MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. animalis ATCC 25527 chromosome

Total Repeats: 42919

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_017834	GGA	2	6	257142	257147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386866415
6002	NC_017834	GAC	2	6	257218	257223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866415
6003	NC_017834	CGC	2	6	257252	257257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866415
6004	NC_017834	GCT	2	6	257271	257276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866415
6005	NC_017834	CGC	2	6	257277	257282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866415
6006	NC_017834	GCT	2	6	257286	257291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866415
6007	NC_017834	GC	3	6	257347	257352	0 %	0 %	50 %	50 %	386866415
6008	NC_017834	CTG	2	6	257360	257365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866415
6009	NC_017834	CGG	2	6	257394	257399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866415
6010	NC_017834	CAC	2	6	257439	257444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386866415
6011	NC_017834	CCCA	2	8	257470	257477	25 %	0 %	0 %	75 %	386866415
6012	NC_017834	GCC	3	9	257515	257523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866415
6013	NC_017834	ATG	2	6	257531	257536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386866415
6014	NC_017834	GGA	2	6	257580	257585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386866415
6015	NC_017834	GGC	2	6	257631	257636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866415
6016	NC_017834	GC	3	6	257652	257657	0 %	0 %	50 %	50 %	386866415
6017	NC_017834	GCAA	2	8	257714	257721	50 %	0 %	25 %	25 %	386866415
6018	NC_017834	CAC	2	6	257799	257804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386866415
6019	NC_017834	CGT	2	6	257808	257813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866415
6020	NC_017834	GCC	2	6	257919	257924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866415
6021	NC_017834	GGA	2	6	257925	257930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386866415
6022	NC_017834	GCT	2	6	257952	257957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866415
6023	NC_017834	GCA	2	6	257958	257963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866415
6024	NC_017834	TCG	2	6	257978	257983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866415
6025	NC_017834	CG	3	6	257990	257995	0 %	0 %	50 %	50 %	386866415
6026	NC_017834	ATC	2	6	257997	258002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386866415
6027	NC_017834	GCA	2	6	258012	258017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866415
6028	NC_017834	CCA	2	6	258020	258025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386866415
6029	NC_017834	TCC	2	6	258034	258039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386866415
6030	NC_017834	GCC	2	6	258061	258066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866415
6031	NC_017834	GAC	3	9	258133	258141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866415
6032	NC_017834	GAG	2	6	258211	258216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386866415
6033	NC_017834	GCA	2	6	258225	258230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866415
6034	NC_017834	CGA	2	6	258309	258314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866415
6035	NC_017834	CAG	2	6	258355	258360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866415
6036	NC_017834	CGA	2	6	258393	258398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866415
6037	NC_017834	GGCG	2	8	258540	258547	0 %	0 %	75 %	25 %	386866415
6038	NC_017834	GCC	2	6	258558	258563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866415
6039	NC_017834	CGA	3	9	258582	258590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866415
6040	NC_017834	GAC	2	6	258604	258609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866415
6041	NC_017834	ATG	2	6	258626	258631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386866415
6042	NC_017834	CGA	2	6	258693	258698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866415
6043	NC_017834	AAC	2	6	258703	258708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386866415
6044	NC_017834	CGC	2	6	258754	258759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6045	NC_017834	GAG	2	6	258773	258778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_017834	TGGCAT	2	12	258785	258796	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386866416
6047	NC_017834	ACG	2	6	258797	258802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866416
6048	NC_017834	GC	3	6	258860	258865	0 %	0 %	50 %	50 %	386866416
6049	NC_017834	CTG	2	6	258883	258888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866416
6050	NC_017834	TCG	2	6	258917	258922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866416
6051	NC_017834	TG	3	6	258975	258980	0 %	50 %	50 %	0 %	386866416
6052	NC_017834	AGC	2	6	258985	258990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866416
6053	NC_017834	CGT	2	6	259015	259020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866416
6054	NC_017834	GTG	2	6	259039	259044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386866416
