MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 217

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017822	CAA	2	6	129	134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386859016
2	NC_017822	AAT	2	6	217	222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859016
3	NC_017822	TTA	2	6	263	268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859016
4	NC_017822	TAG	2	6	354	359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386859016
5	NC_017822	ATC	2	6	391	396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859016
6	NC_017822	ATT	2	6	502	507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017822	AAT	2	6	512	517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017822	AAT	2	6	566	571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859017
9	NC_017822	CAT	3	9	614	622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859017
10	NC_017822	ACT	2	6	672	677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859017
11	NC_017822	TAA	2	6	684	689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859017
12	NC_017822	TAA	2	6	717	722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859017
13	NC_017822	TTG	2	6	758	763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386859017
14	NC_017822	CAG	2	6	839	844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386859017
15	NC_017822	CAC	2	6	884	889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386859017
16	NC_017822	ATG	2	6	926	931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386859017
17	NC_017822	ATT	2	6	1038	1043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859017
18	NC_017822	ATT	2	6	1154	1159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859018
19	NC_017822	GTT	2	6	1186	1191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386859018
20	NC_017822	CAA	2	6	1228	1233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386859018
21	NC_017822	CTA	2	6	1234	1239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859018
22	NC_017822	TCA	2	6	1448	1453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859019
23	NC_017822	TTA	3	9	1466	1474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859019
24	NC_017822	TAC	2	6	1645	1650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859020
25	NC_017822	ATT	2	6	1688	1693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859020
26	NC_017822	TTC	2	6	1700	1705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859020
27	NC_017822	ATT	2	6	1736	1741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859020
28	NC_017822	CAA	2	6	1965	1970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017822	AAT	2	6	1999	2004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017822	GAG	2	6	2042	2047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017822	TAC	2	6	2409	2414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017822	AGT	2	6	2420	2425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386859021
33	NC_017822	ATA	2	6	2436	2441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859021
34	NC_017822	AAC	2	6	2484	2489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386859021
35	NC_017822	GAA	2	6	2513	2518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386859021
36	NC_017822	AAG	2	6	2571	2576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386859021
37	NC_017822	AGT	2	6	2716	2721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386859021
38	NC_017822	ATT	2	6	3328	3333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017822	GCT	2	6	3515	3520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386859022
40	NC_017822	CTT	2	6	3620	3625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859023
41	NC_017822	ATC	2	6	3639	3644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859023
42	NC_017822	AGC	2	6	3654	3659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386859023
43	NC_017822	TGC	2	6	3669	3674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386859023
44	NC_017822	CAA	2	6	3701	3706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386859023
45	NC_017822	TTG	2	6	3763	3768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386859024
46	NC_017822	GCT	2	6	3777	3782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386859024
47	NC_017822	ACT	2	6	3894	3899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859024
48	NC_017822	TGC	2	6	3957	3962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386859024
49	NC_017822	CAG	2	6	3971	3976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386859025
50	NC_017822	CAC	2	6	3998	4003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386859025
51	NC_017822	CTT	2	6	4022	4027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859025
52	NC_017822	AGT	2	6	4038	4043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386859025
53	NC_017822	ACC	2	6	4053	4058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386859025
54	NC_017822	TGC	2	6	4089	4094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386859025
55	NC_017822	TCT	2	6	4201	4206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017822	TCA	2	6	4258	4263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859026
57	NC_017822	CTA	2	6	4319	4324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859026
58	NC_017822	CAG	2	6	4385	4390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386859026
59	NC_017822	GCT	2	6	4438	4443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386859026
60	NC_017822	CTA	2	6	4457	4462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859026
61	NC_017822	TAA	2	6	4481	4486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859026
62	NC_017822	CTT	2	6	4499	4504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859026
63	NC_017822	TAG	2	6	4568	4573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386859026
64	NC_017822	ACT	2	6	4736	4741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859027
65	NC_017822	CAT	2	6	4748	4753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859027
66	NC_017822	CTT	2	6	4773	4778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017822	ATC	2	6	4820	4825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017822	TTC	2	6	4953	4958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859028
69	NC_017822	TCT	2	6	5014	5019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859028
70	NC_017822	TAT	2	6	5046	5051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859028
