	12	168089	168100	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386866343
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3856	NC_017834	GCCC	2	8	168344	168351	0 %	0 %	25 %	75 %	386866343
3857	NC_017834	GCTC	2	8	168357	168364	0 %	25 %	25 %	50 %	386866343
3858	NC_017834	TCG	2	6	168408	168413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866343
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3862	NC_017834	GC	3	6	168624	168629	0 %	0 %	50 %	50 %	386866343
3863	NC_017834	TTC	2	6	168638	168643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386866343
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3988	NC_017834	GCGT	2	8	173855	173862	0 %	25 %	50 %	25 %	386866346
3989	NC_017834	TGT	2	6	173879	173884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386866346
3990	NC_017834	CGC	2	6	173891	173896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866346
3991	NC_017834	CAC	2	6	174024	174029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386866346
3992	NC_017834	CG	3	6	174060	174065	0 %	0 %	50 %	50 %	386866346
3993	NC_017834	TCC	2	6	174121	174126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386866346
3994	NC_017834	CGG	2	6	174172	174177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866346
3995	NC_017834	ATC	2	6	174178	174183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386866346
3996	NC_017834	GT	3	6	174194	174199	0 %	50 %	50 %	0 %	386866346
3997	NC_017834	CGG	3	9	174228	174236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866346
3998	NC_017834	GCATC	2	10	174254	174263	20 %	20 %	20 %	40 %	386866346
3999	NC_017834	CTC	2	6	174291	174296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386866346
4000	NC_017834	CGG	2	6	174302	174307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866346

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