6055	NC_017834	GAG	2	6	259045	259050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386866416
6056	NC_017834	ACGC	2	8	259074	259081	25 %	0 %	25 %	50 %	386866416
6057	NC_017834	GCG	2	6	259112	259117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866416
6058	NC_017834	GCT	2	6	259167	259172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866416
6059	NC_017834	ACG	2	6	259184	259189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866416
6060	NC_017834	ACC	3	9	259243	259251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386866416
6061	NC_017834	GCC	2	6	259259	259264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866416
6062	NC_017834	CGC	2	6	259271	259276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866416
6063	NC_017834	GCG	2	6	259319	259324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866416
6064	NC_017834	CGA	2	6	259338	259343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866416
6065	NC_017834	CG	3	6	259357	259362	0 %	0 %	50 %	50 %	386866416
6066	NC_017834	CGT	2	6	259372	259377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866416
6067	NC_017834	ATA	2	6	259445	259450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_017834	CGG	2	6	259531	259536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866417
6069	NC_017834	TCG	2	6	259538	259543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866417
6070	NC_017834	GCCGAC	2	12	259547	259558	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386866417
6071	NC_017834	CGC	2	6	259577	259582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866417
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6074	NC_017834	CGT	2	6	259618	259623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866417
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6080	NC_017834	CCA	2	6	259941	259946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386866417
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6083	NC_017834	CG	3	6	260071	260076	0 %	0 %	50 %	50 %	386866417
6084	NC_017834	ACG	2	6	260097	260102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866417
6085	NC_017834	GTC	2	6	260116	260121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866417
6086	NC_017834	TGC	2	6	260226	260231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866417
6087	NC_017834	ATT	2	6	260291	260296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6088	NC_017834	CAATA	2	10	260297	260306	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6089	NC_017834	TA	3	6	260315	260320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6090	NC_017834	GACA	2	8	260337	260344	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6091	NC_017834	ATT	2	6	260408	260413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386866418
6092	NC_017834	ACA	2	6	260430	260435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386866418
6093	NC_017834	GCG	2	6	260457	260462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866418
6094	NC_017834	CGA	2	6	260467	260472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866418
6095	NC_017834	GGCG	2	8	260542	260549	0 %	0 %	75 %	25 %	386866418
6096	NC_017834	CCG	2	6	260562	260567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866418
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6101	NC_017834	GC	3	6	260726	260731	0 %	0 %	50 %	50 %	386866418
6102	NC_017834	TTC	2	6	260732	260737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386866418
6103	NC_017834	GAG	2	6	260750	260755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386866418
6104	NC_017834	CGC	2	6	260797	260802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866418
6105	NC_017834	ACG	2	6	260826	260831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866418
6106	NC_017834	CGTG	2	8	260833	260840	0 %	25 %	50 %	25 %	386866418
6107	NC_017834	CGT	2	6	260884	260889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866418
6108	NC_017834	CGG	2	6	260893	260898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866418
6109	NC_017834	CAA	2	6	260930	260935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6110	NC_017834	CGG	2	6	260942	260947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6111	NC_017834	CGA	2	6	261051	261056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866419
6112	NC_017834	GGA	2	6	261147	261152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386866419
6113	NC_017834	CCG	2	6	261161	261166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866419
6114	NC_017834	TCT	2	6	261191	261196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386866419
6115	NC_017834	CGG	2	6	261197	261202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866419
6116	NC_017834	GCG	2	6	261203	261208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866419
6117	NC_017834	CTC	2	6	261267	261272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386866419
6118	NC_017834	ACG	3	9	261287	261295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866419
6119	NC_017834	GAC	2	6	261325	261330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866419