71	NC_017822	CCG	2	6	5054	5059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386859028
72	NC_017822	TAT	2	6	5072	5077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859028
73	NC_017822	ACC	2	6	5082	5087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386859028
74	NC_017822	ATT	2	6	5088	5093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859028
75	NC_017822	TGC	2	6	5094	5099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386859028
76	NC_017822	TCC	2	6	5136	5141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_017822	AAC	2	6	5243	5248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017822	TCT	2	6	5253	5258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017822	TGC	2	6	5311	5316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017822	CAT	2	6	5376	5381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859029
81	NC_017822	TAT	2	6	5389	5394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859029
82	NC_017822	ATA	2	6	5596	5601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017822	ATA	2	6	5647	5652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017822	ATT	2	6	5816	5821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017822	TAA	2	6	7215	7220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017822	CAT	2	6	7363	7368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017822	AAT	2	6	7470	7475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859030
88	NC_017822	GGT	2	6	7495	7500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386859030
89	NC_017822	ATT	2	6	7522	7527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859030
90	NC_017822	TTG	2	6	7568	7573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386859030
91	NC_017822	AAT	2	6	7636	7641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859030
92	NC_017822	ATA	2	6	7706	7711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859030
93	NC_017822	TTG	2	6	7898	7903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386859030
94	NC_017822	TGA	2	6	7949	7954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386859030
95	NC_017822	TAG	2	6	8006	8011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386859030
96	NC_017822	TAA	2	6	8109	8114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859030
97	NC_017822	AAT	2	6	8131	8136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859030
98	NC_017822	TTA	2	6	8163	8168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859030
99	NC_017822	AAG	3	9	8341	8349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386859031
100	NC_017822	AAT	2	6	8414	8419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859031
101	NC_017822	TAA	2	6	8659	8664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859031
102	NC_017822	GAA	2	6	8745	8750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386859031
103	NC_017822	TAT	2	6	8908	8913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017822	TTA	2	6	8963	8968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017822	AAC	2	6	9001	9006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017822	AAT	2	6	9007	9012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017822	GAT	2	6	9043	9048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017822	TTA	2	6	9163	9168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017822	TAA	2	6	9319	9324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017822	AAT	2	6	9355	9360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017822	ACA	2	6	9378	9383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017822	GAA	2	6	9449	9454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017822	ATT	2	6	9490	9495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017822	ATG	2	6	9501	9506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017822	TCA	2	6	9816	9821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017822	TTA	2	6	9849	9854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017822	AAG	2	6	10772	10777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017822	AGA	3	9	10801	10809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017822	GAA	3	9	10810	10818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017822	AGA	2	6	10845	10850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386859032
121	NC_017822	TGA	2	6	10893	10898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386859032
122	NC_017822	ATA	2	6	10940	10945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859032
123	NC_017822	CCG	2	6	10957	10962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386859032
124	NC_017822	ACT	2	6	10999	11004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859032
125	NC_017822	TGA	2	6	11078	11083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386859032
126	NC_017822	AGA	2	6	11094	11099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386859032
127	NC_017822	GAT	2	6	11100	11105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386859032
128	NC_017822	AAG	2	6	11132	11137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017822	AGA	2	6	11148	11153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017822	TGA	2	6	11239	11244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017822	ATA	2	6	11305	11310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017822	TGT	2	6	11437	11442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386859033
133	NC_017822	AGA	2	6	11476	11481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386859033
134	NC_017822	AGA	2	6	11512	11517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386859033
135	NC_017822	ATT	2	6	11621	11626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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138	NC_017822	TAA	2	6	11968	11973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859034
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142	NC_017822	TAA	2	6	12206	12211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017822	AAG	2	6	12253	12258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017822	ATA	2	6	12279	12284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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146	NC_017822	ATT	2	6	12334	12339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_017822	ATA	2	6	12974	12979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859035
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.