MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. animalis ATCC 25527 chromosome

Total Repeats: 42919

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017834	ATT	2	6	46785	46790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386866240
1002	NC_017834	GTT	2	6	46802	46807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386866240
1003	NC_017834	TTGC	2	8	46875	46882	0 %	50 %	25 %	25 %	386866240
1004	NC_017834	GA	3	6	46892	46897	50 %	0 %	50 %	0 %	386866240
1005	NC_017834	GGCGG	2	10	46944	46953	0 %	0 %	80 %	20 %	386866240
1006	NC_017834	AT	3	6	47078	47083	50 %	50 %	0 %	0 %	386866240
1007	NC_017834	CCA	2	6	47128	47133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386866240
1008	NC_017834	A	6	6	47148	47153	100 %	0 %	0 %	0 %	386866240
1009	NC_017834	GGT	2	6	47162	47167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386866240
1010	NC_017834	GAA	2	6	47246	47251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386866240
1011	NC_017834	GGAAG	2	10	47264	47273	40 %	0 %	60 %	0 %	386866240
1012	NC_017834	GCG	2	6	47363	47368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866240
1013	NC_017834	GTC	2	6	47416	47421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866240
1014	NC_017834	TTC	2	6	47451	47456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386866240
1015	NC_017834	ATCC	2	8	47467	47474	25 %	25 %	0 %	50 %	386866240
1016	NC_017834	CG	3	6	47667	47672	0 %	0 %	50 %	50 %	386866240
1017	NC_017834	CGG	2	6	47734	47739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866240
1018	NC_017834	CGG	2	6	47873	47878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866240
1019	NC_017834	GAC	3	9	47964	47972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866240
1020	NC_017834	TCT	2	6	47977	47982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386866240
1021	NC_017834	TTTGA	2	10	48108	48117	20 %	60 %	20 %	0 %	386866240
1022	NC_017834	GAGTT	2	10	48172	48181	20 %	40 %	40 %	0 %	386866240
1023	NC_017834	AAGC	2	8	48190	48197	50 %	0 %	25 %	25 %	386866240
1024	NC_017834	GCTAT	2	10	48238	48247	20 %	40 %	20 %	20 %	386866240
1025	NC_017834	GAG	2	6	48333	48338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386866240
1026	NC_017834	GAA	2	6	48341	48346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386866240
1027	NC_017834	AT	3	6	48372	48377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_017834	TA	4	8	48383	48390	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_017834	TC	3	6	48422	48427	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1030	NC_017834	GA	3	6	48442	48447	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_017834	TG	3	6	48459	48464	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_017834	GTT	2	6	48466	48471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_017834	TCC	2	6	48555	48560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1034	NC_017834	TGT	2	6	48597	48602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_017834	TC	3	6	48608	48613	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1036	NC_017834	TTC	2	6	48674	48679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386866241
1037	NC_017834	T	6	6	48721	48726	0 %	100 %	0 %	0 %	386866241
1038	NC_017834	GTA	2	6	48727	48732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386866241
1039	NC_017834	CTG	2	6	48742	48747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866241
1040	NC_017834	CGA	2	6	48762	48767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866241
1041	NC_017834	CCT	2	6	48819	48824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386866241
1042	NC_017834	TGT	2	6	48868	48873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386866241
1043	NC_017834	GC	3	6	49068	49073	0 %	0 %	50 %	50 %	386866241
1044	NC_017834	GAT	2	6	49129	49134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386866241
1045	NC_017834	CCT	2	6	49149	49154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1046	NC_017834	AGT	2	6	49172	49177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_017834	GA	3	6	49299	49304	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_017834	AT	3	6	49312	49317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_017834	GT	3	6	49324	49329	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_017834	CGA	2	6	49360	49365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_017834	ATG	2	6	49374	49379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_017834	GGA	2	6	49383	49388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_017834	GGC	2	6	49390	49395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_017834	TCT	2	6	49500	49505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_017834	GAG	2	6	49575	49580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_017834	ATC	2	6	49596	49601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_017834	GTT	2	6	49628	49633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_017834	CCG	2	6	49635	49640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1059	NC_017834	ACC	2	6	49641	49646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1060	NC_017834	GCT	2	6	49662	49667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_017834	GGT	2	6	49695	49700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_017834	TGG	2	6	49723	49728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_017834	GTT	2	6	49763	49768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_017834	TCT	2	6	49875	49880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386866242
1065	NC_017834	GCCT	2	8	49885	49892	0 %	25 %	25 %	50 %	386866242
1066	NC_017834	CCG	2	6	49907	49912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866242
1067	NC_017834	CGC	2	6	49918	49923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866242
1068	NC_017834	GTC	2	6	49933	49938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866242
1069	NC_017834	TGC	2	6	49946	49951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866242
1070	NC_017834	TGC	2	6	49982	49987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866242
1071	NC_017834	GCC	2	6	50003	50008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866242
1072	NC_017834	CG	3	6	50037	50042	0 %	0 %	50 %	50 %	386866242
1073	NC_017834	TTTC	2	8	50074	50081	0 %	75 %	0 %	25 %	386866242
1074	NC_017834	GTC	2	6	50252	50257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866243
1075	NC_017834	CTT	2	6	50318	50323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386866243
1076	NC_017834	CGCT	2	8	50345	50352	0 %	25 %	25 %	50 %	386866243
1077	NC_017834	CGT	2	6	50380	50385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866243
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1079	NC_017834	ATCA	2	8	50396	50403	50 %	25 %	0 %	25 %	386866243
1080	NC_017834	CA	3	6	50402	50407	50 %	0 %	0 %	50 %	386866243
1081	NC_017834	CCA	2	6	50408	50413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386866244
1082	NC_017834	CT	3	6	50497	50502	0 %	50 %	0 %	50 %	386866244
1083	NC_017834	GTG	2	6	50552	50557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386866244
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1085	NC_017834	TGC	2	6	50586	50591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866244
