MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 54

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017820	ATA	2	6	40	45	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017820	AAC	2	6	64	69	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017820	TTC	2	6	115	120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017820	TAT	2	6	294	299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386860120
5	NC_017820	CTC	2	6	320	325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386860120
6	NC_017820	TAA	2	6	343	348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386860120
7	NC_017820	GCT	2	6	498	503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386860120
8	NC_017820	TCT	2	6	525	530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386860120
9	NC_017820	CTT	2	6	588	593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386860120
10	NC_017820	TTA	2	6	696	701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386860120
11	NC_017820	TTC	2	6	721	726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386860120
12	NC_017820	CAT	2	6	766	771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386860120
13	NC_017820	ATT	2	6	830	835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386860120
14	NC_017820	CCT	2	6	850	855	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_017820	AAT	3	9	1043	1051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386860121
16	NC_017820	TCT	2	6	1052	1057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386860121
17	NC_017820	TAT	2	6	1099	1104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386860121
18	NC_017820	TTC	2	6	1139	1144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386860122
19	NC_017820	AGG	2	6	1256	1261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386860122
20	NC_017820	AAC	2	6	1323	1328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386860122
21	NC_017820	TCT	2	6	1347	1352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386860122
22	NC_017820	TTA	2	6	1410	1415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386860122
23	NC_017820	ATA	2	6	1457	1462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386860122
24	NC_017820	AAT	2	6	1580	1585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386860122
25	NC_017820	ATT	2	6	1632	1637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386860122
26	NC_017820	CTT	2	6	1707	1712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386860123
27	NC_017820	TTA	2	6	1742	1747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386860123
28	NC_017820	ATA	2	6	1783	1788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386860123
29	NC_017820	ACA	2	6	1898	1903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386860123
30	NC_017820	TCT	2	6	1915	1920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386860123
31	NC_017820	ATA	2	6	1927	1932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386860123
32	NC_017820	TAA	2	6	1957	1962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386860123
33	NC_017820	AAT	2	6	2011	2016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386860123
34	NC_017820	TTC	2	6	2032	2037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386860123
35	NC_017820	TAT	2	6	2094	2099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386860123
36	NC_017820	TCT	2	6	2191	2196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386860123
37	NC_017820	TTC	2	6	2277	2282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386860124
38	NC_017820	TCT	2	6	2337	2342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386860124
39	NC_017820	CTT	2	6	2434	2439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386860124
40	NC_017820	ATT	2	6	2453	2458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386860124
41	NC_017820	ATT	2	6	2468	2473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386860124
42	NC_017820	TAT	2	6	2479	2484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386860124
43	NC_017820	TGT	2	6	2553	2558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386860124
44	NC_017820	TAA	2	6	2699	2704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386860124
45	NC_017820	AAT	2	6	2714	2719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386860124
46	NC_017820	TTA	2	6	2724	2729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386860124
47	NC_017820	ATT	2	6	2769	2774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386860124
48	NC_017820	TGT	2	6	2887	2892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386860124
49	NC_017820	ATT	2	6	2936	2941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386860124
50	NC_017820	ATT	2	6	3079	3084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017820	TAA	2	6	3104	3109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017820	ATA	2	6	3142	3147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386860125
53	NC_017820	TAA	2	6	3158	3163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386860125
54	NC_017820	CAA	2	6	3183	3188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386860125

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.