6120	NC_017834	CGA	2	6	261333	261338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866419
6121	NC_017834	CAT	2	6	261384	261389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386866419
6122	NC_017834	CG	3	6	261472	261477	0 %	0 %	50 %	50 %	386866419
6123	NC_017834	AGC	2	6	261485	261490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866419
6124	NC_017834	TGA	2	6	261491	261496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386866419
6125	NC_017834	GGC	2	6	261507	261512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866419
6126	NC_017834	CGG	2	6	261543	261548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866419
6127	NC_017834	CCA	2	6	261572	261577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386866419
6128	NC_017834	GC	3	6	261583	261588	0 %	0 %	50 %	50 %	386866419
6129	NC_017834	GAC	2	6	261631	261636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866419
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6141	NC_017834	CG	3	6	262008	262013	0 %	0 %	50 %	50 %	386866419
6142	NC_017834	CGGT	2	8	262088	262095	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6143	NC_017834	ATCG	2	8	262205	262212	25 %	25 %	25 %	25 %	386866420
6144	NC_017834	AACA	2	8	262218	262225	75 %	0 %	0 %	25 %	386866420
6145	NC_017834	CG	3	6	262287	262292	0 %	0 %	50 %	50 %	386866420
6146	NC_017834	GC	3	6	262296	262301	0 %	0 %	50 %	50 %	386866420
6147	NC_017834	CG	3	6	262391	262396	0 %	0 %	50 %	50 %	386866420
6148	NC_017834	CAC	2	6	262424	262429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386866420
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6151	NC_017834	GC	3	6	262554	262559	0 %	0 %	50 %	50 %	386866420
6152	NC_017834	CGA	2	6	262574	262579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866420
6153	NC_017834	GAG	2	6	262599	262604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386866420
6154	NC_017834	TCGCCA	2	12	262609	262620	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386866420
6155	NC_017834	GCA	2	6	262622	262627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866420
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6159	NC_017834	CG	3	6	262784	262789	0 %	0 %	50 %	50 %	386866420
6160	NC_017834	GCG	2	6	262826	262831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6161	NC_017834	TGCGT	2	10	262851	262860	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6162	NC_017834	CGG	2	6	262967	262972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6163	NC_017834	CG	3	6	263041	263046	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6164	NC_017834	CCCT	2	8	263114	263121	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6165	NC_017834	CG	4	8	263149	263156	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6166	NC_017834	AGG	2	6	263193	263198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6239	NC_017834	TGT	2	6	266178	266183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386866422
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6241	NC_017834	CGT	2	6	266424	266429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866422
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6243	NC_017834	TGG	2	6	266463	266468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386866422
6244	NC_017834	GTT	2	6	266497	266502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386866422
6245	NC_017834	GCC	2	6	266527	266532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866422
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6360	NC_017834	GAA	2	6	270727	270732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6361	NC_017834	GA	3	6	270894	270899	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6362	NC_017834	TA	3	6	270944	270949	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6363	NC_017834	GGC	2	6	270951	270956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6364	NC_017834	CG	3	6	271008	271013	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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6487	NC_017834	GCG	2	6	275605	275610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866427
6488	NC_017834	GGC	2	6	275627	275632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866427
6489	NC_017834	GC	4	8	275631	275638	0 %	0 %	50 %	50 %	386866427
6490	NC_017834	CG	3	6	275747	275752	0 %	0 %	50 %	50 %	386866427
6491	NC_017834	TGC	2	6	275776	275781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386866427
6492	NC_017834	CGAA	2	8	275881	275888	50 %	0 %	25 %	25 %	386866427
6493	NC_017834	GGC	2	6	275900	275905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386866427
6494	NC_017834	CGA	2	6	275951	275956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866427
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6496	NC_017834	CGC	2	6	275976	275981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386866427
6497	NC_017834	A	6	6	276000	276005	100 %	0 %	0 %	0 %	386866427
6498	NC_017834	GAC	2	6	276006	276011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386866427
6499	NC_017834	CACGC	2	10	276021	276030	20 %	0 %	20 %	60 %	386866427
6500	NC_017834	CG	3	6	276054	276059	0 %	0 %	50 %	50 %	386866427

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