1086	NC_017834	TGC	2	6	50618	50623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866244
1087	NC_017834	GGT	2	6	50700	50705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386866244
1088	NC_017834	GTC	2	6	50733	50738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866244
1089	NC_017834	CAT	2	6	50766	50771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386866244
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1091	NC_017834	CGC	2	6	50861	50866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866244
1092	NC_017834	TCTGGC	2	12	50924	50935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866244
1093	NC_017834	ATT	2	6	50983	50988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386866244
1094	NC_017834	AGT	2	6	51016	51021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386866244
1095	NC_017834	TG	3	6	51087	51092	0 %	50 %	50 %	0 %	386866244
1096	NC_017834	ATG	2	6	51118	51123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386866244
1097	NC_017834	C	6	6	51125	51130	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1098	NC_017834	CGA	2	6	51310	51315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866245
1099	NC_017834	CGC	2	6	51322	51327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866245
1100	NC_017834	CAAGC	2	10	51359	51368	40 %	0 %	20 %	40 %	386866245
1101	NC_017834	GGTC	2	8	51369	51376	0 %	25 %	50 %	25 %	386866245
1102	NC_017834	GCC	2	6	51515	51520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1103	NC_017834	ATG	2	6	51542	51547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_017834	TCG	2	6	51700	51705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_017834	CGC	2	6	51738	51743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1106	NC_017834	CAT	2	6	51748	51753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_017834	CGTTCC	2	12	51840	51851	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	386866246
1108	NC_017834	TG	3	6	51873	51878	0 %	50 %	50 %	0 %	386866246
1109	NC_017834	TCA	2	6	51880	51885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386866246
1110	NC_017834	TGAT	2	8	51918	51925	25 %	50 %	25 %	0 %	386866246
1111	NC_017834	TCGT	2	8	52200	52207	0 %	50 %	25 %	25 %	386866246
1112	NC_017834	GTC	2	6	52247	52252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866246
1113	NC_017834	CAT	2	6	52255	52260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386866246
1114	NC_017834	CAA	2	6	52262	52267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386866246
1115	NC_017834	AGC	2	6	52268	52273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866246
1116	NC_017834	CG	3	6	52308	52313	0 %	0 %	50 %	50 %	386866246
1117	NC_017834	AGTG	2	8	52341	52348	25 %	25 %	50 %	0 %	386866246
1118	NC_017834	TGA	2	6	52390	52395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386866246
1119	NC_017834	CAAT	2	8	52411	52418	50 %	25 %	0 %	25 %	386866246
1120	NC_017834	TCC	2	6	52434	52439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1121	NC_017834	CG	3	6	52449	52454	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1122	NC_017834	TGC	3	9	52545	52553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_017834	TG	3	6	52592	52597	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_017834	CCT	2	6	52619	52624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1125	NC_017834	GTGCT	2	10	52711	52720	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1126	NC_017834	TCG	2	6	52741	52746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_017834	GAG	2	6	52927	52932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_017834	CTG	2	6	53164	53169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866247
1129	NC_017834	CGT	2	6	53183	53188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866247
1130	NC_017834	GAA	2	6	53220	53225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386866247
1131	NC_017834	GAGG	2	8	53248	53255	25 %	0 %	75 %	0 %	386866247
1132	NC_017834	CTG	2	6	53341	53346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866247
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1135	NC_017834	CGC	2	6	53444	53449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866247
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1139	NC_017834	TGC	2	6	53636	53641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866247
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1143	NC_017834	TGC	2	6	53787	53792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866247
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1149	NC_017834	AG	3	6	54206	54211	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1150	NC_017834	TGCT	2	8	54220	54227	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1151	NC_017834	GGTG	2	8	54285	54292	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1152	NC_017834	TGT	2	6	54502	54507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1153	NC_017834	GGAA	2	8	54596	54603	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1154	NC_017834	TGC	2	6	54638	54643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866248
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1162	NC_017834	GC	3	6	54873	54878	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1163	NC_017834	GCT	2	6	54990	54995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866249
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1182	NC_017834	GGGC	2	8	56107	56114	0 %	0 %	75 %	25 %	386866250
1183	NC_017834	CG	3	6	56147	56152	0 %	0 %	50 %	50 %	386866250
1184	NC_017834	GAG	2	6	56161	56166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386866250
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1188	NC_017834	GC	3	6	56350	56355	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1248	NC_017834	CG	3	6	59196	59201	0 %	0 %	50 %	50 %	386866253
1249	NC_017834	GCCTT	2	10	59228	59237	0 %	40 %	20 %	40 %	386866253
1250	NC_017834	GGT	2	6	59287	59292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1251	NC_017834	CAT	2	6	59354	59359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1252	NC_017834	G	6	6	59421	59426	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1253	NC_017834	GAG	2	6	59428	59433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1254	NC_017834	CG	3	6	59528	59533	0 %	0 %	50 %	50 %	386866254
1255	NC_017834	CG	3	6	59581	59586	0 %	0 %	50 %	50 %	386866254
1256	NC_017834	CGCACG	2	12	59603	59614	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386866254
1257	NC_017834	CCGC	2	8	59682	59689	0 %	0 %	25 %	75 %	386866254
1258	NC_017834	CGA	2	6	59752	59757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866254
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1260	NC_017834	AGCC	2	8	59852	59859	25 %	0 %	25 %	50 %	386866254
1261	NC_017834	ATC	2	6	59867	59872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386866254
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1293	NC_017834	GGT	2	6	60927	60932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386866255
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1370	NC_017834	CAG	2	6	63915	63920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866258
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